Определение аналитической специфичности методов ПЦР для идентификации Acidovorax citrulli
Оценка аналитической специфичности существующих молекулярно-генетических методов идентификации возбудителя бактериальной пятнистости тыквенных культур Acidovorax citrulli. Определения значения эксклюзивности каждого метода полимеразной цепной реакции.
| Рубрика | Биология и естествознание |
| Вид | статья |
| Язык | русский |
| Дата добавления | 11.08.2021 |
| Размер файла | 235,7 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
9. Zarco-Tejada PJ, Camino C, Beck PSA, Calderon R, Hornero A, Hernandez-Clemente R, Kattenborn T, Montes-Borrego M, Susca L, Morelli M, Gonzalez-Dugo V, North PRJ, Landa BB, Boscia D, Saponari M, Navas-Cortes JA. Previsual symptoms of Xylella fastidiosa infection revealed in spectral plant-trait alterations. Nature Plants. 2018. 4(7):432-439. doi: 10.1038/s41477-018-0189-7
10. Gorobey IM, Osipova GM. The problem of bacterioses in plants and approaches to solving it. Siberian Herald of Agricultural Science. 2017;47(4):94-102. In Russian, English summary.
11. Islam MR, Hossain MR, Kim HT, Jesse DMI, Abuyusuf M, Jong HJ, Park JI, Nou IS. Development of molecular markers for detection of Acidovorax citrulli strains causing bacterial fruit blotch disease in melon. Int. J. Mol. Sci. 2019;20(11).2715:1-16. doi: 10.3390/ijms20112715
12. Cunty A, Audusseau C, Paillard S, Olivier V First report of Acidovorax citrulli, the causal agent of bacterial fruit blotch, on melon (Cucumis melo) in Guadeloupe (France). Plant Disease. 2018;103(5):1017. doi: 10.1094/PDIS-10-18-1825-PDN
13. Kruse A, Fleites LA, Heck M. Lessons from one fastidious bacterium to another: What can we learn about Liberibacter species fromXylella fastidiosa. Insects. 2019;10(9).300:1-23. doi: 10.3390/insects10090300
14. Boykin LM, Sseruwagi P, Alicai T, Ateka E, Mohammed IU, Stanton JL, Kayuki C, Mark D, Fute T, Erasto J, Bachwenkizi H, Muga B, Mumo N, Mwangi J, Abidrabo P, Okao-Okuja G, Omuut G, Akol J, Apio HB, Osingada F, Kehoe MA, Eccles D, Savill A, Lamb S, Kinene T, Rawle CB, Muralidhar A, Mayall K, Tairo F, Ndunguru J. Tree lab: Portable genomics for early detection of plant viruses and pests in Sub-Saharan Africa. Genes. 2019;10(9).632:1- 13. doi: 10.3390/genes10090632
15. PM 7/127 (1) Acidovorax citrulli. EPPO Bulletin. 2016;46(3):444-462. doi: 10.1111/ epp.12330
16. PM 7/76 (5) Use of EPPO diagnostic standards. EPPOBulletin. 2018;48(3):373-377. doi: 10.1111/epp.12506
17. PM 7/98 (3) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. EPPO Bulletin. 2018;48(3):387-404. doi: 10.1111/epp.12508
18. Giovanardi D, Sutton SA, Stefani E, Walcott RR. Factors influencing the detection of Acidovorax citrulli in naturally contaminated cucurbitaceous seeds by PCR-based assays. Seed Science and Technology. 2018;46(1):93-106. doi: 10.15258/sst.2018.46.1.09
19. Cho MS, Park DH, Ahn T, Park SP. Rapid and specific detection ofAcidovoraxavenae subsp. citrulli using SYBR Green-based real-time PCR amplification of the YD-repeat protein gene. J. Microbiol. Biotechnol. 2015;25(9):1401-1409. doi: 10.4014/jmb.1502.02029
20. Zhong J, Lin ZY, Ma YM, Gao BD, Liu HQ, Zhao TC, Schaad NW. Rapid discrimination between groups I and II of Acidovorax citrulli using a primer pair specific to a pilL gene. J Phytopathology. 2015;1-5. doi: 10.1111/jph.12435
21. Zivanovic M, Walcott RR. Further characterization of genetically distinct groups of Acidovorax citrulli strains. Phytopathology. 2017;107(1): 29-35. doi: 10.1094/PHYTO-06- 16-0245-R
22. Lavrenchuk LS, Ermoshin AA. Mikrobiologiya: Praktikum [Microbiology: Workshop]. Berezina EV, editor. Yekaterinburg: Izdatel'stvo Ural'skogo universiteta Publ.; 2019. 107 p. In Russian
23. King EO, Ward MK, Raney DE. Two simple media for the demonstration of pyocyanin and fluorescin. J Laboratory and Clinical Medicine. 1954;44:301-307.
24. Sanger F, Coulson AR. A rapid method for determining sequences in DNA by primed syntesis with DNA polymerase. J Mol Biol. 1975;94:444-448.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Сущность и содержание метода полимеразной цепной реакции, особенности его использования в реальном времени для диагностики различных, в том числе и вирусных, заболеваний. Актуальность и этапы разработки быстрых и эффективных диагностических тестов.
статья [686,1 K], добавлен 26.07.2013- Эффективность и качество использования полимеразной цепной реакции в лабораторной диагностике гриппа
Рассмотрение сути метода полимеразной цепной реакции. Понятие амплификации как процесса увеличения числа копий дезоксирибонуклеиновой кислоты. Основные принципы подбора праймеров при создании тест-системы. Подготовка пробы биологического материала.
курсовая работа [610,8 K], добавлен 14.11.2014 Фенотипические последствия гибридизации животных. Молекулярные методы определения видов. Молекулярно-генетические исследования видов рода Aquila. Разработка специфических праймеров для полимеразной цепной реакции. Особенности секвенирования по Сэнгеру.
дипломная работа [3,7 M], добавлен 25.06.2017Характеристика и классификация микроорганизмов. Систематика, метаболизм и клиническое значение энтеробактерий. Сравнительный анализ традиционного и экспресс-метода биохимической идентификации при определении представителей семейства Enterobacteriaceae.
дипломная работа [8,9 M], добавлен 23.01.2018Метод полимеразной цепной реакции в реальном времени, его использование в диагностике мутаций в генах, приводящих к возникновению рака молочной железы и яичника. Действие генов-супрессоров на формирование опухолевого процесса. Наследственные формы рака.
дипломная работа [306,1 K], добавлен 09.10.2013Выявление трансформантов среди растений Т2 поколения. Выявление инсерционных мутантов, имеющих фенотипические изменения. Идентификация трансгенной природы трансформированных растений Arabidopsis thaliana. Использование метода полимеразной цепной реакции.
контрольная работа [380,4 K], добавлен 25.03.2016Коннекторный и рестриктазно-лигазный методы конструирования рекомбинантных молекул ДНК in vitro, их применение в генной инженерии. Реакция лигирования; рестриктазные операции. Использование метода амплификации сегментов ДНК в полимеразной цепной реакции.
презентация [985,3 K], добавлен 17.08.2015Методы обнаружения нуклеотидных замен в геномной ДНК. Обнаружение мутации в геномной ДНК при помощи блот-гибридизации с помощью меченых олигонуклеотидов в качестве гибридизационных зондов. Исследование фрагментов ДНК при полимеразной цепной реакции.
учебное пособие [2,5 M], добавлен 11.08.2009Изготовление микропланшетов. Определение спектра поглощения. Электрофоретическое разделение нуклеиновых кислот в образцах ПЦР-смеси после амплификации. Протокол полимеразной цепной реакции с использованием TaqMan. Система детекции результатов анализа.
дипломная работа [873,4 K], добавлен 15.12.2008Определение назначения и описание механизма гистохимических методов идентификации химических веществ в гистологических срезах. Описание электронной, люминесцентной и ультрафиолетовой микроскопии. Радиоавтография и культура клеток и тканей вне организма.
реферат [28,2 K], добавлен 09.09.2014Понятие и направления исследования реакции связывания комплемента, ее главные этапы и фазы. Сущность и значение иммунофлюоресцентного метода как способа выбора для быстрого выявления и идентификации неизвестного микроорганизма в исследуемом материале.
презентация [184,5 K], добавлен 31.05.2015Преимущества использования методики выделения ДНК из волоса при помощи ионообменной смолы Chelex. Применение хлороформ-фенольной экстракции и последующих концентрирования и фильтрации экстракта на "Центриконе-100" для идентификации личности по волосам.
реферат [27,9 K], добавлен 23.09.2010История открытия полимеразной цепной реакции (ПЦР). Разновидности ПЦР, ее проведение. Наличие в реакционной смеси ряда компонентов. Циклический и температурный режим. Основные принципы подбора праймеров. Подготовка пробы биологического материала.
курсовая работа [51,0 K], добавлен 16.06.2014Механизм действия и модификация антисмысловых олигонуклеотидов. Физико-химические аспекты взаимодействия олигонуклеотида и РНК-мишени. Буферные растворы, использовавшиеся в работе. Электрофорез нуклеиновых кислот. Проведение полимеразной цепной реакции.
курсовая работа [1,3 M], добавлен 18.01.2013Сущность полимеразной цепной реакции, ее сопоставление с реакцией атомного взрыва. Последовательность операций включения ДНК в плазмиду. Комплекс мер по умножению количества индивидуального белка и его подлинность. Физические основы электрофореза.
реферат [62,1 K], добавлен 11.12.2009- Идентификация микроводорослей Euglena glacilis и анализ их чувствительности к ингибирующим веществам
Методы выделения чистых культур микроводорослей и способы их идентификации. Выделение чистой культуры Euglena glacilis; рассмотрение способов определения жизнеспособности клеток. Изучить влияния разобщителей дыхания и синтеза АТФ на подвижность клеток.
дипломная работа [1,7 M], добавлен 24.05.2012 Культивирование бактерий на питательных средах, выделение чистой культуры возбудителя и ее идентификация. Состав питательной среды, способ посева исследуемого материала. Мультимикротесты для идентификации энтеробактерий; микроскопическое изучение колоний.
презентация [4,3 M], добавлен 11.01.2014Дефицит кислорода как стрессовый фактор для растений. Энергетическое состояние клетки в условиях гипоксии. Проведение полимеразной цепной реакции в реальном времени. Динамика активности фумаратгидротазы в зеленых листья кукурузы в условиях гипоксии.
курсовая работа [325,9 K], добавлен 09.08.2016Рассмотрение структуры бактериальной клетки, устройства и функций клеточной мембраны. Изучение основных методов дезинтеграции. Описание особенностей разрушения клеточной стенки при использовании физических, химических и химико-ферментативных методов.
реферат [171,5 K], добавлен 17.01.2015Способность организмов передавать свои признаки и особенности развития потомству на молекулярно-генетическом уровне. Изменчивость наследственного материала. Процесс возникновения мутаций. Результаты, причины и значение генетических мутаций у человека.
презентация [21,5 M], добавлен 03.10.2014
