Агломеративная когнитивная кластеризация нозологических образов в ветеринарии
Рассмотрение проблемы, возникающей при нозологической диагностике: различные нозологические единицы в ряде случаев имеют сходную симптоматику и являются сложно различимыми из-за чего возникает опасность постановки неверного диагноза и неправильного лечени
Рубрика | Сельское, лесное хозяйство и землепользование |
Вид | статья |
Язык | русский |
Дата добавления | 22.05.2018 |
Размер файла | 4,5 M |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
АГЛОМЕРАТИВНАЯ КОГНИТИВНАЯ КЛАСТЕРИЗАЦИЯ НОЗОЛОГИЧЕСКИХ ОБРАЗОВ В ВЕТЕРИНАРИИ
06.02.00 Ветеринария и Зоотехния
Луценко Евгений Вениаминович
д.э.н., к.т.н., профессор
Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т.Трубилина
В статье на небольшом численном примере рассматривается сходство и различие нозологических образов в ветеринарии с применением нового метода агломеративной кластеризации, реализованного в автоматизированном системно-когнитивном анализе (АСК-анализ). Этот метод получил название: «Агломеративная когнитивная кластеризация». Этот метод отличается от известных традиционных тем, что: а) в нем параметры обобщенного образа кластера вычисляются не как средние от исходных объектов (классов) или их центр тяжести, а определяются с помощью той же самой базовой когнитивной операции АСК-анализа, которая применяется и для формирования обобщенных образов классов на основе примеров объектов и которая действительно корректно обеспечивает обобщение; б) в качестве критерия сходства используется не евклидово расстояние или его варианты, а интегральный критерий неметрической природы: «суммарное количество информации», применение которого теоретически корректно и дает хорошие результаты в неортонормированных пространствах, которые обычно и встречаются на практике; в) кластерный анализ проводится не на основе исходных переменных, матриц частот или матрицы сходства (различий), зависящих от единиц измерения по осям, а в когнитивном пространстве, в котором по всем осям (описательным шкалам) используется одна единица измерения: количество информации, и поэтому результаты кластеризации не зависят от исходных единиц измерения признаков объектов. Все это позволяет получить результаты кластеризации, понятные специалистам и поддающиеся содержательной интерпретации, хорошо согласующиеся с оценками экспертов, их опытом и интуитивными ожиданиями, что часто представляет собой проблему для классических методов кластеризации
Ключевые слова: автоматизированный системно-когнитивный анализ, интеллектуальная система «эйдос», когнитивное пространство, агломеративная кластеризация
The article deals with the similarity and difference of nosological images in veterinary medicine using a new method of agglomerative clustering implemented in Automated system-cognitive analysis (ASC-analysis) on a small numerical example. This method is called Agglomerative cognitive clustering. This method differs from the known traditional facts: a) parameters of a generalized image of the cluster are computed not as averages from the original objects (classes) or their center of gravity, and are defined using the same underlying cognitive operations of ASC-analysis, which is used for the formation of generalized images of the classes on the basis of examples of objects and which is really correct and provides a synthesis; b) as a criterion of similarity we do not use Euclidean distance or its variants, and the integral criterion of non-metric nature: "the total amount of information", the use of which is theoretically correct and gives good results in non-orthonormal spaces, which are usually found in practice; c) cluster analysis is not based on the original variables, matrices of frequency or a matrix of similarities (differences) dependent on the measurement units of the axes, and in the cognitive space in which all the axes (descriptive scales) use the same unit of measurement: the quantity of information, and therefore, the clustering results do not depend on the original units of measurement features. All this makes it possible to obtain clustering results that are understandable to specialists and can be interpreted in a meaningful way that is in line with experts' assessments, their experience and intuitive expectations, which is often a problem for classical clustering methods.
Keywords: automative system-cognitive analysis, intellectual system "eidos", cognitive space, agglomerative clusterization
В данной статье процесс диагностики и лечения животных рассматривается с позиций теории управления с применением искусственного интеллекта.
Состав классической системы управления с обратной связью приведен на рисунке 1:
Рисунок 1. Цикл управления в замкнутой системе управления
нозологическая диагностика сходная симптоматика
Конкретизируем стандартные универсальные термины теория управления для ветеринарии:
- объектом управления является животное;
- управляющая система - это ветеринар;
- информация обратной связи о состоянии объекта управления - это клиническая картина (непосредственно наблюдаемая симптоматика) и, возможно, данные лабораторных исследований;
- управляющие факторы - это лечебные воздействия со стороны ветеринара на больное животное;
- целью управления является перевести животное из нежелательного состояния болезни в здоровое состояние.
Для принятия решения об управляющих воздействиях, т.е. для разработки плана лечения, необходимо предварительно поставить больному животному нозологический диагноз (от греч. nosos -- болезнь и logos -- слово, учение; букв.-- учение о болезни), т.е. выработать заключение о сущности заболевания и состоянии животного, выраженное в нозологических терминах (установить болезненную форму или нозологическую единицу).
Задача нозологической диагностики может решаться в частности на основе знания симптоматики и по сути представляет собой задачу классификации объекта по его признакам (идентификация, распознавание). Решение этой задачи в ветеринарии (как и задач: поддержки управляющих решений и исследования моделируемой предметной области путем исследования ее модели) подробнейшим образом рассмотрено в работе [1]. Для решения этих задач применен автоматизированный системно-когнитивный анализ (АСК-анализ) и его программный инструментарий Универсальная автоматизированная система «Эйдос» [2, 3] http://lc.kubagro.ru/aidos/Presentation_Aidos-online.pdf .
В данной работе рассматривается и решается проблема, возникающая при нозологической диагностике (классификации), состоящая в том, что различные нозологические единицы в ряде случаев имеют сходную симптоматику и являются сложно различимыми из-за чего возникает опасность постановки неверного диагноза и, соответственно, неправильного лечения Известно, что лечение не от той болезни иногда может быть привести к более плачевным результатам, чем отсутствие лечения. Это может быть связано как с весьма нежелательными побочными эффектами применяемых методов, так и в очень большой степени просто с потерей ценнейшего времени..
Предлагается идея решения проблемы состоящей в том, что ветеринар должен иметь информацию о степени сходства-различия нозологических образов по симптоматике должен учитывать ее при интерпретации выходных форм по результатам диагностики. Если говорить более конкретно, то ветеринар понимая этиологию различных заболеваний может видеть глубокую внутреннюю взаимосвязь между ними и иногда может увидеть причину симптоматически более ярко выраженного заболевания в другом заболевании, симптоматика которого выражена менее четко.
Отметим, что первоначально под нозологией понимали раздел патологии, включающий общее учение о болезни (общая нозология), а также изучающий этиологию, патогенез клинические и патологоанатомические проявления отдельных болезней (частная нозология), а также классификацию и номенклатуру болезней В этом понимании нозология не имеет чётких границ с патологией..
В качестве примера рассмотрим результат нозологической диагностики, приведенный на рисунке 21 из работы [1], отображающий сходство клинической картины конкретного пациента («Мурка») с обобщенными нозологическими образами (рисунок 2):
Рисунок 2. Экранная форма с результатами нозологической диагностики пациента «Мурка», (симптоматика из обучающей выборки)
Возникает вопрос, от какого заболевания лечить Мурку, от 1-го в этом списке, или 2 или может быть даже 3-го.
Для ответа на этот вопрос применим кластерный анализ нозологических образов.
Кластерный анализ (англ. Data clustering) - это задача разбиения заданной выборки объектов (ситуаций) на подмножества, называемые кластерами, так, чтобы каждый кластер состоял из схожих объектов, а объекты разных кластеров существенно отличались.
Однако мы не будем применять классические методы кластерного анализа и реализующий их программный инструментарий. Причиной этого является то, что эти методы имеют ряд довольно существенных на взгляд автора недостатков. Эти недостатки подробно проанализированы в работе [4], в ней же предложено и их решение [4, 5]. Поэтому в данной статье мы не будем их подробно рассматривать. Отметим лишь, что многие из этих недостатков, являющихся проблемами классических методов кластерного анализа, преодолены в АСК-анализе и интеллектуальной системе «Эйдос» (таблица 1).
Таблица 1 - ПРОБЛЕМЫ КЛАССИЧЕСКИХ МЕТОДОВ КЛАСТЕРИЗАЦИИ И ИХ РЕШЕНИЕ ПРЕДЛАГАЕМЫЕ В АСК-АНАЛИЗЕ И СИСТЕМЕ «ЭЙДОС»
№ |
Формулировка проблемы кластерного анализа |
Предлагаемое в АСК-анализе и реализованное в системе «Эйдос» решение |
|
1. |
Проблема 1.1 выбора метрики, корректной для неортонормированных пространств. |
Предлагается применить неметрический интегральный критерий, представляющий собой суммарное количество информации в системе признаков о принадлежности объекта к классу («информационное расстояние»), никак не основанный на предположении об ортонормированности пространства и корректно работающий в неортонормированных пространствах |
|
2. |
Проблема 1.2 ортонормирования пространства. |
Поддерживается |
|
3. |
Проблема 2.1 сопоставимой обработки описаний объектов, описанных признаками различной природы, измеряемыми в различных единицах измерения (проблема размерностей). |
Объекты формально описываются в виде векторов, затем рассчитывается матрица абсолютных частот и на ее основе - матрица знаний, с использованием которой все признаки измеряются в одних единицах измерения: единицах измерения количества данных, информации и знаний - битах, байтах, и т.д. |
|
Проблема 2.2 формализации описаний объектов, имеющих как количественные, так и качественные признаки. |
Числовые шкалы преобразуются в интервальные значения, после чего градации всех типов шкал обрабатываются единообразно (см.п.3) |
||
4. |
Проблема 3.1 доказательства гипотезы о нормальности исходных данных. |
Нет необходимости, т.к. предлагаемые частные и интегральные критерии не предполагают нормальности исходных данных |
|
5. |
Проблема 3.2 нормализации исходных данных. |
Реализованы режимы ремонта или взвешивания исходных данных. |
|
6. |
Проблема 3.3 применения непараметрических методов кластеризации, корректно работающих с ненормализованными данными. |
Предлагаемые методы являются непараметрическими и корректно работают с ненормализованными данными |
|
7. |
Проблема 4 разработки такого метода кластерного анализа, математическая модель и алгоритм и которого органично включали бы фильтр, подавляющий шум в исходных данных, в результате чего данный метод кластеризации корректно работал бы при наличии шума в исходных данных. |
Предлагаемый метод включает фильтр подавления шума на уровне формирования матрицы абсолютных частот и самой математической форме интегрального критерия. Кроме того, реализованы режимы удаления или корректной обработки артефактов, выбросов (нетипичных объектов) и малопредставленных данных, по которым нет достаточной статистики в исходных данных |
|
8. |
Проблема 5 разработки метода кластерного анализа, математическая модель и алгоритм и которого обеспечивали бы выявление «выбросов» (артефактов) в исходных данных и позволяли либо вообще не показывать их в дендрограммах, либо показывать, но так, чтобы было наглядно видно, что это артефакты. |
Поддерживается исключение выбросов и артефактов из дендрограмм, либо их отображение специальным для них образом. |
В статье [4] были отмечены и недостатки самого предложенного в ней решения, а также указаны перспективы его развития. Эти недостатки связаны прежде всего с программной реализацией DOS-версии самой системы «Эйдос», которая была текущей на момент написания работы [4]. В текущей версии системы «Эйдос» от 21.04.2018 все эти ограничения DOS-версии преодолены и реализованы многие из указанных в [4] перспектив. В частности реализован режим агломеративной когнитивной кластеризации (режим 4.2.2.3). Вместо описания данного режима приведем его Help (рисунок 3):
Рисунок 3. окно настроек визуализации дендрограмм и Help режима агломеративной когнитивной кластеризации
На рисунках 4 приведены агломеративные дендрограммы нозологических образов, построенные на основе моделей, созданных и исследованных в работе [1].
Рисунок 4. Дендрограммы нозологических образов, построенные на основе моделей, созданных и исследованных в работе [1]
На рисунках 5 приведены графики межкластерных расстояний нозологических образов, построенные на основе моделей, созданных и исследованных в работе [1].
Рисунок 5. Межкластерные расстояния нозологических образов, построенные на основе моделей, созданных и исследованных в работе [1]
Отметим, что в традиционных формах агломеративного кластерного анализа есть частичный аналог дендрограммы в модели ABS, а дендрограммы, аналогичные полученным в моделях PRC1, PRC2 и в системно-когнитивных моделях: INF1, INF2, INF3, INF4, INF5, INF6 и INF7 вообще отсутствуют.
Результаты кластерно-конструктивного анализа классов отображаются также в форме когнитивных диаграмм, пример одной из которых приведен на рисунке 6:
Рисунок 6. Пример когнитивной диаграммы с результатами
кластерно-конструктивного анализа классов
По результатам статьи можно сделать обоснованный вывод о том, что метод «Агломеративной когнитивной кластеризации» является адекватным средством решения поставленной проблемы, т.к. позволяет достоверно оценить сходство-различие нозологических образов в ветеринарии по их симптоматике. Это позволяет ветеринару более обоснованно применять решение о назначении лечения с учетом не только результатов диагностики, но и классификации самих нозологических образов и их этиологии.
В качестве недостатка предлагаемого метода можно указать на более значительные затраты времени и вычислительных ресурсов по сравнению с классическими традиционными методами кластеризации.
Как перспективу развития метода отметим: повышение размерности дендрограмм и разработку режима агломеративной когнитивной кластеризации признаков.
Материалы данной статьи могут быть использованы в учебном процессе при преподавании дисциплин: «Интеллектуальные информационные системы», «представление знаний в информационных системах», «Современные технологии в образовании (магистратура)», «Управление знаниями (магистратура)», «Введение в искусственный интеллект», «Интеллектуальные и нейросетевые технологии в образовании (магистратура)», «Основы искусственного интеллекта» и других.
Планируется продолжить исследования и разработки, представленные в данной статье, по следующим направлениям:
1. Агломеративная когнитивная кластеризация симптомов и синдромов в ветеринарии.
2. Разработка в среде интеллектуальной системы Эйдос-Х++ ветеринарных диагностических тестов и проведение научных исследований на основе эмпирических данных (данных наблюдений и экспериментов).
3. Интеграция в среде интеллектуальной системы Эйдос-Х++ без программирования нескольких диагностических тестов в батарею тестов или в супертест с одной общей моделью.
Этим и другим применениям способствует и то, что система «Эйдос» является мультиязычной интеллектуальной on-line средой для обучения и научных исследований [3, 4] http://lc.kubagro.ru/aidos/Presentation_Aidos-online.pdf и находится в полном открытом бесплатном доступе (причем с подробно комментированными открытыми исходными текстами: http://lc.kubagro.ru/_AIDOS-X.txt) на сайте автора по адресу: http://lc.kubagro.ru/aidos/_Aidos-X.htm.
В заключение автор выражает благодарность проректору по научной работе Кубанского ГАУ им. И.Т. Трубилина доктору биологических наук профессору Андрею Георгиевичу Кощаеву за помощь в публикации статьи.
Список литературы
1. Луценко Е.В. Автоматизированный системно-когнитивный анализ в ветеринарии (на примере разработки диагностических тестов) / Е.В. Луценко // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета (Научный журнал КубГАУ) [Электронный ресурс]. - Краснодар: КубГАУ, 2018. - №03(137). С. 143 - 196. - IDA [article ID]: 1371803031. - Режим доступа: http://ej.kubagro.ru/2018/03/pdf/31.pdf, 3,375 у.п.л.
2. Луценко Е.В. Открытая масштабируемая интерактивная интеллектуальная on-line среда для обучения и научных исследований на базе АСК-анализа и системы «Эйдос» / Е.В. Луценко // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета (Научный журнал КубГАУ) [Электронный ресурс]. - Краснодар: КубГАУ, 2017. - №06(130). С. 1 - 55. - IDA [article ID]: 1301706001. - Режим доступа: http://ej.kubagro.ru/2017/06/pdf/01.pdf, 3,438 у.п.л.
3. Луценко Е.В., Открытая масштабируемая интерактивная интеллектуальная on-line среда «Эйдос» («Эйдос-online»). Свид. РосПатента РФ на программу для ЭВМ, Заявка № 2017618053 от 07.08.2017, Гос.рег.№ 2017661153, зарегистр. 04.10.2017. - Режим доступа: http://lc.kubagro.ru/aidos/2017661153.jpg, 2 у.п.л.
4. Луценко Е.В. Метод когнитивной кластеризации или кластеризация на основе знаний (кластеризация в системно-когнитивном анализе и интеллектуальной системе «Эйдос») / Е.В. Луценко, В.Е. Коржаков // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета (Научный журнал КубГАУ) [Электронный ресурс]. - Краснодар: КубГАУ, 2011. - №07(071). С. 528 - 576. - Шифр Информрегистра: 0421100012\0253, IDA [article ID]: 0711107040. - Режим доступа: http://ej.kubagro.ru/2011/07/pdf/40.pdf, 3,062 у.п.л.
5. Луценко Е.В., Подсистема агломеративной когнитивной кластеризации классов системы «Эйдос» ("Эйдос-кластер"). Пат. № 2012610135 РФ. Заяв. № 2011617962 РФ 26.10.2011. Опубл. От 10.01.2012. - Режим доступа: http://lc.kubagro.ru/aidos/2012610135.jpg, 3,125 у.п.л.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Ветеринария как наука о болезнях животных, диагностике, лечении и профилактике. Предмет изучения общей и частной ветеринарии. Виды болезней, методы их диагностики. Основные показатели у лошади в состоянии покоя. Пути введения лекарственных веществ.
презентация [2,3 M], добавлен 11.05.2015Основы клинической диагностики, классификация и номенклатура болезней животных, нозологические единицы и формы. Симптомы болезни: их классификация, распознавание и оценка диагностической значимости. Синдромы болезней животных и их характеристика.
реферат [28,2 K], добавлен 22.12.2011Личная гигиена и техника безопасности при работе с животными. Методы введения лекарственных веществ. Магнитные зонды и техника их постановки. Осложнения при введении зондов и способы их устранения. Терапия раздражающими и отвлекающими средствами.
курсовая работа [109,7 K], добавлен 22.05.2012Понятие о хонропротекторах и действующие вещества, особенности химического состава и функциональные особенности. Хондропротекторы, применяемые в ветеринарии лошадей и собак, их отличительные особенности, условия и возможности практического применения.
реферат [432,3 K], добавлен 15.04.2015Физические основы работы лазера. Действие лазерного излучения на органы и ткани. Принципы и методы лазеротерапии ран, костных патологий, суставов, кожных болезней, опухолей, офтальмологии и ортопедии. Перспективы использования лазеров в ветеринарии.
курсовая работа [70,9 K], добавлен 25.04.2013Предмет и основные задачи изучения истории ветеринарии. Меры предупреждения массовых болезней животных. Аптечное дело и популяризация знаний по ветеринарии. Развитие коннозаводства. Эпизоотическая обстановка и меры борьбы с заразными заболеваниями.
курс лекций [235,5 K], добавлен 22.11.2014Классификация иммунотропных лекарственных препаратов. Состав и биологическая активность иммуномодуляторов. Особенности применения ИМД в ветеринарии при вирусных и бактериальных инфекциях, паразитарных инвазиях (гельминтозы, протозоозы, арахноэнтомозы).
контрольная работа [42,0 K], добавлен 31.05.2014Составление акта судебно-ветеринарного вскрытия трупа поросенка. Проведение наружного и внутреннего осмотра трупа, постановка диагноза. Выяснение обстоятельств, от чего пало животное, можно ли было его спасти. Методы профилактики выявленного заболевания.
курсовая работа [4,4 M], добавлен 19.08.2010История открытия энергоканалов. Морфологические и физиологические аспекты иглотерапии в ветеринарии. Расположение акупунктурных точек. Доказательства наличия меридиан в акупунктуре. Определение меридиан различных внутренних органов в лечении животных.
реферат [1,9 M], добавлен 08.05.2012История развития ветеринарии Курского края, в частности лабораторного дела. Создание и развитие ветеринарно-бактериологической лаборатории, основанной Н.Д. Диковским, которая дала мощный импульс развитию современной биологической промышленности в крае.
реферат [33,6 K], добавлен 10.12.2009Состояние животного в момент исследования. Исследование кожных покровов, опорно-двигательного аппарата, сердечнососудистой, пищеварительной, дыхательной, мочеполовой, нервной системы. Принципы постановки диагноза, течение болезни и схема его лечения.
курсовая работа [33,2 K], добавлен 26.06.2014Изучение основных задач и структуры КГБУ "Новосёловского отдела ветеринарии". Эпизоотическое состояние района. Планы ветеринарных мероприятий по предупреждению и ликвидации болезней животных. Анализ порядка выдачи ветеринарных справок и свидетельств.
курсовая работа [43,1 K], добавлен 11.02.2013Порядок вправления выпавшей матки у суки. Демодекоз как широко распространенное хроническое сезонное заболевание, механизм постановки диагноза, профилактики и лечения. Ответственность за материальное обеспечение проведения мероприятий по дезинфекции.
отчет по практике [28,0 K], добавлен 05.01.2011Понятие и характерные признаки везикулярной болезни свиней, ее эпизоотология и патогенез, причины появления и клиническая картина. Методика постановки диагноза и возможность излечения. Специфическая профилактика хозяйств и меры борьбы с заболеванием.
реферат [12,6 K], добавлен 26.09.2009Понятие, признаки и лечение транспортной болезни, возникающей при перевозках животных на дальние расстояния. Ознакомление с основными документами на судебно-ветеринарную экспертизу. Рассмотрение особенностей профилактики транспортной болезни у коров.
курсовая работа [30,8 K], добавлен 19.05.2015Клинические проявления коронавирусной инфекции у телят, ее патогенез и степень опасности для жизни животного. Постановка диагноза и возможность лечения заболевания, специфическая профилактика хозяйств. Меры борьбы с инфекцией и опасность ее для человека.
реферат [13,0 K], добавлен 26.09.2009Понятие и основное содержание протокола патологоанатомического вскрытия, порядок его составления, типы осмотра: наружный, внутренний. Клинико-анатомический анализ диагностического случая заболевания. Порядок и принципы постановки окончательного диагноза.
отчет по практике [28,2 K], добавлен 13.04.2014Этиология и патогенез флегмоны затылка, возбудители и разновидности заболевания. Клиническая картина протекания заболевания у лошадей, особенности постановки диагноза и прогноза выздоровления. Схема лечения в начальной стадии и послеоперационный период.
курсовая работа [20,4 K], добавлен 04.02.2011Протокол вскрытия: анамнестические и клинические данные, патологоанатомический диагноз, лабораторные исследования и порядок составления заключения. Сальмонеллезы: общее описание, этиология и патогенез, порядок постановки дифференциального диагноза.
контрольная работа [30,3 K], добавлен 21.10.2013Актуальность проблемы гельминтозов в ветеринарии, их негативное воздействие на организм животного и выраженный полиморфизм клинических проявлений. Морфология и биология возбудителя. Клинический и лабораторный диагноз. Методы лечения и профилактики.
курсовая работа [6,4 M], добавлен 12.03.2015