Идентификация фенотипов винограда по спектрам изоферментов
Особенности выбора генетических маркеров для углубления биологических знаний и повышения эффективности селекционных программ. Выделение морфологических признаков, которые могут служить надежными генетическими маркерами при селекции на примере винограда.
Рубрика | Сельское, лесное хозяйство и землепользование |
Вид | статья |
Язык | русский |
Дата добавления | 25.11.2018 |
Размер файла | 1006,4 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
Идентификация фенотипов винограда по спектрам изоферментов
В.И. Рисованная,
Институт винограда и вина "Магарач"
Л.П. Трошин,
Кубанский государственный аграрный университет
Т.А. Ракицкая, О.Е. Лазебный, А.В. Шурхал,
Институт общей генетики им.Н.И. Вавилова РАН
Введение
Для углубления биологических знаний и повышения эффективности селекционных программ принципиальное значение имеет выбор генетических маркеров. У сельскохозяйственных растений, в том числе и винограда, чрезвычайно сложно выделить морфологические признаки, которые могут служить надежными генетическими маркерами при селекции. Кроме того, почти все они представлены только двумя аллельными состояниями, то есть в принципе обычные морфологические генетические маркеры имеют ограниченную информативность [15].
Перспективы использования генетических маркеров в селекции значительно расширились с открытием полиморфизма белков
При этом электрофоретические варианты белков строго детерминированы генетически и имеют кодоминантный характер наследования. Работы в этом направлении привели к конкретным результатам, имеющим большое научное и практическое значение. Оказалось возможным определять по белкам-маркерам принадлежность растения к виду, сорту, биотипу, устанавливать степень родства или генетической совместимости культурных растений с их дикими сородичами, выявлять генетическую гетерогенность в морфологически однородных популяциях и т.д. Белки, в том числе и изоферменты, как маркеры генов все чаще используются в разработке проблем частной генетики и селекции растений.
Современные методы разделения и идентификации белковых молекул (электрофорез, изоэлектрофокусирование, иммуноэлектрофорез и т.д.) позволили получить достоверную информацию о разнообразии макромолекул, и следовательно, о различии генотипов, что особенно актуально для решения вопросов их идентификации.
Узким местом селекционного процесса является отсутствие простых признаков, которые могли бы характеризовать потенциальные возможности генотипа и служить критерием для более целенаправленного подбора родительских пар при гибридизации и отбора трансгрессивных рекомбинантов. И поэтому для практиков очень важно иметь в распоряжении генетические маркеры, позволяющие выявлять новые комбинации генов. Такими маркерами могут служить ассоциации аллельных вариантов белков либо аллельные варианты отдельных белков. Поиск и идентификация с помощью молекулярно-генетических маркеров таких ассоциаций, сопряженных с изменчивостью полезных признаков, - одно из главных направлений генетики винограда. Оно перспективно для оценки сомаклональных вариантов, генетико-биохимической паспортизации сортов, изучения вопросов филогении, таксономии, систематики и других вопросов генетики винограда. Кроме того, необходимость изучения генетических характеристик форм винограда по молекулярным маркерам основана на большом количестве сортов, таксономическая номенклатура которых до сих пор не упорядочена, на наличии огромного количества сортов-синонимов, отсутствии унифицированного описания сортов и видов винограда, а также единых данных относительно их происхождения.
В целом изучение изменчивости и таксономии винограда основывается на результатах морфологических и в последнее время - кариологических исследований [20, 21, 22]. В настоящее время получение характеристик и сортов связано с анализом их по комплексу количественных и качественных морфологических признаков, принятых Международной организацией винограда и вина (окраска цветка и ягоды, форма и тип опушения листовой пластинки, длина побега и др.). Однако полигенное наследование большей части этих признаков затрудняет интерпретацию полученных результатов. По мнению большинства исследователей, проблема идентификации видов и сортов винограда останется неразрешенной до тех пор, пока не будут применены молекулярно-генетические критерии [1, 3, 4, 9].
Для решения этой проблемы представляется перспективным применение метода электрофоретического разделения макромолекул [6, 11, 12, 13, 15]. Его неоспоримыми достоинствами являются стабильность, возможность однозначной интерпретации полученных результатов и генетическая детерминация используемых маркеров. Использование белков (в том числе изоферментов) в качестве генетических маркеров удобно также в силу следующих обстоятельств:
изоферменты можно определять в малом объёме образца и при этом анализировать много проб одновременно;
с помощью электрофоретического анализа изоферментов удается выявить мутации на молекулярном уровне, что может оказаться актуальным при клоновой селекции винограда.
Все эти преимущества электрофореза могут привести к повышению эффективности и разрешающей способности классических методов ампелографии [18].
Сущность метода электрофореза белков в том, что находящиеся в буферном растворе макромолекулы (смесь белков, полученная в результате экстракции из любой растительной или животной ткани) обладают некоторым суммарным электрическим зарядом, величина и знак которого зависят от рН среды, а его основной источник - аминокислоты. Под действием электрического поля макромолекулы в соответствии со своим суммарным зарядом мигрируют в направлении катода или анода. Такое явление носит название электрофореза. В зависимости от величины заряда и размеров макромолекулы приобретают разные скорости. Постепенно исходный препарат, состоящий из макромолекул, разделяется на зоны молекул, мигрирующих с одной скоростью. После разделения белков их фиксируют, специфически окрашивают и получают спектр полос, несущих информацию о компонентном составе исследуемых белков. Возникновение множественности ферментов может быть обусловлено как множественностью генных локусов, так и аллелей. В первом случае электрофоретические варианты - это изозимы (изоферменты), во втором - аллозимы (аллоферменты) [9, 23].
Полученные множественные молекулярные формы белков используются для дальнейших изучений.
Исследования по биохимической генетике винограда и генетической изменчивости его разных таксономических форм винограда по спектрам изоферментов впервые в бывшем СССР были начаты на материале ампелографической коллекции ИВиВ "Магарач" и на базе Института общей генетики (1985, табл.1).
фенотип виноград генетический маркер
Таблица 1
Виды, межвидовые гибриды, сорта, клоны |
Число форм |
|
Род Ampelopsis Michx. Parthenosisus Planch. Vitis L., подрод Euvitis Planch.: Виды подвид V. v. sativa D. C. (сорта) эк. - геогр. группа V. v. s. convar. occidentalis Negr. V. v. s. convar. orientalis Negr. V. v. s. convar. orientali-mediterranea Gram. V. v. s. convar. pontica Negr. Клоны сортов: Рислинг, Алиготе, Мускат белый, Бастардо магарачский, Серсиаль, Ркацители, Кокур белый, Карабурну |
2 2 17 136 370 |
В качестве анализируемых образцов использовали ткань листа, находящегося в стадии морфологической стабилизации, показывающего свежую зелень без признаков патологии и отобранного в фазу цветения на 7-10-м междоузлиях. Для получения экстрактов активных белков предложен буфер Витис, основу которого составила среда Шефера [17] с нашими модификациями. Буфер Витис можно использовать для экстракции белков из тканей семян, ягод, пыльцы. Более подробные данные о методике проведения электрофоретического разделения смеси белков из тканей винограда, идентификации и интерпретации полученных электрофоретических спектров ферментов представлены ранее [6].
В работе использовали стандартные методы статистической генетики. Кластерный анализ проведен по методу UPGMA [16] на основе матриц генетических дистанций, полученных по методу Нея [7]. Кроме того, для визуализации матриц генетических расстояний пользовались методом многомерного шкалирования [19]. Идентичность спектров изученных ферментов у разных таксономических форм винограда определяли по формуле Socal [14]. При обработке данных использовали пакеты прикладных программ: SYSTAT v4.1, SYSTAT v5.0, HARVARD GRAPHICS V.2.0.
В результате электрофоретического анализа ферментов ткани листа винограда разных таксономических форм были получены спектры 17 ферментов (табл.2) Для дальнейшего анализа взяты первые 10 полиморфных ферментных систем, остальные были либо мономорфными, либо трудно интерпретируемыми, либо их электрофоретические спектры были не стабильными.
Для изучения генотипов видов винограда родов Ampelopsis Michx., Parthenosisus Planch. и Vitis L. подрод Euvitis Planch., методом электрофореза в полиакриламидном геле проанализирована ткань листа 21 вида по спектрам 5 ферментов, схемы которых представлены на рис.1.
По результатам анализа полученных спектров изоферментов идентифицированы генотипы видов взятой пробы по 8 локусам, осуществляющим генетический контроль указанных ферментов. При этом генотипы оказались уникальными для каждого вида, то есть не выявлены ни у одного другого вида данной выборки.
В табл.3 приведены фенотипы видов по изученным ферментам. Для изучения генетической изменчивости видов рода Vitis L. соответственно степени их генетического сходства (различия) на основе полученных результатов электрофоретического анализа указанных ферментов была построена матрица расстояний по Нею [7], анализ которой проведен методами кластеризации UPGMA и многомерного шкалирования [6, 19].
По данным ампелографии, виды V. vulpina Linn. и V. riparia Michx. - синонимы, но анализ имеющихся в коллекции образцов обнаружил довольно значительное генетическое различие (0,60) между ними.
Дальнейший анализ генетической изменчивости винограда рода Vitis L. из коллекции ИВиВ "Магарач" по спектрам изоферментов позволил дать оценку чистоты коллекции видов, в результате которой выявлена примесь: образцы видов, зарегистрированных в каталоге коллекции как виды V. kaempferia Koch., V. silvestris Gmel. и неустановленная форма V. amurensis Rupr.
Последующий анализ коллекционных образцов видов VKA, VAM*, VSI, VVU, VRI по сумме признаков (спектры изоферментов и классические ампелографические признаки), проведенный сотрудниками отдела ампелографии и селекции ИВиВ "Магарач", позволил предположить, что анализируемые растения представляют завезенные при закладке коллекции филлоксероустойчивые подвои для европейских сортов.
Генетическая изменчивость сортов разных эколого-географических групп изучена по спектрам 7 изоферментов, но в данном сообщении приведены результаты по спектрам ферментов GPI, IDH, 6PGD, SOD. По ранее полученным данным известно, что генетический контроль этих изоферментов осуществляется 8 локусами, 4 из которых полиморфны (Gpi2, Idh, 6Pgd1, Sod2). Дальнейший анализ генетической изменчивости сортов проведен по полиморфным локусам. Ниже представлены некоторые результаты.
Установлены фенотипы более 130 сортов V. v. sativa D. C. по спектрам ферментов GPI, IDH, SOD, 6PGD, LAP.
Проведена паспортизация 20 сортов V. v. pontica balcanica Negr. и 15 крымских аборигенных сортов.
Проведены тесты на гетерозиготность генотипов сортов группы бассейна Черного моря.
На основании полученных данных об изоферментных спектрах и локусах, их контролирующих, для 48 сортов западноевропейской и восточной групп построена матрица генетических расстояний, анализ которой проведен вышеуказанными методами. Представлена локализация групп сортов винограда в пространстве 1 и 2 фактора многомерного шкалирования (рис.2). Рассмотренные сорта (кроме сортов смешанной группы) преимущественно входят в кластеры, отражающие происхождение и направление селекции [5, 21].
Таким образом, выявлена генетическая дифференциация изученных сортов V. v. sativa D. C. на 3 группы: западноевропейскую, восточную и восточно-средиземноморскую, последняя из которых состоит из 2 подгрупп: технических и столовых сортов. Полученные результаты свидетельствуют о значительных генетических последствиях разного направления селекционной работы с этими сортами.
Идентификация генотипов особенно важна при клоновой селекции, когда среди массы фенотипически однородных, как правило, высокопродуктивных растений необходимо выделять генотипические вариации.
Материалом для аналилиза служили высокопродуктивные бессимптомные клоны 8 сортов (см. табл.1). В результате были выделены клоны, генетически отличные от базового сорта.
Таким образом, несмотря на особенности изучаемой культуры, наши результаты подтверждают правильность выбора метода (электрофоретическое разделение молекул белков на гелевых носителях) и генетических маркеров для целей идентификации сортов и групп винограда, что согласуется с некоторыми литературными данными [2]. Более того, этот метод представляет большой интерес, поскольку позволяет анализировать в любое время года любой сорт. Анализ полученных результатов и данных литературы представил по-новому гипотезы относительно общепринятой классификации сортов V. vinifera L., базирующейся только на одном наблюдении морфологической конвергенции между сортами. Предлагаемый подход к анализу таксономии сортов винограда показывает, что некоторые сорта подразделяются на группы (1,3-5), совпадающие с группами предыдущих классификаций, другие же разделяются менее четко или входят в группы, не соответствующие классификации, более или менее допускаемой до сих пор (смешанная группа). Исследование сортов винограда по дополнительным изоферментным маркерам позволит решить подобные затруднения и усовершенствовать классификацию.
Данные, представленные в нашем сообщении, продолжают анализироваться.
Литература
1. Alleveldt G., Detweiller E. A model to differentiate grapevine cultivars witr help morfological characteristics // Rivista di viticulture ed Enologia. - 1989. - XLII - № 1. - P.59-63.
2. Benin M., Gasquer I., Mahfoudi A. et. al. Caracterisation biochimique des cepages de Vitis vinifera L. par electrophorese d'isoenzymes foliares: Essai de classification desvarietes // Vitis. - 1988. - 27. - № 3. - S.157-172.
3. Calo A., Costacurta A., Paludetii G., Colo G., Arulsekar S., Parfitt D. The use of isozyme markers to characterize grape cultivars // Rivista di viticoltura a di enologia. - 1989. - 1. - P.15-22.
4. Garaglio P. G. Enciclopedia vifivinicola mondiale La vifi eil vinonella legenda, nelle fradizioni e nella sforin // Enciclopedia vifivinicola mondiale. - Milano. - Italia. - 1973. - P.11-18.
5. Грамoтенко П.М. Естественные сортотипы восточной эколого-географической группы сортов винограда (convar. orientalis Negr.) // Вопросы виноградарства и виноделия. - 1968. - С 156-166.
6. Клочнева В.И., Трошин Л.П., Шурхал А.В., Ракицкая Т.А. Межвидовая и внутривидовая изменчивость винограда по аллозимным локусам // Научные труды ВНИИВиПП "Магарач". - 1989. - 9 - С.109-114.
7. Nei M. Genetic distance beffween populations // Amer. Natur. - 1972. - 106. - P.283-292.
8. Клочнева В.И., Трошин Л.П., Шурхал А.В., Ракицкая Т.А., Животовский Л.А. Идентификация видов, сортов и клонов винограда по белкам как маркерам генов (Методические указания). - М., 1990. - 35 с.
9. Parfitt D.E. The use of isozyme electrophoresis fop ampelography and evaluation of genetic diversity in Vitis vinifera L. // Rivista di viticoltura e di enologia. - 1989. - 1. - P.7-14.
10. Райдер К., Тейлор К. Изоферменты. - М.: Мир, 1983. - 107 с.
11. Рисованная В.И., Трошин Л.П. Характеристика видов и сортов рода Vitis L. c использованием молекулярно-генетических маркеров // Тез. док. Международной конференции "Молекулярно-генетические маркеры и селекция растений". - Киев, 1994.
12. Рисованная В.И., Шурхал А.В. Изучение коллекционных форм винограда по изоферментным признакам // Тез. док.6 съездa ВОГИС. - Саратов, 1994.
13. Рисованная В.И., Полулях А.А. Генетическая изменчивость винограда // Тез. док.6 Международного симпозиума по селекции винограда. - Ялта, 1994.
14. Socal R. R., Rohlf F. J. Biometry. - San Francisco. - W. N. Freeman. - 1969.
15. Созинов А.А. Полиморфизм белков и его значение в генетике и селекции. - М.: Наука, 1985.
16. Sheat P. H., Socal R. R. Numerical taxonomy. - San Francisco. - W. N. Freeman and Co. - 1973. - 573 p.
17. Stavrakakis M. N. et. al. The between - and - within grape cultivars genetic variation // Scientia Horticulture. - 1983. - P.321-334.
18. Терехина А.Ю. Анализ данных методами многомерного шкалирования. - М.: Наука, 1986. - 167 с.
19. Топалэ Ш.Г. Полиплоидия у винограда. - К.: Штиинца, 1983. - 215 с.
20. Трошин Л.П. Оценка и отбор селекционного материала винограда. - Ялта, 1990. - 136 с.
21. Трошин Л.П., Рисованная В.И., Полулях А.А. Изменчивость признаков листа сортов винограда Vitis vinifera pontica balcanica Negr. // Виноградарство и виноделие. - Ялта. - 1995.
22. The nomenclature of multiple forms of enzymes. Recommendation // Biochem. J. - 1972. - Vol.126. - № 4. - P.769-772.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Компоненты плодов винограда и виноградного сока. Сравнительный анализ сортов винограда, их свойства, влияние условий выращивания и элементов агротехники на качество и сохранность винограда. Хранение, транспортирование и товарная обработка винограда.
курсовая работа [686,8 K], добавлен 17.10.2014Место отрасли виноградарства в экономике РД, хозяйственно-технологические особенности столовых сортов винограда. Анализ динамики сахаронакопления в ягодах. Увологическая характеристика сортов. Механические свойства и транспортабельность винограда.
курсовая работа [1,6 M], добавлен 13.05.2014Обзор фенологических наблюдений, показателей сахаристости и кислотности столовых сортов винограда. Определение продолжительности вегетационного периода. Совершенствование промышленного сортимента винограда в анапо-таманской зоне Краснодарского края.
статья [341,9 K], добавлен 22.12.2015Изучение классификации винограда, его значение как сельскохозяйственной культуры. Эфирные масла, фитостериновые вещества, кислоты винограда. Милдью, мучнистая роса, хлороз, некроз как основные болезни винограда. Селекция виноградных сортов, их иммунитет.
реферат [49,3 K], добавлен 23.08.2016Виноград как род растений семейства Виноградовых: технология выращивания, рассмотрение основных способов переработки. Характеристика химического состава и питательных веществ многолетнего растения. Особенности влияния винограда на организм человека.
презентация [4,2 M], добавлен 06.12.2012Исторические сведения о появлении, распространении и вредоносности милдью винограда. Предупреждение первичного и вторичного заражения растений во время вегетации. Повышение сопротивляемости виноградных растений к милдью, выведение устойчивых сортов.
курсовая работа [34,6 K], добавлен 02.12.2010Обзор основных видов сорняков: полные паразиты и полупаразиты сорных растений. Методы обрезки плодовых и ягодных растений. Правила формирования деревьев, их подрезки или укорачивания. Особенности обрезки кустов винограда. Минеральные, фосфорные удобрения.
курсовая работа [243,9 K], добавлен 17.10.2010Агроклиматическая и почвенная характеристика Анапо-Таманской и Черноморской зоны. Сущность и характеристика разновидностей стимуляторов роста. Исследование влияния биостимулирующих препаратов и регуляторов роста на урожайность и качество винограда.
реферат [32,5 K], добавлен 25.04.2011Хозяйственно-технологическая оценка сортов винограда группы Шасла. Биологическая природа продукта и влияние на него экологических и агротехнических факторов. Характеристика сортов по содержанию сока, гребней, кожицы и твердых частей мякоти в ягодах.
статья [15,5 K], добавлен 24.11.2015Ботаническая и биологическая характеристика яровой пшеницы, технология возделывания. Задачи и направления селекции культуры; методы оценки селекционного материала. Характеристика генотипа, генетическая детерминация и наследование селекционных признаков.
курсовая работа [947,9 K], добавлен 04.11.2013Сущность конкуренции и конкурентоспособности продукции. Современное состояние и особенности производства винограда. Снижение себестоимости производства продукции виноградарства. Пути повышения конкурентоспособности производства продукции виноградарства.
дипломная работа [880,2 K], добавлен 06.02.2011Анализ агроклиматических и почвенных показателей исследуемого хозяйства, обоснования выбора участка под закладку виноградника и организации его территории. Выбор форм кустов, техники их ведения и расчет нагрузки при обрезке. План уборки винограда.
дипломная работа [94,1 K], добавлен 31.07.2015Характеристика морфологических элементов и признаков почвы. Типы строения почвенного профиля. Система символов для обозначения генетических горизонтов почв. Влияние химического состава на окраску почв. Классификация почвенных новообразований и включений.
реферат [178,5 K], добавлен 22.12.2013Изучение морфологических и биологических свойств возбудителя лептоспироза. Исследование особенностей распространения, динамики патогенеза, клинических признаков и патологоанатомических изменений. Диагностика, методы лечения, профилактика и меры борьбы.
курсовая работа [768,8 K], добавлен 30.03.2014Горох - основная зернобобовая культура России. Карты хромосом гороха с молекулярными маркерами. Навыки по анализу наследования количественных признаков гороха посевного в расщепляющихся гибридных популяциях, что необходимо в селекционной работе.
курсовая работа [447,2 K], добавлен 26.03.2013Описание селекционных признаков крупного рогатого скота, наследование его качественных признаков при воспроизводстве стада. Отбор молочных коров по генетической корреляции признаков продуктивности. Достоверность корреляции по косой длине туловища коров.
курсовая работа [324,6 K], добавлен 24.10.2014Характеристика диких предков домашних свиней и место домашней свиньи в зоологической классификации. Анализ изменений биологических особенностей и продуктивных качеств свиней в процессе одомашнивания, эволюции и целенаправленной методической селекции.
курсовая работа [149,1 K], добавлен 28.06.2011Характеристика процесса совершенствования пород, базирующихся на единстве действия отбора и подбора. Основные направления и методы селекции животных. Особенности видов и признаков отбора. Принципы внутрипородного разведения. Отдаленная гибридизация.
презентация [2,0 M], добавлен 14.04.2015Сорта винограда, особенности строения куста и годичный цикл его развития. Влияние внешних условий на формирование виноградного растения. Выращивание саженцев путём кильчеванния. Формирование куста типа "приземный среднерукавный двухсторонний кордон".
курсовая работа [73,8 K], добавлен 08.05.2012Почвенно-климатические условия и организация территории для закладки виноградника. Особенности подбора и характеристика столовых сортов винограда. Уход за молодым и плодоносящим виноградником. Правила и техника обрезки виноградных кустов и сбора урожая.
курсовая работа [60,2 K], добавлен 12.12.2009