Омиксные технологии в изучении Bacillus anthracis
Результаты актуальных исследований возбудителя сибирской язвы, полученные с помощью омиксных технологий. Основные достижения в области геномики, протеомики, транскриптомики, интерактомики, метаболомики Bacillus anthracis в результате их применения.
| Рубрика | Биология и естествознание |
| Вид | статья |
| Язык | русский |
| Дата добавления | 03.06.2021 |
| Размер файла | 60,5 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
33. Passalacqua K.D., Varadarajan A., Ondov B.D., Okou D.T., Zwick M.E., Bergman NH. Structure and complexity of a bacterial transcriptome. J. Bacteriol., 2009, vol. 191, no. 10, pp. 3203-3211. doi: 10.1128/JB.00122-09.
34. Passalacqua K.D., Bergman N.H., Lee J.Y., Sherman D.H., Hanna P.C. The global transcriptional responses of Bacillus anthracis Sterne (34F2) and a AsodA1 mutant to paraquat reveal metal ion homeostasis imbalances during endogenous superoxide stress. J. Bacteriol., 2007, vol. 189, no, 11, pp. 3996-4013. doi: 10.1128/JB.00185-07.
35. Pearson T., Busch J.D., Ravel J., Read T.D., Rhoton S.D., U'Ren J.M., Simonson T.S., Kachur S.M., Leadem R.R., Cardon M.L., Van Ert M.N., Huynh L. Y, Fraser C.M., Keim P. Phylogenetic discovery bias in Bacillus anthracis using single-nucleotide polymorphisms from whole-genome sequencing. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, vol. 101, no. 37, pp. 13536-13541. doi: 10.1073/pnas.0403844101.
36. Ravel J., Jiang L., Stanley S.T., Wilson M.R., Decker R.S., Read T.D., Worsham P., Keim P.S., Salzberg S.L., Fraser-Liggett C.M., Rasko D.A. The complete genome sequence of Bacillus anthracis Ames «Ancestor». J. Bacteriol., 2009, vol. 191, no. 1, pp. 445-446. DOI: 10.1128/JB.01347-08.
37. Read T.D., Salzberg S.L., Pop M., Shumway M., Umayam L., Jiang L., Holtzapple E., Busch J.D., Smith K.L., Schupp J.M. Solomon D., Keim P., Fraser C.M. Comparative genome sequencing for discovery of novel polymorphisms in Bacillus anthracis. Science, 2002, vol. 296, no. 5575, pp. 2028-2033. doi: 10.1126/science.1071837.
38. Read T.D., Peterson S.N., Tourasse N., Baillie L.W., Paulsen I.T., Nelson K.E., Tettelin H., Fouts D.E., Eisen J.A., Gill S.R., Holtzapple E.K., Okstad O.A., Helgason E., Rilstone J., Wu M., Kolonay J.F., Beanan M.J., Dodson R.J., Brinkac L.M., Gwinn M., DeBoy R.T., Madpu R., Daugherty S.C., Durkin A.S., Haft D.H., Nelson W.C., Peterson J.D., Pop M., Khouri H.M., Radune D., Benton J.L., Mahamoud Y., Jiang L., Hance I.R., Weidman J.F., Berry K.J., Plaut R.D., Wolf A.M., Watkins K.L., Nierman W.C., Hazen A., Cline R., Redmond C., Thwaite J.E., White O., Salzberg S.L., Thomason B., Friedlander A.M., Koehler T.M., Hanna P.C., Kolst0 A.B., Fraser C.M. The genome sequence of Bacillus anthracis Ames and comparison to closely related bacteria. Nature, 2003, vol. 423, no. 6935, pp. 81-86. doi: 10.1038/nature01586.
39. Riojas M.A., Kiss K., McKee M.L., Hazbon M.H. Multiplex PCR for species-level identification of Bacillus anthracis and detection of pXO1, pXO2, and related plasmids. Health Secur., 2015, vol. 13, no. 2, pp. 122-129. doi: 10.1089/hs.2014.0056.
40. Seo G.M., Jung K.H., Kim S.J., Kim J.C., Yoon J.W., Oh K.K., Lee J.H., Chai Y G Bacillus anthracis spores influence ATP synthase activity in murine macrophages. J. Microbiol. Biotechnol., 2008, vol. 18, no. 4, pp. 778-783.
41. Seo G.M., Kim S.J., Kim J.C., Nam D.H., Yoon M.Y., Koo B.S., Chai Y G. Targeting of Bacillus anthracis interaction factors for human macrophages using two-dimensional gel electrophoresis. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2004, vol. 322, no. 3, pp. 854-859. doi: m. 1016/j.bbrc.2004.07.190.
42. Spratlin J.L., Serkova N.J., Eckhardt SG Clinical applications of metabolomics in oncology: a review. Clin. Cancer Res., 2009, vol. 15, no. 2, pp. 431-440. doi: 10.n58/1078-0432.CCR-08-1059.
43. Van Ert M.N., Easterday W.R., Huynh L.Y., Okinaka R.T., Hugh-Jones M.E., Ravel J., Zanecki S.R., Pearson T., Simonson T.S., U'Ren J.M., Kachur S.M., Leadem-Dougherty R.R., Rhoton S.D., Zinser G, Farlow J., Coker P.R., Smith K.L., Wang B., Kenefic L.J., Fraser-Liggett C.M., Wagner D.M., Keim P. Global genetic population structure of Bacillus anthracis. PLoS One, 2007, vol. 2, no. 5, pp. e 461. doi: 10.1371/journal.pone.0000461.
44. Vitzthum F., Behrens F., Anderson N.L., Shaw J.H. Proteomics: from basic research to diagnostic application. A review of requirements & needs. J. Proteome Res., 2005, vol. 4, no. 4, pp. 1086-1097. doi: 10.1021/pr050080b.
45. Wang Z., Gerstein M., Snyder M. RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics. Nat. Rev. Genet., 2009, vol. 10, no. 1, pp. 57-63. doi: 10.1038/nrg2484.
46. Wunschel D.S., Hutchison J.R., Deatherage Kaiser B.L., Merkley E.D., Hess B.M., Lin A., Warner M. G Proteomic signatures differentiating Bacillus anthracis Sterne sporulation on soil relative to laboratory media. Analyst., 2017, vol. 143, no. 1, pp. 123-132. doi: 10.1039/c7an01412k.
47. Zhong W., Shou Y., Yoshida T.M., Marrone B.L. Differentiation of Bacillus anthracis, B. cereus, and B. thuringiensis by using pulsed-field gel electrophoresis. Appl. Environ. Microbiol., 2007, vol. 73, no. 10, pp. 3446-3449. doi: 10.1128/AEM.02478-06 1.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
История и классификация антибиотиков. Их влияние на бактерии рода Bacillus. Интенсивность роста колоний данного микроорганизма при различных концентрациях антибиотика, растворённого в питательной среде. Метод диффузии в агар с использованием желобка.
курсовая работа [1,8 M], добавлен 09.09.2009Характеристика возбудителя сибирской язвы: бацилла антрацис - крупная спорообразующая грамположительная палочка, морфологические свойства, ферментативная активность, антигенная структура; устойчивость микроба, эволюция и вирулентность; источник инфекции.
курсовая работа [36,5 K], добавлен 05.01.2011It was proposed to use the 2H-labeled hydrolysate of RuMP facultative methylotroph Brevibacterium methylicum, obtained from deuterated salt medium dM9 as a substrate for the growth of inosine producing bacterium Bacillus subtilis.
статья [550,4 K], добавлен 23.10.2006Формирование геномики и протеомики как новых фундаментальных дисциплин в 1990-х гг. Установление матричного механизма белкового синтеза с передачей генетического кода от ДНК к белку. Методы решения задачи полного секвенирования генома микроорганизмов.
реферат [25,8 K], добавлен 16.11.2013Механизм воздействия прокариотических микроорганизмов на спав и липазу. Щелочные протеиназы рода Bacillus. Методика выделения, изучение свойств концентрированного ферментного препарата и порядок его применения в процессе обезжиривания меховой овчины.
дипломная работа [169,7 K], добавлен 27.11.2010Классификация возбудителя чумы. Прижизненная микроскопическая картина клеток. Температурный оптимум чумы. Бактерии вирулентных штаммов. Природный резервуар чумной инфекции. Механизм развития заболевания бруцелеза, чумы, сибирской язвы, туляремия.
презентация [36,4 M], добавлен 17.03.2014Аэробные спорообразующие бактерии (бациллы), род Bacillus семейства Bacillaceae, их морфолого-физиологические признаки. Санитарно-показательные микроорганизмы. Санитарно-гигиеническая характеристика пищевых продуктов. Возбудители кишечных заболеваний.
контрольная работа [20,4 K], добавлен 10.06.2009Общие бактериальные болезни насекомых, энтомопатогенные бактерии. Негативное влияние бактерий на здоровье человека. Характеристика и механизм действия бактерий Bacillus thuringiensis. Бактериальные препараты: применение и методы повышения эффективности.
курсовая работа [48,4 K], добавлен 02.12.2010Анализ биотехнических мероприятий, проводимых для сибирской косули в Ромненском районе Амурской области. Динамика численности косули на территории района. Разработка предложений по организации и проведению биотехнических мероприятий для сибирской косули.
дипломная работа [80,8 K], добавлен 21.11.2009Осуществлен биосинтез 2Н-меченого пуринового рибонуклеозида инозина с использованием адаптированного к дейтерию штамма Bacillus subtilis в тяжеловодородной среде высокого уровня дейтерированности с гидролизатом биомассы метилотрофной бактерии.
статья [2,5 M], добавлен 23.10.2006Воздействие синергетики на современные высокие социальные технологии. Синергетика как междисциплинарное направление научных исследований. Основные понятия синергетики. Синергетический подход в биофизике. Основные принципы синергетики в естествознании.
реферат [18,8 K], добавлен 25.06.2010Главные направления научной деятельности Э. Чаргаффа. Биография и исследовательские работы Р. Коха. Методы изучения патогенных организмов Р. Коха. Обнаружение Кохом сибирской язвы. Анализ медицинской практики Коха. Изучение Кохом туберкулеза и холеры.
презентация [740,7 K], добавлен 02.03.2012Среда обитания, образ жизни и кормление сибирской ряпушки. Эмбриональное и постэмбриональное развитие. Управление половыми циклами. Транспортировка икры, личинок, молоди и взрослых особей сибирской ряпушки. Изучение биологических основ акклиматизации.
курсовая работа [2,4 M], добавлен 06.12.2016Объекты, полученные в результате клонирования. Метод "переноса ядра" как наиболее успешный из методов клонирования высших животных. Получение стволовых клеток, генетически совместимых с донорским организмом. Репродуктивное клонирование человека.
презентация [657,4 K], добавлен 21.04.2013Развитие и унификация технических средств информационных технологий. Современные средства накопления информации. Проблемы воспроизведения живого образа, голографическая память и нейронные сети, лазерные технологии. Истоки микроэлектронной технологии.
реферат [77,8 K], добавлен 13.12.2009Качественная оценка охотничьих угодий Михайловского района по сибирской косуле, их классификация. Типы леса Михайловского района. Биология косули, морфологические различия европейской и сибирской косуль. Бонитировка охотничьих угодий Михайловского района.
курсовая работа [46,3 K], добавлен 30.10.2009Сущность и механизм развития ноосферы как предположительно новой, высшей стадии эволюции биосферы, становление которой связано с развитием общества. Современные достижения в данной области, характер, особенности исследований Вернадского, условия развития.
презентация [570,4 K], добавлен 11.04.2015Рассмотрены основные области применения протеаз - ферментов, расщепляющих белки. Пищевая промышленность. Применение в бытовой химии. Применение протеаз в легкой промышленности. Применение протеиназ в кожевенном производстве. Меховое производство.
реферат [8,7 K], добавлен 19.04.2004Операторы выбора родителей. Рекомбинация бинарных строк. Моделирование одно-, двух- и многоточечного, триадного кроссинговеров. Построение рулетки для отбора хромосом. Выбор партнера для скрещивания. Результаты применения генетических операторов.
курсовая работа [362,5 K], добавлен 27.03.2016Пути миграции селемджинской популяции сибирской косули в Мазановском районе Амурской области, основные места зимовок селемджинской. Динамика численности популяции на территории МУМП "Мазановский охотпромхоз" в зависимости от высоты снежного покрова.
дипломная работа [79,1 K], добавлен 23.01.2010
