Альфа-N-ацетилгалактозамінідаза та альфа-галактозидаза Аspergillus niger 185ш

Виділення і вивчення ферментних препаратів альфа-N-ацетилгалактозамінідази та альфа-галактозидази з Аspergillus niger. Вплив різних факторів на процес біосинтезу позаклітинних ферментів, їхні фізико-хімічні та каталітичні властивості, специфічність дії.

Рубрика Биология и естествознание
Вид автореферат
Язык украинский
Дата добавления 28.06.2014
Размер файла 360,2 K

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

Размещено на http://www.allbest.ru/

Національна академія наук України

Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного

УДК 577.152.32:577.151.5:582

Альфа--ацетилгалактозамінідаза та альфа-галактозидаза Аspergillus niger 185ш

03.00.07 -- мікробіологія

Автореферат

дисертації на здобуття наукового ступеня кандидата біологічних наук

Борзова Наталія Вікторівна

Київ 2003

Дисертацією є рукопис.

Робота виконана у відділі біохімії мікроорганізмів Інституту мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України

Науковий керівник: доктор біологічних наук, старший науковий співробітник, Варбанець Людмила Дмитрівна, Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України, завідувач відділу біохімії мікроорганізмів

Офіційні опоненти:

доктор біологічних наук, професор, Зайченко Олександр Максимович, Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України, завідувач лабораторії вторинних метаболітів мікроміцетів

доктор біологічних наук, професор, Костерін Сергій Олексійович, Інститут біохімії ім. О.В. Паладіна НАН України, завідувач відділом біохімії м'язів

Провідна установа: Одеський національний університет ім. І.І. Мечникова

Захист відбудеться "19" березня 2003 р. о 1000 годині на засіданні Спеціалізованої вченої ради Д 26.233.01 по захисту докторських дисертацій при Інституті мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України за адресою: 03143, м. Київ, вул. Заболотного, 154.

З дисертацією можна ознайомитись у бібліотеці Інституту мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України (03143, м. Київ, вул. Заболотного, 154).

Автореферат дисертації розіслано "_13_" лютого 2003 р.

Вчений секретар Спеціалізованої вченої ради, кандидат біологічних наук Пуріш Л.М.

ферментний ацетилгалактозамінідаза галактозидаза

ЗАГАЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА РОБОТИ

Актуальність проблеми. -N-ацетилгалактозамінідаза та -галактозидаза є ферментами, високоспецифічними щодо термінальних залишків -N-ацетилгалактозаміна та -D-галактози, які присутні в природних глікокон'югатах та синтетичних глікозидах. Ці властивості ферментів дозволяють використовувати їх у двох основних напрямках досліджень:

1) теоретичному -- для встановлення структури, а також для модифікації природних олігосахаридів, гліканів та глікокон'югатів;

2) практичному -- а) в зв'язку з можливістю їх використання в медицині для трансформації еритроцитів крові груп А(ІІ) та В(ІІІ) в уніфіковані за АВО-специфічністю еритроцити О-типу. За даними американських дослідників, економічний ефект від застосування такої трансформованої крові може складати 2-3 млрд доларів на рік. Такі універсальні еритроцити можна переливати без урахування групової приналежності реципієнтів, що є вкрай важливим в екстремальних ситуаціях; б) для лікування хвороб людини (Шиндлера та Фабрі), обумовлених спадковою відсутністю цих глікозидаз, що супроводжується порушеннями глікопротеїнового обміну; в) в ксенотрансплантації для пригнічення реакції антиген-антитіло шляхом інактивації -галактозних глікотопів під дією -галактозидази; г) в розробці тест-систем для діагностики СНІДу, оскільки в останні роки виявлено наявність -галактозних та -N-ацетилгалактозамінних епітопів у вірусу імунодефіциту людини; д) у харчовій промисловості: для одержання соєвого молока підвищеної якості, для переробки меласи з метою створення безвідходної технології одержання цукру.

На сьогодні відомо декілька джерел -галактозидази необхідної специфічності (-галактозидаза зелених бобів кави та продуценти родів Absidia, Mortierella, Streptomyces), однак досі не знайдено високопродуктивного та технологічно ефективного продуцента -N-ацетилгалактозамінідази. Описані у літературі продуценти мікробного походження Clostridium perfringens, Acremonium sp., Ruminococcus torques мають ряд серйозних недоліків, що робить їх непридатними до використання. З огляду на це, пошук нових, більш ефективних продуцентів високоспецифічних та стабільних -N-ацетилгалактозамінідази та -галактозидази лишається актуальним. Найбільш технологічними джерелами ферментів є мікроорганізми, завдяки їх високій швидкості розмноження та здатності до контрольованого синтезу біологічно активних речовин.

Зв'язок роботи з науковими програмами, планами, темами. Роботу виконано у відповідності з напрямком науково-дослідних робіт Інституту мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного в рамках проведення досліджень за темами: „Вивчення залежності біологічної активності глікополімерів мікробної клітини від фізико-хімічних та структурних особливостей. Розробка нових стратегій використання глікополімерів” (1998-2002 рр., № держ. Реєстр. 0198V008078, шифр теми за планом інституту 07.20), “Вивчити фізико-хімічні та біологічні властивості --ацетилгалактозамінідази” (2000 - 2001 рр., шифр теми за планом інституту 2.30.5.2), „Дослідження фізико-хімічних властивостей та субстратної специфічності -галактозидази та --ацетилгалактозамінідази активних штамів продуцентів мікроміцетів” (2002 р., шифр теми за планом інституту 2.30.5.2).

Мета і задачі дослідження. Метою досліджень було одержання високоочищених препаратів --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази, вивчення їх фізико-хімічних та каталітичних властивостей, субстратної специфічності для розробки основ практичного застосування цих ферментів.

Відповідно до поставленої мети задачами наших досліджень були:

пошук серед представників різних таксономічних груп високоефективних продуцентів --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази;

підвищення вихідної активності ферментів шляхом оптимізації умов культивування продуцента;

вивчення впливу індукторів різної хімічної природи на синтез та активність ферментів;

розробка методів одержання ферментів у гомогенному стані;

вивчення фізико-хімічних і каталітичних властивостей ферментного препарату, специфічності його дії;

дослідження функціональних груп у активному центрі ферменту.

Об'єктами дослідження були позаклітинні ферменти --ацетилгалактозамінідаза (-2-ацетамідо-2-дезокси--галактозид ацетамідо-дезоксигалактогідролаза -- КФ 3.2.1.49) та -галактозидаза (--галактозид галактогідролаза -- КФ 3.2.1.22) Aspergillus niger Thom (185ш).

Предметом дослідження було вивчення умов біосинтезу ферментів, вивчення їх фізико-хімічних властивостей, деяких каталітичних та кінетичних параметрів, специфічності дії.

Матеріали та методи дослідження. Задачі дослідження реалізувалися цілим комплексом засобів, які включали мікробіологічні, біохімічні, імунохімічні методи, а також методи ензимології, препаративної біохімії, хімічної та біохімічної кінетики.

Наукова новизна отриманих результатів.

1. Вперше виявлений штам A. niger, здатний одночасно синтезувати високоактивні -N-ацетилгалактозамінідазу та -галактозидазу. Розроблено наукові засади одерження високоочищеного ферментного препарату.

2. Вперше встановлено, що гуанідингідрокарбонат, нітроаміногуанізон саліцилового та диметиламінобензальдегідів, кооординаційні сполуки германію з янтарною та оксіетилімінодіоцтовою кислотами здатні активувати синтез досліджуваних ферментів на 50-200 %.

3. Встановлено, що оптимальними умовами для прояву --ацетилгалактозамінідазної та -галактозидазної активності є температура 60 оС, рН 3,5-4,1. Ферментний препарат стабільний в діапазоні рН від 3,0 до 7,0, при t від 0 до 20 оС.

4. Показана субодинична структура молекули ферменту, його молекулярна маса за даними гель-фільтрації на сефарозі 6В становить 430 кДа, за даними ДСН-ПААГ - 70 кДа. В молекулі наявні до 30% гідрофобних та 20% кислих амінокислот, а також присутній вуглеводний компонент, який представлений манозою, галактозою, глюкозаміном та двома неідентифікованими гексозамінами.

5. Встановлено, що каталітично активними групами ферментного препарату A. niger 185ш, які відповідають за прояв --ацетилгалактозамінідазної та -галактозидазної активності, є карбоксильна група С-кінцевої амінокислоти (можливо аспарагінової або глутамінової) та імідазольна група гістидину.

6. Вперше встановлено серологічну спорідненість між глікозидазами A. niger 185ш та Cladosporium cladosporioides 189.

7. Показано, що ферментний препарат є пірогенним (0,04 мг/кг ваги), але нетоксичним (500 мг/кг ваги).

Практичне значення одержаних результатів. Розробка ефективних методів виділення і очистки досліджуваних глікозидаз з метою одержання гомогенних препаратів ферментів, систематичне та комплексне дослідження їx фізико-хімічних та каталітичних властивостей дають можливість вирішити важливі та актуальні питання інженерної ензимології та біохімії грибних глікозидаз. Дослідження особливостей механізму дії -галактозидази та -N-ацетилгалактозамінідази на синтетичні та природні субстрати, зокрема складні глікокон'югати, що містять термінальні нередукуючі залишки -D-галактози та -N-ацетилгалактозаміну, які, зокрема, є групоспецифічними детермінантами еритроцитів А(ІІ) і В(ІІІ)-типу, відповідно, а також є основними глікотопами органотрансплантантів та вірусу СНІДу, є фундаментальною основою застосування високоспецифічних глікозидаз в медико-технологічних процесах, зокрема для створення універсальної донорської крові на основі біоконверсії еритроцитів типу А(ІІ) і В(ІІІ), розробці тест-систем для діагностики СНІДу, нейтралізації -галактозних глікотопів трансплантантів при ксенотрансплантації. Поряд з цим, встановлення зв'язку між специфічністю та механізмом дії досліджуваних глікозидаз, з одного боку, та будовою їx активних центрів, з іншого, дозволить встановити детермінанти активності біополімерів. Все це створює передумови для впровадження в Україні новітніх біотехнологій.

Особистий внесок здобувача. Робота виконана автором особисто у відділі біохімії мікроорганізмів Інституту мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України під керівництвом д.б.н., с.н.с. Л.Д.Варбанець.

Комплексоутворюючі похідні гуанідину та координаційні сполуки германію отримані від д.х.н., проф. І.І. Сейфулліної, к.х.н. С.В. Зубкова, аспірантів Е.Е. Марцинко, О.А. Батракової (Одеський національний університет ім. І.І. Мечнікова). В постановці деяких завдань та обговоренні їх результатів приймала участь к.б.н. В.М. Маланчук. Штами мікроорганізмів для скринінгу продуцентів --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази були надані співробітниками відділів промислових мікроорганізмів (к.б.н., с.н.с. С.С. Нагорною) і фізіології та систематики мікроміцетів (к.б.н., с.н.с. О.В. Соколовою, м.н.с. О.С. Харкевич, к.б.н., н.с. Т.І. Редчиць, к.б.н., н.с. О.Т. Школьним, д.б.н., проф. Н.М. Ждановою) ІМВ НАНУ.

Апробація результатів дисертації. Результати досліджень доповідались та обговорювались на конференціях експериментальних робіт Інституту мікробіології і вірусології НАН України (Київ, 1999, 2000, 2002 рр.), ІІ з'їзді Українського мікробіологічного товариства (Чернігів, 2000); на міжнародних конференціях „Микробиология и биотехнология на рубеже ХХI столетия” (Мінськ, 2000); ХХ Чугаєвській конференції по координаційній хімії (Ростов-на-Дону, 2001); XVI симпозіумі по глікокон'югатам (Гаага, 2001); 11 Європейському симпозіумі з вуглеводів Eurocarb XI (Лісабон, 2001); Міжнародній науково-практичній школі для молодих учених і спеціалістів „Природні екосистеми Карпат в умовах посиленого антропогенного впливу” (Ужгород, 2001), VІІІ Українському біохімічному з'їзді (Чернівці, 2002)

Публікації. За матеріалами дисертації опубліковано 10 наукових робіт, з них 5 статей (4 - у фахових виданнях) та 5 тез.

Структура та обсяг роботи. Дисертаційна робота викладена на 174 сторінках машинописного тексту і складається з розділів "Вступ", "Огляд літератури", "Матеріали та методи досліджень", "Результати досліджень та їх обговорення", "Заключення", "Висновки", "Список використаних джерел", який містить 225 посилань, в тому числі 178 іноземних авторів. Робота містить 2 схеми, 22 таблиці, 49 рисунків.

ЗМІСТ РОБОТИ

РОЗДІЛ 1. ОГЛЯД ЛІТЕРАТУРИ

Огляд літератури складається з 5-ти підрозділів, в яких висвітлені питання щодо поширення --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази у природі, їх біологічної ролі та особливостей біосинтезу. Охарактеризовані традиційні та сучасні підходи щодо виділення та очистки грибних глікозидаз, розглянуто фізико-хімічні властивості глікозидаз різного походження, їх субстратну специфічність. Наведені дані щодо вивчення функціональних груп активного центру ферментів з метою керування каталізом, висвітлено деякі аспекти їх практичного застосування.

РОЗДІЛ 2. МАТЕРІАЛИ ТА МЕТОДИ ДОСЛІДЖЕНЬ

Об'єктами дослідженнь були позаклітинні ферменти --ацетилгалактозамінідаза (-2-ацетамідо-2-дезокси--галактозид ацетамідо-дезоксигалактогідролаза -- КФ 3.2.1.49) та -галактозидаза (--галактозид галактогідролаза -- КФ 3.2.1.22) Aspergillus niger Thom (185ш).

Культивування мікроміцета здійснювали періодичним способом в умовах качалок (n=220 об/хв) при температурі 25 1 оС на середовищі такого складу (г/л): соєве борошно - 25,0; (NH4)2SO4 -0,8 (або пептон - 7,5); KH2PO4 - 2,0; CaCl2 - 0,3; MgSO4 7 H2O - 0,3.

Вивчення впливу різних сполук на синтез та активність ферментів здійснювали на адаптованому за джерелами азоту та вуглецю середовищі, досліджувані речовини вносили у концентраціях: природні сполуки (суха бичача кров, вуглеводи) -- 0,01-10 %; синтезовані речовини (похідні гуанідину, координаційні сполуки германію) -- 0,01 та 0,1 %.

При виявленні -галактозидазної активності з використанням природних субстратів кількість глюкози (еквівалентна кількості галактози), вивільненої внаслідок гідролізу мелібіози, визначали глюкозооксидазним методом (Білай, 1982); кількість галактози, що утворилась внаслідок гідролізу рафінози, - методом Somogyi (1952).

Інвертазну активність оцінювали за допомогою глюкозооксидазного методу (Білай, 1982). Визначення протеолітичної активності здійснювали за методом Ансона в модифікації Петрової (Петрова, 1966).

За одиницю активності -галактозидази та інших глікозидаз приймали таку кількість ферменту, яка каталізує гідроліз 1 мкмоля субстрату за хвилину в стандартних умовах досліду (температура 37 оC, рН 5,2).

Білок визначали за методом Lowry et al. (1951), вміст нуклеїнових кислот за методом Спірина (1958), вміст нейтральних цукрів за методом Dubois et al. (1955). Ідентифікацію нейтральних моносахаридів здійснювали методом газо-рідинної хроматографії на приборі “Chrom-5”, Чехія, препарати аналізували у вигляді ацетатів поліолів (Albersheim et al, 1976). Вміст амінокислот та гексозамінів визначали на аналізаторі амінокислот "Hitachi KLA-5" (Японія).

Для виділення та очистки --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази застосовували осадження (NH4)2SO4 при 30 % та 90% насичення, хроматографію на нейтральних (Toyopearl HW-60, “Toyo Soda”, Японія) та заряджених (Fractogel DEAE-650-s, "Merck", Німеччина) TSK-гелях та гель-фільтрацію на Sepharose 6B. Гомогенність ферментних препаратів визначали в системі ДСН-ПААГ за Laemmli (1970). Молекулярну масу в нативній системі оцінювали на Sepharose 6B (Andrews, 1964) з використанням білків-маркерів фірми "Pharmacia", Швеція: альдолази (158 кДа), каталази (232 кДа), ферітину (440 кДа) та тіроглобуліну (669 кДа)..

Максимальну швидкість реакції і константу Михаеліса визначали за методом Лайнуівера-Берка (Корниш-Боуден, 1979). Для ідентифікації функціональних груп активного центру застосовували метод інгібіторного аналізу з використанням аніонів, іонів металів та специфічних хімічних реагентів. Кінетичний аналіз даних по впливу іонів металів (Ag+ та Hg2+) та n-хлормеркурібензоату на -галактозидазну активність здійснювали за методами Діксона та Лайнуівера- Берка (Корниш-Боуден, 1979).

Пірогенність ферментного препарату A. niger 185ш визначали на кролях шляхом внутрішньовенного введення встановленої мінімальної пірогенної дози препарату з подальшою термометрією тварин протягом 3 год.

Токсичну дію препарату досліджували на мишах при внутрішньовенному та внутрішньочеревинному введенні.

Серологічну спорідненість між ферментними препаратами A. niger 185ш та C. cladosporioides 189 вивчали, застосовуючи метод подвійної імунодифузії в агарі за Оухтерлоні (1962).

Результати дослідів обробляли статистично з використанням критерію Ст'юдента.

РОЗДІЛ 3. СКРИНІНГ ПРОДУЦЕНТІВ --АЦЕТИЛГАЛАКТОЗАМІНІДАЗИ

В результаті скринінгу, який проводився серед 1514 штамів мікроорганізмів різних таксономічних груп (32 роди мікроміцетів, 14 родів дріжджів та 6 родів бактерій), встановлено, що фермент більш поширений серед мікроміцетів (20 % активних штамів) - представників родів Aspergillus, Fusarium, Penicillium (табл.1).

Таблиця 1

Скринінг продуцентів -N-ацетилгалактозамінідази

Рід*

Кількість досліджених штамів

Активні штами

Максимум активності, Е/мл

Абсолютна кількість

у %

МІКРОМІЦЕТИ

32 роди

986

Alternaria

12

0

0

0

Aspergillus

439

165

38

0,142

Eurotium

12

1

8,3

0,06

Fusarium

178

0

0

0

Penicillium

189

27

14

0,11

Trichoderma

39

0

0

0

ДРІЖДЖІ

14 родів

171

Candida

26

0

0

0

Kluyveromyces

28

0

0

0

Saccharomyces

38

0

0

0

БАКТЕРІЇ

6 родів

357

Arthrobacter

110

2

0,81

0,108

Pseudomonas

210

0

0

0

Примітка: * в таблиці представлені лише найбільш чисельні за дослідженими штамами роди

На підставі результатів щодо вивчення спектру глікозидазних активностей та здатності ферментів стабільно працювати у фізіологічних умовах (37 оС; рН 6,0, 7,0) для подальших досліджень було відібрано 4 штами A. niger , які характеризувалися найбільш високим рівнем --ацетилгалактозамінідазної (0,128 - 0,142 Е/мл) та -галактозидазної (0,45 - 0,66 Е/мл) активностей у культуральній рідині.

Цінною властивістю відібраних штамів слід вважати відсутність -фукозидазної активності, що виключає можливість інактивації Н-антигенів при використанні препаратів ферментів для біотрансформації еритроцитів крові.

РОЗДІЛ 4. ОПТИМІЗАЦІЯ УМОВ КУЛЬТИВУВАННЯ A. NIGER 185ш ДЛЯ СИНТЕЗУ --АЦЕТИЛГАЛАКТОЗАМІНІДАЗИ ТА -ГАЛАКТОЗИДАЗИ

Широкий спектр глікозидаз, які синтезуються грибними продуцентами, дозволяє отримувати з цього природнього джерела величезну кількість різноманітних за своїми властивостями та специфічністю дії ферментів, а також їх ізоформ. Оскільки відомо, що аспергіли є поліферментними продуцентами, то існує реальна можливість регуляції їх біосинтетичної активності фізіологічними факторами. Відомо, що одним із шляхів активації синтезу є оптимізація поживного середовища за мінеральними компонентами та джерелами вуглецевого та азотного живлення.

Було показано, що всі досліджені джерела вуглецю (в тій чи в іншій мірі) позитивно впливали на ріст культури, але лише кукурудзяне та соєве борошно сприяли синтезу --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази. Встановлено, що найбільш придатним джерелом вуглецю є саме соєве борошно в концентрації 25 г/л. Щодо джерел азоту показано, що оптимальним є вирощування культури на середовищі, що містить пептон у концентрації 7,5 г/л або сульфат амонію - 0,8 г/л. Також були встановлені оптимальні параметри культивування штаму-продуцента (25 оС, рН 6,0, Кs 16,76 мг О2/лгод, швидкість перемішування 220 об/хв). Максимальний рівень активності обох ферментів спостерігався на 6-8 добу культивування. В результаті оптимізації вдалося підвищити рівень активності позаклітинних --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази у культуральній рідині в 1,5 та 2 рази, відповідно.

РОЗДІЛ 5. ІНДУКЦІЯ СИНТЕЗУ ГЛІКОЗИДАЗ A. NIGER 185ш

Відомо, що концентрація деяких ферментів у клітині може суттєво змінюватися при варіюванні складу поживного середовища. Це в першу чергу стосується індуцибельних ферментів. Як правило такі ферменти присутні в клітині у слідових кількостях, однак їх концентрація може швидко зростати, якщо у середовищі з'являється відповідний субстрат. Деякі мікроорганізми мають здатність утворювати індуцибельні ферменти у відповідь на додавання найрізноманітніших речовин, як безпосередніх субстратів, так і взагалі нефізіологічних сполук. Наші дослідження дозволили виявити ряд природних та синтетичних речовин, здатних активувати біосинтез ферментів (рис.1). Це суха бичача кров, глюкоза, мальтоза та сахароза, гуанідин карбонат, нітроаміногуанізон саліцилового та диметиламінобензальдегідів, координаційні сполуки германію з янтарною та оксіетилімінодіоцтовою кислотами. Додавання цих сполук до середовища росту збільшувало секрецію --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази на 50 - 200 %.

Рис. 1 Індукуюча дія деяких сполук на секрецію -N-ацетилгалактозамінідази та -галактозидази культурою A. niger 185ш

Механізм індукуючої дії досліджених сполук ймовірно є різним. Активуючий вплив сухої бичачої крові обумовлений скоріш за все наявністю термінальних -зв'язаних -галактоз та -ацетилгалактозамінів у глікопротеїнах крові (Yomamoto, 1990). Дія похідних гуанідину може бути пов'язана як з активацією метаболізму клітини взагалі, так і з безпосередньою дією на активні центри ферментів. Спираючись на отримані дані можна припустити, що для індукції глікозидаз суттєвою є наявність саме гуанідинової групіровки, а положення, при якому одна з аміногруп вільна, а інша заміщена фенільним залишком, є вагомою для прояву --ацетилгалактозамінідазної та -галактозидазної активностей. Цікавим здається виявлений нами вперше активуючий вплив комплексів германію (ІV) з органічними кислотами на синтез та активність глікозидаз. Результати цих досліджень дозволяють зробити припущення про те, що ефективність цих сполук у більшій мірі пов'язана з присутністю іону германію, ніж його лігандів. Використання перерахованих сполук дозволило нам підвищити активність --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази у культуральній рідині майже у 3 рази (їх активність склала 0,6 та 2,2 Е/мл, відповідно).

РОЗДІЛ 6. ВИДІЛЕННЯ ТА ОЧИСТКА --АЦЕТИЛГАЛАКТОЗАМІНІДАЗИ ТА -ГАЛАКТОЗИДАЗИ A. NIGER 185ш

Для виділення та очистки ферментів з культуральної рідини A. niger 185ш були використані такі методи очистки: фракціонування сульфатом амонію, гель-фільтрацію та аніонообмінну хроматографію. Очистку здійснювали під контролем електрофорезу в ДСН-ПААГ.

Таким чином, був отриманий очищений в 600 разів, порівняно з культуральною рідиною, ферментний препарат, який проявляв лише --ацетилгалактозамінідазну та -галактозидазну активності (10,5 та 25 Е/мг білка, відповідно). В препараті були відсутні інвертазна та протеолітичні активності. Специфічна активність препарату відповідає рівню відомих на сьогодні продуцентів та промислових препаратів -галактозидази, але дещо поступається --ацетилгалактозамінідазі з печінки курчат (фірма "Sigma").

Таким чином, нами розроблені наукові засади одержання з A. niger 185ш конкурентноздатного препарату з -N-ацетилгалактозамінідазною та -галактозидазною активностями.

РОЗДІЛ 7. ХАРАКТЕРИСТИКА ФЕРМЕНТНОГО ПРЕПАРАТУ A. NIGER 185ш

Дослідження властивостей ферменту проводили на очищеному препараті, який був гомогенним за даними гель-фільтрації на сефарозі 6В, а його молекулярна маса складала 430 кДа. Молекулярна маса ферменту за даними електрофорезу в ДСН-ПААГ складала 70 кДа, що може свідчити про субодиничну структуру молекули. Це припущення також підтверджується даними досліджень щодо впливу денатуруючих агентів таких як сечовина та гуанідингідрохлорид. На сьогодні вже відомі грибні глікозидази олігомерної будови, хоча наявність високомолекулярних ферментів є більш характерною для бактеріальних продуцентів.

Ферментний препарат містить 20 % кислих та 30 % гідрофобних амінокислот, а також вуглеводний компонент, який представлений нейтральними (маноза, галактоза) та зарядженими (глюкозамін та 2 неідентифіковані гексозаміни) моносахаридами (рис.2).

Рис. 2 Амінокислотний та моносахаридний склад ферментного препарату A. niger 185ш

Термо- та рН-оптимуми гідролізу синтетичних субстратів п-нітрофеніл--ацетил---галактопіранозиду та п-нітрофеніл---галактопіранозиду ферментним препаратом A. niger 185ш знаходились при 60 оС та рН 3,5 і 4,1, відповідно. Однак у діапазоні значень від 3,0 до 6,0 спостерігалося до 70 % від максимальної активності. Фермент був стабільним у діапазоні рН від 3,0 до 7,0 та при 37 оС протягом 90 хв. Не спостерігали зменшення --ацетилгалактозамінідазної та -галактозидазної активностей препарату при зберіганні у 3 М розчині сульфату амонію протягом 2 років та ліофільно висушеного препарату - протягом 6 місяців (4 оС). Висока стабільність препарату ферменту може бути пов'язана як із значним вмістом гідрофобних амінокислот, так і з присутністю вуглеводного компонента.

Таблиця 2

Субстратна специфічність ферментних препаратів A. niger 185ш та C. cladosporioides 189

Субстрат

Структура

Препарат ферменту A. niger 185ш

Препарат ферменту C. cladosporioides 189

Vmax, мкмоль/хв/ мг білка

Кm, мМ

Vmax, мкмоль/хв/ мг білка

Кm, мМ

п-Нітрофеніл--Ас---галактозамінід

ГалАс 1-п-НФ

10,5

1,25

0

--

п-Нітрофеніл--Ас---галактозамінід

ГалАс 1-п-НФ

0

--

1,13

1,10

п-Нітрофеніл---галактозид

Гал 1-п-НФ

25

1,19

34

0,76

п-Нітрофеніл---галактозид

Гал 1-п-НФ

0

--

0

--

п-Нітрофеніл--Ас---глюкозамінід

ГлюАс 1-п-НФ

0

--

0

--

п-Нітрофеніл--Ас---глюкозамінід

ГлюАс 1-п-НФ

0

--

2,93

0,85

п-Нітрофеніл---глюкозид

Глю 1-п-НФ

0

--

0

--

п-Нітрофеніл---глюкозид

Глю 1-п-НФ

0

--

5,31

0,91

п-Нітрофеніл---фукозид

Фук 1-п-НФ

0

--

0

--

п-Нітрофеніл---ксилозид

Кси1-п-НФ

0

--

0

--

п-Нітрофеніл---манозид

Ман1-п-НФ

0

--

0

--

Мелібіоза

Гал1,6 Глюк

0

--

1,60

1,70

Рафіноза

Гал1,6Глю1,2Фру

0

--

3,30

2,20

Стахіоза

Гал1,6Гал1,6Глю1,2Фру

0

--

2,5

1,80

Таблиця 3

Деякі властивості глікозидаз A. niger 185ш та С.cladosporioides 189

Властивість

Ферментний препарат A. niger 185ш

-Галактозидаза С.cladosporioides 189

Молекулярна маса, кДа

430

70

400

66

Термооптимум гідролізу

синтетичного субстрату

60

50

рН-Оптимум гідролізу

синтетичного субстрату

3,5-4,1

5,0

рН-стабільність

3,0 -- 7,0

4,0 -- 7,0

Моносахаридний склад

галактоза, маноза, глюкозамін

арабіноза, рамноза маноза, глюкозамін

Вивчення каталітичних властивостей ферментного препарату показало, що відповідні синтетичні нітрофенільні субстрати конкурентно інгібують --ацетилгалактозамінідазну та -галактозидазну активності ферменту A. niger 185ш. Наші результати узгоджуються з аналогічними даними щодо більшості досліджених -галактозидаз. Відповідні дані щодо --ацетилгалактозамінідаз, на жаль, відсутні у літературі. Також було показано, що --ацетилгалактозамінідазна та -галактозидазна активності препарату A. niger 185ш конкурентно інгібуються продуктом реакції - -ацетилгалактозаміном та -галактозою, відповідно.

Ферментний препарат A. niger 185ш виявляв вузьку специфічність щодо глікону: серед багатьох глікозильних залишків він виявляв здатність відщеплюва2ти від нітрофенільного субстрату тільки -зв'язані -ацетилгалактозамін та -галактозу (Km 1,25 та 1,19 мМ, Vmax 10,5 та 25 мкмоль/хв/мг білка, відповідно). Препарат виявився також нездатним гідролізувати такі природні субстрати, як мелібіоза, рафіноза та стахіоза, які містять термінальну -1,6-зв'язану -галактозу (табл.2). Причиною цього, як нам здається, може бути нездатність ферменту або атакувати природний субстрат взагалі, або гідролізувати -1,6-зв'язки. За специфічністю дії глікозидаза A. niger 185ш значно відрізняється від -галактозидази C. cladosporioides 189, яка крім --галактозидів гідролізує --глюкозиди, а також нітрофенільні похідні аміноцукрів в -конфігурації, хоча дуже близька за своїми фізико-хімічними властивостями та компонентним складом молекули ферменту (табл.3).

РОЗДІЛ 8. ДОСЛІДЖЕННЯ ФУНКЦІОНАЛЬНИХ ГРУП В АКТИВНОМУ ЦЕНТРІ --АЦЕТИЛГАЛАКТОЗАМІНІДАЗИ ТА -ГАЛАКТОЗИДАЗИ

Хоча фізико-хімічні властивості глікозидаз досить добре вивчені, питання щодо специфічності їх дії ще не вирішене. Причиною цього є недостатнє вивчення механізму каталізу, що не дозволяє створити узагальнюючу концепцію дії цих ферментів та наблизитися до розшифровки їх специфічності. Важливим підходом до вирішення цієї проблеми є ідентифікація функціональних груп активного центру ферменту, який бере участь у каталізі. Однак цей підхід ускладнюється тим, що фізико-хімічні властивості групи, що ідентифікується, можуть суттєво змінюватися під дією близько розташованих до неї інших дисоціюючих груп молекули ферменту. Надійний висновок можна зробити лише у разі співпадання результатів, отриманих різними способами. Саме такий підхід і було використано у роботі.

Аналіз кінетичних кривих залежності швидкості -галактозидазної та --ацетилгалактозамінідазної реакції від величини рН дозволив встановити наявність двох груп, що іонізуються в активному центрі ферменту A. niger 185ш із значеннями рК 2,2 і 2,8 та 5,9 і 6,2, які відповідають карбоксильній групі С-кінцевої амінокислоти та імідазольній групі гістидину. Участь імідазольної групи гістидину та карбоксильної групи аспарагінової кислоти в реакції, що каталізується -галактозидазою показано для ферментів з насіння Vicia faba та манго, а також -галактозидаз C. cladosporioides, P. canescens. Присутність саме цих груп було підтверджено величинами знайденої теплоти іонізації (Н). Слід зазначити, що величина Н є важливим критерієм ідентифікації груп. Так деякі автори вважають, що достатньо встановити величину рК та теплоту іонізації групи, щоб однозначно визначитися з її хімічною природою (Edsall, 1958). Наявність імідазольної групи гістидину також була підтверджена нашими дослідами з фотоокислення в присутності метиленового синього. Нами спостерігалася фотоінактивація, яка зростала в часі та при зменшенні концентрації Н+-іонів у середовищі, що є характерним саме для цієї групи.

Для виявлення інших функціональних груп, що можуть впливати на каталіз, було застосовано інгібіторний аналіз --ацетилгалактозамінідазної та -галактозидазної реакції з застосуванням іонів металів та аніонів, а також специфічних хімічних агентів.

--ацетилгалактозамінідаза та -галактозидаза відносяться до групи ферментів, для яких присутність металу не є обов'язковою умовою прояву активності, але вона може впливати на конформацію молекули ферменту і робити активні центри більш доступними для субстрату, при цьому змінюватися можуть також групи, які знаходяться на великій відстані від активного центру. При вивченні впливу різних металів на активність ферментного препарату A. niger 185ш було показано, що досліджувані ефектори не виявляють значного впливу на його активність, крім декількох випадків. При цьому дія на --ацетилгалактозамінідазну та -галактозидазну активність суттєво відрізнялися. Так показана активація (в 2 рази) --ацетилгалактозамінідазної активності іонами германію на фоні значного зниження (на 50 %) -галактозидазної. Значне пригнічення -галактозидазної активності препарату спостерігалось також в присутності іонів срібла та ртуті. Аналогічні дані одержано для -галактозидаз з інших мікроміцетів: Cephalosporium acremonium, Absidia ramosa, A. awamori, в той час як інактивація --ацетилгалактозамінідази іонами ртуті відмічалася тільки у ферменту з Acremonium sp. Вважається, що інгібування ферментів іонами срібла та ртуті є наслідком їх взаємодії з сульфгідрильними, карбоксильними або імідазольними групами білка. Дослідження впливу на ферментативну активність препарату таких металозв'язуючих агентів, як ЕДТА, о-фенантролін, а також азид натрію, показало (табл.4), що вони не впливають на швидкість --ацетилгалактозамінідазної та -галактозидазної реакції. Ці результати дозволяють зробити висновок, що в каталізі, який здійснюється ферментом з A. niger 185ш не беруть участь групи, що містять атоми металів, а фермент є металонезалежним. Це узгоджується з літературними відомостями щодо -галактозидаз інших мікроорганізмів (Улезло, 1989). Виявились неактивними щодо ферментного препарату реагенти, які здатні відновлювати дисульфідні зв'язки (табл.4). Можливо, в молекулі ферменту відсутні дисульфідні групи, або ж вони глибоко занурені у білковій глобулі та недоступні впливу цих реагентів.

Таблиця 4

Вплив деяких хімічних реагентів на --ацетилгалактозамінідазну та -галактозидазну активність ферментного препарату A. niger 185ш

Реагент

Концентрація реагента, М

Залишкова активність, %

--ацетилгалактозамінідазна

-галактозидазна

Контроль

100

100

ЕДТА

10-3

90 4,2

85 4,0

п-хлормеркурібензоат

10-3

94 2,5

15 1,0

10-4

98 3,3

21 2,3

о-фенантролін

10-3

96 5,0

85 2,3

дитіотреїтол

10-3

100 5,0

105 3,4

L-цистеїн

10-3

108 5,3

95 4,8

-меркаптоетанол

10-3

100 5,0

96 4,5

азид натрію

10-3

90 4,5

100 5,2

арсеніт натрію

10-3

96 4,5

87 5,0

сульфіт натрію

10-3

65 2,3

40 4,1

Ag+

10-3

100 4,5

5 0,1

Hg+2

10-3

100 6,2

5 0,1

Дослідження дії інших специфічних хімічних агентів показало (табл.4), що -галактозидазна реакція інгібується п-хлормеркурібензоатом та вже згаданими іонами срібла і ртуті. Інгібування цими речовинами носило неконкурентний характер. Зважаючи на відсутність захисного ефекту -галактози на молекулу ферменту, а також на дані щодо кінетики реактивації тіоловими реагентами, можна припустити, що в молекулі ферменту, але не в його активному центрі, присутні SH-групи, які не беруть участі у каталітичному акті, але важливі для прояву -галактозидазної активності, оскільки виконують функцію додаткових зв'язків, необхідних для орієнтації і зв'язування потрібним чином молекули субстрату з активним центром ферменту, обумовлюючи тим самим специфічність дії -галактозидази. Слід відмітити, що на --ацетилгалактозамінідазну активність ці реагенти не впливають. Як -галактозидазна, так і --ацетилгалактозамінідазна активності інгібувалися сульфітом натрію, який, як відомо, також є специфічним агентом щодо SH-груп. Відомо, що для сполук, які містять близько розташовані SH-групи (дитіоли), характерна висока спорідненість до арсеніту натрію, в результаті чого утворюються циклічні дитіоарсеніти. Було показано, що в концентрації 10-3 М арсеніт лише в дуже незначній мірі впливав на активність ферментів (табл. 4). Цей факт дозволяє припустити, що у найближчому оточені SH-групи, важливої для прояву активності -галактозидази, відсутні сусідні сульфгідрильні групи.

Таким чином, наші результати дають підстави вважати, що каталітично активними групами у ферменті A. niger 185ш є карбоксильна група С-кінцевої амінокислоти (можливо аспарагінової або глутамінової) та імідазольна група гістидину. Також на деякій відстані від активного центру можуть розташовуватися сульфгідрильні групи, які не беруть безпосередньої участі у каталізі, але необхідні для прояву -галактозидазної активності ферментного препарату A. niger 185ш. В той же час, вони є несуттєвими для --ацетилгалактозамінідазної реакції.

РОЗДІЛ 9. ВИЗНАЧЕННЯ ТОКСИЧНОСТІ ТА ПІРОГЕННОСТІ ПРЕПАРАТУ A. NIGER 185ш

Оскільки ферментний препарат A. niger 185ш може знайти використання у медико-технологічних процесах, доречним було дослідити його токсичність та пірогенність. При внутрішньочеревинному та внутрішньовенному введенні піддослідним тваринам препарату ферменту в концентрації 5, 50, 250 та 500 мг/кг ваги препарат не виявляв токсичного ефекту. Визначення пірогенної дії ферментного препарату A. niger 185ш проводили на кролях. Результати термометрії показали (рис.4), що підвищення температури у експериментальних тварин більше ніж на 0,45 оС виникало при введенні 100 мкг препарату/кроля в непірогенному ізотонічному розчині. Таке збільшення виходить за межі фізіологічної норми здорової тварини. У літературі відсутні дані щодо пірогенної дії -галактозидаз та --ацетилгалактозамінідаз з інших джерел. Виявлений нами пірогенний ефект потребує більш детального дослідження в перспективі подальшого впровадження ферменту в медичну практику.

Рис. 3 Пірогенна дія ферментного препарату A. niger 185ш

РОЗДІЛ 10. ВИЗНАЧЕННЯ СЕРОЛОГІЧНОЇ СПОРІДНЕНОСТІ ГРИБНИХ ГЛІКОЗИДАХ

Для встановлення серологічних зв'язків між глікозидазами, ізольованими з різних продуцентів (A. niger 185ш та C. cladosporioides 189), була одержана антисироватка до ферментного препарату A. niger 185ш і в реакції подвійної імунодифузії в агарі за Оухтерлоні було показано серологічну спорідненість між ферментами A. niger 185ш та C. cladosporioides 189.

Результати досліджень з сироваткою, виснаженою -галактозидазою C. cladosporioides 189 (рис.6), показали, що така сироватка серологічно інертна щодо препарату A. niger 185ш.

Ці дослідження дозволяють припустити, що одержаний нами препарат представлений лише одним ферментом, який проявляє --ацетилгалактозамінідазну та -галактозидазну активності.

ВИСНОВКИ

В результаті скринінгу серед 1514 культур мікроорганізмів -- представників 32 родів мікроміцетів, 14 родів дріжджів та 6 родів бактерій, --ацетилгалактозамінідазна активність була виявлена у штамів, що належали до родів Aspergillus, Eurotium, Penicillium та Arthrobacter. Відібрано штам Aspergillus niger 185ш, який відрізнявся високим рівнем активності --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази (0,142 та 0,7 Е/мл, відповідно).

Внаслідок оптимізації умов культивування штаму Aspergillus niger 185ш вдалося підвищіти рівень активності --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази в культуральній рідині в 1,5 та 2,0 рази, відповідно.

Вперше встановлено, що ряд природних (суха бичача кров, глюкоза, мальтоза, сахароза) та синтетичних (гуанідин карбонат, нітроаміногуанізон саліцилового та диметиламінобензальдегідів, координаційні сполуки германію з янтарною та оксіетилімінодіоцтовою кислотами) речовин здатні активувати синтез --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази на 50 - 200 %.

Розроблено методи виділення з культуральної рідини та очистки ферментного препарату, які включають фракціонування сульфатом амонію, аніонообмінну та гель-фільтрацію на TSK-гелях. Питома --ацетилгалактозамінідазна та -галактозидазна активність очищеного в 600 разів препарату складає 10,5 та 25 Е/мг білка, відповідно.

Встановлено, що оптимальними умовами для гідролізу відповідних синтетичних субстратів ферментним препаратом є значення рН 3,5-4,1, температури 60 оС. Ферментний препарат стабільний при t від 0 до 20 оС в діапазоні рН від 3,0 до 7,0. Показана субодинична структура молекули ферменту, його молекулярна маса за даними гель-фільтрації на сефарозі 6В становить 430 кДа, за даними ДСН-ПААГ - 70 кДа. В молекулі ферменту переважають кислі (20 %) та гідрофобні (30 %) амінокислоти, а також присутній вуглеводний компонент, представлений манозою, галактозою, глюкозаміном та двома неідентифікованими гексозамінами.

Встановлено, що ферментний препарат A. niger 185ш проявляє вузьку специфічність відносно глікону.

Показано, що фермент A. niger 185ш є металонезалежним, в його молекулі відсутні іони металів. Досліджені іони металів не впливали на ферментативну активність препарату, за винятком іонів Ge4+, який мав активуючу дію щодо --ацетилгалактозамінідази, але одночасно інгібував -галактозидазну активність.

Встановлено, що каталітично активними групами ферментного препарату A. niger 185ш, які відповідають за прояв --ацетилгалактозамінідазної та -галактозидазної активності, є карбоксильна група С-кінцевої амінокислоти (можливо аспарагінової або глутамінової) та імідазольна група гістидину. Виявлено наявність поза активним центром ферменту SH-груп, важливих для прояву -галактозидазної активності, але не суттєвих для --ацетилгалактозамінідазної.

Вперше встановлено серологічну спорідненість між глікозидазами A. niger 185ш та C. cladosporioides 189.

Показано, що препарат ферменту є нетоксичним (500 мг/кг ваги), але пірогенним (0,04 мг/кг ваги).

Одержання високоактивного ферментного перпарату з --ацетилгалактозамінідазною та -галактозидазною активностями та дослідження його властивостей створює передумови для впровадження в Україні новітніх медичних біотехнологій.

СПИСОК РОБІТ, ОПУБЛІКОВАНИХ ЗА ТЕМОЮ ДИСЕРТАЦІЇ

1. Борзова Н.В., Маланчук В.М., Варбанец Л.Д., Школьный А.Т., Соколова Е.В., Харкевич Е.С., Жданова Н.Н., Нагорная С.С. Скрининг продуцентов --ацетилгалактозаминидазы среди микроорганизмов различных таксономических групп // Мікробіол. журн. - 2000.- 62, №5. - С.3-13.

2. Борзова Н.В., Маланчук В.М., Варбанец Л.Д., Сейфуллина И.И., Зубков С.В. Оптимизация условий культивирования Aspergillus niger для синтеза --ацетилгалактозаминидазы и -галактозидазы // Мікробіол. журн. - 2001.- 63, № 4. - С.27-36.

3. Борзова Н.В. Вплив деяких цукрів на синтез -N-ацетилгалактозамінідази та -галактозидази Aspergillus niger // Науковий вісник Ужгородського університету. - Серія “Біологія” - № 10. -Ужгород, 2001. - С. 130-132.

4. Сейфуллина И.И., Марцинко Е.Э., Батракова О.Л., Борзова Н.В., Иванко Е.В., Варбанец Л.Д. Влияние координационных соединений германия на синтез и активность ферментов // Мікробіол. журн. - 2002. - 64, №4. - С. 3-11.

5. Борзова Н.В., Варбанец Л.Д., Маланчук В.М., Школьный А.Т., Жданова Н.Н. Грибная --ацетилгалактозаминидаза // Материалы международной конференции “Микробиология и биотехнология на рубеже XXI столетия” (Мінськ, 1-2 червня 2000) -Тез. доп.: Минск, 2000. - С.106-107.

6. Борзова Н.В., Маланчук В.М., Варбанец Л.Д., Сейфуллина И.И., Зубков С.В. Производные гуанидина - индукторы синтеза --ацетилгалактозаминидазы и -галактозидазы // Бюллетень інс-ту сільсько-господарської мікробіології - Чернігів - 2000. -№ 7. - С.26-27.

7. Сейфуллина И.И., Марцинко Е.Э., Батракова О.Л., Борзова Н.В., Иванко Е.В., Варбанец Л.Д. Координационные соединения германия как эффекторы синтеза и активности ферментов // Материалы XX международной Чугаевской конференции по координационной химии (Ростов-на-Дону, 25-29 червня 2001г.)- Тез.доп.: Ростов-на-Дону, - 2001. - С. 401.

8. Borzova N.V., Varbanets L.D., Seifullina I.I., Zubkov S.V. -Galactosidase and -N-acetylgalactosaminidase of Aspergillus niger // Glycoconjugate J. - XVI International Symposium on Glycoconjugates: Proc. (Hague, Netherlands, 19-24 August, 2001). -2001. - V. 18, № 1/2. - P. 108.

9. Borzova N.V., Malanchuk V.M., Varbanets L.D. The studies of functional groups of fungal -galactosidases active center // 11th European carbohydrate symposium Eurocarb XI - Proc. (Lisboa, Portugal, 2-7 September, 2001) - Lisboa, 2001. - P. 385.

10. Борзова Н.В., Варбанец Л.Д. Выделение и характеристика грибных гликозидаз -- -N-ацетилгалактозаминидазы и -галактозидазы //Укр. біохім. журн. - 2002. - 74, № 4б. - Матеріали VIII Українського Біохімічного з'їзду (Чернівці, 2002) - С.151.

АНОТАЦІЇ

Борзова Н.В. -N-ацетилгалактозамінідаза та -галактозидаза Aspergillus niger 185ш. - Рукопис.

Дисертація на здобуття наукового ступеня кандидата біологічних наук за спеціальністю 03.00.07 - мікробіологія. - Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України, Київ, 2003.

Дисертація присвячена виділенню та дослідженню ферментного препарату з --ацетилгалактозамінідазною та -галактозидазною активностями. Штам-продуцент A. niger 185ш було відібрано в результаті поетапного скринінгу серед 1514 культур мікроміцетів, бактерій та дріжджів. Було вивчено трофічні потреби продуцента та вплив різних факторів на процес біосинтезу позаклітинних --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази. Були виявлені ряд природних (суха бичача кров, глюкоза, мальтоза та сахароза) та синтетичних (гуанідин карбонат, нітроаміногуанізон саліцилового та диметиламінобензальдегідів, координаційні сполуки германію з янтарною та оксіетилімінодіоцтовою кислотами) речовин, здатних спричиняти активуючий вплив на біосинтез ферментів. Додавання цих сполук до середовища росту збільшувало секрецію --ацетилгалактозамінідази та -галактозидази на 50 - 200 %. Здійснена очистка в 600 разів та отримано ферментний препарат з -галактозидазною та --ацетилгалактозамінідазною активностями 25 та 10,5 Е/мг білка, відповідно. Були досліджені фізико-хімічні та каталітичні властивості ферменту, специфічність його дії. Встановлено, що препарат характеризується високим вмістом гідрофобних та кислих амінокислот, а також присутністю манози, галактози, глюкозаміну та двох неідентифікованих гексозамінів в його вуглеводному компоненті. Фермент проявляє вузьку специфічність щодо глікону. --ацетилгалактозамінідазна та -галактозидазна активності препарату A. niger 185ш інгібуються відповідними синтетичними субстратами та продуктами реакції: -ацетилгалактозаміном та -галактозою. Молекула ферменту не містить атомів металу. --Ацетилгалактозамінідазна реакція активується іонами германію (ІV) на фоні пригнічення -галактозидазної активності ферменту. Показано, що в активному центрі глікозидази присутні карбоксильна група С-кінцевої амінокислоти та імідазольна група гістидину. Сульфгідрильні групи не беруть участі у каталізі, але відіграють важливу роль у підтриманні активної конформації білкової молекули. Препарат ферменту був нетоксичним, але проявляв пірогенні властивості. Встановлено серологічну спорідненість між ферментом A. niger та -галактозидазою С. cladosporioides.

Ключові слова: --ацетилгалактозамінідаза, -галактозидаза, Aspergillus niger, очистка, фізико-хімічні властивості, каталітична активність.

Борзова Н.В. -N-ацетилгалактозаминидаза и -галактозидаза Aspergillus niger 185ш. - Рукопись.

Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.00.07 - микробиология. - Институт микробиологии и вирусологии им. Д.К. Заболотного НАН Украины, Киев, 2003.

Диссертация посвящена выделению и исследованию ферментного препарата с --ацетилгалактозаминидазной и -галактозидазной активностями. Штамм-продуцент A. niger 185ш был получен в результате поэтапного скрининга, проведенного среди 1514 культур микромицетов, бактерий и дрожжей. Выделенный продуцент A. niger 185ш характеризовался наиболее высоким уровнем --ацетилгалактозаминидазной и -галактозидазной активности в культуральной жидкости, а также отсутствием -фукозидазной активности. Для увеличения выхода ферментов были изучены трофические свойства продуцента, а также исследовано влияние различных факторов на процесс биосинтеза --ацетилгалактозаминидазы и -галактозидазы. Были выявлены ряд природных (сухая бычья кровь, глюкоза, мальтоза, сахароза) и синтетических (гуанидин карбонат, нитроаминогуанизон салицилового и диметиламинобензальдегидов, координационные соединения германия с янтарной и оксиэтилиминодиуксусной кислотами) веществ, способных оказывать активирующий эффект на продукцию ферментов культурой A. niger 185ш. Было показано, что внесение этих соединений в среду роста увеличивало секрецию искомых гликозидаз на 50-200 %. Для получения высокоочищенного препарата были использованы методы препаративной биохимии: фракционирование сульфатом аммония (30 и 90 % насыщения), гель-фильтрация и анионообменная хроматография на TSK-гелях, рехроматография на сефарозе 6В. В результате получили очищенный в 600 раз с выходом 28 % ферментный препарат, удельная --ацетилгалактозаминидазная активность которого составила 10,5 Е/мг белка, а -галактозидазная - 25 Е/мг белка. Препарат был гомогенным: по данным гель-фильтрации на сефарозе 6В его молекулярная маса составила 430 кДа, ДСН-ПААГ - 70 кДа, что даёт основание предположить олигомерное строение молекулы фермента. Установлено, что молекула фермента характеризуется высоким содержанием гидрофобных (около 30 %) и кислых (20 %) аминокислот. В препарате также отмечено присутствие углеводного компонента (около 10 %), который представлен незаряженными (манноза, галактоза) и заряженными (глюкозамин, два неидентифицированых гексозамина) моносахаридами. Термо- и рН-оптимумы гидролиза ферментом нитрофенильных субстратов находились при 60о С и рН 3,5-4,1. Препарат стабилен в диапазоне температур 0о-20о С, рН - 3,0-7,0, устойчив при хранении. Ферментный препарат проявляет узкую специфичность относительно гликона. --ацетилгалактозаминидазная и -галактозидазная активности препарата A. niger 185ш ингибируются соответствующими синтетическими субстратами и продуктами реакции: -ацетилгалактозамином и -галактозой. Изученная гликозидаза является металлонезависимым ферментом, молекула которого не содержит атомов металла. Показано, что --ацетилгалактозаминидазная реакция активируется ионами германия (ІV) на фоне уменьшения -галактозидазной активности фермента. В активном центре молекулы фермента присутствует карбоксильная группа С-концевой аминокислоты (возможно аспарагиновой или глутаминовой) и имидазольная группа гистидина. Вблизи активного центра присутствуют сульфгидрильные группы, которые, хотя и не участвуют в катализе, однако играют важную роль в поддержании активной конформации молекулы фермента, обеспечивая проявление -галактозидазной активности. Показано, что препарат фермента нетоксичный (500 мг/кг), однако пирогенный (0,04 мг/кг). Установлено серологическое сродство между ферментом A. niger и -галактозидазой С. cladosporioides.

Ключевые слова: --ацетилгалактозаминидаза, -галактозидаза, Aspergillus niger, очистка, физико-химические свойства, каталитическая активность.

Borzova N.V. -N-acetylgalactosaminidase and -galactosidase of Aspergillus niger 185ш. - Manuscript.

The thesis for a candidate's degree by speciality 03.00.07 - microbiology.- Institute of microbiology and virology named D.K. Zabolotny of National Academy of Sciences of Ukraine, Kiev, 2003.

The thesis is focused on the isolation and investigation of enzyme with --acetylgalactosaminidase and -galactosidase activity. The screening for --acetylgalactosaminidase among 1514 cultures of micromycetes, yeast and bacteria permit to select strain-producer A. niger 185ш. Its trophic characteristics examined and different factors for their effect on the process of biosynthesis of extracellular --acetylgalactosaminidase and -galactosidase have been investigated. A number of natural (dry bovine blood, glucose, maltose and sucrose) and synthetic (guanidine carbonate, nitroaminoguanizone dimethylbenzaldehyde and nitroaminoguanizone salicilic aldehyde, germanium complexes with succinic and oxyethyliminodiacetic acids) agents possess increasable effect on synthesis of the above mentioned enzymes (50-200 %). The enzyme was purified about 600-fold, activity of --acetylgalactosaminidase and -galactosidase in enzyme preparation were 10,5 and 25 U/mg protein, respectively. The molecular weight of the enzyme was estimated to be 430 kDa and 70 kDa by gel filtration and SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, respectively. Enzyme preparation including high content of the dicarbonic and hydrophobic aminoacids and carbohydrate component, containing the mannose, galactose, glucosamine and two nonidentified hexosamines. Enzyme was found to exhibit strict specificity towards the glycon. --acetylgalactosaminidase and -galactosidase activity of A. niger enzyme was inhibited by corresponding synthetic substrates and reaction products - -acetylgalactosamine and -galactose. There are absent groups containing the atoms of metals in the enzyme molecule. Glycosidase active center appears to contain the carboxyl group and imidazole histidine group. Sulfhydryl groups are not involved in the catalysis; however, it's possible they may play essential role in supporting the active conformation of the protein molecule. Preparation of enzyme was nontoxic, but pyrogenic. Serological relationship between A. niger enzyme and C. cladosporioides -galactosidase was found.

...

Подобные документы

  • Історія дослідження і вивчення ферментів. Структура і механізм дії ферментів. Крива насичення хімічної реакції (рівняння Міхаеліса-Ментен). Функції, класифікація та локалізація ферментів у клітині. Створення нових ферментів, що прискорюють реакції.

    реферат [344,3 K], добавлен 17.11.2010

  • Основные свойства антигенов: антигенность, специфичность и иммуногенность. Биополимеры гистосовместимости: гликопротеиды, альфа- и бета-цепь. Природа опухольассоциируемых ангитенов: вирусные, эмбриональные, нормальные гиперэкспрессируемые и мутантные.

    презентация [1,1 M], добавлен 14.04.2014

  • Особливості та основні способи іммобілізації. Характеристика носіїв іммобілізованих ферментів та клітин мікроорганізмів, сфери їх застосування. Принципи роботи ферментних і клітинних біосенсорів, їх використання для визначення концентрації різних сполук.

    реферат [398,4 K], добавлен 02.10.2013

  • Опытное получение излучения в результате бомбардировки бериллия альфа-частицами в ходе физических экспериментов. Оценка его энергии супругами Кюри. Предположения Дж. Чедвика. Характеристики выделенной частицы, которая получила название нейтрона.

    презентация [435,9 K], добавлен 05.01.2015

  • Процеси утворення іонів з нейтральних атомів або молекул. Альфа-випромінювання, бета-випромінювання, гамма-випромінювання. Джерела зовнішнього опромінення. Внутрішнє опромінення людини. Ступінь впливу іонізуючих випромінювань на живий організм.

    презентация [228,4 K], добавлен 28.10.2013

  • Структура цитоплазматической мембраны бактерии. Анализ функций клетки: деление, биосинтез ряда компонентов, хемо и фотосинтез. Трансмембранный фрагмент белка как альфа-спираль. Транспорт веществ в бактерии: пассивный, активный транслокация групп.

    презентация [812,1 K], добавлен 17.11.2013

  • Обедненный уран (U238) в окружающей среде. Пути поступления U238 в организм человека. Мероприятия, ограничивающие накопление U238 в сельскохозяйственных культурах. Плазменно-эмиссионный и альфа-спектрометрический метод определения урана в растениях.

    дипломная работа [6,6 M], добавлен 14.05.2011

  • Фізико-хімічні, біологічні, фармакологічні властивості і застосування металів нанорозмірів. Методи отримання та характеристика наночастинок золота, їх взаємодія з білками, з бактеріальними клітинами; вплив на ферментативну активність пухлинних клітин.

    презентация [362,3 K], добавлен 20.09.2013

  • Характеристика основных экологических групп грибов и оценка влияния экологических условий на рост микромицетов. Особенности использования микроскопическими грибами источников углерода, исследование роста Aspergillus на различных источниках углерода.

    дипломная работа [1,5 M], добавлен 11.09.2010

  • Процеси, які підтримують постійний зв'язок організму з навколишнім середовищем. Основні процеси біосинтезу. Властивості генетичного коду. Синтез поліпептидних ланцюгів білків по матриці іРНК. Найважливіші органічні речовини в організмі рослин і тварин.

    презентация [1,1 M], добавлен 14.03.2013

  • Розвиток еволюційного вчення і еволюція людини. Властивості популяції як біологічної системи. Закономірності існування популяцій людини. Вплив елементарних еволюційних факторів на генофонд людських популяцій. Демографічні процеси в популяціях людини.

    дипломная работа [106,9 K], добавлен 06.09.2010

  • Основні джерела антропогенного забруднення довкілля. Вплив важких металів на фізіолого-біохімічні процеси рослин, зміни в них за впливу полютантів. Структура та властивості, функції глутатіон-залежних ферментів в насінні представників роду Acer L.

    дипломная работа [950,6 K], добавлен 11.03.2015

  • Гідробіонти як переважно первинноводні тварини, які все життя проводять у воді. Вплив середовища існування на гідробіонтів: температури, прозорості води, газового режиму водоймища, вуглекислого газу, водневого показника (рН), різних речовин, організмів.

    курсовая работа [27,0 K], добавлен 28.10.2010

  • Будова, фізичні та хімічні властивості білків. Для виявлення білків у різних матеріалах застосовують кольорові реакції, найважливішими з яких є ксантопротеїнова і біуретова. Елементарний склад, молекулярна маса білків. Застосування білків у промисловості.

    реферат [296,8 K], добавлен 09.11.2010

  • Важкі метали в навколишньому середовищі. Їх хімічні властивості і роль для живої природи. Вплив важких металів на ріст і розвиток рослин. Важкі метали - забруднювачі навколишнього середовища. Межі витривалості навантаження важкими металами.

    реферат [28,7 K], добавлен 31.03.2007

  • Гістамін: історія вивчення, властивості, структура, шляхи синтезу і вивільнення. Активність супероксиддисмутази, каталази, глутатіонпероксидази у нирках інтактних тварин. Зміна активності у нирках щура за дії гістаміну у концентраціях 1 та 8 мкг/кг.

    курсовая работа [1,5 M], добавлен 20.07.2014

  • Антиоксидантна система як захист проти вільних радикалів. Гістамін:історія вивчення, структура, шляхи синтезу і вивільнення. Визначення активності супероксиддисмутази, каталази, глутатіонпероксидази, вплив на неї наявності гістаміну в нирці щура.

    курсовая работа [1,7 M], добавлен 22.06.2014

  • Вплив внутрішніх та зовнішніх факторів на характер геоботанічного районування, конфігурація і структура ареалу. Фізико-географічне районування України. Біоценотична класифікація, картографування та районування за аналогічними та гомологічними ознаками.

    курсовая работа [44,6 K], добавлен 21.09.2010

  • Поняття та відмінні особливості біосфери, чисельність різних груп організмів в ній. Структура і розподіл життя у біосфері, три групи життєзабезпечуючих факторів. Геохімічна робота живої речовини та її властивості. Функції живої речовини в біосфері.

    реферат [452,7 K], добавлен 22.11.2010

  • Біологічне значення процесів виділення. Анатомічна будова, структурна і функціональна одиниця нирки. Фільтраційно-реабсорбційна теорія утворення сечі нирками, механізм канальцевої реабсорбції та виведення сечі. Гормональна регуляція діяльності нирок.

    реферат [14,5 K], добавлен 29.11.2009

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.