Теоретические и практические аспекты генетического мониторинга в коневодстве

6. Изучение молекулярно-генетических особенностей лошадей четырех рысистых пород выявило существенные генетические различия между орловскими и стандартбредными рысаками по наличию и частотам встречаемости аллелей структурных и микросателлитных локусов AНT4, AНT5, ASB17, ASB23, CA425, HMS1, HMS2, HTG4, HTG6, HTG10. Сравнительно высокая степень генетического сходства по локусам полиморфных систем крови и микросателлитов ДНК была отмечена между русскими, стандартбредными и французскими рысаками, имеющими общность происхождения.

7. Выявленные различия заводских субпопуляций лошадей изученных пород по частотам встречаемости отдельных генотипов, аллелей, уровню полиморфности и степени гетерозиготности маркерных генов являются составной частью генетического внутрипородного разнообразия, которое обеспечивает их дальнейшее совершенствование.

8. Мониторинг аллелофонда шести заводских пород лошадей на протяжении 1980-2005 годов выявил тенденцию снижения генетического разнообразия в тракененской, орловской и русской рысистых породах, обусловленную сокращением генотипического разнообразия жеребцов-производителей на фоне уменьшения общей численности племенного поголовья. В большинстве обследованных заводских субпопуляций лошадей наблюдался волнообразный процесс изменения уровня полиморфности, а также тренд аллелей TfF, EsI, Ddk и Dcgm.

9. Сравнительный анализ генетической вариабельности и ее динамики в группах жеребцов-производителей и маток заводских пород показал, что степень генетического разнообразия заводских кобыл обычно выше и более стабильно сохраняется при смене поколений. Поэтому массив племенных кобыл в значительной степени определяет особенности и генетическую структуру каждой породы.

10. Изучение аллелофонда лошадей чистокровной верховой породы, имеющей длительную историю чистопородного разведения, показало, что отечественная популяция также характеризуется высокой степенью генетической консолидации и имеет типичную для данной породы генетическую структуру, уровень полиморфности и степень гетерозиготности. Не было выявлено существенных различий в генетической структуре племенного ядра и массива породы. Жеребцы отечественного происхождения не отличались от импортированных производителей спектром аллелей изученных локусов и при этом имели более высокий уровень гетерозиготности.

11. Жеребцы-производители разных линий различались между собой по наличию и частотам встречаемости аллелей микросателлитных локусов и индексу дифференциации (ID=0,181-0,494). Дендрограмма линий, построенная на основе генетических дистанций по микросателлитам ДНК, в целом соответствовала генеалогической схеме развития линий этой породы.

12. Индекс генетической дифференциации маточных семейств чистокровной верховой породы варьировал в том же интервале (ID = 0,196-0,469), что и у жеребцов разных линий. Матки разных семейств достоверно различались по наличию и частотам встречаемости аллелей полиморфных систем крови и микросателлитных локусов.

13. Анализ генотипов 1945 чистокровных верховых лошадей по 13 локусам микросателлитов ДНК выявил высокую вариабельность степени гомозиготности как аутбредных, так и инбредных животных (0-69,2%) при нормальном типе распределения этого показателя с модальным классом 30,8%. Повышение степени гомозиготности лошадей было отмечено только при уровне инбридинга 3,1% и выше. Самые высокие показатели воспроизводства имели матки с максимальной гетерозиготностью (100%). Снижение степени гетерозиготности кобыл ниже уровня 38% сопровождалось резким ухудшением репродуктивных качеств.

14. Оценка генотипического сходства пробандов с выдающимся предком, основанная на анализе наследования маркерных генов в поколениях родословной, показывает, что теоретические и фактические показатели генетического сходства животных могут существенно различаться. Генетическое сходство геномов полных сибсов по микросателлитным локусам колеблется в интервале 42-69%. Генотипирование лошадей по полиморфным локусам позволяет методом семейного анализа прослеживать передачу маркерных генов из поколения в поколение и оценивать фактическое генетическое сходство пробанда со своими предками.

15. Анализ скаковой работоспособности лошадей, унаследовавших разные отцовские аллели микросателлитной ДНК, показал, что локус HMS2 может быть связан с генами, оказывающими влияние на дистанционные способности лошадей чистокровной верховой породы.

Предложения производству

1. С целью широкого внедрения в коневодство методов генетико-популяционного анализа и контроля генетической ситуации в породах и субпопуляциях лошадей использовать разработанные рекомендации по генотипированию, паспортизации и мониторингу аллелофонда пород с использованием иммуногенетических и молекулярно-генетических маркеров.

2. Для более полной реализации генетического потенциала породы необходимо поддерживать существующую генеалогическую и генетическую структуру мужских линий и женских семейств. С этой целью целесообразно использовать базу данных генетических маркеров лошадей, полученных при проведении контроля происхождения.

3. Для оценки генетической дифференциации линий, популяций и пород использовать генетико-популяционные параметры уровня полиморфности (Ae), степени гетерозиготности (Ho), индекса фиксации (Fst), а также разработанного индекса дифференциации (ID), характеризующего генетические различия данной группы животных от средних показателей всей изученной популяции.

4. В практику племенной работы необходимо внедрять маркерную систему оценки родословных, включающую определение степени гетерозиготности, контроль передачи геномной информации из поколения в поколение и определение фактического генотипического сходства пробанда с выдающимися предками.

СПИСОК ОСНОВНЫХ РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

Рекомендации

1. Храброва, Л.А. Рекомендации по взятию и транспортировке проб крови для генетической экспертизы происхождения лошадей /Л.А. Храброва, А.М. Зайцев. - Дивово, 2004. - 15 с.

2. Храброва, Л.А. Методические рекомендации по ведению генетического мониторинга местных пород лошадей /Л.А. Храброва, А.М. Зайцев, И.Б. Юрьева и др. - Дивово, 2005. - 50 с.

3. Храброва, Л.А. Методические рекомендации по производству и использованию сывороток-реагентов для типирования групп крови лошадей /Л.А. Храброва и др. - Дивово, 2005.- 42с.

4. Храброва, Л.А. Методы генетической сертификации лошадей по полиморфным системам крови / Л.А. Храброва и др. - Дивово, 2010. - 70с.

5. Храброва, Л.А. Метод оценки генетического разнообразия и степени генотипического сходства лошадей заводских и местных пород /Л.А. Храброва и др. - Дивово, 2011. - 25с.

6. Храброва Л.А. Методические положения по использованию ДНК-анализа лошадей для оценки генетических ресурсов в коневодстве /Л.А. Храброва и др. - Дивово, 2011. - 28с.

В рецензируемых журналах, рекомендуемых ВАК

7. Калашников, В.В. Влияние американского рысака на формирование генетической структуры, резвость и плодовитость лошадей русской рысистой породы / В.В. Калашников, Л.А. Храброва, Р.И. Николаева // Доклады РАСХН. - 2004. - №3. - С.32-34.

8. Храброва, Л.А. Определение филогенетических связей между породами лошадей с помощью сравнительной генетической характеристики / Л.А. Храброва, В.В. Калашников, А.М. Зайцев // Доклады РАСХН. - 2005. - №4. - С.31-34.

9. Храброва Л.А. Использование ДНК-анализа при контроле происхождения лошадей / Л. А. Храброва и др. // Коневодство и кон. спорт. - 2006. - №3. - С.32-33.

10. Храброва, Л.А. Генетические аномалии и болезни лошадей / Л.А. Храброва // Коневодство и кон. спорт. - 2006. - № 6. - С.19-21.

11. Храброва, Л.А. Генетическая дифференциация чистокровных пород лошадей по локусам микросателлитов ДНК / Л.А. Храброва. Л.В. Калинкова, М.А. Зайцева // С.-х. биология. - 2008. - №2. - С.31-34.

12. Храброва, Л.А. Генетическая оценка популяционного разнообразия в чистокровной верховой породе лошадей / Л.А. Храброва, М.М Кузнецова // Коневодство и кон. спорт. - 2008. - №2. - С.13-15.

13. Храброва, Л.А. Мониторинг генетической структуры пород в коневодстве / Л.А. Храброва // Доклады РАСХН. - 2008. - №3. - С.42-44.

14. Храброва, Л.А. Особенности аллелофонда местных пород лошадей /Л.А. Храброва, А.М. Зайцев // Коневодство и кон. спорт. - 2008. - №3. - С.9-10.

15. Зайцева, М.А. Внутрипородная дифференциация по 17 локусам микросателлитной ДНК лошадей разных линий чистокровной арабской породы / M.А Зайцева, Л.А. Храброва, Л.В. Калинкова // Коневодство и кон. спорт. - 2010. - № 1.- С.19-21.

16. Храброва, Л.А. Использование генетических исследований в коневодстве / Л.А. Храброва // Коневодство и кон. спорт. - 2010. - № 2. - С.11-13.

17. Храброва, Л.А. Происхождение и генетические особенности хакасской лошади / Л.А. Храброва и др. // Коневодство и кон. спорт. - 2010. - № 2.- С.30-32.

18. Зайцева, М.А Генетическая дифференциация маточных семейств арабской породы по локусам микросателлитной ДНК / M.А Зайцева, Л.А. Храброва, Л.В. Калинкова // Коневодство и кон. спорт.- 2010. - № 4. - С.13-15.

19. Храброва, Л.А. Оценка гомозиготности лошадей с разным уровнем инбридинга по локусам микросателлитной ДНК / Л.А. Храброва // Зоотехния. - 2010. - № 9. - С.2-3.

20. Храброва, Л.А. Влияние инбридинга на степень гомозиготности чистокровных верховых лошадей по локусам микросателлитов ДНК / Л.А. Храброва // Коневодство и кон. спорт. - 2010. - № 5.- С.7-8.

21. Храброва, Л.А. ДНК-технологии в селекции лошадей арабской породы / Л.А. Храброва и др. // Коневодство и кон. спорт. - 2010. - № 6. - С.7-8.

22. Калашников, В.В. Изучение полиморфизма сателлитной ДНК лошадей заводских и местных пород // В.В. Калашников, Л.А. Храброва. А.М. Зайцев и др./ Доклады РАСХН. - 2010. - № 6. - С. 48-50.

23. Храброва, Л.А. Оценка аллелофонда заводских и местных пород лошадей по полиморфным системам крови / Л.А. Храброва и др. // Коневодство и кон. спорт. - 2011. - № 1. - С.7-8.

24. Калашников, В.В. Полиморфизм микросателлитной ДНК у лошадей заводских и локальных пород // В.В. Калашников, Л.А. Храброва. А.М. Зайцев и др./ С.-х. биология, - 2011. - № 2 .- С.11-14.

25. Храброва, Л.А. Влияние степени гомозиготности микросателлитных локусов на плодовитость и работоспособность кобыл чистокровной верховой породы / Л.А. Храброва, Н.В. Блохина // Коневодство и кон. спорт. - 2011. - № 4. - С.8-9.

В сборниках научных трудов и материалах конференций

26. Храброва, Л.А. Работоспособность лошадей рысистых пород с разными типами белков и ферментов крови / Л.А. Храброва // Совершенствование селекции пород лошадей: сб. науч. тр. / ВНИИ коневодства. - М., 1983. - С.109-112.

27. Храброва, Л.А. Работоспособность и плодовитость лошадей различной гетерозиготности по полиморфным системам крови / Л.А. Храброва // Пути повышения эффективности коневодства и коннозаводства: тез. докл. - ВНИИ коневодства, 1984. - С.18-20.

28. Храброва, Л.А. Влияние инбридинга на степень гомозиготности полиморфных локусов у лошадей рысистых пород / Л.А. Храброва // Научно-технический прогресс и резервы повышения эффективности коневодства: тез. докл. - ВНИИК, 1987. - С.34-36.

29. Храброва, Л.А. Влияние селекции на генетическую структуру арабской породы /Л.А. Храброва, Н.В. Каплун // Перспективы коневодства России в XXI веке: тез докл. науч. - произв. конф., посвящ. 70-л. ин-та / ВНИИ коневодства. - Дивово, 2000. - Ч.2. - С.65-67.

30. Храброва, Л.А. Генетические маркеры в селекционной практике / Л.А. Храброва // Актуальные вопросы развития коневодства в России и странах СНГ: материалы науч. - произв. конф. - СПб., 2000. - С.33-37.

31. Храброва, Л.А. Использование иммуногенетических и ДНК-маркеров при контроле происхождения лошадей / Л.А. Храброва, А.М. Зайцев // Проблемы и перспективы коневодства России на рубеже веков: тез. докл. науч. - произв. конф. / ВНИИ коневодства. - М., 2000. - С. 33-37.

32. Храброва, Л.А. Использование молекулярно-генетических маркеров в коневодстве / Л.А. Храброва // Перспективы коневодства в России в ХХI веке: тез. докл. науч. - произв. конф., посвящ. 70-л. ин-та / ВНИИ коневодства. - Дивово, 2000. - Ч.1. - С.42-44.

33. Храброва, Л.А. Оценка гетерогенности американского рысака по полиморфным системам крови /Л.А. Храброва, Г.А. Филиппова // Перспективы коневодства в России в ХХI веке: тез. докл. науч.-произв. конф., посвящ. 70-л. ин-та / ВНИИ коневодства. - Дивово, 2000. - Ч.2. - С.67-70.

34. Храброва, Л.А. Современное состояние аллелофонда чистокровной верховой породы / Л.А. Храброва, А.Д. Карелина // Там же. - С.63-65.

35. Храброва, Л.А. Гемолитическая болезнь новорожденных жеребят: диагностика и профилактика / Л.А. Храброва, Н.М. Мелентьева // Материалы 2-й науч. конф. по болезням лошадей. - М., 2001. - С.98-99.

36. Храброва, Л.А. Генетические аспекты селекции лошадей / Л.А. Храброва // Материалы науч. сессии Россельхозакадемии «Стратегия развития жив-ва России - ХХI век» (сек. коневодства). - Дивово, 2001. - С.63-66.

37. Храброва, Л.А. Использование генетических маркеров в селекции пород лошадей / Л.А. Храброва // Стратегия развития жив-ва России - ХХI век.- М., 2001. - Ч. 1. - С.412-421.

38. Храброва. Л.А. Влияние селекции на динамику генетической структуры американской стандартбредной породы лошадей /Л.А. Храброва, И.С. Гавриличева // Науч. основы сохранения и совершенствования пород лошадей: сб. науч. трудов / ВНИИ коневодства. - Дивово, 2002. - С.177-184.

32. Храброва, Л.А. Генетическая детерминация гемолитической болезни жеребят / Л.А. Храброва, Н.М. Мелентьева // Там же. - С.74-80.

39. Масасина, Е.В. Генетическая структура орловской рысистой породы по полиморфным белкам и D-системе групп крови / Е.В. Масасина, Г.В. Калинкина, Л.А. Храброва // Там же. - С.92-103.

40. Николаева, Н.В. Генетическая характеристика заводских популяций русского рысака по полиморфным системам крови / Н.В. Николаева, В.В. Калашников, Л.А. Храброва // Там же. - С.169-176.

41. Гавриличева, И.С. Генетическая характеристика маточных семейств американского рысака по полиморфным системам крови / И.С. Гавриличева. Л.А. Храброва // Междунар. науч. конф. «Современные достижения и проблемы технологии с.-х. жив-х»: материалы. - Дубровицы, 2002. - 173-174.

42. Храброва, Л.А. Использование генетических маркеров в коневодства: итоги и перспективы / Л.А. Храброва // Научн. основы сохранения и совершенствования пород лошадей: сб. науч. трудов / ВНИИ коневодства. - Дивово, 2002. - С.73-74.

43. Храброва, Л.А. Использование генетического маркирования для характеристики аллелофондов трех отечественных пород лошадей / Л.А. Храброва, А.М. Зайцев // Там же. - С.81-92

44. Мелентьева, Н.М. Технологические аспекты микрометода определения групп крови лошадей / Н.М. Мелентьева. Л.А. Храброва // Итоги исследований по коневодству в первом году ХХI века: тез. докл. / ВНИИ коневодства. - Дивово, 2002.- С.38-40.

45. Khrabrova, L.A. The genetic structure of Vyatka horse populations / L.A. Khrabrova, A.M. Zaitcev // Proc. XXVIII Inter. Conf. on Animal Genetics. - Gottingen (Germany), 2002.- P.109.

46. Удина, И.Г. Анализ генетического разнообразия отечественных пород лошадей с помощью молекулярно-генетических методов / И.Г. Удина, М.В. Костюченко, Л.А. Храброва и др. // Современные достижения и проблемы биотехнологии с.-х. жив-х: материалы Междунар. конф. - Дубровицы, 2003. - С.70-73.

47. Храброва, Л.А. Маркер - вспомогательная селекция в коневодстве / Л.А. Храброва // Проблемы и научное обеспечение отрасли коневодства Европ. Севера РФ: материалы Междунар. науч. - практ. конф. - Архангельск-Мезень, 2003. - С.67-76.

48. Мелентьева, Н.М. Усовершенствование методики получения сывороток-реагентов для открытых систем групп крови лошадей /Н.М. Мелентьева, Л.А. Храброва // Проблемы сохранения генофонда, повышения племенных и продуктивных качеств заводских и местных пород лошадей: тез. докл. - Дивово, 2003. - С.41-44.

49. Гавриличева, И.С. Влияние степени инбридинга на уровень гомозиготности лошадей американской стандартбредной породы / И.С. Гавриличева, Л.А. Храброва // Искусственное осеменение лошадей - истоки биотехнологии в животноводстве: тез. докл./ ВНИИ коневодства. - Дивово, 2004. - С.145-148.

50. Храброва, Л.А. Генетические особенности локальных пород лошадей России / Л.А. Храброва, А.М. Зайцев // Прошлое, настоящее и будущее зоотехнической науки: материалы Междунар. науч.-практ. конф. к 75-л. Ин-та / ВИЖ. - Дубровицы, 2004. - Вып. 62, т.1. - С.181-184.

51. Храброва, Л.А. Итоги 28-й конференции ISAG: курс на типирование ДНК / Л.А. Храброва, Н.В. Киселева // Искусственное осеменение лошадей - истоки биотехнологии в жив-ве: тез. докл. / ВНИИ коневодства. - Дивово, 2004. - С.148-151.

52. Храброва, Л.А. Основные направления маркер-вспомогательной селекции в коневодстве / Л.А. Храброва // Материалы науч.-практ. семинара «Генетические маркеры в селекции жив-х». - Быково, 2005. - Вып. 11. - С.120-121.

53. Храброва, Л.А. Прогресс генетических исследований в коневодстве / Л.А. Храброва // Сб. науч. трудов национал. аграр. ун-та. - Киев, 2005. - Вып. 85. - С. 187-191.

54. Храброва, Л.А. Стратегия маркер-вспомогательной селекции в коневодстве / Л.А. Храброва // Наука о коневодстве на рубеже веков: сб. науч. тр. / ВНИИ коневодства. - Дивово, 2005. - С.133-140.

55. Храброва, Л.А. Успехи и перспективы использования достижений генетики в коневодстве / Л.А. Храброва и др. // Там же. - С.126-133.

56. Храброва, Л.А. Генетические аспекты сохранения вятской породы лошадей / Л.А. Храброва, И.С. Гавриличева, А.М. Зайцев // Новое в науке о коневодстве: сб. науч. тр. / ВНИИК, Дивово, 2006. - С.73-76.

57. Храброва, Л.А. Генетический полиморфизм лошадей чистокровной верховой породы по микросателлитам ДНК / Л.А. Храброва, А.М. Зайцева // Там же. - С.71-73.

58. Храброва Л.А. Особенности генетической структуры башкирской лошади по белкам и ферментам крови // Л.А. Храброва, Л.П. Готлиб, О.И. Коршунова // Там же. - С.76-78.

59. Храброва, Л.А. Теоретические и практические аспекты генетического мониторинга в коневодстве / Л.А. Храброва // Актуальные проблемы развития жив-ва на современ. этапе: межвуз. науч. тр. - СПб., 2006. - С.15-21.

60. Храброва, Л.А. Характеристика популяций лошадей чистокровной верховой породы по микросателлитам ДНК / Л.А. Храброва, М.А. Зайцева // Там же. - С.46-50.

61. Храброва, Л.А. Эффективность контроля происхождения лошадей чистокровной верховой породы по ДНК-маркерам / Л.А. Храброва, Л.В. Калинкова, А.М. Зайцева // Современные достижения и проблемы биотехнологии с.-х. жив-х: материалы 6-й Междунар. науч. конф. - Дубровицы, 2006. - С.198-200.

62 Храброва, Л.А. Контроль происхождения лошадей по микросателлитам ДНК / Л.А. Храброва и др. // Научное обеспечение конкурентноспособности племенного, спортивного и продуктивного коневодства в России и странах СНГ: сб. науч. тр. / ВНИИ коневодства. - Дивово, 2007. - Ч.1. - С.98-102.

63. Храброва, Л.А. Влияние селекции на генетическую структуру пород лошадей / Л.А. Храброва // Научное обеспечение конкурентоспособности племенного, спортивного и продуктивного коневодства в России и странах СНГ: сб. науч. тр. / ВНИИ коневодства. - Дивово, 2007. - Ч.2. - С.7-12.

64. Храброва, Л.А. Полиморфизм микросателлитных локусов у лошадей чистокровной верховой и арабской пород / Л.А. Храброва. Л.В. Калинкова, М.А. Зайцева // Там же. - С.12-18.

65. Храброва, Л.А. Генетические профили и особенности аллелофонда местных пород лошадей / Л.А. Храброва и др. // Генетические основы и технология повышения конкурентноспособности продукции животноводства: материалы Междунар. науч.-практ. конф. - Алматы, 2008. - Т. 1. - С.15-21.

66. Khrabrova, L.A. Polymorphism of 17 microsatellite loci in Akhal-Teke, Arabian and thoroughbred horses in Russia // L. A. Khrabrova et al. // Proc. XXXI Inter. Conf. ISAG. - Amsterdam, 2008.- P.2043.

67. Kalinkova, L.V. Genetics characterization of Orlov trotter / L.V. Kalinkova, L.A. Khrabrova et al. // Proc. XXXI Inter/ Conf. ISAG. - Amsterdam, 2008. - P.2072.

68. Khrabrova, L.A. Monitoring of the Genetic Structure of Breeds in Horse Breeding / L.A. Khrabrova // Russian Agricultural Science, 2008. - Vol. 34, N 4. - P.261-263.

69. Храброва, Л.А. Генетическая паспортизация местных пород лошадей России / Л.А. Храброва и др. // Материалы Междунар. науч.-техн. конф. «Зоотехнич. и ветер. аспекты развития жив-ва в соврем. условиях аграрного производства». - Мичуринск, 2009. - С.89-93.

70. Храброва, Л.А. Генетическая дифференциация линейной структуры чистокровной верховой породы лошадей по микросателлитам ДНК / Л.А. Храброва и др.// Материалы Междунар. науч. конф. «Достижения в генетике, селекции и воспроизводстве с.-х. жив-х». - СПб. - Пушкин, 2009. -Ч.2. - С.111-114.

71. Храброва, Л.А. Влияние генотипов жеребцов на скаковую работоспособность приплода / Л.А. Храброва, М.М. Кузнецова // Материалы науч.-практ. конф. «Стратегия развития зоотехн. науки». - Жодино, 2009. - С.165-167.

72. Храброва, Л.А. Молекулярно-генетическая характеристика местных пород лошадей России / Л.А. Храброва и др. // Материалы Междунар. науч.-практ. конф. «Актуальные проблемы животноводства». - М.: 2009. - С.92-95.

73. Храброва, Л.А. Использование микросателлитной ДНК для оценки гетерозиготности лошадей с разным уровнем инбридинга // Тез. докл. Междунар. науч.-практ. конф. «Инновационные технологии в жив-ве». - Жодино, 2010. - Ч. 1. - С.173-175.

74. Храброва, Л.А. Использование метода ПЦР для дифференциальной диагностики пироплазмозов лошадей / Л.А. Храброва и др. // Междунар. конф. «Молекулярная диагностика - 2010».: тез. докл. - М., 2010. - Т. 2. - С. 112-114.

Размещено на Allbest.ru