Мутации митохондриального генома лейкоцитов крови при атеросклерозе сонных артерий и ишемической болезни сердца у человека
Степень влияния уровней гетероплазмии мутаций митохондриального генома лейкоцитов крови на выраженность атеросклеротического поражения сонных артерий. Праймеры для проведения пиросеквенирования, Оценка повторяемости и воспроизводимости измерений.
Рубрика | Биология и естествознание |
Вид | автореферат |
Язык | русский |
Дата добавления | 10.11.2018 |
Размер файла | 94,9 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
Размещено на http://www.allbest.ru/
АВТОРЕФЕРАТ
диссертации на соискание учёной степени кандидата биологических наук
Мутации митохондриального генома лейкоцитов крови при атеросклерозе сонных артерий и ишемической болезни сердца у человека
14.03.03 - Патологическая физиология
Желанкин Андрей
МОСКВА - 2013
Работа выполнена в лаборатории клеточных механизмов атерогенеза ФГБУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии» РАМН. митохондриальный лейкоцит пиросеквенирование
Научные руководители:
Доктор медицинских наук
Игорь Александрович Собенин
Кандидат биологических наук
Маргарита Александровна Сазонова
Официальные оппоненты:
Всеволод Григорьевич Пинелис
Доктор медицинских наук, профессор
ФГБУ «Научный центр здоровья детей» РАМН
Заведующий лабораторией клеточных и молекулярных технологий
Ника Валентиновна Петрова
Доктор биологических наук
ФГБУ «Медико-генетический научный центр» РАМН
Ведущий научный сотрудник лаборатории генетической эпидемиологии
Ведущая организация: ФГБОУ ВПО «Российский университет дружбы народов».
Общая характеристика работы
Актуальность проблемы
В России, как и в большинстве индустриальных стран, сердечно-сосудистые заболевания (ССЗ), такие как ишемическая болезнь сердца, острый инфаркт миокарда, нарушение мозгового кровообращения, занимают первое место в структуре инвалидизации и смертности, в том числе, преждевременной, а также ведут к эскалации расходов на здравоохранение. Поскольку морфологической основой смертности от сердечно-сосудистых заболеваний в 90% случаев является атеросклероз, то вклад заболеваний атеросклеротического генеза и их последствий в общую смертность является наиболее весомым. Несмотря на существенные достижения в области медицины и биологии, заболеваемость и смертность от атеросклеротических заболеваний остаются на недопустимо высоком уровне, в то время как арсенал эффективных терапевтических средств и адекватных целей антиатеросклеротической терапии остается весьма ограниченным. Одной из причин этого неблагоприятного дисбаланса является недостаточное количество верифицированных биомаркеров ССЗ. Современные алгоритмы оценки сердечно-сосудистого риска, учитывающие совокупное взаимодействие нескольких факторов риска, в состоянии объяснить около 70% вариабельности возникновения клинических проявлений атеросклероза.
Важным и перспективным дополнением к существующим системам оценки сердечно-сосудистого риска является анализ генетической предрасположенности. За последнее десятилетие, в условиях стремительного расширения возможностей молекулярно-генетического анализа, большое количество публикаций в области медицинской генетики было посвящено поиску генетических биомаркеров атеросклероза и ССЗ в ядерном геноме человека. Ассоциация с атеросклерозом и ИБС была обнаружена для полиморфизмов в генах, продукты которых так или иначе вовлечены в метаболизм сосудистой стенки. На развитие и прогрессирование ИБС могут повлиять генетически обусловленные вариации активности белков, вовлеченных в патогенез атеросклероза и его осложнений, в том числе участвующие в процессах активации эндотелия, развитии воспалительных реакций, регуляции миграции и пролиферации гладкомышечных клеток, а также связанные с коагуляцией и фибринолизом [Lane D.A., Grant P.J., 2000, Damani S.B., Topol E.J., 2007, Packard R.R., Libby P., 2008]. Но даже в сравнении с отдельными традиционными факторами риска сердечно-сосудистых заболеваний, мутации ядерного генома, как факторы риска, имеют весьма низкую диагностическую и прогностическую значимость. При наличии любого из вариантов полиморфизмов, достоверно ассоциированного с какими-либо сердечно-сосудистыми заболеваниями, относительный риск варьирует в пределах 1,06-1,40. В совокупности, все известные полиморфизмы ядерного генома объясняют не более 5% наличия сердечно-сосудистых заболеваний [John P.A., Ioannidis M.D., 2009].
На развитие патологий могут влиять изменения как в ядерном, так и в митохондриальном геноме человека. Известно, что некоторые мутации митохондриального генома ассоциированы с различными патологиями, среди которых такие социально значимые заболевания как сахарный диабет, различные типы кардиомиопатии, артериальная гипертония и ИБС. Недавние исследования показывают взаимосвязь ряда мутаций мтДНК с тяжестью атеросклеротических поражений аорты [Собенин И.А. с соавт., 2011, Sazonova M.A. et al., 2009]. Поиск мутаций митохондриального генома, ассоциированных с атеросклерозом и ИБС, может привести к их включению в список генетических факторов риска и увеличить экспланаторную ценность совокупности генетических маркеров сердечно-сосудистых заболеваний. Анализ уровня мутантных мтДНК в лейкоцитах крови, как наиболее эффективном и доступном прижизненном биологическом материале, раскрывает возможности для дальнейшего использования соматических митохондриальных мутаций в качестве биомаркеров для ранней диагностики рассматриваемых патологий.
Цель исследования
Выявление взаимосвязи мутаций митохондриального генома лейкоцитов крови человека с атеросклерозом сонных артерий и ИБС, а также сопутствующими атеросклерозу заболеваниями: сахарным диабетом 2-го типа, артериальной гипертонией и гиперлипидемией.
Задачи исследования
1) Определить уровень гетероплазмии 9 мутаций митохондриального генома лейкоцитов крови внутри выборки, гетерогенной по полу, возрасту, выраженности атеросклероза сонных артерий и наличию ИБС.
2) Выявить степень влияния уровней гетероплазмии мутаций митохондриального генома лейкоцитов крови на выраженность атеросклеротического поражения сонных артерий.
3) Оценить ассоциацию уровня гетероплазмии 9 мутаций митохондриального генома лейкоцитов крови с наличием ИБС, перенесенного острого инфаркта миокарда, артериальной гипертонии, сахарного диабета 2 типа и гиперлипидемии.
Научная новизна
Впервые метод количественной оценки мутантного аллеля митохондриального генома на основе технологии пиросеквенирования был использован в клинико-эпидемиологическом исследовании гетерогенной выборки для выявления гетероплазмичных митохондриальных мутаций в лейкоцитах крови человека. Установлено, что в выборке, гетерогенной по полу, возрасту, тяжести атеросклеротических поражений атеросклероза и наличию ИБС, уровни гетероплазмии мутаций митохондриального генома C3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G15059A в лейкоцитах крови коррелируют (абсолютные значения коэффициентов корреляции по Спирмену от 0,150 до 0,492) с толщиной интимо-медиального слоя сонных артерий и с размером атеросклеротических бляшек. Также установлено, что имеются достоверные различия (p<0,05) в средних уровнях гетероплазмии этих же мутаций между группами лиц с наличием и отсутствием ИБС. Впервые оценена прогностическая значимость мутационной нагрузки митохондриального генома (по совокупности мутаций A1555G, C3256T, T3336C, C5178A, G12315A, G13513A, G14459A, G14846A, G15059A) лейкоцитов крови как биомаркера атеросклероза сонных артерий и наличия ИБС у человека.
Практическая значимость
Результаты проведённой работы наглядно демонстрируют значимость детекции мутаций C3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G15059A митохондриального генома лейкоцитов человека для идентификации предрасположенности к атеросклерозу сонных артерий и сердечно-сосудистому риску атеросклеротического генеза. Дальнейшее упрощение и удешевление процедуры выявления мутаций мтДНК может способствовать внедрению в широкую клиническую практику специфической тест-системы для ранней диагностики предрасположенности к сердечно-сосудистым событиям атеросклеротического генеза.
Научные положения, выносимые на защиту
В выборке лиц из Москвы и Московской области уровень гетероплазмии мутаций C3256T, T3336C, C5178A, G12315A, G13513A и G15059A митохондриального генома лейкоцитов крови ассоциирован со степенью выраженности атеросклероза сонных артерий, при этом пять мутаций имеют проатерогенный характер (C3256T, T3336C, G12315A, C5178A, G15059A), а мутация G13513A - антиатерогенный характер.
Генетическая предрасположенность к атеросклерозу сонных артерий, связанная с митохондриальным геномом, обусловлена суммарной мутационной нагрузкой по атерогенным и антиатерогенным мутациям.
Для мутаций C3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G14459A лейкоцитов крови человека обнаружены значимые различия (с достоверностью более 95%) в средних уровнях гетероплазмии между группами лиц с наличием и отсутствием ИБС.
Исследованные мутации митохондриального генома лейкоцитов крови не ассоциированы с артериальной гипертонией, а мутации A1555G, G13513A и G14846A ассоциированы с наличием сахарного диабета 2-го типа у женщин.
Внедрение результатов исследования в практику
По результатам диссертационного исследования опубликована 21 работа, в том числе в журналах, рецензируемых ВАК, - 6 публикаций, из них одна публикация в зарубежном журнале с импакт-фактором 4,4. Полученные результаты в дальнейшем планируется использовать с целью разработки генетической тест-системы для диагностики предрасположенности к атеросклерозу и сердечно-сосудистым заболеваниям атеросклеротического генеза.
Апробация работы
Апробация диссертации состоялась на межлабораторной конференции ФГБУ «Научно-исследовательского института общей патологии и патофизиологии» РАМН 28 июня 2013 г.
Структура и объём диссертации
Диссертация содержит: введение, обзор литературы, описание материалов и методов, изложение и обсуждение полученных результатов, выводы, заключение, библиографический указатель, включающий работы на русском (14) и иностранных языках (170), и приложение. Работа изложена на 129 страницах машинописного текста, содержит 14 таблиц и 18 рисунков.
Материалы и методы исследования
Материал
В общей сложности были набраны 192 участника из Москвы и Московской области (85 мужчин, 107 женщин) со средним возрастом 65,0 лет (SD 9,4), среди них 45 участников (24%) имели клинические проявления ИБС. Соотношение полов было одинаковым среди здоровых участников и больных ИБС (р=0,17). Пациенты с ИБС были старше, чем здоровые участники; средний возраст составлял 70,0 (SD 8,7) и 63,5 (SD 9,0) лет, соответственно, p<0,001. Для прижизненной диагностики атеросклероза использовали ультрасонографию высокого разрешения в В-режиме с помощью линейного сосудистого датчика с частотой 7,5 МГц, далее произведена компьютерная оценка ТИМC общих сонных артерий.
Выделение ДНК из крови
Кровь для генетического анализа в количестве 9 мл брали утром натощак из локтевой вены в пластиковую пробирку объемом 15 мл, содержащую в качестве антикоагулянта натриевую соль этилендиаминтетрауксусной кислоты (Na-ЭДТА). Выделение тотальной ДНК из образцов крови (5мл) проводилось с помощью метода фенол-хлороформной экстракции с использованием протеиназы К. Полученный раствор ДНК доводили Трис-ЭДТА-буфером до концентрации 200 нг/мкл, и хранили при -20оС. Концентрация раствора ДНК измерялась на наноспектрофотометре при длине волны 260 нм.
ПЦР
Реакционная смесь объемом 30 мкл содержала 0,4 - 0,6 мкг ДНК; 16,6 мкМ (NH4)2SO4; 0,3 пикомоль каждого праймера, 200 мкМ каждого дезоксирибонуклеозидтрифосфата, 67 мМ трис/HCl (pH 8,8), 2,5/4 mM MgCl2 и 3 ед. Taq-полимеразы. Условия амплификации и последовательности праймеров даны в таблице1. Режимы проведения ПЦР были следующими:
Режим AT1: 94 oС - 3 мин; 94 oС - 30 сек, 56 oС - 30 сек, 72 oС - 1 мин (35 циклов); 72 oС - 7 мин; 20 oС - 4 мин.
Режим AT2: 94 oС - 3 мин; 94 oС - 30 сек, 50 oС - 30 сек, 72 oС - 1 мин (35 циклов); 72 oС - 7 мин; 20 oС - 4 мин.
Режим AT3: 94 oС - 4 мин; 94 oС - 45 сек, 50 oС - 45 сек, 72 oС - 1 мин (35 циклов); 72 oС - 7 мин; 20 oС - 4 мин.
Обратный праймер был биотинилирован в целях дальнейшего пиросеквенирования ПЦР-фрагмента. Исследование проводилось с использованием амплификатора «PTC DNA Engine 200». Детекцию продуктов ПЦР проводили с помощью электрофореза в горизонтальном аппарате в 1,5% агарозном геле.
Таблица 1: Условия для ПЦР фрагментов митохондриального генома
Мутация |
Праймеры для ПЦР |
C(Mg2+) |
Режим |
|
A1555G |
TAGGTCAAGGTGTAGCCCATGAGGTGGCAA bio-GTAAGGTGGAGTGGGTTTGGG |
2.5mM |
AT2 |
|
C3256T |
bio-AGGACAAGAGAAATAAGGCC ACGTTGGGGCCTTTGCGTAG |
2.5mM |
AT1 |
|
T3336C |
||||
C5178A |
bio-GCAGTTGAGGTGGATTAAAC GGAGTAGATTAGGCGTAGGTAG |
2.5mM |
AT3 |
|
G12315A |
bio-CTCATGCCCCCATGTCTAA TTACTTTTATTTGGAGTTGCAC |
2.5mM |
AT2 |
|
G13513A |
CCTCACAGGTTTCTACTCCAAA bio-AAGTCCTAGGAAAGTGACAGCGAGG |
1.5mM |
AT1 |
|
G14459A |
CAGCTTCCTACACTATTAAAGT bio-GTTTTTTTAATTTATTTAGGGGG |
1.5mM |
AT2 |
|
G14846A |
bio-CATTATTCTCGCACGGACT GCTATAGTTGCAAGCAGGAG |
1.5mM |
AT1 |
|
G15059A |
Таблица 2: Праймеры для проведения пиросеквенирования
Мутация |
Праймер |
|
A1555G |
ACGCATTTATATAGAGGA |
|
C3256T |
AAGAAGAGGAATTGA |
|
T3336C |
TGCGATTAGAATGGGTAC |
|
C5178A |
ATTAAGGGTGTTAGTCATGT |
|
G12315A |
TTTGGAGTTGCAC |
|
G13513A |
AGGTTTCTACTCCAA |
|
G14459A |
GATACTCCTCAATAGCCA |
|
G14846A |
GCGCCAAGGAGTGA |
|
G15059A |
TTTCTGAGTAGAGAAATGAT |
Пиросеквенирование
После проведения ПЦР амплификаты были пиросеквенированы для выявления точечных замен или микроделеций митохондриального генома человека. Исследования проводили на автоматическом пиросеквенаторе PSQTMHS96MA. При постановке эксперимента была реализована схема приготовления проб, описанная в прилагающемся к пиросеквенатору методическом пособии (использовались сефарозные частицы). Последовательности праймеров для пиросеквенирования представлены в таблице 2. Визуализация результатов осуществлялась с помощью программы, прилагающейся при установке пиросеквенатора.
Количественное определение уровня гетероплазмии мутаций митохондриального генома
Количественная оценка мутантного аллеля заключалась в расчете уровней гетероплазмии мутаций мтДНК с использованием высот пиков пирограммы в исследуемой области одноцепочечного ПЦР-фрагмента митохондриального генома. Метод расчета уровней гетероплазмии мутаций мтДНК является новым и был недавно разработан и впервые применен в нашей лаборатории Сазоновой М.А. [Сазонова М.А. с соавт., 2011]. Наша задача заключалась в оценке уровня гетероплазмии исследуемой мутации, то есть отношения количества фрагментов митохондриальных геномов, содержащихся в данной пробе, несущих исследуемую мутацию, к общему их количеству. Общая формула для подсчёта уровня гетероплазмии выглядит следующим образом:
где P - уровень гетероплазмии, h -высота пика исследуемого нуклеотида, N - высота пика исследуемого нуклеотида, соответствующая наличию в образце 100% нормальных аллелей, M - высота пика исследуемого нуклеотида, соответствующая наличию в образце 100% мутантных аллелей. Основными этапами анализа пирограммы являлись:
Вычисление усредненного фонового значения пирограммы.
Введение поправки для пиков нуклеотида «А».
Выбор контрольных пиков
Определение уровня гетероплазмии
Для удобства расчета уровня гетероплазмии, для каждой конкретной мутации на основании общей была создана собственная формула. Расчёт производился с помощью программы Microsoft Exсel 2010.
Статистическую обработку данных проводили с помощью программного пакета SPSS версии 17.0 (SPSS Inc., США). Были использованы подпрограммы описательной статистики, вариационного анализа, параметрической и непараметрической статистики, ковариационного анализа, линейной и логистической регрессии.
Результаты исследования
Оценка повторяемости и воспроизводимости измерений
Для оценки повторяемости и воспроизводимости метода количественного определения уровня гетероплазмии митохондриальных мутаций были выбраны следующие условия:
1) Анализируемым параметром являлся уровень гетероплазмии мутации митохондриального генома C5178A
2) Изначальными образцами для анализа являлись растворы ДНК, выделенной из крови пациентов
3) Было проанализировано 5 образцов
4) Для каждого образца количество измерений уровня гетероплазмии составило 6 раз
Для анализа были взяты 2 образца, для которых предварительный анализ пирограмм показал наличие мутации (100% аллеля A) и отсутствие мутации (100% аллеля С), соответственно. Искусственно были получены еще 3 образца с теоретическим уровнем гетероплазмии 25%, 50% и 75%. Для этих образцов была поставлена ПЦР с праймерами для детекции мутации С5178А, и пиросеквенирование, согласно изложенной выше операционной процедуре, и были рассчитаны уровни гетероплазмии. Исходя из средних значений уровня гетероплазмии, были рассчитаны коэффициенты вариации для каждого из пяти образцов. Наибольшая вариация значений наблюдалась при измерении уровня гетероплазмии, близкого к нулю - коэффициент вариации составил 34,7%. Среди трех промежуточных измерений средний коэффициент вариации составил 4,7%. При определении уровня гетероплазмии, приближающегося к 100%, вариации значений почти не наблюдалось (коэффициент вариации 2,1%). Было установлено, что при определении уровня гетероплазмии выше, чем 10%, коэффициент вариации не выходит за пределы значения 10%.
Оценка влияния факторов риска сердечно-сосудистых заболеваний на степень атеросклеротических поражений сонных артерий в исследованной выборке
В исследуемой выборке наблюдалась достоверная положительная корреляция величин ТИМС с возрастом, как для мужчин, так и для женщин (r=0,552, p<0,01 и r=0,394, p<0,01, соответственно). Среднее значение ТИМС среди мужчин в исследуемой выборке было выше, чем для женщин, при этом внутри всех возрастных групп, кроме первой, значения ТИМС также были выше среди мужчин. У больных ИБС значения ТИМС значительно превышали таковые у лиц без клинических проявлений атеросклероза. Это говорит о самостоятельной роли ТИМС сонных артерий как фенотипического фактора риска ИБС. Величина размера атеросклеротических бляшек положительно коррелировала с ТИМС (коэффициэнт корреляции Спирмена 0,487, p<0,01). Средний балл размера атеросклеротической бляшки был достоверно выше среди лиц с ИБС, по сравнению с лицами без клинических проявлений атеросклероза (p<0,05).
Внутри исследуемой выборки была проведена оценка влияния традиционных факторов риска атеросклероза, а именно: наличия сахарного диабета, гипертонии, индекса массы тела, курения, содержания в крови триглицеридов, общего холестерина, а также холестерина ЛНП и ЛВП - на степень развития атеросклероза и выраженность его клинических проявлений. Результаты многофакторного дисперсионного анализа показали, что в данной выборке влиянием совокупности традиционных факторов риска можно объяснить 10,7 % случаев утолщения интимо-медиального слоя сонных артерий, 9,1% наличия атеросклеротических бляшек в просвете сосудов, и 15,2 % случаев клинических проявлений атеросклероза.
Ассоциация мутаций мтДНК со степенью атеросклеротических поражений сонных артерий
В исследованной выборке были обнаружены корреляции между средней толщиной интимы-медии сонных артерий (ТИМС) и уровнями гетероплазмии для мутаций митохондриального генома C3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G15059A (коэффициенты корреляции по Спирмену, 0,362, p<0,001, 0,152, p=0,036, 0,306, p<0,001, -0,357, p<0,001, 0,316, p<0,001, соответственно). Уровни гетероплазмии мутаций A1555G, C5178A, G14459A, и G14846A не коррелировали с величиной ТИМС (абсолютные значения коэффициентов Спирмена менее 0,1 при p>0,05).
Был проведен регрессионный анализ связи между показателями гетероплазмии по всем изученным мутациям и ТИМС, который показал, что все исследованные мутации в совокупности объясняют не более 21,5 % случаев утолщения интимо-медиального слоя сонных артерий.
Следует отметить, что уровни гетероплазмии для мутаций C3256T, C3336T, G12315A, G13513A, G14459A, G14846A, и G15059A достоверно коррелировали с размером атеросклеротических бляшек в любом визуализированном сегменте сонных артерий, при этом размер бляшек был оценен по 4-балльной шкале (коэффициент корреляции Спирмена, 0,317, p<0,001; 0,328, p<0,001; 0,356, p<0,001; -0,492, p<0,001;, -0,150, p=0,038;
-0,153, p=0,034; и 0,210, p=0,003, соответственно). Однако уровни гетероплазмии для мутаций A1555G и C5178A не коррелировали с размером атеросклеротических бляшек. Регрессионный анализ с использованием порядковой регрессии показал, что все проанализированные мутации в совокупности объясняют 32,7% вариабельности размера бляшки, при этом наибольший вклад (22,5 %) вносит мутация C3256T.
Для выявления ассоциации мутаций митохондриального генома с наличием атеросклероза, было произведено разделение исследуемой выборки на группы, учитывающие как величину ТИМС, так и размер атеросклеротической бляшки. Отсутствием атеросклероза считали сочетание следующих параметров: квартили ТИМС с 1 по 3 и отсутствие бляшки (0 балов); наличием атеросклероза: выявление бляшки более чем 1 балл; 4 квартиль ТИМС; сочетание размера бляшки 1 балл и 3-4 квартили ТИМС. Между группами лиц с наличием и отсутствием атеросклероза были обнаружены значимые отличия (p<0,01) уровней гетероплазмии мутаций С3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G15059A. При этом средний уровень гетероплазмии мутаций С3256T, T3336C, G12315A и G15059A у лиц с наличием атеросклероза был выше, а для мутации G13513A - ниже по сравнению с условно здоровыми пациентами. Результаты регрессионного анализа показали, что влиянием совокупности всех исследованных мутаций можно объяснить 28,5 % случаев наличия атеросклероза по критерию, учитывающему как толщину интимо-медиального слоя сонных артерий, так и размер атеросклеротической бляшки.
Следует подчеркнуть, что для тех мутаций, уровни гетероплазмии которых достоверно коррелировали с ТИМС и/или размером атеросклеротических бляшек, уровни гетероплазмии также коррелировали между собой (табл. 3). Как правило, уровни гетероплазмии мутаций, положительно коррелировавшие с атеросклерозом сонных артерий, также были непосредственно связаны друг с другом, но отрицательно коррелировали с уровнями гетероплазмии мутаций, которые имели негативные ассоциации с атеросклерозом.
Из этих данных можно сделать вывод о том, что мутации, по всей видимости, имеют наследственный характер, так как частая совместная встречаемость высокого уровня мутантного аллеля для мутаций, возникших соматическим путем, маловероятна. Вследствие того, что полученные корреляции показали наличие неравновесия по сцеплению как мутаций между собой, так и с атеросклерозом, мы использовали величину "суммарной мутационной нагрузки митохондриального генома", которая рассчитывалась как простая арифметическая сумма номеров квартилей (рангов) уровней гетероплазмии всех исследованных мутаций в образце. Если уровень гетероплазмии положительно коррелировал с ТИМС сонных артерий, его номер квартили был взят с положительным знаком, для отрицательной корреляции - с отрицательным знаком. Величина суммарной мутационной нагрузки варьировалась от -7 до 11, со средним значением 2.
Таблица 3.
Корреляция между уровнями гетероплазмии мутаций мтДНК лейкоцитов крови, ассоциированных с ТИМС и/или размером атеросклеротических бляшек.
Мутация |
Коэффициент корреляции Спирмена |
||||||
T3336C |
G12315A |
G13513A |
G14459A |
G14846A |
G15059A |
||
C3256T |
0,573 p<0,001 |
0,735 p<0,001 |
-0,690 p<0,001 |
-0,366 p<0,001 |
-0,112 p=0,121 |
0,268 p<0,001 |
|
T3336C |
- |
0,587 p<0,001 |
-0,426 p<0,001 |
-0,110 p=0,127 |
0,134 p=0,064 |
0,342 p<0,001 |
|
G12315A |
- |
-0,520 p<0,001 |
-0,249 p<0,001 |
0,040 p=0,586 |
0,311 p<0,001 |
||
G13513A |
- |
0,332 p<0,001 |
0,052 p=0,477 |
-0,367 p<0,001 |
|||
G14459A |
- |
0,345 p<0,001 |
0,147 p=0,042 |
||||
G14846A |
- |
0,316 p<0,001 |
Суммарная мутационная нагрузка достоверно коррелировала как с ТИМС (корреляция по Спирмену, 0,376, p<0,001), так и с размером атеросклеротической бляшки (корреляция по Спирмену, 0,487, p<0,001). В группе лиц с наличием атеросклероза средняя мутационная нагрузка была достоверно выше (p<0,05), чем среди лиц с его отсутствием (рис. 1).
Величина «суммарная атеросклеротическая нагрузка» была также использована для анализа, она рассчитывалась как простая арифметическая сумма номеров квартилей ТИМС (с поправкой на возраст и пол), с оценкой размеров атеросклеротических бляшек в любом визуализированном сегменте сонной артерии. Две величины - суммарная мутационная нагрузка и суммарная атеросклеротическая нагрузка - также достоверно коррелировали между собой (корреляция по Спирмену, 0,405, p<0,001). Для количественной оценки мутационной нагрузки по пяти мутациям, продемонстрировавшим наиболее высокую степень корреляции с наличием атеросклероза (С3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G15059A), был введён новый термин - «мутационный эксцесс». Расчет мутационного эксцесса производился аналогично расчету суммарной мутационной нагрузки, но с включением только пяти озвученных мутаций. Как и суммарная мутационная нагрузка, величина мутационного эксцесса положительно коррелировала с атеросклеротической нагрузкой (корреляция по Спирмену, 0,397, p<0,001). Однофакторный дисперсионный анализ подтвердил тесную взаимосвязь как между атеросклеротической нагрузкой и суммарной мутационной нагрузкой (F=4,595, p<0,001), так и между атеросклеротической нагрузкой и мутационным эксцессом (F=16,209, p<0,001).
Рис. 1. Вариабельность величины суммарной мутационной нагрузки среди групп, сформированных по наличию атеросклероза сонных артерий (группа 1 - отсутствие атеросклероза; 2 - промежуточная группа; 3 - наличие атеросклероза, см. с. 77).
Ассоциация мутаций мтДНК с ИБС и перенесенным инфарктом миокарда
В ходе исследования была проанализирована связь между уровнями гетероплазмии мтДНК и клиническими проявлениями атеросклероза у участников исследования. Для этого было проведено сравнение уровней гетероплазмии исследованных мутаций митохондриального генома между группами с наличием и отсутствием ИБС с использованием теста Манна-Уитни. Уровни гетероплазмии для мутаций C3256T, T3336C, и G12315A были значительно выше, а для G13513A и G14459A - значительно ниже у больных ИБС по сравнению с лицами без клинических проявлений атеросклероза. Таким образом, мутации C3256T, T3336C, G12315A и G13513A ассоциированы как с увеличением ТИМС и развитием атеросклеротической бляшки, так и с клиническими проявлениями атеросклероза. Следует отметить, что у семи больных ИБС в анамнезе был перенесенный острый инфаркт миокарда, и уровни гетероплазмии мутаций C3256T и G12315A в их лейкоцитах крови были значительно выше по сравнению с другими участниками исследования (38,4%, SD 20,7, против 22,7%, SD 14,2, р = 0,041, и 48,0%, SD 18,5, против 32,1%, SD 19,3, р = 0,043).
Ассоциация мутаций мтДНК с артериальной гипертонией и сахарным диабетом
Наличие артериальной гипертонии определялось величинами систолического и диастолического артериального давления в момент взятия крови, а также на основе данных о периодичности повышения артериального давления пациента. Для выявления ассоциативных связей между уровнями гетероплазмии исследованных мутаций и наличием артериальной гипертонии и сахарного диабета 2-го типа, был проведен корреляционный анализ по Спирмену. Корреляцию между уровнями гетероплазмии исследуемых мутаций с систолическим и диастолическим артериальным давлением, наличием артериальной гипертонии и сахарного диабета 2-го типа можно охарактеризовать как весьма слабую (абсолютные значения коэффициентов корреляции по Спирмену не превышали 0,15). Стоит отметить, что у женщин, больных сахарным диабетом 2 типа, уровни гетероплазмии мутаций мтДНК A1555G, G13513A были достоверно ниже, а для мутации G14846A - достоверно выше, чем среди здоровых лиц (p<0,05).
Корреляционная связь мутаций мтДНК с липидными характеристиками крови
Гиперхолестеринемия и изменение липидных характеристик крови являются общеизвестным фактором риска атеросклероза. Снижение уровня холестерина ЛПНП и отношения холестерина ЛПНП и ЛПВП связано с меньшей степенью выраженности атеросклероза у обследуемых пациентов [Arai H. et al, 2010]. В рамках диссертационной работы была исследована взаимосвязь мутаций митохондриального генома лейкоцитов крови с различными липидными параметрами крови пациентов, среди которых: триглицериды, общий холестерин, холестерин ЛПНП и холестерин ЛПВП. Коэффициенты корреляции по Спирмену между содержанием в крови триглицеридов и уровнями гетероплазмии мутаций C3256T, G12315A, G15059A составили 0,184, 0,157 и 0,160, соответственно, для остальных мутаций абсолютные значения коэффициентов не превышали 0,1. Уровень гетероплазмии мутации G12315A положительно коррелировал с уровнями холестерина и холестерина ЛПНП в крови (коэффициенты Спирмена 0,156 и 0,168, соответственно). Также уровень гетероплазмии мутации C5178A коррелировал с уровнем холестерина ЛПНП в крови (коэффициент Спирмена 0,189). Низкие значения полученных корреляционных коэффициентов говорят о слабой ассоциативной связи исследуемых мутаций митохондриального генома с гиперлипидемией и гиперхолестеринемией.
Оценка диагностической значимости мутаций митохондриального генома как биомаркера атеросклероза и риска ИБС
Комбинированная оценка чувствительности и специфичности (экспланаторности) генетических маркеров была проведена методом построения ROC-кривых, показывающих зависимость количества верно классифицированных положительных примеров от количества неверно классифицированных отрицательных примеров. Для получения численного значения клинической значимости теста, а также для сравнения двух тестов, использовался показатель площади под ROC-кривой, рассчитываемый автоматически при проведении ROC-анализа в программе SPSS 17.0. Судить о качестве теста можно по экспертной шкале для значений площади под кривой: 0,5-0,6 - неудовлетворительное; 0,6-0,7 - среднее; 0,7-0,8 - хорошее; 0,8-0,9 - очень хорошее; 0,9-1,0 - отличное. Данные ROC-анализа для модели суммарной мутационной нагрузки как биомаркера атеросклероза и его клинических проявлений представлены в табл. 4. Модель, где суммарная мутационная нагрузка используется как предиктор клинических проявлений атеросклероза, является неудовлетворительной, но, тем не менее, существенно превышает порог случайного угадывания. Высокую экспланаторность показывают прогностические модели суммарной мутационной нагрузки как биомаркера утолщения ТИМС, наличия атеросклеротической бляшки, и наличия атеросклероза в целом.
Таблица 4.
Анализ чувствительности и специфичности прогностической модели для суммарной мутационной нагрузки 9 мутаций митохондриального генома как биомаркера атеросклероза сонных артерий и ИБС.
Положительное состояние предсказываемой характеристики |
Площадь под ROC-кривой ± SD |
p (значимость) |
Нижний и верхний 95%-ные доверительные интервалы |
|
Утолщение ТИМС, превышающее возрастные нормы |
0,687±0,044 |
<0,01 |
0,602-0,773 |
|
Наличие атеросклеротической бляшки в любом визуализированном сегменте сонной артерии |
0,728±0,037 |
<0,01 |
0,656-0,800 |
|
Наличие ИБС |
0,594±0,047 |
0,056 |
0,503-0,685 |
|
Наличие атеросклероза (по анализу совокупности увеличения ТИМС и наличия и размера бляшек) |
0,710±0,038 |
<0,01 |
0,636-0,784 |
Обсуждение полученных результатов
При оценке риска развития и степени тяжести сложных мультифакториальных заболеваний, как правило, используется широкая панель медико-биологических и социально-средовых факторов риска. Поиск новых высокоинформативных биомаркеров таких заболеваний, которые, в совокупности с традиционными факторами риска, призваны увеличить их прогностическую и экспланаторную ценность, является одной из важных задач патофизиологии. Исследование, проведенное в рамках данной работы, направлено на поиск генетических биомаркеров атеросклероза и ИБС в митохондриальном геноме человека. Результаты данной работы показали, что уровень гетероплазмии ряда мутаций митохондриального генома, для которых ранее была выявлена ассоциация со степенью атеросклеротических поражений человека на аутопсийном материале внутренней стенки аорты, варьируется в широких пределах в лейкоцитах крови человека.
Полученные данные доказывают, что наличие гетероплазмии мутаций мтДНК в лейкоцитах может не приводить к развитию патологий, связанных с полным нарушением функций продукта гена, в котором происходит мутация. Такая картина вполне соответствует данным ряда исследований, показавших, что для проявления у индивида клинических признаков митохондриальных заболеваний уровень гетероплазмии мтДНК обычно должен превысить некий порог, выше которого влияние дефектов генов митохондриального генома становится фенотипически значимым [Merante F. et al, 1994; Silvestri G. et al, 1994]. Кроме того, эксперименты по слиянию митохондрий с наличием и отсутствием мутации показали, что функции клеток, связанные с работой дыхательной цепи, могут оставаться в норме при сосуществовании внутри клетки нормальных и дефектных мтДНК [Ono T. et al, 2001]. Наличие мутации мтДНК в состоянии гетероплазмии может не приводить к полному блокированию дыхательной цепи в митохондриях, но следствием мутации является частичное нарушение дыхательной функции клетки за счет изменения структуры продуктов, кодируемых мтДНК. Это, в свою очередь, приводит к митохондриальной дисфункции, что может стать причиной патологических процессов в тканях, содержащих клетки с повышенным уровнем мутантной мтДНК.
Мутации мтДНК C3256T и G12315A происходят в генах, кодирующих митохондриальную тРНК лейцина. Мутация C3256T вызывает нарушение терминации трансляции, что препятствует отделению полипептидной цепи от рибосомы и приводит к блокированию дальнейшего использования как полипептида, так и рибосомы. Мутация G12315A приводит к замене A на G в одной из цепей тРНК лейцина, что нарушает ее третичную структуру. Общим последствием дефектов тРНК является нарушение трансляции и, как следствие, снижение продукции белков дыхательной цепи в митохондриях.
Мутация T3336C (ген первой субъединицы NADH-дегидрогеназы) вызывает замену последовательности ATT на ATC, не приводящую к изменению аминокислотной последовательности белка. Возможно, ассоциация гетероплазмии этой мутации с атеросклерозом объясняется тем, что данная мутация является сцепленной с другой (или несколькими другими) мутациями мтДНК, приводящими к дисфункции митохондрий. Такое предположение подкрепляется тем фактом, что уровни гетероплазмии мутаций, наиболее явно ассоциированных с атеросклерозом, коррелировали между собой.
Мутация G13513A вызывает замену аспарагиновой кислоты на аспарагин в белке субъединицы 5 комплекса NADH-дегидрогеназы, что приводит к нарушению переноса NADH с убихинона на различные цепи пластохинона. Продукт, синтезируемый дефектной мтДНК, является нефункциональным, и наличие гетероплазмии по данной мутации приводит к снижению эффективности работы комплекса I дыхательной цепи митохондрий, следствием чего может стать их дисфункция.
Однонуклеотидная замена G15059A является нонсенс-мутацией и приводит к замене глицина на стоп-кодон в позиции 190 цитохрома B. Это вызывает остановку трансляции, уменьшение размера белка и потерю 244 аминокислот С-конца белка. Цитохром B является частью комплекса III дыхательной цепи, функцией которого является перенос электронов на цитохром C и параллельный выброс четырёх протонов в межмембранное пространство митохондрий. Результатом данной мутации является ослабление ферментной функции цитохрома B.
Для всех мутаций митохондриального генома, исследованных в данной работе, ранее была выявлена связь с тяжестью атеросклеротического поражения аорты у человека. Одними из различных типов клеток, играющих роль в патофизиологии атеросклероза, являются клетки крови, мигрирующие из кровотока через эндотелий сосуда в интимо-медиальный слой. Лимфоциты при попадании в сосудистую стенку выполняют сигнальную роль в формировании иммунного и воспалительного ответа. Моноциты же формируют макрофагальные клетки, функция которых в сосудистой стенке сводится к удалению холестерина, накапливающегося в очаге атеросклеротического поражения. Наиболее существенным является их способность секретировать цитокины и хемокины и, тем самым, поддерживать воспалительный процесс в стенке сосуда. Активированные макрофаги способны к синтезу индуцируемой NO-синтазы и реактивных форм кислорода. Как полагают, именно эти факторы усугубляют эндотелиальную дисфункцию, способствуют миграции и пролиферации гладкомышечных клеток, и, в итоге, к формированию атеросклеротической бляшки. Можно предположить, что моноциты, несущие гетероплазмичные мутации мтДНК, модифицируясь в макрофаги после инфильтрации в субэндотелиальное пространство сосуда, из-за митохондриальной дисфункции не способны полностью метаболизировать модифицированные липопротеиды низкой плотности, накапливающиеся в атеросклеротической бляшке, и усугубляют ее развитие, превращаясь в пенистые клетки. При сравнении результатов проведенного исследования с данными, получеными Сазоновой М.А и соавторами [Sazonova M.A. et al, 2009] обнаружилось, что уровни гетероплазмии мутаций мтДНК C3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G15059A сходным образом взаимосвязаны со степенью атеросклеротического поражения, как при детекции наличия атеросклероза ультрасонографическим методом и изучении мтДНК лейкоцитов крови, так и при изучении мтДНК в тканях из различных типов атеросклеротических поражений на аутопсийном материале аорты человека. Эта тенденция служит подтверждением теории о роли циркулирующих моноцитов в процессе атерогенеза. Такое предположение может дополнить современные представления о молекулярно-клеточных механизмах атерогенеза, но оно, безусловно, требует доказательства путем изучения способности накопления липопротеидов, а также экспрессии про- и противовоспалительных цитокинов в культурах моноцитов, в которых клетки имеют различные уровни гетероплазмии изученных мутаций мтДНК.
В данной работе впервые была показана ассоциация мутаций митохондриального генома лейкоцитов крови человека с клиническими проявлениями атеросклероза - уровни гетероплазмии мутаций C3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G14459A были ассоциированы с наличием ИБС, а для мутаций C3256T и G12315A - также с перенесенным инфарктом миокарда. Мутации, имевшие положительную корреляцию уровня гетероплазмии мутаций мтДНК со степенью развития атеросклероза, имели достоверно более высокие уровни гетероплазмии у лиц, имевших клинические проявления атеросклероза, по сравнению с условно здоровыми пациентами.
Таким образом, в настоящей диссертационной работе разработаны подходы к генетической диагностике предрасположенности к атеросклерозу и сердечно-сосудистому риску, основанные на использовании мутаций митохондриального генома как биомаркеров. В исследованной гетерогенной выборке совокупность проанализированных мутаций объяснила 21,5% вариабельности патологического увеличения ТИМС, 32,7% случаев возникновения атеросклеротических бляшек и 28,5% случаев наличия атеросклероза, что превысило диагностические характеристики любого из традиционных факторов риска сердечно-сосудистых заболеваний. Дальнейшие исследования могут быть направлены на поиски новых генетических маркеров - мутаций митохондриального генома, ассоциированных с атеросклерозом, а также на проведение эпидемиологических исследований для оценки реальных сердечно-сосудистых рисков, обусловленных данными мутациями.
Выводы
В лейкоцитах крови человека обнаружено наличие гетероплазмии митохондриального генома по мутациям A1555G, C3256T, T3336C, C5178A, G12315A, G13513A, G14459A, G14846A и G15059A.
В выборке лиц из Москвы и Московской области уровни гетероплазмии мутаций С3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G15059A коррелировали как с толщиной интимо-медиального слоя сонных артерий, так и с размером атеросклеротических бляшек (абсолютные значения коэффициентов корреляции по Спирмену от 0,152 до 0,492).
Для мутаций C3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G14459A лейкоцитов крови человека обнаружены значимые различия (с достоверностью 95%) в средних уровнях гетероплазмии между группами лиц с наличием и отсутствием ИБС.
Для мутаций, ассоциированных с атеросклерозом сонных артерий, в большинстве случаев абсолютные значения коэффициентов корреляции между уровнями гетероплазмии друг для друга превышали 0,5, что указывает на преимущественно наследственную природу данных мутаций.
Влиянием совокупности всех исследованных мутаций можно объяснить 28,5 % случаев наличия атеросклероза сонных артерий, в то время как для совокупности традиционных факторов риска сердечно-сосудистых заболеваний это значение составляет не более 10%.
Оценена прогностическая значимость суммарной мутационной нагрузки по девяти исследованным мутациям как биомаркера наличия атеросклероза сонных артерий, для данной модели значение площади под ROC-кривой составило 0,71.
Практические рекомендации
Определение уровней гетероплазмии мутаций С3256T, T3336C, G12315A, G13513A и G15059A можно рекомендовать для увеличения эффективности диагностики повышенной предрасположенности к атеросклерозу и сердечно-сосудистым заболеваниям атеросклеротического генеза. Для измерения гетероплазмии митохондриального генома можно использовать как метод пиросеквенирования, описанный в работе, так и разрабатывать новые методы с целью удешевления анализа панели мутаций для одного пациента.
Список работ, опубликованных по теме диссертации
1. Сазонова М.А., Иванова М.М., Желанкин А.В., Митрофанов К.Ю., Хасанова З.Б., Собенин И.А., Мясоедова В.А., Постнов А.Ю., Орехов А.Н. Прямая количественная оценка мутантного аллеля митохондриального генома // Фундаментальные науки и практика. - 2010. - Т.1, №2. - С.19-21.
2. Иванова М.М., Сазонова М.А., Желанкин А.В., Митрофанов К.Ю., Хасанова З.Б., Собенин И.А., Мясоедова В.А., Постнов А.Ю., Орехов А.Н. Мутации митохондриального генома в патологии человека // Фундаментальные науки и практика. - 2010. - Т.1, №4. - С.164-167.
3. Сазонова М.А., Иванова М.М., Желанкин А.В., Митрофанов К.Ю., Хасанова З.Б., Собенин И.А., Мясоедова В.А., Постнов А.Ю., Орехов А.Н. Ассоциация мутации митохондриального генома 652insG с атеросклеротическими поражениями человека // Фундаментальные науки и практика. - 2010. - Т.1, №4. - С.168-171.
4. Сазонова М.А., Иванова М.М., Желанкин А.В., Митрофанов К.Ю., Коробов Г.А., Мясоедова В.А., Хасанова З.Б., Собенин И.А., Постнов А.Ю., Орехов А.Н. Детекция митохондриальной делеции гуанина в позиции 652 при атеросклеротических поражениях человека // Проблемы и перспективы современной науки. - 2011. - Т.3, №1. - С.105-107.
5. Сазонова М.А., Иванова М.М., Желанкин А.В., Митрофанов К.Ю., Хасанова З.Б., Собенин И.А., Мясоедова В.А., Постнов А.Ю., Орехов А.Н. Детекция мутации митохондриального генома человека 652insG при атеросклеротических поражениях сосудов человека // Молекулярная диагностика-2010. Сборник трудов VII всероссийской научно-практической конференции с международным участием. - Т.V. - С.109-112.
6. Сазонова М.А., Желанкин А.В., Иванова М.М., Митрофанов К.Ю., Постнов А.Ю., Орехов А.Н., Собенин И.А. Анализ мутации митохондриального генома A1555G при атеросклерозе интимы аорты человека // Современный мир, природа и человек. - 2011.- Т.2, №1. - С.67-69.
7. Желанкин А.В., Сазонова М.А., Коробов Г.А., Хасанова З.Б., Постнов А.Ю., Орехов А.Н., Собенин И.А. Детекция замены тимина на цитозин в позиции 3336 митохондриального генома при атеросклеротических поражениях человека // Современный мир, природа и человек. - 2011. - Т.2, №1. - С.59-61.
8. Сазонова М.А., Иванова М.М., Желанкин А.В., Митрофанов К.Ю., Коробов Г.А., Мясоедова В.А., Хасанова З.Б., Собенин И.А., Постнов А.Ю., Орехов А.Н. Детекция митохондриальной делеции гуанина в позиции 652 при атеросклеротических поражениях человека // Проблемы и перспективы современной науки. - 2011. - Т.3, №1. - С.105-107.
9. Желанкин А.В., Сазонова М.А. Роль мутаций митохондриального генома человека в развитии сахарного диабета 2 типа, артериальной гипертонии и различных видов кардиомиопатии // Проблемы и перспективы современной науки. - 2011. - Т.3, №1. - С.85-87.
10. Сазонова М.А., Желанкин А.В., Митрофанов К.Ю., Коробов Г.А., Иванова М.М., Постнов А.Ю., Собенин И.А. Мутации митохондриального гена 12s рРНК при атеросклерозе // Высокие технологии, фундаментальные и прикладные исследования в физиологии, фармакологии и медицине. - 2011. - Т.2. - С.283-284.
11. Сазонова М.А., Желанкин А.В., Иванова М.М., Митрофанов К.Ю., Коробов Г.А., Хасанова З.Б., Постнов А.Ю., Орехов А.Н., Собенин И.А. Детекция мутации G13513A в интиме аорты человека // Современный мир, природа и человек. - 2011. - Т.7, №1. - С.73-76.
12. Сазонова М.А., Желанкин А.В., Иванова М.М., Орехов А.Н., Постнов А.Ю. Анализ митохондриальной мутации A1555G в тотальных гомогенатах атеросклеротических поражений // Вестник уральской медицинской академической науки. - 2012. - Т.2, №39. - С.72-73.
13. Сазонова М.А., Желанкин А.В., Иванова М.М. Уровень гетероплазмии митохондриальной мутации C5178A в тотальных гомогенатах пораженной атеросклерозом интимы аорты // Вестник уральской медицинской академической науки. - 2012. - Т.2, №39. - С.73-74.
14. Митрофанов К.Ю., Желанкин А.В., Сазонова М.А., Собенин И.А., Постнов А.Ю. Хроническиe заболевания невоспалительного генеза и мутации митохондриального генома человека // Кардиологический вестник. - 2012. - Т.7, №19. - С.57-61.
15. Желанкин А.В., Сазонова М.А. Ассоциация мутаций митохондриального генома человека с хроническими заболеваниями невоспалительного генеза: сахарным диабетом 2 типа, артериальной гипертонией и различными видами кардиомиопатии // Патологическая физиология и экспериментальная терапия. - 2012. - Т.3. - С.124-129.
16. Sobenin I.A., Sazonova M.A., Ivanova M.M., Zhelankin A.V., Myasoedova V.A., Postnov A.Y., Nurbaev S.D., Bobryshev Y.V., Orekhov A.N. Mutation C3256T of Mitochondrial Genome in White Blood Cells: Novel Genetic Marker of Atherosclerosis and Coronary Heart Disease // PLoS ONE. - 2012. - Vol. 7, №10. - e46573. - doi: 10.1371/journal.pone.0046573.
17. Косогорова С.А., Сазонова М.А., Чичёва М.М., Митрофанов К.Ю., Желанкин А.В., Коробов Г.А., Собенин И.А. Анализ гетероплазмии митохондриальной мутации C5178A гена субъединицы 2 NADH дегидрогеназы в гомогенатах пораженной интимы аорты // Биомедицинский журнал Medline.ru. - 2012. - Т.13. - СТ. 75. - С.895-899.
18. Zhelankin A.V., Sazonova M.A., Ivanova M.M., Nikitina N.A., Sobenin I.A., Postnov A.Y., Orekhov A.N. Association of human mitochondrial DNA mutations with chronic noninflammatory diseases: hypertension, type 2 diabetes, and CHD // 80st Congress of the European Atherosclerosis Society, Milan, Italy. - 2012, May 25-28. - Interactive poster session. - Abstr. № 981.
19. Sazonova M.A., Ivanova M.M., Zhelankin A.V., Mitrofanov K.Y., Korobov G.A., Postnov A.Y., Sobenin I.A. Mutations of mitochondrial genes of subunits 1, 2, 5 and 6 of NADH dehydrogenase are associated with atherosclerotic lipofibrous plaques // 80st Congress of the European Atherosclerosis Society, Milan, Italy. - 2012, May 25-28. - Interactive poster session. - Abstr. № 986.
20. Sazonova M.A., Zhelankin A.V., Ivanova M.M., Korobov G.A., Mitrofanov K.Y., Postnov A.Y., Sobenin I.A. Detection of mutations G14846A and G15059A of gene coding cytochrome b in lipofibrous plaques in intima of human aortas // 80st Congress of the European Atherosclerosis Society, Milan, Italy. - 2012, May 25-28. - Interactive poster session. - Abstr. № 991.
21. Sobenin I.A., Sazonova M.A., Chicheva-Ivanova M.M., Mitrofanov K.Y., Zhelankin A.V., Bobryshev Y.V., Orekhov A.N. The level of heteroplasmy of mitochondrial genome is an explanatory biomarker for both subclinical and manifested atherosclerosis // 81st Congress of the European Atherosclerosis Society, Lyon, France. - 2013, June 2-5. - Interactive poster session. - Abstr. № 416.
Список сокращений
NADH - никотинамидадениндинуклеотидфосфат
АТФ - аденозинтрифосфат
ВАК - Высшая Аттестационная Комиссия
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
ИБС - ишемическая болезнь сердца
ЛПВП - липопротеиды высокой плотности
ЛПНП - липопротеиды низкой плотности
мтДНК - митохондриальная ДНК
ПЦР - полимеразная цепная реакция
ТИМС - толщина интимо-медиального слоя
тРНК - транспортная рибонуклеиновая кислота
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Анализ регуляторной, терморегуляторной, дыхательной, гомеостатической, питательной и защитной функций крови. Исследование форменных элементов крови. Химический состав тромбоцитов. Характеристика сферы действия лейкоцитов. Место лимфоцитов в системе крови.
презентация [630,7 K], добавлен 27.01.2016Структура геномов эукариот. Опыты Фредерика Гриффита. Принципы строения ДНК. Сюрпризы митохондриального генома. Эксперимент Альфреда Херши и Марты Чейз. Особенности структуры хроматина. Характеристика нуклеосомы и ее состав. Понятие структурного гена.
лекция [247,9 K], добавлен 21.07.2009Внутренняя среда организма. Система крови. Основы гемопоэза. Физико-химические свойства крови, состав плазмы. Резистентность эритроцитов. Группы крови и резус-фактор. Правила переливания крови. Количество, виды и функции лейкоцитов. Система фибpинолиза.
лекция [29,4 K], добавлен 30.07.2013Общая характеристика крови, ее свойства (суспензионные, коллоидные, электролитные) и основные функции. Состав плазмы, строение эритроцитов и лейкоцитов. Факторы, обуславливающие разделение крови людей на группы. Особенности процесса кроветворения.
реферат [405,2 K], добавлен 25.12.2012Генетическая терминология, организация генома вирусов, понятие о лизогенном и литическом цикле. Особенности генома и жизненного цикла ретровирусов, геном бактерий. Современные представления о геноме человека: теоретические и практические аспекты.
презентация [125,3 K], добавлен 04.04.2011Общая характеристика и функции иммунной системы. Органы и клетки иммунной системы. Основные виды иммунитета. Обеспечение оптимальной для метаболизма массы циркулирующей крови и количества форменных элементов крови (эритроцитов, лейкоцитов и тромбоцитов).
презентация [1001,2 K], добавлен 21.01.2015Системы транспорта ионов калия в митохондриях. Структура митохондриального АТФ-зависимого калиевого канала. Экстрагирование белков из митопластов. Определение проводимости бислойных липидных мембран. Выделение белка с молекулярной массой.
дипломная работа [516,3 K], добавлен 15.12.2008Легочная артерия, аорта и их крупные ветви. Распределение потока крови по всем тканям организма. Регуляция пропускной способности. Изменение просвета внеорганных артерий нервным и гуморальным путем. Сосуды возврата крови к сердцу. Причины движения крови.
лекция [4,2 M], добавлен 27.05.2014Особенности развития, строения, химического состава, обмена веществ и функций эритроцитов, лейкоцитов и тромбоцитов. Существующие типы гемоглобина. Токсичные формы кислорода в крови человека. Основные составляющие антиоксидантной системы организма.
презентация [202,4 K], добавлен 18.05.2015Химический состав крови. Исследование взаимосвязи группы крови и характера человека. Анализ и интерпретация результатов: лидерские качества, коммуникабельность, темпераменты, реакция на стрессовые ситуации. Болезни, присущие людям с разной группой крови.
курсовая работа [31,4 K], добавлен 14.01.2008Понятие лейкоцитоз и лейкопения. Основные функции лейкоцитов: защитная, транспортная, синтетическая, санитарная. Анализ групп лейкоцитов в зависимости от их строения: зернистые, незернистые. Главные причины возникновение лейкоцитоза и лейкопении.
реферат [27,7 K], добавлен 05.03.2012Амплификация как важный механизм увеличения объема генома. Роль горизонтального переноса генетического материала в эволюции генома. Значение сохранения дозового баланса генов в генотипе для формирования фенотипа. Взаимодействия между генами в генотипе.
реферат [18,7 K], добавлен 24.02.2010Изучение процесса образования, развития и созревания клеток крови: лейкоцитов, эритроцитов, тромбоцитов у позвоночных. Исследование основных гемопоэтических факторов роста. Клетки - предшественницы кроветворения. Анализ основных классов клеток крови.
презентация [2,9 M], добавлен 07.04.2014Понятие о системе крови. Органы кроветворения человека. Количество крови, понятия о ее депонировании. Форменные элементы и клетки крови. Функциональное значение белков плазмы. Поддержание постоянной кислотно-щелочного равновесия крови человека.
презентация [3,1 M], добавлен 29.10.2015Классификация и свойства генов, особенности структурных и регуляторных генов. Структурные единицы наследственности организмов. Особенности генома человека. Наследственный материал, заключенный в клетке человека. Уровни структурной организации хромосом.
презентация [564,6 K], добавлен 28.10.2014Обусловленность наследственной изменчивости типов мутаций и их комбинаций в последующих скрещиваниях. Генные, геномные, хромосомные мутации. Снижение жизнеспособности особей как последствие мутаций. Причины возникновения мутаций, безуспешность их лечения.
презентация [5,5 M], добавлен 11.02.2010Особенности эволюции человека как биологического и социального существа, а также понятие "генотип" и "фенотип". Классификация мутации, основанной на размерах сегментов генома. Комплементация функционального дефекта в клетках больных анемией Фанкони.
курсовая работа [48,2 K], добавлен 15.08.2014Физико-химические свойства крови. Выявление взаимосвязи группы крови и характера человека. Различные проявления лидерских качеств, коммуникабельности, темперамента, реакции на стрессовые ситуации. Болезни, свойственные людям с разной группой крови.
реферат [41,1 K], добавлен 22.11.2010Объем крови в организме взрослого здорового человека. Относительная плотность крови и плазмы крови. Процесс образования форменных элементов крови. Эмбриональный и постэмбриональный гемопоэз. Основные функции крови. Эритроциты, тромбоциты и лейкоциты.
презентация [4,2 M], добавлен 22.12.2013Кровь — жидкая ткань организма, состоящая из плазмы и взвешенных в ней клеток: лейкоцитов, эритроцитов и тромбоцитов. Свойства крови, транспортная, защитная, терморегуляторная функции. Антигенные характеристики эритроцитов, определяющих группы крови.
презентация [532,1 K], добавлен 21.02.2016