Галофильные бактерии — первичные деструкторы в соленом озере гуджирганское (Баргузинская долина, северное Прибайкалье)

Размещено на http://www.allbest.ru

Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН

Галофильные бактерии -- первичные деструкторы в соленом озере гуджирганское (Баргузинская долина, северное Прибайкалье)

Лаврентьева Елена Владимировна

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник,

Банзаракцаева Туяна Геннадьевна

кандидат биологических наук, научный сотрудник,

Эрдынеева Елена Базыровна

Биджоян Арман Мурадович

Бурятский государственный университет,

Россия, 670000, г. Улан-Удэ, ул. Смолина 24а

Кабилов Марсель Расимович

кандидат биологических наук, руководитель Центра ЦКП «Геномика» СО РАН

В данной статье представлены результаты по изучению микробного сообщества донных осадков в озере Гуджирганское. Количественные данные по подсчету гетеротрофных бактерий показали активное распространение галофильных прокариот, способных осуществлять первичную деструкцию органического вещества в экстремальных условиях солености. В результате секвенирования суммарной ДНК показано, что в микробном сообществе донных осадков доминировали представители хемоорганоторофных бактерий, ответственные за деструкцию органического вещества. Эти бактерии являются типичными представителями засоленных мест обитания и хорошо адаптированы к постоянно изменяющимся физико-химическим условиям континентальных соленых озер.

Ключевые слова: галофильные бактерии; микробное сообщество донных осадков; сульфатно -- натриевый тип воды; соленое озеро Гуджирганское. галофильный бактерия микробный

HALOPHILIC BACTERIA -- PRIMARY DESTRUCTORS IN THE SALT LAKE GUDZHIRGANSKOE (BARGUZIN VALLEY,

NORTH CISBAIKALIA)

E. V. Lavrentieva, T. G. Banzaraktsaeva, E. B. Erdyneeva, A. M. Bidjoyan, M. R. Kabilov

Lavrentieva Elena Vladimirovna candidate of biological science, researcher,

Institute of General and Experimental Biology SB RAS Russia, 670047, Ulan-Ude, Sakhyanova Str., 6 Buryat State University, Ulan-Ude, Smolina st. 24a

Banzaraktsaeva Tuyana Gennadievna candidate of biological science, Senior researcher Institute of General and Experimental Biology SB RAS Russia, 670047, Ulan-Ude, Sakhyanova Str., 6

Erdyneeva Elena Bazyrovna

Institute of General and Experimental Biology SB RAS

Russia, 670047, Ulan-Ude, Sakhyanova Str., 6

Bidjoyan Arman Muradovich

Buryat State University, Ulan-Ude, Smolina st. 24a

Kabilov Marsel Rasimovich

candidate of biological science, head of GCF,

SB RAS Genomics Core Facility, ICBFM SB RAS Russia, 630090, Novosibirsk, Lavrentiev av. 8

The study of the microbial community in bottom sediments of Lake Gudzhirganskoe is presented in this article. Quantitative data on the calculation of heterotrophic bacteria showed the widely distribution of halophilic prokaryotes capable of carrying out the primary destruction of organic matter in extreme conditions of salinity. The sequence of total DNA have shown that chemoorganotropic bacteria responsible for the destruction of organic matter dominated in the microbial community of bottom sediment. These bacteria are typical representatives of saline environment and are well adapted to physicochemical conditions of continental saline lakes.

Keywords: halophilic bacteria; microbial community of bottom sediments; sulphate-sodium type of water; Gudzhirganskoe salt lake.

Введение

На территории Баргузинской долины расположено более 1000 солоноватых, соленых и реже пресных озер (Замана, 1988). Соленые озера в Баргузинской долине разнообразны по происхождению и морфологии, гидрохимическому и гидрологическому режиму. Многие из них имеют повышенную минерализацию, и на некоторых озерах наблюдается садка солей или образование гуджира -- вы- солы солей образующихся на берегах или на дне высохшего озера (Водные системы Баргузинской котловины, 2007). Донные отложения соленых озер представляют собой чрезвычайно сложную динамическую систему и являются местом активной деятельности галофильных бактерий. В экстремальных условиях соленых озер развивается специфическое микробное сообщество, включающее представителей всех основных трофических групп микроорганизмов (Заварзин и др., 2001; Егорова и др., 2011).

Тем не менее, анализ современного состояния изученности микробных сообществ засоленных озер Баргузинской долины, которые характеризуются мелко- водностью, нестабильным водным режимом, полным промерзанием в зимний период, значительными колебаниями солености и температуры воды, показал недостаток данных для получения полноценной картины функционирования микробных сообществ в условиях семиаридного климата.

Цель: распространение галофильных бактерий -- первичных деструкторов и их разнообразие в донных осадках озера Гуджирганское.

Объекты и методы исследования

Озеро Гуджирганское (53°38781'N109°56'807"E) расположено в пойме реки Баргузин, в 12 км от с. Суво. Площадь водного зеркала на момент отбора проб составила 0,3 км2, глубина 0,2 м.

Озеро Гуджирганское -- относится к группе Алгинских озер, который представляет единый гидроминеральный комплекс общей площадью около 15 км2. Формирование сульфатного натриевого состава солоноватых и рапных озер обусловлено сочетанием трех факторов -- тектонических условий впадины, климата и состава термальных вод (Намсараев и др., 2007).

Физико-химические параметры воды были определены на месте отбора проб с использованием следующих портативных приборов: температура и рН (РН-200 HM Digital, Южная Корея); минерализация воды (тест-кондуктометр TDS-4 (Сингапур).

ДНК выделяли с помощью набора AxyPrep Bacterial Genomic DNA Miniprep Kit (Axygen, США). Глубокое секвенирование ампликонов V3-V6 16S рРНК проведено в ЦКП «Геномика» СО РАН (ИХБФМ СО РАН) на платформе MiSeq (Illumina).

Определение численности проводили методом предельных разведений на среде Пфеннига с добавлением субстратов: для протеолитиков -- 1,5% пептона, для сахаролитиков -- 1,5% глюкозы (Практикум по микробиологии, 2005).

Результаты и их обсуждение

Условия места обитания. Вода озер имеет высокие показатели рН и минерализации. Значения минерализации воды озера в период исследований составила 100 г/дм3. В период отбора проб температура воды в озере составила +12 °С. Значение рН воды находилось в щелочной области -- 9,8. Исследование ионносолевого состава исследуемых озер показало, что их характерной особенностью является преобладание в них ионов натрия. По анионному составу установлено преобладание сульфат-ионов.

Численность гетеротрофных бактерий. Количество гетеротрофных организмов определяли при низких и высоких значениях концентрации NaCl в питательной среде (таблица 1). Результаты показали высокую численность протеолитических аэробных и анаэробных бактерий при содержании NaCl 5 г/л -- до 1 млн. кл/мл. Подсчет бактериальных клеток при концентрации соли 150 г/л выявил уменьшение численности у протеолитических бактерий аэробов -- до 100 тыс. кл/мл и анаэробов -- до 100 кл/мл. Число сахаролитических аэробных бактерий при 150 г/л хлорида натрия достигало 1 млн. кл/мл, количество спорообразующих сахаролитиков было в пределах 10 тыс. кл/мл.

Таблица 1

Численность гетеротрофных бактерий

в осадках озеро Гуджирганское, тыс.кл/мл

Разнообразие микробного сообщества донных осадков. Методом секвениро- вания был определен состав и разнообразие микробного сообщества донного осадка озера Гуджирганское. Показано, что в сообществе донных осадков доминировали представители филумов Firmicutes (38,7%), Proteobacteria (32,6%) и Bacteroidetes (20,5%). Представители филума Actinobacteria в донных осадках составили 4.6%. В минорных количествах (менее 2%) представлены филумы Deinococcus-Thermus, Cyanobacteria/Chloroplast, представители архей-Euryarchaeota и unc_Bacteria (рис. 1).

Рис. 1 Таксономическое разнообразие микробного сообщества донного осадка озера Гуджирганское

Отмечено, что в микробном сообществе донного осадка Гуджирганское доминируют представители деструкционного звена. Бактерии филума Firmicutes были представлены классами Clostridia 19,9% и unc_Firmicutes 18,8%. Известно, что представители Firmicutes ответственны за процессы деструкции органического вещества в микробном сообществе. Представители класса Gammaproteobacteria 27,4% включают многочисленную и метаболически разнообразную группу бактерий. Данному классу принадлежат две основные группы: одна фотоавтотрофная и другая гетеротрофная. Фотоавтотрофная часть представлена родами Ectothiorhodospira. Бактерии этого рода, как правило, обитают в щелочных рассолах с концентрацией соли до насыщения. Гетеротрофная часть класса Gammaproteobacteria представлена большой группой хемоорганотрофных бактерий -- Alcanivorax.

В сообществе донного осадка филум Bacteroidetes включает бактерий Gracilimonas. Эти бактерии ранее были описаны как типичные представители глубоководных морских осадков.

Таким образом, по гидрохимическому составу воды озера Гуджирганское относятся к сульфатно-натриевому типу. Среди макрокомпонентов преобладают SO4 и Na. Высокая степень минерализации объясняется не только степенью испарения воды, но и наличием дополнительных источников сульфат-ионов. Формирование собственно сульфатных вод возможно при наличии дополнительных источников поступления в озера сульфатов. Так, для группы Алгинских озер в Баргузинской впадине -- это воды питающего их термального источника (Водные системы Баргузинской котловины, 2007, Замана и др., 2010).

По отношению к солености микроорганизмы делятся на несколько групп. Гало- толерантные бактерии способны развиваться в средах до 10% содержания хлорида натрия (Заварзин, Колотилова, 2001). Полученные нами результаты по численности протеолитических бактерий в осадках исследуемого озера свидетельствуют о широком распространении галотолерантных бактерий в сообществе. Количественные данные по подсчету гетеротрофных бактерий при высокой концентрации хлорида натрия показали также активное распространение галофильных прокариот, способных осуществлять первичную деструкцию органического вещества в экстремальных условиях солености. Рост и развитие гетеротрофных бактерий на средах содержащих 15% NaCl позволяет утверждать о потенциальных возможностях сообщества в трансформации вещества и энергии при изменениях климата в сторону аридизации и соответственно повышения концентрации солей.

В результате секвенирования суммарной ДНК, выделенной из донных осадков озера Гуджирганское выявлены представители шести филумов Bacteria и одного филума Archaea. Следует отметить, что в микробном сообществе донных осадков доминировали представители хемоорганоторофных бактерий, ответственные за деструкцию органического вещества. Эти бактерии являются типичными представителями засоленных мест обитания и хорошо адаптированы к постоянно изменяющимся физико-химическим условиям континентальных соленых озер. Многие бактерии способны к спорообразованию и устойчивы к ионизирующему и ультрафиолетовому излучению, что способствует их выживанию в периодически пересыхающем озере семиаридного климата и высокой солнечной инсоляции региона.

Литература

Замана Л. В. Мерзлотно-гидрогеологические и мелиоративные условия Баргузинской впадины. -- Новосибирск: Наука, 1988. -- 126 с.

Водные системы Баргузинской котловины / Б. Б. Намсараев, В. В. Хахинов, Е. Ж. Гармаев, Д. Д. Бархутова, З. Б. Намсараев, А. М. Плюснин. -- Улан-Удэ: Изд-во Бурят. гос. ун-та, 2007. -- 154 с.

Егорова Д. В., Козырева Л. П. Деструкция органических веществ в донных осадках содово-соленых озер Забайкалья // Вестник Бурятского государственного университета. Сер. 2: Биология.-- Улан-Удэ: Изд-во БГУ, 2011. -- Вып. 4. -- С.158-162.

Практикум по микробиологии / под ред. А. И. Нетрусова. -- М.: Академия, 2005. -- 608 с.

Замана Л. В., Борзенко С. В. Гидрохимический режим соленых озер ЮгоВосточного Забайкалья // География и природные ресурсы. 2010. № 4. С. 100-107.

Заварзин Г. А., Колотилова Н. Н. Введение в природоведческую микробиологию: учебное пособие. -- М.: Университет, 2001. -- 256 с.

Размещено на Allbest.ru