Частота встречаемости KIR-генов и их HLA-лигандов среди пациентов инфицированных вирусом гепатита С в Азербайджане
Анализ инфекции, вызванной вирусом гепатита С. Оценка распределения KIR-генов, HLA-лигандов, KIR/HLA комбинаций среди пациентов, инфицированных гепатитом С. Статистически значимые различия между контрольной группой и хроническими носителями ВГС-инфекции.
Рубрика | Биология и естествознание |
Вид | статья |
Язык | русский |
Дата добавления | 29.12.2019 |
Размер файла | 101,0 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
Частота встречаемости KIR-генов и их HLA-лигандов среди пациентов инфицированных вирусом гепатита С в Азербайджане
Инфекция, вызванная вирусом гепатита С (ВГС), является важной причиной хронического заболевания печени, характеризуются тяжелым клиническим течением, являясь частой причиной цирроза и первичного рака печени, чья распространенность колеблется от 0,01% до 26% по всему миру [1-3].
Иммуноглобулинподобные рецепторы киллерных клеток (KIR), взаимодействуя со своими лигандами - антигенами главного комплекса гистосовместимости (HLA) I класса, играют ключевую роль в регуляции функциональной активности натуральных киллерных клеток (NK), которые, являясь важнейшим компонентом врожденного иммунитета, обеспечивают быструю элиминацию инфицированных клеток, сохраняя при этом толерантность к неповрежденным клеткам организма [4, 5]. Связывание HLA-лигандов с ингибирующими KIR-рецепторами (iKIR) приводит к подавлению функциональной активности NK-клеток, а с активирующими (аKIR) - к усилению функциональной активности NK-клеток [6-8]. Так же как и система HLA, система KIR-генов обладает чрезвычайно высоким уровнем полиморфизма [9, 10]. Полиморфизм KIR-генов и сочетания KIR-HLA являются важным иммуногенетическим фактором, играющим существенную роль в предрасположенности и резистентности к инфекционным, аутоиммунным и онкологическим заболеваниям [11-13].
Целью настоящего исследования явилось изучение распределения KIR-генов, HLA-лигандов и KIR/HLA комбинаций среди пациентов инфицированных гепатитом С.
Материалы и методы исследования. Нами было обследовано 109 пациентов инфицированных гепатитом С на частоту встречаемости КИР генов, в возрасте от 25 до 50 лет. В качестве материала исследования использовали геномную ДНК, которую выделяли из периферической крови. Типирование генов KIR-системы осуществляли методом полимеразной цепной реакции с сиквенс-специфическими праймерами, c использованием наборов «KIR Genotyping SSP Kit» (Invitrogen). Данные наборы позволяют определять наличие или отсутствие всех известных на настоящее время KIR-генов: 2DL1, 2DL2, 2DL3, 2DL4, 2DL5А, 2DL5В, 2DS1, 2DS2, 2DS3, 2DS4, 2DS5, 3DL1, 3DL2, 3DL3, 3DS1, 2DP1, 3DP1, а также полные и делегированные аллельные варианты 2DS4 и 3DP1.
Результаты и их обсуждение. Согласно результатам проведенного нами исследования, было выявлено, что у ВГС инфицированных лиц с хронической формой течения болезни, увеличивается частота встречаемости KIR2DS1 и KIR2DL5 генов, по сравнению с здоровыми носителями (доноры) (табл. 1).
Таблица 1. Сравнительная характеристика частоты встречаемости KИР генов среди доноров и хроническими носителями гепатита С, %
Сравнительное исследование, проведенное между здоровой популяцией (доноры) и инфицированными лицами с ХВГС инфекцией, показали более высокую частоту встречаемости ингибирующих KIR генов (гаплотип А) и более низкую частоту встречаемости активирующих KIR генов (гаплотип В) в обеих группах (как в контрольной группе, так и в группе инфицированных лиц с хронической ВГС инфекцией). Тем не менее, были обнаружены небольшие различия в частоте встречаемости KIR генов между контрольной группой (доноры) и хроническими носителями ВГС инфекции, так, например, частота встречаемости ингибированной KIR2DL2 (44,3%) и KIR2DL3 (58,5%) генов среди доноров в 1,1 раз больше, чем у хронических носителей гепатита С (40,0%, 53,1%). KIR2DL3 среди доноров составляет 88,9% случаев, что в 1,02 раза больше, чем у ХВГС (87,0%), KIR3DL1 среди доноров составляет 95,0% случаев, что в 1,11 раз больше, чем среди ХВГС (85%).
Частота встречаемости активированных KIR генов среди доноров и хроническими носителями гепатита С тоже имеют свои различия. Так частота встречаемости активированных KIR2DS1 (42,0%) в 1,05 раз, а KIR2DS5 (30,0%) в 1,2 раз выше среди ХГС, чем в контрольной группе обследованных доноров (KIR2DS1 40,0%, KIR2DS5 25,0%).
Частота встречаемости активированных KIR2DS2 гена (46,5%) в 1,47 раз выше, чем соответствующий ген у хронических носителей гепатита С (31,5%), частота встречаемости активированных KIR2DS3 (38,5%) в 1,21 раз выше у доноров, по сравнению с группой обследованных ХВГС (31,7%) , а частота встречаемости активированных KIR3DS1 (38,3%) в 1,27 раз выше у здоровой популяции доноров, по сравнению с группой хронических носителей гепатита С (30,1%).
Таблица 2. Частота встречаемости комбинаций KИР генов с их HLA-C лигандами среди доноров и хроническими носителями гепатита С, %
Как при сравнительной характеристике частоты встречаемости КИР генов между донорами и инфицированными лицами с ХВГС, так и при сравнительной характеристике частоты встречаемости комбинаций KIR генов с их HLA-C лигандами, наблюдалось более высокая частота встречаемости гаплотипа A и более низкая частота встречаемости гаплотипа B, как в контрольной группе (доноры), так и у пациентов с хроническим гепатитом С. Были обнаружены небольшие различия в частоте встречаемости KИР генов с их HLA-C лигандами между контрольной группой (доноры) и хроническими носителями ВГС инфекции, так, например, частота встречаемости комбинации ингибированных KIR генов и HLA C1C1 лиганда следующая: KIR2DL1C1C1 (75,0%) и KIR2DL3C1C1(77,0%) у лиц хронических носителей гепатита С, что в 1,14 раз выше, чем в контрольной группе обследованных доноров (KIR2DL1C1C166,0%, KIR2DL3C1C1 67,2%). Частота встречаемости KIR2DL2C1C1 (62,1%) у лиц с ХВГС в 1,21 раз ниже, чем в контрольной группе обследованных доноров (51,0%).
Частота встречаемости комбинации KIR2DL1C1C2 среди хронических носителей гепатита С составляет 22,1%, что в 1,4 раз ниже, чем у контрольной группы обследованных доноров (31,1%). Тогда, как KIR2DL2C1C2 среди хронических носителей гепатита С (49,0%) в 1,4 раз выше, чем у контрольной группы обследованных доноров (35,0%). Частота встречаемости KIR2DL3C1C2 комбинации у лиц с ХВГС (19,6%) в 1,58 раз меньше данной комбинации у контрольной группы обследованных доноров (31,0%). Не было выявлено ни каких различий в частоте встречаемости KIR2DL1C2C2 в обеих группах обследованных. Комбинация KIR2DL2C2C2 был выявлен только в контрольной группе обследованных доноров и составил 2,9%. Частота встречаемости комбинации KIR2DL3C2C2 в 2,6 раз выше в группе лиц с ХВГС(3,4%), чем в контрольной группы обследованных доноров (1,3%).
Частота встречаемости комбинации активированных KIR генов с HLA-C1C1 лиганда среди доноров и хроническими носителями гепатита С тоже имеют свои различия. Так частота встречаемости KIR 2DS1C1C1 среди хронических носителей гепатита С составляет 70,1%, что в 1,2 раза больше, чем частота встречаемости данной комбинации в контрольной группе обследованных доноров (62,2%). KIR2DS2C1C1 в 1,33 раз меньше встречается у лиц с ХВГС (57,2%), чем у контрольной группы доноров (76,2%). Частота встречаемости KIR2DS3C1C1 среди лиц с ХВГС составило 74,1%, что в 1,05 выше, чем у контрольной группы доноров (70,0%). Частота встречаемости комбинации KIR2DS1C1C2 среди хронических носителей гепатита С составляет 28,2%, что в 1,04 раз ниже, чем у контрольной группы обследованных доноров (29,5%). Частота встречаемости KIR2DS2C1C2 комбинации у лиц с ХВГС (42,8%), что в 1,81 раз превышает показатели частоты встречаемости данной комбинации у контрольной группы обследованных доноров (23,6%). KIR2DS3C1C2 среди хронических носителей гепатита С (21,2%) в 1,34 раз ниже, чем у контрольной группы обследованных доноров (28,6%).
У лиц с ХВГС частота KIR2DS1C2C2 составило 1,7%, что в 4,5 раз ниже данной комбинации у доноров. Комбинация KIR2DS2C2C2, также как и при частоте встречаемости комбинации KIR2DL2C2C2, был выявлен только в контрольной группе обследованных доноров и составил 2,2 %.
KIR2DS3C2C2 в 3,35 раз выше в группе лиц с ХВГС(4,7%), чем в контрольной группы обследованных доноров (1,4%).
Не было обнаружено статистически значимых различий между контрольной группой (доноры) и хронических носителями ВГС инфекции, при сравнении частоты встречаемости комбинаций KИР генов с их HLA-C лигандами.
Список использованных источников
инфекция гепатит kir ген
1. Middleton D., Gonzalez F. The extensive polymorphism of KIR genes // Immunology. - 2009. - Vol. 129. - P. 8-19.
2. Vejbaesya S., Nonnoi Y., Tanwandee T., Srinak D. Killer cell immunoglobulin-like receptors and response to antiviral treatment in Thai patients with chronic hepatitis C virus genotype 3a // J Med Virol. - 2011. - Vol. 83 - P. 1733-1737.
3. Vilches C., Parham P. KIR: diverse, rapidly evolving receptors of innate and adaptive immunity // Annual Reviews of Immunology. - 2002. - Vol. 20. - P. 217-251.
4. Askar M., Avery R., Corey R., Lopez R. Lack of killer immunoglobulin-like receptor 2DS2 (KIR2DS2) and KIR2DL2 is associated with poor responses to therapy of recurrent hepatitis C virus in liver transplant recipients // Liver Transpl. - 2009 Nov. - Vol. 15(11), P. 1557-63.
5. Du Z., Gjertson D.W., Reed E.F., Rajalingam R. Receptor-ligand analyses defi ne minimal killer cell Iglike receptor (KIR) in humans // Immunogenetics. - 2007. - Vol. 59. - P. 1-15.
6. Irshad M., Khushboo I., Singh S. Hepatitis C Virus (HCV): A review of immunological aspects // Int Rev Immunol. - 2008. - Vol. 27. - P. 497-517.
7. Montes-Cano M.A., Caro-Oleas J.L., Romero-Gуmez M. et al. HLA-C and KIR genes in hepatitis C virus infection // Hum Immunol. - 200. - Vol. 66. - P. 1106-1109.
8. Romero V., Azocar J., Zъсiga J., Clavijo O.P. Interaction of NK inhibitory receptor genes with HLA-C and MHC class II alleles in hepatitis c virus infection outcome // Mol Immunol. - 2008. - Vol. 45, P. 2429-2436.
9. Ge D., Fellay J., Thompson A.J., Simon J.S. et al. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance // Nature. - 2009. - Vol. 461. - P. 399-401.
10. Parham P. MHC class I molecules and KIRs in human history, health and survival // Nature Reviews. Immunology. - 2005. - Vol. 5. - P. 201-214.
11. Hollenbach J.A., Meenagh A., Sleator C. et al. Report from the killer immunoglobulin-like receptor (KIR) anthropology component of the 15th International Histocompatibility Workshop: worldwide variation in the KIR loci and further evidence for the co-evolution of KIR and HLA // Tissue Antigens. - 2010. - Vol. 76. - P. 9-17.
12. Single R.M., Martin M.P., Gao X. et al. Global diversity and evidence for coevolution of KIR and HLA // Nature Genetics. - 2007. - Vol.39, №9. - P. 1114-1119.
13. Stewart C.A., Laugier-Anfossi F., Vely F. et al. Recognition of peptide-MHC class I complexes by activating killer immunoglobulin-like receptors // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2005. - Vol. 102. - №37. - P. 13224-13229.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Адсорбция лигандов на поверхности бислоя. Классы лигандов, взаимодействующих с липидным бислоем. Коэффициент распределения для поверхностных концентраций. Проницаемость биомембран и потенциал внутренних диполей. Измерение трансмембранного потенциала.
реферат [3,1 M], добавлен 03.08.2009Дифференциальная экспрессия генов и ее значение в жизнедеятельности организмов. Особенности регуляции активности генов у эукариот и их характеристики. Индуцибельные и репрессибельные опероны. Уровни и механизмы регуляции экспрессии генов у прокариот.
лекция [2,8 M], добавлен 31.10.2016Эволюция представлений о гене. Основные методы идентификации генов растений. Позиционное клонирование (выделение) генов, маркированных мутациями. Выделение генов, маркированных делециями методом геномного вычитания и с помощью метода Delet-a-gen.
контрольная работа [937,4 K], добавлен 25.03.2016Особенности транскрипции генов оперонов на примере пластома ячменя. Структурно-термодинамические исследования генов. Поиск, картирование элементов геномных последовательностей. Анализ гена растительных изопероксидаз. Характеристика модифицированных генов.
реферат [23,2 K], добавлен 12.04.2010Формы взаимодействия аллельных генов: полное и неполное доминирование; кодоминирование. Основные типы взаимодействия неаллельных генов: комплементарность; эпистаз; полимерия; гены-модификаторы. Особенности влияния факторов внешней среды на действие генов.
курсовая работа [601,5 K], добавлен 21.09.2010Разнообразие генов, регулирующих процесс цветения растений. Схематическое изображение генеративного побега арабидопсиса. Молекулярная характеристика генов, контролирующих идентичность цветковой меристемы. Экспрессия генов идентичности цветковых меристем.
реферат [709,9 K], добавлен 06.01.2010Инсерционный мутагенез как метод прямой и обратной генетики. Типы инсерционных мутагенов и их особенности. Использование инсерционного мутагенеза для инактивации генов на основе явления РНК-интерференции. Выделение генов, маркированных инсерцией.
контрольная работа [1,3 M], добавлен 25.03.2016Основные типы взаимодействия неаллельных генов. Комплементарное взаимодействие на примере наследования формы гребня у кур. Расщепление по фенотипу. Эпистатическое взаимодействие генов. Доминантный эпистаз на примере наследования масти у лошадей.
презентация [121,3 K], добавлен 12.10.2015Понятие и общее описание механизма рекомбинации генов, классификация и типы форм его реализации: общей и сайт-специфической. Особенности взаимодействий, обусловленных спариванием оснований между комплементарными цепями гомологичных спиралей ДНК.
курсовая работа [37,4 K], добавлен 18.10.2013Изучение регуляции экспрессии генов как одна из актуальных проблем современной генетики. Строение генома Drosophila melanogaster. Характеристика перекрывающихся генов leg-arista-wing complex и TBP-related factor 2. Подбор рациональной системы экспрессии.
дипломная работа [2,0 M], добавлен 02.02.2018Исследование понятия и основных особенностей ДНК-геномных вирусов. Изучение жизненного цикла вируса. Характеристика вируса папилломы человека. Описание болезней, вызываемых вирусом папилломы человека. Лабораторная диагностика папилломавирусной инфекции.
реферат [94,2 K], добавлен 17.03.2014Основные способы заражения куриных эмбрионов вирусом. Этапы получения субкультур: снятие клеточного слоя, отделение и посев клеток, методика заражения клеточных культур вирусом, учет результатов. Полуперевиваемые культуры клеток человека и животных.
презентация [4,2 M], добавлен 29.01.2015Экспрессия генов - способность контролировать синтез белка. Структура и свойства генетического кода, его универсальность и просхождение. Передача генетической информации, транскрипция и трансляция. Митохондриальный и хлоропластный генетические коды.
реферат [41,5 K], добавлен 27.01.2010Внесение мутированного гена в наследственную информацию клеток с целью "препарирования" генетического заболевания. Определение роли метилирования ДНК и механизма его негативного воздействия организм. Содержание методики "программируемого нокаута генов".
реферат [608,3 K], добавлен 15.06.2010Понятие "ген", развитие представлений о нем, раскрытие фундаментального понятия современной генетики. Структура генов и генетическая информация о первичной структуре белка. Структурные гены, характеризующиеся уникальными последовательностями нуклеотидов.
реферат [167,3 K], добавлен 29.09.2009Ген как последовательность ДНК, несущая информацию об определенном белке. Идентификация генов по кластеру (группе) мутаций. Элементарный фактор наследственности: доминантные и рецессивные признаки. Независимость генов, роль хромосом в наследственности.
реферат [2,9 M], добавлен 26.09.2009Рассмотрение разных наследственных форм мухи дрозофилы. Выведение Морганом закона о сцепленном наследовании генов, находящихся в одной хромосоме. Хромосомная теория наследственности. Изучение случаев нарушения сцепления генов в процессе кроссинговера.
презентация [1,9 M], добавлен 11.04.2013Транскрипция и основные ферменты, которые осуществляют транскрипцию, ДНК-зависимые РНК-полимеразы. Структурные и функциональные домены больших субъединиц эукариотической РНК-полимеразы. Регуляция экспрессии генов на уровне транскрипции у прокариот.
реферат [373,5 K], добавлен 29.09.2009Классы иммуноглобулинов и их функции, принципиальная особенность, нейтрализующее действие в минимальных концентрациях. Процесс рекомбинации генов, кодирующих легкие и тяжелые цепи иммуноглобулинов. Конфигурация Т-клеточных рецепторов, виды генов.
реферат [35,6 K], добавлен 02.04.2016Основные положения и этапы процесса экспрессии генов. Перенос информации о нуклеотидной последовательности ДНК на уровень РНК. Процессинг РНК у прокариот. Генетический код, его назначение и порядок формирования. Общие особенности процесса трансляции.
курсовая работа [54,6 K], добавлен 27.07.2009