Генетична спорідненість патогенних Ієрсиній

Дослідження генетичної спорідненості видів бактерій Ієрсинія. Визначення факторів патогенності та спорідненості між Yersinia pseudotuberculosis, Y. pestis таY. еnterocolitica. Аналіз адгезинів, які дозволяють збудникам-вторгненням закріпитися в хазяїні.

Рубрика Сельское, лесное хозяйство и землепользование
Вид статья
Язык украинский
Дата добавления 25.09.2024
Размер файла 751,4 K

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

Размещено на http://www.allbest.ru/

Размещено на http://www.allbest.ru/

Національний університет біоресурсів і природокористування України

Генетична спорідненість патогенних Ієрсиній

А.В. Ушкалов,

канд. вет. наук, докторант

Анотація

Наукова робота присвячена питанням дослідження генетичної спорідненості видів бактерій Уеіпіа. Мета роботи - провести узагальнення літературних даних стосовно факторів патогенності та спорідненості між Yersinia pseudotuberculosis, Y. pestis таY. еnterocolitica. Дослідження проводили шляхом аналізу даних літератури стосовно факторів патогенності та спорідненості між Yersinia pseudotuberculosis і Y. pestis та Y. enterocolitica. Під час виконання виконання роботи використовували порівняльний метод дослідження, епізиотичний, аналіз. Використовували базу джерел закордонних авторів (Bonacorsi et al., 1994: Achtman et al., 2004; Abreu-Goodger & Merino, 2005; Wagner et al., 2014; Santos-Montanez et al., 2015) та багато інших, які проводили дослідження з даного питання та відобразили результати у своїх науково-дослідницьких роботах. Встановлено, що до «арсеналу патогенності» Yersiniu включає низку адгезинів, які дозволяють збудникам-вторгненням закріпитися в хазяїні та прикріпитися до певних тканин пізніше під час інфікування. Коли вроджена імунна система хазяїна активована, усі три патогени виробляють структуру, подібну до медичної голки для ін'єкцій. У поєднанні з транслоконом, який утворює пору в мембрані хазяїна, утворений канал забезпечує перенесення шести «ефекторних» білків у цитоплазму клітини хазяїна. Ці білки імітують білки клітини-хазяїна, але є більш ефективними, ніж їхні рідні аналоги, у модифікації цитоскелета клітини-господаря, викликаючи апоптоз клітини-господаря. Такий складний арсенал гарантує, що ієрсинії зберігають перевагу, незважаючи на всі зусилля хазяїна протидіяти інфікуючому патогену.

Ключові слова: Yersinia адгезини, патогенність, вірулентність, фактори вірулентності, гени, діагностика, білки.

Abstract

yersinia бактерія патогенність адгезин

Genetic relatedness of pathogenic Yersinia

А. Ushkalov

National University of Bioresources and Nature Management of Ukraine

The scientific work is devoted to the study of genetic relatedness of Yersinia bacterial species. The purpose of the work is to generalize literature data on pathogenicity factors and relatedness between Yersinia pseudotuberculosis, Y. pestis and Y. enterocolitica. The research was carried out by analyzing data from the literature regarding pathogenicity factors and relatedness between Yersinia pseudotuberculosis and Y. pestis and Y. enterocolitica. During the execution of the work, a comparative method of research, episiotic, and analysis was used. Used the source base of foreign authors (Bonacorsi et al., 1994: Achtman et al., 2004; Abreu-Goodger & Merino, 2005; Wagner et al., 2014; Santos-Montanez et al., 2015) and many others who conducted research on this issue and reflected the results in their research works. It has been established that Yersinia's «arsenal of pathogenicity» includes a number of adhesins that allow invading pathogens to establish themselves in the host and attach to certain tissues later in the course of infection. When the host's innate immune system is activated, all three pathogens produce a structure similar to a medical needle for injection. In combination with the translocon, which forms a pore in the host membrane, the formed channel ensures the transfer of six «effector» proteins into the cytoplasm of the host cell. These proteins mimic host cell proteins but are more efficient than their native counterparts in modifying the host cell cytoskeleton, inducing host cell apoptosis. Such a complex arsenal ensures that уersinia maintain an advantage, despite all the efforts of the host to counteract the infecting pathogen.

Keywords: Yersinia, adhesins, pathogenicity, virulence, virulence factors, genes, diagnostics, proteins

Основна частина

Із 17 різних видів грамнегативного роду Yersinia, тільки три види завдають шкоди людям і тваринам, а саме Yersinia enterocolitica, Y. pseudotuberculosisі Y. pestis. Y. pseudotuberculosisвідокремився від Y. enterocoliticaміж 41 і 186 мільйонами років тому, тоді як Y. pestisвідокремився від Y. pseudotuberculosisпротягом останніх 1500-20000 років, що означає, що ці два види більш тісно пов'язані генетично, при тому, що і Y. pseudotuberculosis, і Y. enterocoliticaвикликають кишкові токсикоінфекції, вони набагато менше пов'язані на рівні ДНК, ніж Y. pestisз Y. Pseudotuberculosis (Abreu-Goodger &Merino, 2005).

Необхідно зауважити, що Y. pestis та Y. pseudotuberculosisвикористовуючи радикально інший механізм передачі, арсенал факторів вірулентності викликають різні клінічні захворювання у своїх господарів. Так, Y. pestisє зоонозним патогеном, який викликає чуму, трансмісивну хворобу, що передається блохами, і є однією з найбільш смертоносних хвороб. найбільш відомий тим, що спричинив три пандемії, включаючи чуму Юстиніана (541-542 роки), чорну смерть (1347-1353 рр.), і третю пандемію, коли Y. pseudotuberculosisпоширилася по всьому світу (1894-1921 рр.) (Achtman et al., 2004; Cui et al., 2013; Wagner et al., 2014).

Y. pestisвсе ще активно викликає захворювання в багатьох частинах світу, включаючи Північну Америку (2007), Перу (2010), Мадагаскар (2015-2017, 2021), Китай (2020),

Демократична республіка Конго (2020) (Califf et al., 2015). Захворювання, викликані Y. pestis, як правило, піддаються лікуванню протимікробними препаратами (Bonacorzi, et al., 1994), хоча в окремих випадках на Мадагаскарі спостерігалася набута резистентність (Galimand et al., 2006).

Y. pseudotuberculosisможе міститися в різних резервуарах тварин, наприклад: у собак, кішок, великої рогатої худоби, коней, кроликів, оленів, індиків, качок та багатьох інших, а також у грунті, рослинах, комахах та амебах у навколишньому середовищі. Захворювання Y. Pseudotuberculosis, зазвичай виникає після вживання зараженої їжі або води, після чого вона колонізує шлунково-кишковий тракт, спочатку в пейєрових ділянках дистального відділу тонкої кишки, а потім поширюється в печінку та селезінку або безпосередньо, або через мезентеріальні лімфатичні вузли. Інфекції викликані Y. pseudotuberculosisуу людей зазвичай призводять до гастроентериту, що характеризується самообмежувальним мезентеріальним лімфаденітом і діареєю. Зазвичай, антибіотики навіть не потрібні; однак у людей з основними хронічними захворюваннями печінки або з ослабленим імунітетом інфекція була пов'язана з септичними ускладненнями, і у них можуть розвинутися серйозні та потенційно смертельні системні інфекції. Y. enterocoliticaможуть проводити значну частину свого життя поза ссавцями-господарями в грунті та воді, а також у вільноживучих амебах з різноманітними джерелами поживних речовин, і тому вони зберігають метаболічні можливості, які були втрачені у Y. Pestis (Lambrecht et al., 2013; Santos-Montanezet al., 2015).

Всесвітня організація охорони здоров'я вважає Y. pestisемерджентним збудником, патогеном, що «знову з'являється», що викликає занепокоєння, який здатний набувати стійкості до багатьох антибіотики, а також є серйозною потенційною загрозою біотероризму. Відмінності в способі життя та вірулентності між Y. pseudotuberculosisі Y. pestisздебільшого пояснюються незначними геномними відмінностями у відповідних хромосомах і наявністю двох додаткових плазмід вірулентності, якими володіє Y. pestis. Необхідно додати, що Y. pestis та Y. pseudotuberculosisприблизно на 98% ідентичні на рівні ДНК (Guiyoule et al., 2001).

Y. ruckeri - збудник септичних захворювання лососевих риб, переважно райдужної форелі. Воно відоме, також, під назвою «enteric red mouth - ERM» - ентерит, що супроводжується почервонінням ротової порожнини. Крім лососевих риб, Y. ruckeriвиділяють від інших видів риб (великоротого американського окуня, жирноголового гольяну, окуня, ленського осетра, європейських вугрів, осетрових і коропів, лососеві, європейських вугрів, осетрових і коропів), а також раків і ондатр (Kumar et al., 2015).

Мета роботи - провести узагальнення літературних даних стосовно факторів патогенності та спорідненості між Yersinia pseudotuberculosis, Y. pestisта Y. enterocolitica.

Матеріали і методи. Для аналізу використовували інформаційні Internet ресурси наукових журналів, нормативно-правові акти України, а також бази даних WHO - Всесвітньої організації охорони здоров'я, WOAH - Всесвітньої організації здоров'я тварин, FAO - Продовольчої та сільськогосподарської організації, CDC-Центру з контролю та профілактики захворювань в США, ECDC - Європейського центру по нагляду та попередженню захворювань, EFSA - Європейського відомства з безпеки харчових продуктів, тощо.

Результати й обговорення. Патогенність (грец. pathos - страждання, хвороба + genos - рід) - видова полідетермінантна ознака збудника, що позначає його потенційну здатність викликати інфекційний (інвазійний) процес у «хазяїна», тобто проникати в організм хазяїна, розмножуватися в ньому та уражувати його. Патогенність збудника виявляється відносно особин одного виду або групи до чітко визначених хазяїв. Патогенність, як правило, контролюється сукупністю генів, які зумовлюють проникнення паразита в організм, адаптацію його там, пригнічення захисних сил організму, ушкодження клітин і тканин і перехід до нового хазяїна. Матеріальні носії патогенності називаються факторами патогенності (Paliy, 1995).

Вірулентність (лат. Virulentus - отрутний) - ступінь хвороботворності (патогенності) певного інфекційного агента (штаму бактерії чи вірусу).

Вірулентність залежить як від властивостей інфекційного агента, так і від сприйнятливості (чутливості) інфікованого організму. Вираженість патогенної властивості залежить від наявності в мікроорганізмі відповідних генів патогенності й контрольованих ними факторів патогенності - структур і речовин, що забезпечують взаємодію з макроорганізмом у ході інфекції. До факторів вірулентності, зокрема, відносять багато поверхневих структур мікроорганізмів (ворсинки, капсули), компоненти зовнішньої мембрани і клітинної стінки (ліпополісахарид, білки адгезини та інвазини, тейхоєві кислоти), ферменти і токсини, що виділяються збудником. Зміна вірулентності штаму може бути результатом набуття або втрати тих чи інших факторів патогенності, а також наслідком зміни вираженості патогенних властивостей. В основі цих процесів лежать закономірності функціонування генів. Вірулентність складається з низки патогенних властивостей мікроорганізму: адгезивності - здатності мікроорганізму розпізнавати і міцно зв'язуватися з поверхнею клітин хазяїна; інвазивності - здатності до внутрішньоклітинного і позаклітинного проникнення і поширення збудника в тканинах хазяїна; персистентних властивостей (антифагоцитарні, антикомплементарні, антигенна мімікрія тощо) - здатності ухилятися від захисних реакцій макроорганізму чи переборювати їх; цитотоксичності - здатності ушкоджувати клітини хазяїна; токсичності і токсигенності - здатності до синтезу токсинів, що порушують функції органів і систем хазяїна (Borisov &Freidlin, 1975).

Нижче, буде наведено низку ключових факторів вірулентності, які забезпечують ефективне приєднання до клітин/тканин хазяїна та підривають функції клітин хазяїна які споріднюють патогенні Yersinia, які в свою чергу споріднюють види патогенів людини та тварин.

Ключовими детермінантами вірулентності Yersiniaі, звичайно, найбільш повно вивченими є ті, що виділяються через систему секреції третього типу (T3SS). Ця система вводить набір ефекторних білків, відомих як Yops (зовнішні білки Yersinia), уцитозоль клітин - господарів, які контактують з бактеріями (Pan &Brady, 2008).

T3SS був описаний як молекулярний шприц, який доставляє цитотоксичні ефектори в клітини-господарі. Оскільки цей механізм вірулентності зберігається у багатьох патогенних організмів, він стає привабливою мішенню для нових терапевтичних засобів. Втручання в ефективну доставку ефекторів може мати суттєві наслідки для патології захворювання, тому що бактерії відчувають контакт клітин, щоб активувати T3SS узгоджується точність і кінетика доставки ефекторів (Dewoody et al., 2013).

Щоб уникнути вродженого імунітету хазяїна та дозволити патогену реплікуватися та розмножуватися позаклітинно, усі патогенні для людини види Yersiniaмістять приблизно 70 кб вірулентну плазміду. На цій плазміді знаходиться набір генів, транскрипція яких активується при температурі 37°C у присутності мілімолярних концентрацій кальцію, умов, що представляють хазяїна ссавця. Ці гени кодують «наномашину» T3SS, підшкірну голкоподібну структуру (ін'єктисому) і транслокон, який утворює пору на мембрані клітини - господаря (рис. 1) (Atkinson &Williams, 2016).

Рис. 1. Збірка голки третього типу (T3SS) (Atkinson &Williams, 2016)

Структурно основа ін'єктисоми складається з ряду білків, які мають циліндричну архітектуру, подібну до будови джгутикового базального тіла, які спрямовуються до мембрани секреційним (Se^-залежним шляхом. Ін'єктисома містить два мембранних кільця, які називаються кільцями MS (мембрана та надмембрана) і OM (зовнішня мембрана). Вони з'єднані з п'ятьма інтегральними мембранними білками, які відіграють роль у експорті білків. Безпосередньо експортувальний апарат фланкований YscQ, який сприяє зв'язуванню АТФази YscN і комплексів секреції субстрат-шаперон. YscN забезпечує рушійну силу протонів, необхідну для секреції ефекторів Yop (Jackson &Plano, 2000; Edqvist et al., 2003; Sorg, et al., 2007; Zarivach et al., 2007; Diepold et al., 2010; Diepold & Armitage, 2015).

У позаклітинний простір від базального тіла виступає порожниста голка, утворена спіральною полімеризацією субодиниць білка YscF, яка визначає довжину голки та обмежує її розмір. Нещодавно було показано, що повністю сформовані голки T3SS утворюють кластери на поверхні бактеріальних клітин, і нові голки, здається, локалізуються в цих кластерах, а не розподіляються випадковим чином (рис. 2). Кінчик голки покритий LcrV, білком, який керує утворенням пори або «транслокону». Транслокон складається з тристоронньої білкової пори, яка вставляється в мембрани клітини-хазяїна і забезпечує транслокацію ефекторів Yop в цитоплазму клітини-мішені. Пора складається з трансмембранних білків YopB і YopD і ін'єктисомного комплексу LcrV. Бактерії, у яких відсутні білки верхівки та транслокону, здатні секретувати ефектори у позаклітинне середовище, але мають дефекти в транслокації Yops у клітини господаря (Diepold &Armitage, 2015).

Рис. 2. Голки системи секреції типу 3 (T3SS) (обведені) збираються разом, коли утворюються на поверхні клітини (Kudryashev et al., 2015)

Білок відповіді V з низьким вмістом кальцію (LcrV або V-антиген, 37-39 кДа) був вперше ідентифікований у Y. Pestisбільше 50 років тому/ Згодом цей кодований плазмідами секретований білок також був ідентифікований у всіх патогенних для людини Yersinia.

LcrV було ідентифіковано як багатофункціональний фактор вірулентності, що демонструє характеристики транслокаторних і ефекторних білків. LcrV бере участь у регуляції виробництва Yop, транслокації білків вірулентності, сприяючи формуванню кінчика голки, та утворенню пор у мембрані клітини-мішені, оскільки він полегшує вбудовування YopB та YopD у мембрани клітин-господарів. Нещодавно було описано, що LcrV у Y. pseudotuberculosisнеобхідний для раннього націлювання на YopH in vivo. LcrV секретується T3SS і був виявлений на поверхні бактерій і в цитозолі клітин-мішеней. Очевидно, LcrV проникає в клітини-хазяїни незалежно від T3S і пори YopB-YopD, однак, потрібен прямий контакт Yersiniaз клітиною-мішенню, оскільки позаклітинно доданий LcrV не здатний проникати в клітини (Grabowski et al., 2017).

Враховуючи складність T3SS, частина його складності пов'язана з його вбудованою здатністю розрізняти структурні та секреційні субстрати, забезпечуючи суворий порядок, щоб гарантувати, що голка збирається та полімеризується перед секрецією транслокону та ефектора Yop. Таке впорядкування вимагає специфічних шаперонів, як правило, невеликих білкових димерів, які захищають цільовий білок T3SS від деградації і запобігають передчасній олігомеризації, а також вступ до ін'єкційної соми. Ці шаперони зв'язуються з транслоконними білками YopB, YopD і LcrV (рис. 3), а шаперони класу III мають тенденцію утворювати гетеродимери та асоціювати зі структурними компонентами ін'єктисоми (Cornelis et al., 1996; Wolf-Watz, 1997; Cheng, Schneewind, 1999; Diepold & Armitage, 2015).

Рис. 3. Плазміда, що кодує Yersinia T3SS. Загальна плазміда вірулентності тут представлена картою pIB1 Y. Pseudotuberculosis (Lavander, 2005)

Загалом вважається, що білок Yopмодулює імунний захист організму та дозволяє бактеріям розмножуватися позаклітинно в лімфатичних тканинах і органах. Щонайменше шість ефекторних Yop були ідентифіковані в Yersinia: YopH, YopE, YopM, YopO (YpkA), YopJ (YopP у Y. enterocolitica)і YopT. Біохімічна активність, мішені білків хазяїна та вплив на культивовані клітини були описані для більшості Yops. Наприклад, YopH, YopE, YopO та YopT відіграють роль у запобіганні фагоцитозу бактерій макрофагами, нейтрофілами та/або епітеліальними клітинами; однак видалення будь-якого з цих Yops не усуває антифагоцитарну активність бактерій. YopE та YopT викликають цитотоксичність епітеліальних клітин. Нарешті, YopJ індукує апоптоз макрофагів. YopH - це тирозинфосфатаза, яка націлена на багато білків, що призводить до різноманітних ефектів у культивованих клітинах. YopH локалізується у вогнищевих спайках і впливає на передачу сигналів інтегрину, тим самим запобігаючи фагоцитозу. YopH також впливає на окислювальний вибух макрофагів і пригнічує передачу сигналів Т- і В-клітин, проліферацію Т-клітин і передачу сигналів Ca2+в нейтрофілах. YopE - це білок, що активує GTP-азу Rho/Rac (GAP), який дестабілізує нитки актину і тим самим запобігає фагоцитозу. YopT інактивує RhoA; однак YopT не виробляється у всіх штамах Y. pseudotuberculosis. YopO впливає на актиновий цитоскелет епітеліальних клітин і зв'язується з Rho і Rac у GTP - або GDP-зв'язаному стані. Проте клітинні мішені YopO та його точний механізм і функція вірулентності все ще невідомі. YopM є єдиним Yop, який локалізується в ядрі еукаріотичних клітин після транслокації, і нещодавно було виявлено, що він взаємодіє з двома кіназами ссавців, PRK2 і RSK1 (Logsdon &Mecsas, 2003).

Мутації у більшості Yop Yersinia spp. послабити вірулентність інфекційного процесу у тварин. У більшості випадків роль Yop у вірулентності була визначена шляхом аналізу на здатність мутантного штаму Yopвикликати загибель(падіж) інфікованих лабораторних мишей. Такі експерименти ідентифікували YopH, YopE, YopO, YopJ і YopM, як фактори вірулентності. Інші дослідження аналізували здатність мутантів Yop колонізувати певні тканини після інфікування порожнини рота. Після інфікування порожнини рота, YopE та YopO мутантні штами колонізують РР на ранній стадії інфікування, але мутанти не доживають до 4-го дня або не колонізують селезінку. Крім того, мутант YopJ демонструє зниження колонізації селезінки та MLN через 4 дні після інфікування ротової порожнини. Однак значні відмінності в тому, як проводилися експерименти на тваринах (тобто різні лінії інбредних лабораторних мишей, різні види Yersiniaта різні шляхи зараження) ускладнюють порівняння відносної важливості кожного Yop для колонізації та стійкості бактерій у різні тканини (Logsdon &Mecsas, 2003).

Групу білків, які опосередковують взаємодію патоген-господар, складають адгезини: інвазин, Ail, YadA, YadB, YadC, Pla та антиген pH 6 - належать до найвідоміших ієрсиніозних адгезинів, про які детально зазначено нижче.

Інвазин є хромосомно кодованим білком, який опосередковує прикріплення до клітин хазяїна та входження в них Y. pseudotuberculosisі Y. enterocolitica, хоча в Y. pestisвін є псевдогеном і тому неактивним (рис. 4).

Рис. 4. Фактори вірулентності, виявлені на поверхні Yersinia pseudotuberculosis, Y. enterocolitica (a) і Y. pestis (b) (Mikula et al., 2012)

Експресія інвазину регулюється як температурою, так і pH у Y. enterocolitica. Ефект дії рН не виявляється у Y. pseudotuberculosis, що свідчить про те, що механізми регуляції експресії інвазину можуть відрізнятися між двома видами. Було встановлено, що два регулятори важливі для експресії інвазину: RovA, необхідний для позитивної регуляції інвазину, та YmoA, необхідний для негативної регуляції. Ген інвазину максимально експресується при 26°C, досягаючи піку під час пізньої експоненціальної/ранньої стаціонарної фази з нижчими рівнями експресії, що спостерігаються при 37°C. Це очевидне протиріччя, оскільки інвазин необхідний для інфікування при 37°C, було вирішено, коли вченими виявлено, що експресія інвазину при 37°C відновлюється до рівнів, які спостерігаються при 26°C, коли pH знижується до 5,5. Було припущено, що експресія інвазину за температури навколишнього середовища, а не експериментальний артефакт, може підготувати бактерії до інфекції після проковтування та сприяти швидкому трансцитозу через епітелій. Ефект рН не виявляється у Y. рseudotuberculosis, що свідчить про те, що механізми регуляції експресії інвазину можуть відрізнятися між двома видами. Було виявлено, що два регулятори важливі для експресії інвазину: RovA, необхідний для позитивної регуляції інвазину, і YmoA, необхідний для негативної регуляції. І RovA, і YmoA розпізнають промоторну область інвазину та конкурують за зв'язування. Як тільки RovA зв'язується, він, здається, запобігає зв'язуванню YmoA, таким чином пригнічуючи негативну регуляцію інвазину. Сама експресія rovA регулюється температурою через RovM, який діє як репресор експресії rovA в умовах індукції росту (Diepold &Armitage, 2015).

Одразу після потрапляння в організм, бактерії вже мають присутній на своїй поверхні білок зовнішньої мембрани ^M) інвазин, який експресується в стаціонарній фазі при низьких температурах (наприклад, у продуктах харчування, що зберігаються). Він відіграє вирішальну роль на перших фазах інфекції, сприяючи ефективній транслокації, і в тому числі, через кишковий епітеліальний бар'єр (Mikula et al., 2012).

Було встановлено, що важливі два регулятори для експресії інвазину: RovA, необхідний для позитивної регуляції інвазину, та YmoA, необхідний для негативної регуляції. RovA, і YmoA розпізнають промоторну область інвазину та конкурують за зв'язування. Як тільки RovA зв'язується, він, здається, запобігає зв'язуванню YmoA, таким чином пригнічуючи негативну регуляцію інвазину. Сама експресія rovA регулюється температурою через RovM, який діє як репресор експресії rovA в умовах індукції росту (Diepold &Armitage, 2015).

Ail - це невеликий мономерний поверхнево-асоційований білок, локалізований в зовнішній мембрані. Представники великої групи Enterobacteriaceae має сімейство білків зовнішньої мембрани Ail/OmpX/PagC/Lom, які знайдено в геномах усіх патогенних ієрсиній (Pieperet al., 2009).

Будова Ail білка неоднорідна - вона первинна, вторинна і третинна. Геном Y. pestis кодує чотири гомологи білка Ail: y1324, y1682, y2034 та y2446, які також присутні в Y. pseudotuberculosis. Ген, позначений, як y1324, кодує білок з прогнозованою молекулярною масою 17,47 кДа (без сигнальної послідовності) і має найбільшу схожість амінокислотної послідовності з білком Ail, як Y. enterocolitica (~70%) (Kolodziejek et al., 2007).

Ключовими фенотипами, опосередкованими в Ail-білку є наступні: інгібування бактерицидних властивостей комплементу, прикріплення та доставка Yop до тканини хазяїна, запобігання залученню поліморфноядерного лейкоцита (PMNL) до лімфатичних вузлів, інгібування запальної відповіді (Hinnebusch et al., 2011)/

YadA-є найбільш вивченим і найкраще описаним тримерним білком AT.Більшість діяльності Yersinia, яку тепер приписують YadA, були описані до самої УлсІАЦе: встановлення інфекції, адгезія до молекул ECM, аутоаглютинація, резистентність сироватки, фагоцитоз стійкість та інвазія (Kudryashev et al., 2015).

YadA кодується на pYV, плазміді вірулентності, і експресується як фактор вірулентності EPECY. Enterocoliticaта Y. Pseudotuberculosisвідразу після того, як вони перетинають слизову оболонку кишечника. Експресія білка регулюється температурою та індукується, коли бактерія піддається впливу температури +37°C. YadA має важливе значення для вірулентності Y. enterocolitica, але не для Y. pseudotuberculosis. Крім того, ^^adA присутній у третьому патогенному для людини виду Yersinia, Y. pestis, але як псевдоген, через зсув рамки, спричинений делецією одного нуклеотиду. Однак нещодавно виявлено та охарактеризовано два хромосомні гениyadBтаyadC, подібні доyadA (Kudryashev et al., 2015).

YadA є прототипом нефімбріального адгезину, для якого була створена теоретична модель, що підтверджується структурними даними та аналізом подібності послідовностей.

Довжина YadA змінюється між 422 і 455 амінокислотними залишками. Для виживання бактерії в хазяїні необхідна стійкість не тільки до адаптивної імунної системи, а й до вродженої. YadA відіграє ключову роль у блокуванні всіх трьох шляхів комплементу: класичного, альтернативного та лектинового. Це має вирішальне значення для витривалості Y. enterocolitica, але не для Y. рseudotuberculosis. YadA зв'язується з регуляторами комплементу фактором H (FH) та С4Ьр. Таким чином, він діє як негативний регулятор як для класичного, так і для альтернативного шляху. YadA відповідає за інші види діяльності, включаючи опосередковану аутоаглютинацію. Головний домен має самоафінність і взаємодіє антипаралельно, подібно до блискавки (взаємодіє більш дистальна частина білка), викликаючи бактеріальну флокуляцію (Kudryashev et al., 2015).

Y. pestisзазнала значної втрати генів у видоутворенні від Y. pseudotuberculosis, і інактивовані гени включають ті, що кодують YadA та інвазином. Це може бути відображенням змін у способі життя Y. рestisпорівняно з Y. рseudotuberculosis. Натомість Y. рestisмістить два хромосомно закодовані ортологи YadA, YadB і YadC. yadB- і yadC-гени розташовані в біцистронному опероні. Це незвичайне розташування може свідчити про функціональний зв'язок, як-от створення комплексу на поверхні бактеріальної клітини. Експресія YadB і C, як і YadA, є максимальною при 37°C у стаціонарній фазі (Rosqvist et al., 1988; Simonet et al., 1996; Forman ete al., 2008).

YadB (35 кДа) і YadC (61,6 кДа) аналогічні YadA, але мають подібність лише в С - кінцевій частині (14% ідентичності та 20% подібності за 264 залишками) і в межах домену короткої шийки (10 із 21 залишків ідентичні. Існує також подібність у періодичності стебла між YadA та YadC. З іншого боку, область голови YadC не має послідовності, подібної до YadA чи будь-якого іншого білка, і передбачені повтори мають іншу періодичність, ніж у YadA. YadB, здається, має лише невеликий головний домен (7,3 кДа) з 29% ідентичністю відповідному регіону в YadC (Kolodziejek et al., 2007).

YadB і YadC, подібно до YadA, можуть утворювати олігомери, що призводить до агрегації. Вони опосередковують інвазію в епітеліальні клітини, хоча не є необхідними для приєднання. Мутація обох білків значно знижує здатність бактерій вторгатися в епітеліоїдні клітини HeLa і пневмоцити типу I, але не впливає на їхню здатність кріпитися до клітин. Крім того, видалення YadB і YadC викликало 2000-кратне збільшення підшкірної LD-50 у мишачої моделі легеневої чуми; для порівняння, видалення PsaA (білка, який утворює антиген рН 6) призвело лише до 100-кратного збільшення підшкірної LD-50. YadB і YadC не потрібні для вірулентності Y. pestisпри легеневій чумі, але є важливими для вірулентних властивостей і повної летальності в мишачій моделі бубонної чуми. YadB і C також зустрічаються в Y. pseudotuberculosis, хоча не в Y. enterocolitica, але вони не є ключовими білками під час інфекції. Таким чином, необхідні подальші дослідження, щоб визначити роль YadB і YadC (Catelyn et al., 2006; Kolodziejek et al., 2007).

Активатор плазміногену (Pla) - це фактор вірулентності, адгезин і протеаза, закодовані в плазміді pPCP1 і високо експресовані під час інвазії хазяїна Y. pestis. Це має вирішальне значення для зараження бубонною чумою у тварин, підтримуючи метастази з внутрішньошкірної тканини в лімфатичні вузли. Крім того, при легеневій чумі у людей це дозволяє Y. pestisнакопичуватися в дихальних шляхах (Haiko et al., 2009; Felek et al., 2010).

Pla належить до сімейства протеаз/адгезинів OM, відомих як омптини, які мають високу ідентичність послідовності, але відрізняються біологічною функцією. Вони широко поширені в грамнегативних патогенних бактеріях, що вражають як тварин, так і рослини. Структура Pla має вузьку Р-стволку з еліптичним поперечним перерізом, що складається з 10 антипаралельних Р-ланцюгів, з яких п'ять петель L1-L5 піддаються впливу позаклітинного зовнішнього середовища (PDB: 2X55) (рис. 5 А, Б). Периплазматична сторона містить лише короткі витки. Стовбур має довжину близько 70 А у найвищій точці (Kukkonen &Korhonen, 2004).

Омптини, становлять унікальний клас протеаз.Їхні консервативні каталітичні залишки Asp84, Asp86, Asp206 і His208 (нумерація Pla) відрізняються від залишків інших протеаз, що свідчить про новий каталітичний механізм, що включає каталітичну діаду Asp-His і пару AspAsp, яка активує нуклеофільну молекулу води (рис. 5B). Друга унікальна особливість омптинів полягає в тому, що вони вимагають наявності шорсткого LPS для ферментативної активності та інгібуються ланцюгами О-антигену, присутніми в гладкому LPS. Основною функцією Pla є активація плазміногену до плазміну. Плазмін руйнує мережі в позаклітинних матрицях шляхом активації proMMP (матриксних металопротеїназ), що забезпечує міграцію клітин.

Рис. 5. Кристалічна структура Pla з Y. Pestis. (Топологічні діаграми структури Pla (2X55). (A) Вид збоку, що представляє положення передбачуваного об'єкту зв'язування LPS (залишки D84, D86, D206 і H208 у вигляді палички). (Б) Вигляд зверху активного сайту^84 і D86 координують нуклеофільну молекулу води W1 прямо або опосередковано через другу молекулу води W2.D206 і H208, причому останній є водневим зв'язком з W1, утворюють каталітичну діаду) (Eren et al., 2010)

Було доведено, що Pla сприяє цитотоксичності Y. pestis, оскільки він, як і Ail, важливий у доставці білків Yop до епітеліальних клітин господаря, особливо при 37°C. Він бере участь у позиціонуванні секреційної системи типу III, щоб можна було вводити Yops, і в мишачих моделях є основним фактором вірулентності Y. pestis.У цій функції він замінює YadA та інвазин у Y. enterocoliticaта Y. Pseudotuberculosis (Felek, Tsang, Krukonis, 2010).

Антиген pH 6є ймовірним адгезином, пов'язаним з вірулентністю Y. pestis.Він має гомополімерну фібрилярну структуру, що складається з 15 кДа субодиниць білка PsaA. Після експресії PsaA та його секреції в периплазматичний простір за допомогою механізму Sec, його транспорту через периплазму допомагають шаперони, функція яких полягає в запобіганні полімеризації та опосередкуванні його транспортування до OM. антиген pH 6 максимально експресується під час ранньої стаціонарної фази при pH від 5 до 6,7, при 37°C, але він функціональний між pH 4 і 10. Експресія антигену pH 6 має вирішальне значення під час бактеріальної інфекції Y. pestis, що узгоджується з висновками, які показують, що бактерії, які експресують psaA, є стійкими до фагоцитозу (Huang &Lindler, 2004).

Крім того, антиген pH 6 також зв'язується з Р1-зв'язаними залишками галактозилу в глікосфінголіпідах, які зустрічаються серед різних типів клітин. Нарешті, він захищає Y. pestis від розпізнавання хазяїном шляхом зв'язування людського Fc імуноглобуліну G неімунним способом, аналогічно EibD або протеїну G. Як і у випадку з Ail і Pla, антиген pH 6 також полегшує доставку Yop системою секреції типу III, хоча він, здається, не такий важливий у цьому, як два інших (Payne et al., 1998; Sjobring et al., 1991; Leo & Goldman, 2009).

Y. pseudotuberculosisі Y. enterocoliticaтакож експресують антиген pH 6 (Myf, мукоїдний фактор Yersinia).Подібно до антигену pH 6, він експресується при 37°C у кислих умовах, і його синтез залежить від п'яти хромосомних генів myfA, B, C, Eта F. Було показано, що антиген Myf опосередковує термоіндуцибельну адгезію Y. pseudotuberculosisдо клітин культури тканини, і аналогічно антиген pH 6 бере участь у гемаглютинації. Навпаки, Y. FnterocoliticaMyfA не сприяє гемаглютинації, а його функція як адгезину та участь у фагоцитозі досі не з'ясовані.

Таблиця 1. Узагальнені дані щодо ключових факторів вірулентності Yersinia

Фактори вірулентності

Вид Yersinia

Y. pseudotuberculosis

Y. pestis

Y. enterocolitica

Y. ruckeri

T3SSYops

+

+

+

-

LcrV

+

+

+

-

Інвазин

+

+*

+

+

Ail

+

+

+

-

YadA

+

+*

+

-

YadB

+

+

+

-

YadC

+

+

+

-

Pla

+

+

+

-

Ph

+

+

+

-

YhlA

-

-

-

+

Азоказеїнова протеаза

-

-

-

+

Yrp1

-

-

-

+

YraS

-

-

-

+

У таблиці 1 наведені узагальнені дані щодо основних факторів вірулентності бактерій Y.pseudotuberculosis, Y. pestis, Y. enterocolitica. Аналізуючи наукові матеріали дослідників, а отже і дані із таблиці наглядно видно що мікроорганізми Y. pseudotuberculosis, Y. pestis, Y.enterocoliticaспоріднені за своїми властивостями, в нашому випадку за факторами вірулентності. В таблиці, також, було наведено для порівняння, фактори вірулентності Y. ruckeri - збудника кишкової червоної хвороби лососевих риб.

Біоплівка - це спільнота мікроорганізмів, вбудованих у самопродуковану матрицю позаклітинних полімерних речовин, які є полімерним конгломератом полісахаридів, білків, нуклеїнових кислот і ліпідів (Flemming &Wingender, 2010). Клітини в біоплівці захищені від антибактеріальних молекул, бактеріофагів, антитіл і фагоцитів та інших антибактеріальних механізмів. Таким чином, утворення біоплівки є способом захисту для росту, який дозволяє мікробним клітинам виживати та розмножуватися в різних несприятливих середовищах, включаючи природні, промислові чи лікарняні умови та інфекційні місця Таким чином, утворення біоплівки сприяє не тільки виживанню в навколишньому середовищі та передачі мікроорганізмів, а й хронічній інфекції патогенами, стійкими як до імунітету господаря, так і до антибіотикотерапії - тобто цю властивість можна розглядати як один із факторів патогенності (Donlan &Costerton, 2002; Davies, 2003; Hall-Stoodley, 2004).

Для формування біоплівок Yersinia pseudotuberculosisі Y. pestisпотрібні гени hmsHFRS, які керують виробництвом полісахаридного позаклітинного матриксу (Hms-ECM). Незважаючи на наявність ідентичних послідовностей hmsHFRS, Yersinia pseudotuberculosis продукує набагато менше Hms-ECM, ніж Y. pestis.

Порівняно з Y. pseudotuberculosis, Y. pestisвикористовує радикально інший механізм передачі в резервуарах гризунів, покладаючись головним чином на укуси бліх-переносників. Розвиток бактеріємії у гризунів має вирішальне значення для надійного зараження бліх, які передають збудник, кусаючи нову тварину-господаря. У інфікованих Y. pestisбліх часто виявляють «закупорку» передшлунку (Darby et al., 2008).

Y. pestisсинтезує біоплівки для прикріплення до поверхні вентрикулярних шипів, і потужна проліферація бактерій у біоплівках сприяє закупорці кишечника бліх (Darby, 2008). Закупорка кишечника у бліх перешкоджає харчуванню, змушує їх відчувати голод і неодноразово намагатися нагодуватися, під час яких проковтнута кров повертається назад у місця укусів, викликаючи зараження наступних господарів Y. pestis.

Низка факторів пов'язана з утворенням біоплівки Yersinia (табл. 2). Оперон hmsHFRS відповідає за синтез екзополісахаридів полі Р - 1,6 - нацетил-О-глюкозаміну, ключового компонента матриці біоплівки багатьох бактерій, що утворюють біоплівку, і необхідний для формування біоплівки та блокування блохами Y. pestis (Hinnebusch &Erickson, 2008). HmsH і HmsF є білками зовнішньої мембрани, тоді як інші чотири білки Hms розташовані у внутрішній мембрані. Оперон hmsHFRS відповідає за синтез екзополісахаридів полі в - 1,6 - нацетил-П-глюкозаміну, ключового компонента матриці біоплівки багатьох бактерій, що утворюють біоплівку, і необхідний для формування біоплівки Y. pestis (Hinnebusch, Erickson, 2008).

Таблиця 2. Гени, що беруть участь у формуванні біоплівки Yesinia (Zhou &Yang, 2011)

Ідентифікатор гену

Назва гену

Функція

Автори

Структурна детермінанта

YPO1951-1954

hmsHFRS

Біосинтез матриці біоплівки

Lorange, 2005

YPO3243

gmhA

Біосинтез гептози

Darby, 2005

YPO3577

yrbH

Біосинтез Kdo

Tan &Darby, 2006

YPO0055-0053

waaAE-coaD

Передача Kdo на LPS

Tan & Darby, 2006

Посттранскрипційна регуляція

YPO0425

hmsT

Біосинтез c-di-GMPбіосинтеза

Simm, 2005

YPO3996

hmsP

Деградаціяofc-di-GMPдеградації

Kirilina et al., 2004, Bobrov, 2005

YPO0929

speA

Біосинтез поліаміна

Patel, 2006, Wortham, 2010

YPO1201

speC

YPO2632

nghA

Деградація матриці біоплівки

Erickson, 2008

Регуляція транскрипції

YPO2449

rcsA rcsC rcsDB

Система фосфорелей Rcs

Sun, 2008

YPO1217YPO1219-1218

YPO1633-1634

phoPQ

Двокомпонентна система PhoP/Q

Sun, 2009

Регуляція розвитку біоплівки у Y. enterocolitica, дещо, відрізняється від тієї, яка відбувається у Y. pestis. Збудник чуми є нерухомим і потребує hmsHFRS, hmsT і hms для формування біоплівок у середній кишці блохи. hmsHFRS і hmsP були ідентифіковані в повній геномній послідовності Y. enterocolitica, але hmsTбув відсутні. hmsT кодує дигуанілатциклазу, яка позитивно регулює виробництво екзополісахариду та необхідна для утворення біоплівки Y. pestis.Відсутність hmsT у Y. enterocoliticamaнерухливий фенотип Y. pestisсвідчать, що механізми розвитку біоплівки, які використовуються цими двома видами, чітко відрізняються (Kim &Young, 2008).

Із 17 різних видів грамнегативного роду Yersinia, тільки три види завдають шкоди людям і тваринам, а саме Yersinia enterocolitica, Y. pseudotuberculosisі Y. pestis..Перелічені мікроорганізми мають спільну стратегію зараження, яка забезпечується арсеналом факторів вірулентності, що дозволяє їм подолати захисні бар'єри макроорганізму, приєднатися до епітелію господаря та колонізувати його, уникаючи захисту господаря. Вказану стратегію забезпечує низка адгезинів, які дозволяють збудникам-вторгненням закріпитися в хазяїні та прикріпитися до певних тканин пізніше під час інфікування.

Багатокомпонентний арсенал вірулентних чинників гарантує перевагу ієрсиніям, незважаючи на всі зусилля хазяїна протидіяти збуднику.

Література

1. Abreu-Goodger, C. &Merino, E. (2005). RibEX: a web server for locating riboswitches and other conserved bacterial regulatory elements. Nucleic Acids Res. 33 690-692

2. Achtman, M., Morelli, G., Zhu, P., Wirth, T., Diehl, I., Kusecek, B., Vogler, AJ, Wagner, DM, Allender, CJ, other authors. (2004). Microevolution and history of the plague bacillus Yersinia pestis. Proc Natl Acad Sci USA, 21; 101 (51):17837-42, doi:10.1073/pnas.0408026101.

3. Achtma, n M, Zurth, K, Morelli, G et al. (1999).Yersinia pestis, the causative agent of the plague, is a recently emerged clone Yersinia pseudotuberculosis. Proc Natl Acad Sci US A.; 96 (24) 23; 96 (24):14043-8.doi: 10.1073/pnas.96.24.14043.

4. Atkinson, S. & Williams, P. (2016). Yersinia virulence factors - a sophisticated arsenal for combating host defences. F1000Res. Jun 14; 5: F1000 Faculty Rev-1370. doi: 10.12688/f1000research.8466.1. PMID: 27347390; PMCID: PMC4909105.

5. Bonacorsi, S., Scavizzi, M., Guiyoule, A., Amouroux, J., Carniel, E. (1994). Evaluation of a fluoroquinolone, three beta-lactams, two aminoglycosides and a cyclin in the treatment of murine Yersinia pestis infection Antimicrobial agents Chemother 38 481-486 10.1128/AAC.38.3.481, doi: 10.1128/aac.38.3.481.

6. Borisov, L.& Freidlin, I. (1975). Great Medical Encyclopedia. A short reference book of microbiological terminology. Moscov.

7. Catelyn, J., Crosby, S., Latham, V., Goldman, V., Miller, W. (2006). RovA, a global regulator of Yersinia pestis, is specifically required for bubonic plague. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103, 13514-13519, doi:10.1073/pnas.0603456103.

8. Cui, Y., Yu, C., Yan, Y., Li, D., Li, Y., Jombart, T., Weinert, LA, Wang, Z., Guo, Z., other authors (2013). Historical variations in the frequency of mutations in an epidemic pathogen, Yersinia pestis. Proc Natl Acad Sci USA110 577-582, doi:10.1073/pnas.1205750110.

9. Cheng, L., Schneewind O: Yersinia enterocolitica type III secretion. (1999). On the role of SycE in targeting YopE into HeLa cells.J Biol Chem.274 (31):22102-8, doi:10.1074/jbc.274.31.2210.

10. Cornelis, G. & Wolf-Watz, H. (1997). The Yersinia Yop virulon: a bacterial system for subverting eukaryotic cells. Mol Microbiol.23 (5): 861-7, doi: 10.1046/j. 1365-2958.1997.2731623.x.

11. Darby, C., Ananth, S.L., Tan, L., and Hinnebusch, B.J. (2005). Identification of gmhA, a Yersinia pestis gene required for flea blockage, by using a Caenorhabditis elegans biofilm system. Infect Immun 73, 7236-7242.

12. Davies, D. (2003). Understanding biofilm resistance to antibacterialagents. NatRevDrug Discov2,114-122.

13. Dewoody, R., Peter, M. Marketon, M. (2013). Regulation of the Yersinia type III secretion system: traffic control, ront. Cell. Infect. Microbiol. Sec. Bacteria and Host Volume 3, doi: 10.3389/fcimb.2013.00004.

14. Diepold, A & Armitage, J. (2015). Type III secretion systems: the bacterial flagellum and the injectisome. Philos Trans R Soc Lond, B Biol Sci. 370 (1679), pii: 20150020, doi: 10.1098/rstb.2015.0020.

15. Diepold, A., Amstutz, M., Abel, S. (2010). Deciphering the assembly of the Yersinia type III secretion injectisome. EMBO J. 29 (11):1928-40, doi: 10.1038/emboj.2010.84.

16. Dongsheng, Zhou & Ruifu, Yang (2011). Formation and regulation of Yersinia biofilms. Protein Cell 2011, 2 (3): 173-179 DOI 10.1007/s13238-011-1024-3.

17. Donlan, R. & Costerton, J. (2002). Biofilms: survival mechanism sofclinically relevant microorganisms. ClinMicrobiol. Rev15,167-193.

18. Edqvist, P., Olsson, J., Lavander, M. (2003). YscP and YscU regulate substrate specificity of the Yersinia type III secretion system. J Bacteriol. 185 (7):2259-66, doi: 10.1128/JB.185.7.2259-2266.2003.

19. Ehren, E., Murphy, M., Gauguin, J., van den Berg, B. (2010). Aqueous network of the active site in plasminogen activator pla from Yersinia pestis. Structure 18, 809-818, doi: 10.1016/j.str.2010.03.013.

20. Erickson, D.L., Jarrett, C.O., Callison, J.A., Fischer, E.R., and Hinnebusch, B.J. (2008). Loss of a biofilm-inhibiting glycosyl hydrolase during the emergence of Yersinia pestis. J Bacteriol 190: 8163-8170

21. Felek, S., Tsang, T., Krukonis, E. (2010).Three Yersinia pestis adhesins facilitate Yop delivery to eukaryotic cells and contribute to plague virulence. Infect. Immun.78, 4134-4150, doi: 10.1128/IAI.00167-10.

22. Flemming, H.C.& Wingender, J. (2010). The biofilm matrix. NatRevMicrobio l8,623-633.

23. Forman, S., Wulff, C., Myers-Morales, T., Cowan, C., Perry, R., Straley, S. (2008). yadBC Yersinia pestis, new determinants of bubonic plague virulence. To infect Immune. 76, 578-587, doi: 10.1128/IAI.00219.

24. Galimand, M., Carniel, E., Courvalin, P. (2006). Resistance of Yersinia pestis to antimicrobial agents. Antimicrob Agents Chemother 50 3233-3236, doi: 10.1128/AAC.00306-06.

25. Grabowski, B., Schmidt, M., Ruter, C. (2017). Immunomodulatory Yersinia outer proteins (Yops) - useful tools for bacteria and humans alike. Virulence. Oct 3; 8 (7):1124-1147. doi: 10.1080/21505594.2017.1303588.

26. Guiyoule, A., Gerbaud, G., Buchrieser, C. (2001). Transferable plasmid-mediated resistance to streptomycin in a clinical isolate of Yersinia pestis. Emerg Infect Dis, doi:10.3201/eid0701.010106.

27. Haiko, J., Suomalainen, M., Ojala, T., Lahteenmaki, K., Korhonen, T.K. (2009). Invited review: breaking barriers - attack on innate immune defences by omptin surface proteases of enterobacterial pathogens. Innate Immun, doi: 10.1177/1753425909102559.

28. Hinnebusch, BJ., Jarrett, C.O., Callison, J.A., Gardner, D., Buchanan, S.K., Plano, G. (2011). Role of the Yersinia pestis Ail protein in preventing a protective polymorphonuclear leukocyte response during bubonic plague. Infect. Immun. 79, 4984-89 doi: 10.1128/IAI.05307-11.

29. Hall-Stoodley, L., Costerton, J., Stoodley, P. (2004). Bacterialbiofilms: from the natural environment to infectious diseases. NatRevMicrobio l2, 95-108.

30. Huang, X. & Lindler, L. (2004).The pH 6 antigen is an antiphagocytic factor produced by Yersinia pestis independent of Yersinia outer proteins and capsule antigen. Infect. Immun. 72, 72127219, doi: 10.1128/IAI.72.12.7212-7219.2004.

31. Jackson, M. & Plano, G. (2000). Interactions between type III secretion apparatus components from Yersinia pestis detected using the yeast two-hybrid system. FEMS Microbiol Lett.186 (1):85 - 90, doi: 10.1111/j. 1574-6968.2000.tb09086.x.

32. Califf, K., Keim, P., Wagner, D., Sal, J. (2015). Redefining the differences in gene content between Yersinia pestis and Yersinia pseudotuberculosis using large-scale comparative genomics. Microb Genome.1 (2): e000028, doi: 10.1099/mgen.0.000028.

33. Kolodziejek, A., Sinclai, r D., Seo, K., Schnider, D., Deobald, C., Rohde, H., Viall, A., Minnich, S., Hovde, C., Minnich, S., Bohach, G. (2007). Phenotypic characterization of OmpX, an Ail homologue of Yersinia pestis KIM. Microbiology 153, 2941-2951

34. Kudryashev, M., Diepold, A., Amstutz, M. (2015). Yersinia enterocolitica type III secretion injectisomes form regularly spaced clusters, which incorporate new machines upon activation. Mol Microbiol. 95 (5):875-84, doi: 10.1111/mmi.12908.

35. Kumar, G., Menanteau-Ledouble, S., Saleh, M. et al. (2015). Yersinia ruckeri, the causative agent of enteric redmouth disease in fish. Vet Res 46, 103. https://doi.org/10.1186/s13567-015-0238-4.

36. Kukkonen M. & Korhonen T., (2004). The omptin family of enterobacterial surface proteases/adhesins: from housekeeping in Escherichia coli to systemic spread of Yersinia pestis. Int. J. Med. Microbiol. 294, 7-14, doi: 10.1016/j.ijmm. 2004.01.003.

37. Kirillina, O., Fetherston, J.D., Bobrov, A.G., Abney, J., and Perry, R.D. (2004). HmsP, a putative phosphodiesterase, and HmsT, a putative diguanylate cyclase, control Hms-dependent biofilm formation in Yersinia pestis. Mol Microbiol 54, 75-88.

38. Lambrecht, E., Bare, J., Van Damme, I., Bert, W., Sabbe, K., Houf, K. (2013). The behavior of Yersinia enterocolitica in the presence of bactericidal Acanthamoeba castellanii. App. Environment. Microbial. 79 6407-6413, doi: 10.1128/AEM.01915-13.

39. Leo, J. & Goldman, A. (2009).The immunoglobulin-binding Eib proteins fromEscherichia coliare receptors for IgG Fc. Mol. Immunol. 46, 1860-1866 doi: 10.1016/j.molimm.2009.02.024.

40. Logsdon, L. & Mecsas, J. Requirement of the Yersinia pseudotuberculosis effectors YopH and YopE in colonization and persistence in intestinal and lymph tissues. (2003). Infect Immun:4595-607. doi: 10.1128/IAI.71.8.4595-4607.2003.

41. Lorange, E.A., Race, B.L., Sebbane, F., and Joseph Hinnebusch, B. (2005). Poor vector competence of fleas and the evolution of hypervirulence in Yersinia pestis. J Infect Dis 191, 19071912.

42. Mikula, K., Kolodziejczyk, R., Goldman, A. (2013). Yersinia infection tools-characterization of structure and function of adhesins. Front Cell Infect Microbiol. 2:169, doi: 10.3389/fcimb.2012.00169.

43. Pan, N., Brady, M., Leong, J., Goguen, J., (2008).Targeting Type III Secretion in Yersinia pestis. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, doi: 10.1128/AAC.00670-08.

44. Paliy, G. (1995). Dictionary of microbiology, virology, immunology and infectious diseases. Vinnica.

45. Patel, C.N., Wortham, B.W., Lines, J.L., Fetherston, J.D., Perry, R.D., and Oliveira, M.A. (2006). Polyamines are essential for the formation of plague biofilm. J Bacteriol 188, 2355-2363.

46. Payne, D., Tatham, D., Williamson, E., Titball, R. (1998). The pH 6 antigen ofYersinia pestisbinds to beta1-linked galactosyl residues in glycosphingolipids. Infect. Immun. 66, 4545-4548, doi: 10.1128/iai.66.9.4545-4548.1998.

47. Pieper, R., Huang, S., Clark, D., Robinson, J., Alami, H., Parma, r P., Suh, M., Kuntumalla, S., C., Perry, R., Fleischmann, R., Peterson, S. (2009). Integral and peripheral association of proteins and protein complexes with Yersinia pestis inner and outer membranes. Proteome Sci. 7, 5, doi: 10.1186/1477-5956-7-5.

48. Rosqvist, R., Skurnyk, M., Wolf-Watz, H. (1988). Increased virulence of Yersinia pseudotuberculosis by two independent mutations. Nature. 334, 522-524, doi: 10.1038/334522a0.

49. Santos-Montanez, J., Benavides-Montano, J., Hinz, A., Vadyvaloo, V. (2015). Yersinia pseudotuberculosisIP32953 survives and replicates in trophozoites and persists in cysts of Acanthamoeba castellanii. (2015). FEMS Microbiology Letters. 362, doi: 10.1093/femsle/fnv091.

50. Simonet, M., Riot, B., Fortino, N., Bersh, P. (1996). Yersinia pestis invasin production is abolished by inserting an IS200-like element into the inv gene. To infect Immune. 64, 375-379.

51. Simm, R., Fetherston, J.D., Kader, A., Romling, U., and Perry, R.D. (2005). Phenotypic convergence mediated by GGDEF-domaincontaining proteins. J Bacteriol 187, 6816-6823.

52. Sjobring, U., Bjorck, L., Kastern, W. (1991).Streptococcal protein G. Gene structure and protein binding properties. J. Biol. Chem. 266, 399-405.

53. Sorg, I, Wagner, S, Amstutz, M. (2007). YscU recognizes translocators as export substrates of the Yersinia injectisome. EMBO J. 26 (12):3015-24, doi: 10.1038/sj.emboj.7601731.

54. Sun, Y.C., Hinnebusch, B.J., and Darby, C. (2008). Experimental evidence for negative selection in the evolution of a Yersinia pestis pseudogene. Proc Natl Acad Sci U S A 105, 80978101.

55. Sun, Y.C., Koumoutsi, A., and Darby, C. (2009). The response regulator PhoP negatively regulates Yersinia pseudotuberculosis and Yersinia pestis biofilms. FEMS Microbiol Lett 290, 8590.

56. Tae-Jong Kim, Briana M. Young, Glenn M. Young. (2008). Effect of Flagellar Mutations on Yersinia enterocolitica Biofilm Formation. ASM JournalsApplied and Environmental Microbiology Vol. 74, No. 17. DOI: https://doi.org/10.1128/AEM.00222-08

57. Tan, L., and Darby, C. (2005). Yersinia pestis is viable with endotoxin composed of only lipid А.J Bacteriol 187, 6599-6600.

58. Wagner, D., Klunk, J., Harbeck, M., Devault, A., Waglechner, N., Sahl, J., Enk, J., Birdsell, D., Kuch, M. (2014). Yersinia pestis and the plague of Justinian AD 541-543: a genomic analysis. Lancet Infect Dis, doi: 10.1016/S1473-3099 (13) 70323-2.

...

Подобные документы

  • Показники економічної ефективності зерновиробництва та їх методика визначення. Індексний аналіз валового збору зернових і зернобобових культур в гсоподарстві, кореляційний аналіз факторів врожайності зернових. Розвиток ринку зерна і зернопродуктів.

    курсовая работа [82,4 K], добавлен 01.02.2011

  • Еколого-гідрохімічна характеристика ставків. Визначення основних видів ставів. Характеристика впливу різноманітних факторів на рибопродуктивність ставів. Особливості основних об`єктів розведення ставкових рибних господарств України: короп, амур, карась.

    курсовая работа [1,3 M], добавлен 21.09.2010

  • Анамнез про життя тварини. Дослідження загального стану тварини. Визначення габітусу, дослідження волосяного покриву, шкіри, її похідних та підшкірної клітковини, видимих слизових оболонок, поверхневих лімфатичних вузлів, окремих органів і систем.

    курсовая работа [459,7 K], добавлен 24.01.2012

  • Породи і типи у свинарстві, нові підходи до годівлі в домашніх умовах. Розрахунок річної потреби в кормах для молодняку корів і свиней. Визначення потреби в земельній площі для виробництва кормів. Складання комбікормів і раціонів для різних видів тварин.

    курсовая работа [449,9 K], добавлен 07.12.2011

  • Особливості вирощування овочевих культур. Прогнозування та аналіз факторів, які впливають на урожайність картоплі. Суть методу аналітичного групування, кореляційного та індексного аналізу, взаємозв’язок між результативною та факторними ознаками.

    курсовая работа [1,2 M], добавлен 11.02.2011

  • Класифікації орних земель за придатністю ґрунтів для вирощування сільськогосподарських культур. Характеристика критеріїв, за якими здійснюються агровиробничі групування ґрунтів: генетична зближеність ґрунтів, ступінь виявлення негативних процесів.

    контрольная работа [48,9 K], добавлен 28.02.2012

  • Характеристика ТОВ Агрофірма "Зоря", Катеринопільського району, Черкаської області. Аналіз факторів, що формують урожайність культури. Підрахунок резервів збільшення виробництва ріпаку, заходи щодо їх використання. Вплив факторів на зміну валового збору.

    курсовая работа [56,4 K], добавлен 28.05.2012

  • Аналіз динаміки виробництва зерна на ЗАТ АПК "Саврань". Вплив факторів, що впливають на зміну валового збору і формулюють урожайність культури. Оперативний аналіз в галузях рослинництва. Резерви збільшення виробництва зерна та заходи щодо їх використання.

    курсовая работа [387,2 K], добавлен 28.05.2012

  • Огляд літературних джерел. Характеристика об’єкта досліджень. Природні та економічні умови виробництва. Статистичний аналіз урожайності кормових культур. Аналіз рівня та факторів урожайності методом аналітичного групування.

    курсовая работа [247,9 K], добавлен 16.08.2007

  • Аналіз посівних площ соняшнику. Динаміка урожайності соняшнику протягом 2000-2009 років. Аналіз валових зборів соняшника та факторів, які зумовлюють їх зміну. Шляхи підвищення урожайності та збільшення валових зборів даної сільськогосподарської культури.

    курсовая работа [57,8 K], добавлен 24.03.2011

  • Огляд методів визначення статі молодняку свійської птиці. Визначення статі добового молодняку птиці японським методом (вентсексинг). Визначення статі курчат за швидкістю росту оперення (федерсексинг). Порівняльний аналіз різних методів сексування курчат.

    курсовая работа [2,9 M], добавлен 14.04.2011

  • Організаційно-економічна характеристика СТОВ "Хлібороб". Аналіз виробництва продукції зернових і зернобобових культур за обсягом, асортиментом та якістю. Аналіз посівних площ та урожайності. Схема зовнішніх факторів, що впливають на виробництво продукції.

    курсовая работа [102,7 K], добавлен 10.10.2014

  • Аналіз розповсюдження бактерій р. Azotobacter у ґрунтах лісостепу України та виділення штамів з комплексом агрономічно цінних властивостей для застосування в сільському господарстві. Здатність штамів азотобактера до мобілізації мінеральних фосфатів.

    автореферат [72,2 K], добавлен 30.06.2012

  • Аналіз розвитку овочівництва в сучасній Україні сільського господарства. Дослідження ефективності та рівня продуктивності даної галузі, визначення значення її для економіки України. Розгляд галузевої та територіальної структури овочівництва країни.

    курсовая работа [1,3 M], добавлен 08.12.2013

  • Методи визначення якості м'яса свинини, забитої у господарстві. Аналіз динаміки надходження свинини у господарство за поточний рік. Дослідження продуктів забою свиней за органолептичними та фізико-хімічними показниками. Бактеріоскопічна оцінка проб м'яса.

    дипломная работа [522,0 K], добавлен 13.10.2010

  • Організаційно-економічна характеристика підприємства. Аналіз виконання плану виробництва і реалізації продукції та рівня ефективності використання виробничої потужності. Обгрунтування основних показників виробничої програми. Вплив факторів на неї.

    курсовая работа [81,7 K], добавлен 17.03.2015

  • Анамнез життя вівці. Визначення габітусу та дослідження волосяного покриву, шкіри, підшкірної клітковини, видимих слизових оболонок та поверхневих лімфатичних вузлів тварини. Функціональна діагностика стану серцево-судинної та дихальної систем вівці.

    реферат [271,9 K], добавлен 10.03.2012

  • Попереднє знайомство з твариною. Фізіологічні властивості шкіри. Дослідження серцево-судинної системи, дихання, органів травлення, сечової та нервової систем. Отримання сироватки крові. Визначення каротину в сироватці крові і його клінічне значення.

    курсовая работа [42,9 K], добавлен 11.02.2013

  • Аналіз рівня факторів продуктивності корів і валового виробництва молока методами аналітичного групування. Динаміка показників продуктивності молодняку методом укрупнення періодів, ковзної середньої, абсолютному приросту і способом найменших квадратів.

    курсовая работа [633,5 K], добавлен 18.04.2011

  • Застосування ґрунтових твердомірів різних конструкцій для визначення твердості ґрунту при обробці. Конструктивна схема твердоміру, принцип роботи та технологічні параметри. Розрахунок вузлів та деталей на міцність. Техніко-економічна оцінка пристрою.

    реферат [813,0 K], добавлен 19.05.2011

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.