Повышение качества и точности противоэпидемической ситуации с применением комбинированной имитационной модели на основе стохастической компартментной модели и клеточного автомата
Использование комбинированной имитационной модели на основе стохастических компартментных моделей и клеточных автоматов. Необходимость исследования динамических свойств разработанной модели для качественной и количественной оценки её адекватности.
Рубрика | Биология и естествознание |
Вид | статья |
Язык | русский |
Дата добавления | 29.06.2017 |
Размер файла | 263,4 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
Повышение качества и точности противоэпидемической ситуации
с применением комбинированной имитационной модели на основе стохастической компартментной модели и клеточного автомата
М.М. Башабшех
Введение
Актуальность разработки проблемно-ориентированных систем управления ограничением эпидемических заболеваний не вызывает сомнения. Важнейшим инструментом изучения этих систем являются адекватные математические модели прогнозирования пространственного распространения эпидемий. К настоящему времени создано значительное количество таких теоретически обоснованных моделей, опирающихся на сложный математический аппарат. К общему недостатку этих моделей относят трудность применения для создания карт пространственно-временного распространения эпидемических заболеваний с учётом сложной формы географических объектов и других пространственно-определённых факторов [1].
Существующие модели распространения эпидемических заболеваний (на примере холеры) на основе компартментных моделей в условиях реализации мероприятий по активному выявлению заболевших, использующих допущение глобального перемешивания в популяции с непрерывной пространственной структурой. Модель динамики передачи холеры [2, 3], которые описывают с четырьмя состояниями для популяции и двумя состояниями для холерных вибрионов: восприимчивых к заболеванию (S); инфекционный симптоматический (Is); инфекционный бессимптомный (Ia); восстановленный (R); высоко-инфекционных холерных вибрионов (); низко-инфекционных холерных вибрионов () [4].
Предложенная модель и сравнительный анализ на основе клеточного автомата
Предлагаемая модель состоит в использовании комбинированной имитационной модели на основе стохастических компартментных моделей и клеточных автоматов. Модель представляет собой вероятностный клеточный автомат, каждая ячейка которого представляет собой модель элементарной популяции с глобальным перемешиванием в популяции с дискретной пространственной структурой. Динамика состояния ячейки описывается стохастической компартментной моделью распространения заболевания с учётом миграционных процессов [5].
Модель миграции (Migration) представляет популяцию как множество элементарных популяций. Каждая популяция обрабатывается отдыльным процессором. Эти популяции развиваются независимо друг от друга в течение одинакового количества поколений T (время изоляции). По истечении времени изоляции происходит обмен особями между популяциями (миграция) [6]. При моделировании миграционных потоков и перемешивания популяции на основе клеточных автоматов между элементарными популяциями, которые соответствует ячейкам, происходит миграция. Отбор особей для миграции может происходить следующим образом: интенсивность миграции постоянно для всей популяции; миграция происходит из всех групп равномерно [7, 8].
Для компьютерного моделирования мы выбрали пакет AnyLogic5 [9]. Пакет предоставляет все преимущества объектно-ориентированного подхода в системной динамике [10]. В связи с этим разработанная нами собственная динамическая модель распространения холеры с использованием стандартных средств, с помощью программы Anylogic5 [11], состоит из двух элементов:
· Компартментная модель распространения холеры в популяции;
· Использование модель эффективности процесса клеточного автомата;
В описанных ниже экспериментах моделировалось развитие эпидемического процесса в популяции, с использованием предложенной модели. Начальные условия моделирования: S = 1000, Is =Ia=R = 0; Чтобы “запустить” эпидемический процесс в начальный момент времени объём группы распространителей инфекции носители бактерий виды холерных вибрионов, BH=99, BL=10. Исследование чувствительности модели к изменению коэффициента скорости миграции (М), при трех различных значениях. Сравнительный анализ компартментной и комбинированной имитационной модели, по интенсивности окрашивания в зависимости от красного цвета для получения результатов в предложенной комбинированной имитационной модели. С другой стороны синий цвет для получения результатов в компартментной модели [12].
На рис. 1 (а-в) представлены результаты исследования компартментной и комбинированной модели распространения холеры в интервале времени [0-100] лет.
Исследование динамических свойств разработанной модели популяции необходимо как для качественной, так и для количественной оценки её адекватности. Параметры модели распространения холеры в популяции, определённые на основании информации из различных источников, очевидно, имеют различную степень точности и достоверности.
Рис. 1. -Исследование чувствительности модели к изменению M.
Заключение
Таким образом, можно сделать вывод о целесообразности применения клеточного автомата при моделировании распространения холеры. Как следует из графиков, значение этого параметра очень сильно влияет на характер развития моделируемого эпидемического процесса.
Результаты исследований предложенной модели показывают, что уменьшение интенсивности миграционных потоков между компартментами ведет к проявлению запаздывания изменения числа инфицированных по сравнению с моделями глобальными перемешиванием.
Предложенная модель на основе клеточного автомата способна легче интегрировать мобильность и взаимодействие между вектором и хозяином для повышения качества и точности противоэпидемической ситуации и прогнозирования эпидемических заболеваний.
Литература
1. Башабшех, М.М., Масленников, Б.И. Имитационное моделирование пространственного распространения эпидемий (на примере холеры) с применением метода клеточных автоматов с помощью программы AnyLogic//Интернет-журнал «Науковедение». 2013 №6 (19) [Электронный ресурс]. -М. 2013. - Режим доступа: http://naukovedenie.ru/PDF/135TVN613.pdf.
2. Capasso and S. L. Paveri-Fontana. A Mathematical Model for the Cholera Epidemic in the European Mediterranean Region. Rev.Epidemic.Sante Publ, 1979. ? p. 121-132.
3. Merrell, DS, Butler, SM, Qadri, F et al. Host-induced epidemic spread of the cholera bacterium. Nature 2002. ? p. 642-645.
4. Nelson EJ, Harris JB, Morris JG, Jr., Calderwood SB, Camilli A (2009) Cholera transmission: The host, pathogen and bacteriophage dynamic. Nat Rev Microbiol.? p. 693-702.
5. Башабшех, М.М., Масленников, Б.И., Скворцов, А.В. Комбинированная имитационная модель пространственного распространения эпидемических заболеваний по холере на основе вероятностного клеточного автомата//Интернет-журнал «Науковедение». 2013 №3 (16) [Электронный ресурс]. -М. 2013. - Режим доступа: http://naukovedenie.ru/PDF/42tvn313.pdf.
6. Панченко, Т.В. Генетические алгоритмы [Tekст]: Учебно-методическое пособие / под ред. Тарасевича-Астрахань. Ю.Ю. Панченко. Т.В // издательский дом "Астраханский университет" , 2007.? С.87.
7. Башабшех М.М., Скворцов А.В., Масленников Б.И. Совмещение вероятностных клеточных автоматов и компартментных моделей для прогнозной оценки пространственного распространения эпидемиологических заболеваний. // Сб. Трудов НТК. Конференции: «Интеграция науки и образования-производству, экономике» , 12 декабря 2012. Tом 2. С10. Тверь.
8. Башабшех М.М., Скворцов А.В., Масленников Б.И. Применение клеточных автоматов для моделирования пространственного распространения эпидемиологических заболеваний. // Вестник тверского государственного технического университета: Научный журнал. Тверь: ТвГТУ. №1, 2013. Вып.23. 9 с.
9. Карпов, Ю.Г. Имитационное моделирование систем. Введение в моделирование с AnyLogic 5 [Текст] / Ю.Г. Карпов. - СПб.: БХВ-Петербург, 2006. - 400 с.
10. Гаврилова З.П. Моделирование системной динамики демографической ситуации в Ростовской области [Электронный ресурс] / З.П. Гаврилова // «Инженерный вестник Дона», 2011, №1 - Режим доступа: http://www.ivdon.ru/magazine/archive/n1y2011/401 (доступ свободный) - Загл. с экрана. - Яз. рус.
11. Свечкарев В.П., Олишевский Д.П. Имитационное моделирование процесса инсорсинга научно-исследовательских услуг [Электронный ресурс] / В.П. Свечкарев, Д.П. Олишевский // «Инженерный вестник Дона», 2010, №1 - Режим доступа: http://www.ivdon.ru/magazine/archive/n1e2010/174 (доступ свободный) - Загл. с экрана. - Яз. рус.
12. Масленников Б.И., Математическое обеспечение информационно-аналитической медицинской системы программные продукты и системы/ Б.И. Масленников, А.В. Скворцов, международное научно-практическое приложение к международному журналу «Проблемы теории и практики управления».- 2008.- C. 158-160.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Схема происхождения клеточных мембран, построенная на основе динамической мембранной модели. Функциональная организация генетического аппарата и взаимодействия его механизмов в различных состояниях клеточного ядра. Компартментная организация ядрышка.
статья [1,5 M], добавлен 02.08.2013Теория Большого Взрыва. Понятие реликтового излучения. Инфляционная теория физического вакуума. Основы модели однородной изотропной нестационарной расширяющейся Вселенной. Сущность моделей Леметра, де Ситтера, Милна, Фридмана, Эйнштейна-де Ситтера.
реферат [27,5 K], добавлен 24.01.2011Открытие периодического закона элементов: история создания и классификация свойств элементов. Развитие представлений о сложном строении атома. Физический смысл атомного номера на основе модели атома Бора. Отражение "застройки" электронных оболочек атома.
контрольная работа [57,1 K], добавлен 28.01.2014Опыт математического моделирования органов и структур человеческого организма с целью предсказания критических ситуаций и выяснения механизмов формирования патологии. Модели гемодинамики сердечно-сосудистой системы и регуляции сердечного выброса.
реферат [617,7 K], добавлен 27.02.2010Клетка как наименьшая морфофизиологическая единица живых систем. Особенности методов получения трехмерных изображений клеток. Определение уравнения поверхности клетки в трехмерных координатах. Проектирование трехмерной модели формы клетки, ее параметры.
контрольная работа [485,3 K], добавлен 30.09.2009Этапы развития химии. Сущность второго начала термодинамики. Реакции, лежащие в основе энергии звезд. Волновые свойства света. Модели развития Вселенной. Типов фазовых переходы. Состав и молекулярное живой клетки. Представления о происхождения жизни.
контрольная работа [45,2 K], добавлен 15.10.2010Развитие естественных наук в средние века, место и роль церкви в государстве. Построение теории строения атома на основе планетарной модели. Развитие астрономии, характеристики галактик. Теории возникновения жизни на Земле. Гипотезы происхождения рас.
контрольная работа [34,7 K], добавлен 14.09.2009Описания истории открытия биологического полимера, состоящего из двух полинуклеотидных цепей, соединенных друг с другом. Анализ модели структуры молекулы ДНК, созданной Френсисом Криком и Джеймсом Уотсоном. Методы выделения дезоксирибонуклеиновых кислот.
презентация [848,5 K], добавлен 07.05.2013Обмен веществ и энергией в живой клетке, обменные процессы в неживой природе. Роль мутаций и окружающей среды в эволюции, значение для естествознания использования корпускулярно-волновых свойств веществ. Модели развития Вселенной, механизмы изменчивости.
контрольная работа [381,3 K], добавлен 17.08.2010Принятие решения о научном исследовании. Формулирование гипотезы, выбор методологии. Составление программы и плана исследования. Обработка результатов эксперимента. Подтверждение или опровержение гипотезы. Составление модели явления, ее верификация.
реферат [225,5 K], добавлен 10.01.2014Модели исследования, методы обнаружения, морфологические признаки и фармакологическая коррекция апоптоза кардиомиоцитов млекопитающих. Перспективы применения антиапоптотических веществ в клинической практике при лечении сердечно-сосудистых заболеваний.
курсовая работа [2,2 M], добавлен 03.10.2014Механические модели биообъектов. Закон Гука при деформации тканей. Механические свойства мышц и костей, стенки кровеносных сосудов. Основные механические процессы в легких. Молекулярные основы упругих свойств биообъектов. Движение хромосом в клетках.
презентация [4,7 M], добавлен 14.03.2015Основы эволюции Вселенной. Анализ сценария образования Вселенной в соответствии с концепцией Большого взрыва. Характеристика моделей расширяющейся и пульсирующей Вселенной. Эволюция концепции единства мира применительно к концепции Большого взрыва.
презентация [204,8 K], добавлен 03.12.2014Особенность синергетики как науки. Синергетика Ч. Шеррингтона, синергия Улана и синергетический подход И. Забуского. Объекты исследования синергетики. Структура и хаос. Теория диссипативных структур и автоволновых процессов. Поиски универсальной модели.
контрольная работа [31,5 K], добавлен 16.04.2011Сущность и содержание теории Большого взрыва, история и основные этапы ее развития, место в естествознании. Описание соответствующей модели, этапы и направления формирования Вселенной. Принципы определения возраста Вселенной, критерии его оценки.
реферат [694,9 K], добавлен 16.03.2014Установление наукой причинно-следственных связей. Правило, закон и принцип как формы обобщения. Реальное пространство консервативной модели, характеристика его свойств. Эволюция представлений о теплоте. Закон распространения теплоты, установленный Фурье.
контрольная работа [30,0 K], добавлен 03.12.2012Сущность процесса адаптации. Стресс как неспецифический стимулятор. Резервы продуктивности биологических систем. Использование резервов организма в спорте, медицине. Построение модели адаптации организма к факторам, выводящим его из состояния равновесия.
курсовая работа [261,7 K], добавлен 25.11.2013Строение и функции кожи, ее связь с другими органами и системами. Характеристика эпидермиса, дермы и подкожной основы. Особенности ухода за нормальной, сухой, жирной, комбинированной и стареющей кожей. Рекомендации косметолога и народные рецепты.
реферат [145,3 K], добавлен 12.05.2009Классы иммуноглобулинов и их функции, принципиальная особенность, нейтрализующее действие в минимальных концентрациях. Процесс рекомбинации генов, кодирующих легкие и тяжелые цепи иммуноглобулинов. Конфигурация Т-клеточных рецепторов, виды генов.
реферат [35,6 K], добавлен 02.04.2016Классификация ферментов Международным союзом молекулярной биологии по типу катализируемых реакций: оксидоредуктаза, трансфераза, гидролаза, лиаза, лигаза, изомераза. Модели соединения фермента с субстратом. Гипотеза Кошланда об индуцированом соответствии.
презентация [729,4 K], добавлен 17.02.2013