Фаги бактерій роду bacillus, ізольованих з водного середовища
Аналіз результатів дослідження ізолятів, яке вказує на те, що бактерії видів роду Bacillus інфіковані бактеріофагами порядку Саudovirales, які мають хвостові відростки, систему інтегрази та ексцизії. Розгляд кодувальної послідовності для ендолізину.
| Рубрика | Биология и естествознание |
| Вид | статья |
| Язык | украинский |
| Дата добавления | 28.09.2022 |
| Размер файла | 54,9 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Аналіз сучасних даних літератури стосовно бактеріофагів, здатних інфікувати бактерії роду Bacillus, ізольованих з водного середовища, свідчить про те, що всі виявлені бактеріофаги належать до порядку Caudovirales. Вони мають ікосаедричну головку, хвостовий відросток та геном, що представлений дволанцюговою ДНК. Описані бактеріофаги характеризуються великим діапазоном умов існування та потреб для розмноження. Вони можуть рости при температурах в діапазоні 4-60 °C, значних змінах рН, впливати на метаболізм хазяїна та процеси споруляції. Подальше виявлення та вивчення фагів у водних мікробних біоценозах дасть розуміння їх ролі у функціонуванні мікробних спільнот, біогеохімічних циклах, біології водних мікроорганізмів, а також визначення перспектив їх використання в біотехнології, в першу чергу для пошуку генів, що відповідають за синтез антибіотичних сполук, та розробки засобів боротьби з такими особливо небезпечними представниками цього роду.
Список використаної літератури
1. Abedon T, Yin J. Bacteriophage plaques: theory and analysis // Methods Mol Biol. - 2009. - Vol. 501. - P. 161-174.
2. Adams M.J., Lefkowitz E.J., King A.M. Ratification vote on taxonomic proposals to the International Committee on Taxonomy of Viruses // Arch Virol. 2016. - Vol. 161. - P. 2921-2949.
3. Arabi E., Griffiths T., She Y. Genome sequence and analysis of a broad-host range lytic bacteriophage that infects the Bacillus cereus group // Virol. J. - 2013. - Vol. 10. - P. 48-59.
4. Asare T., Jeong Y, Ryu S., Klumpp J., Loessner J., MerrillD., Kim P. Putative type 1 thymidylate synthase and dihydrofolate reductase as signature genes of a novel Bastille-like group of phages in the subfamily Spounavirinae // BMC Genomics. - 2015. - Vol. 16. - P 582-587.
5. Barylski E., Dutilh B., Schuller M., Edwards A. Analysis of Spounaviruses as a Case Study for the Overdue Reclassification of Tailed Phages // Systematic Biology. - 2020. - Vol. 69. - P 110-123.
6. Barylski J., Kropinski M., Alikhan F, Adriaenssens M. ICTV Report Consortium. ICTV Virus Taxonomy Profile: Herelleviridae // J Gen Virol. - 2020. - Vol. 101. - P 362-363.
7. Barylski J., Nowicki G., Gozdzicka-JozefiakA. The Discovery of phiAGATE, A Novel Phage Infecting Bacillus pumilus, Leads to New Insights into the Phylogeny of the Subfamily Spounavirinae // PLoS One. - 2014. - Vol. 9. - P 1-14.
8. Begley M., Gahan G., Hill C. The interaction between bacteria and bile // FEMS Microbiol Rev. - 2005. - Vol. 29. - P. 625-651.
9. Brown N.L., Stoyanov J.V., Kidd S.P., Hobman J.L. The MerR family of transcriptional regulators // FEMS Microbiol Rev. - 2003. - Vol. 27. - P. 145-163.
10. Burton M., Marquis A., Sullivan L., Rapoport A., Rudner Z. The ATPase SpolllE transports DNA across fused septal membranes during sporulation in Bacillus subtilis // Cell. - 2007. - Vol. 131. - P. 1301-1312.
11. Casjens S. Prophages and bacterial genomics: what have we learned so far? // Mol Microbiol. - 2003. - Vol. 49. - P. 277-300.
12. Chen Y., Guo X., Wu J., Jin M., Zeng R. A novel deep-sea bacteriophage possesses features of Wbeta-like viruses and prophages // Arch Virol. - 2020. Vol. 165. - P. 1219-1223.
13. Danovaro R., DellAnno A., Corinaldesi C., Magagnini M., Noble R., Tamburini C., WeinbauerM. Major viral impact on the functioning of benthic deep-sea ecosystems // Nature. - 2008. - Vol. 454. - P 1084-1087.
14. Feng Z., Xinwu L., Liu W., Yong N. Complete genome sequence of a novel Bacillus phage, P59, that infects Bacillus oceanisediminis // Archives of Virology. - 2020. - Vol. 165. - P. 1-5.
15. Gao B., Huang Y, Ning D. Metabolic Genes within Cyanophage Genomes: Implications for Diversity and Evolution // Genes (Basel). - 2016. - Vol. 7. P 80-91.
16. Gillis A., Mahillon J. Phages preying on Bacillus anthracis, Bacillus cereus and Bacillus thuringiensis: past, present and future // Viruses. - 2014. - Vol. 6. - P 2623-2672.
17. Han S., Xie G., Challacombe F, Altherr R., Bhotika S., Brown N., Bruce D. Pathogenomic sequence analysis of Bacillus cereus and Bacillus thuringiensis isolates closely related to Bacillus anthracis // J Bacteriol.- 2006. - Vol. 188. P 3382 - 3390.
18. HemphillE., Whiteley R. Bacteriophages of Bacillus subtilis // Bacteriol Rev. 1975. - Vol. 39. - P 257-315.
19. Jean N.L., Rutherford T.J., Lowe J. FtsK in motion reveals its mechanism for double-stranded DNA translocation // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2020. - Vol. 117. - P. 14202-14208.
20. Ji X., Zhang C., Fang Y, Zhang Q., Lin L., Tang B., Wei Y. Isolation and characterization of glacier VMY22, a novel lytic cold-active bacteriophage of Bacillus cereus // Virol Sin. - 2015. - Vol. 30. - P 52-58.
21. Kampf G. Efficacy of ethanol against viruses in hand disinfection // J Hosp Infect. - 2018. - 98 (4). - Р 331-338.
22. Kazlauskas D., Venclovas C. Computational analysis of DNA replicases in double-stranded DNA viruses: relationship with the genome size // Nucleic Acids Research. - 2011. - Vol. 1. - P 8291-8305.
23. Kimura K., Itoh Y. Characterization of poly-gamma-glutamate hydrolase encoded by a bacteriophage genome: possible role in phage infection of Bacillus subtilis encapsulated with poly-gamma-glutamate // Appl Environ Microbiol. - 2003. - Vol. 69. - P 2491-2497.
24. King A., Lefkowitz E., Adams M.J., Carstens E.B. Virus Taxonomy. 1st ed. - Amsterdam: Elsevier. Press, 2011. - 384 p.
25. Klumpp J., Lavigne R., Loessner J., Ackermann W. The SPOl-related bacteriophages // Arch Virol. - 2010. - Vol. 155. - P 1547-1561.
26. Kong L., Ding Y., Wu Q., Wang J., Zhang J., Li H., Yu S., Yu P., Gao T., Zeng H., Yang M., Liang Y., Wang Z., Xie Z., Wang Q. Genome sequencing and characterization of three Bacillus cereus-specific phages DK1, DK2 and DK3 // Arch Virol. - 2019. - Vol. 164. - P. 1927-1929.
27. Kostyk N., Chigbu O., Cochran E., Davis J., Essig J., Do L., Farooque N. Complete Genome Sequences of Bacillus cereus Group Phages AaronPhadgers, ALPS, Beyonphe, Bubs, KamFam, OmnioDeoPrimus, Phireball, PPIsBest, YungSlug and Zainny // Microbiol Resour Announc. - 2021. - Vol. 10. - P 33.
28. Kunst F, Ogasawara N., Moszer I., Albertini M., Alloni G., Azevedo V., Bertero G., Bessieres P, Bolotin A. The complete genome sequence of the gram-positive bacterium Bacillus subtilis // Nature. - 1997. - Vol. 390. - P. 249-256.
29. Lawrence J.G., Hatfull G.F, Hendrix R.W. Imbroglios of viral taxonomy: genetic exchange and failings of phenetic approaches // J Bacteriol. - 2002. - Vol. 184. - P 4891-4905.
30. Li C., Yuan X., Li N. Isolation and Characterization of Bacillus cereus Phage vB_BceP-DLc1 Reveals the Largest Member of the O29-Like Phages // Microorganisms. - 2020. - Vol. 8. - P. 1750-1760.
31. Liu B., Wu S., Song Q., Zhang X., Xie L. Two novel bacteriophages of thermophilic bacteria isolated from deep-sea hydrothermal fields // Curr Microbiol. - 2006. - Vol. 53. - P 163-166.
32. Liu X., Wang D., Pan C., Feng E., Fan H., Li M., Zhu L., Tong Y., Wang H. Genome sequence of Bacillus anthracis typing phage AP631 // Arch Virol. - 2019. - Vol. 164. - P 917-921.
33. Lucchini S., Desiere F, Brussow H. Comparative genomics of Streptococcus thermophilus phage species supports a modular evolution theory // J Virol. - 1999. - Vol. 73. - P 8647-8656.
34. Meijer J., Horcajadas A., Salas M. Phi29 family of phages // Microbiol Mol Biol Rev. - 2001. - Vol. 65. - P 261-287.
35. Mobberley J., Authement N., Segall M., Edwards A., Slepecky A., Paul H. Lysogeny and sporulation in Bacillus isolates from the Gulf of Mexico // Appl Environ Microbiol. - 2010. - Vol. 76. - P. 829-842.
36. Morgado S., Vicente C. Global in-silico scenario of tRNA genes and their organization in virus genomes // Viruses. - 2019. - Vol. 11. - P. 180-188.
37. Paul H. Prophages in marine bacteria: dangerous molecular time bombs or the key to survival in the seas? // ISME J. - 2008. - Vol. 2. - P 579-589.
38. Porter J., Schuch R., Pelzek J., Buckle M., McGowan S., Wilce C., Rossjohn J., RussellR., NelsonD., FischettiA., WhisstockC. The 1.6 A crystal structure of the catalytic domain of PlyB, a bacteriophage lysin active against Bacillus anthracis // J Mol Biol. - 2007. - Vol. 366. - P 540-550.
39. Rodriguez-Valera F, Martin-Cuadrado A.B., Rodriguez-Brito B., Pasic Thingstad T.F., Rohwer F, Mira R. Explaining microbial population genomics through phage predation // Nat Rev Microbiol. - 2009. - Vol. 7. - P. 828-836.
40. Rex A., Etter J., Morris S., Crouse J., McMlain R., Johnson A., Stuart T., Deming W, Thies R., Avery R. Global bathymetric patterns of standing stock and body size in the deep-sea benthos // Marine Ecology Progress Series. - 2006. - Vol. 317. - P. 1-8.
41. Ritz M.P., Perl A.L., Colquhoun J.M., Chamakura K.R., Kuty G.F Complete Genome of Bacillus subtilis Myophage CampHawk // Genome Announc. - 2013. - Vol. 1. - P 984-997.
42. Rocha E.P, Danchin A. Base composition bias might result from competition for metabolic resources // Trends Genet. - 2002. - Vol. 18. - P. 291-294.
43. Sayers W, Barrett T., Benson A., Bolton E., Bryant H., Canese K., Chetvernin V, Church M., Dicuccio M., Federhen S., Feolo M. Database resources of the National Center for Biotechnology Information // Nucleic Acids Res. - 2012. - Vol. 40. - P. 13-25.
44. Schilling T., Hoppert M., Hertel R. Genomic Analysis of the Recent Viral Isolate vB_BthP-Goe4 Reveals Increased Diversity of ф29-Like Phages // Viruses. - 2018. - Vol. 10. - P 624-638.
45. Schuch R., Fischetti VA. Detailed genomic analysis of the Wbeta and gamma phages infecting Bacillus anthracis: implications for evolution of environmental fitness and antibiotic resistance // J Bacteriol. - 2006. - Vol. 188. - P. 3037-3051.
46. Shafikhani H., Mandic-Mulec I., Strauch A., Smith I., Leighton T Postexponential regulation of sin operon expression in Bacillus subtilis // J Bacteriol. - 2002. - Vol. 184. - P 564-571.
47. Siefert J.L., Larios-SanzM., NakamuraL.K., Slepecky R.A., Paul J.H., Moore R., Fox G.E., Jurtshuk P. Phylogeny of marine Bacillus isolates from the Gulf of Mexico // Curr Microbiol. - 2000. - Vol. 41. - P. 84-88.
48. Simoliuniene M., Tumenas D., Kvederaviciute K., Meskys R., Sulcius S., Simoliunas E. Complete Genome Sequence of Bacillus cereus Bacteriophage vB_BceS_KLEB30-3S // Microbiol Resour Announc. - 2020. - Vol. 9. - P 1-3.
49. Stewart C.R., Casjens S.R., Cresawn S.G. The genome of Bacillus subtilis bacteriophage SPO1 // J Mol Biol. - 2009. - Vol. 388. - P 48-70.
50. Willms M., Hoppert M., Hertel R. Characterization of Bacillus subtilis Viruses vB_BsuM-Goe2 and vB_BsuM-Goe3 // Viruses. - 2017. - Vol. 9. - P. 146.
51. Xu L., Zhang R., Wang N., Cai L., Tong G., Sun Q., Chen F, Jiao Z. Novel phage-host interactions and evolution as revealed by a cyanomyovirus isolated from an estuarine environment // Environ Microbiol. - 2018. - Vol. 20. - P 2974-2989.
52. Yee M., Matsumoto T., Yano K., Matsuoka S., Sadaie Y., Yoshikawa H., Asai K. The genome of Bacillus subtilis phage SP10: a comparative analysis with phage SPO1 // Biosci Biotechnol Biochem. - 2011. - Vol. 75. - P 944-952.
53. Yuan Y., Gao M., Wu D., Liu P., Wu Y. Genome Characteristics of a Novel Phage from Bacillus thuringiensis Showing High Similarity with Phage from Bacillus cereus // PLOS ONE. - 2012. - Vol. 7. - P. 143-147.
54. Zhang H., Liu L., He L. Detection and identification of Bacillus cereus susceptible to phage AP631 // Chin J Zoonos. - 2016. - Vol. 32. - P 507-511.
55. Zhao X., Shen M., Jiang X. Transcriptomic and Metabolomics Profiling of Phage-Host Interactions between Phage PaP1 and Pseudomonas aeruginosa // Front Microbiol. - 2017. - Vol. 8. - P 548-571.
56. Zhonghe X., Yang S., Jeffrey W, Cao Y. Directional mechanical stability of Bacteriophage ф29 motor's 3WJ-pRNA: Extraordinary robustness along portal axis // Science Advances. - 2017. - Vol. 3. - P 1-8.
57. Zyl J., Nemavhulani S., Cass J., Cowan A., Trindade M. Three novel bacteriophages isolated from the East African Rift Valley soda lakes // Virol J. - 2016. - Vol. 13. - P 204-228.
58.
References
1. Abedon T, Yin J. Bacteriophage plaques: theory and analysis. Methods Mol Biol. 2009; 501: 161-174.
2. Adams MJ, Lefkowitz EJ, King AM. Ratification vote on taxonomic proposals to the International Committee on Taxonomy of Viruses. Arch Virol. 2016; 161: 2921-2949.
3. Arabi E, Griffiths T, She Y. Genome sequence and analysis of a broad-host range lytic bacteriophage that infects the Bacillus cereus group. Virol. J. 2013; 10: 48-59.
4. Asare T, Jeong Y, Ryu S, Klumpp J, Loessner J, Merrill D, Kim P. Putative type 1 thymidylate synthase and dihydrofolate reductase as signature genes of a novel Bastille-like group of phages in the subfamily Spounavirinae. BMC Genomics. 2015; 16: 582-587.
5. Barylski E, Dutilh B, Schuller M, Edwards A. Analysis of Spounaviruses as a Case Study for the Overdue Reclassification of Tailed Phages. Systematic Biology. 2020; 69: 110-123.
6. Barylski J, Kropinski M, Alikhan F, Adriaenssens M. ICTV Report Consortium. ICTV Virus Taxonomy Profile: Herelleviridae. J Gen Virol. 2020; 101: 362-363.
7. Barylski J, Nowicki G, Gozdzicka-Jozefiak A. The Discovery of phiAGATE, A Novel Phage Infecting Bacillus pumilus, Leads to New Insights into the Phylogeny of the Subfamily Spounavirinae. PLoS One. 2014; 9: 1-14.
8. Begley M, Gahan G, Hill C. The interaction between bacteria and bile. FEMS Microbiol Rev. 2005; 29: 625-651.
9. Brown NL, Stoyanov JV, Kidd SP, Hobman JL. The MerR family of transcriptional regulators. FEMS Microbiol Rev. 2003; 27: 145-163.
10. Burton M, Marquis A, Sullivan L, Rapoport A, Rudner Z. The ATPase SpoIIIE transports DNA across fused septal membranes during sporulation in Bacillus subtilis. Cell. 2007; 131: 1301-1312.
11. Casjens S. Prophages and bacterial genomics: what have we learned so far? Mol Microbiol. 2003; 49: 277-300.
12. Chen Y, Guo X, Wu J, Jin M, Zeng R. A novel deep-sea bacteriophage possesses features of Wbeta-like viruses and prophages. Arch Virol. 2020; 165: 1219-1223.
13. Danovaro R, Dell'Anno A, Corinaldesi C, Magagnini M, Noble R, Tamburini C, Weinbauer M. Major viral impact on the functioning of benthic deep-sea ecosystems. Nature. 2008; 454: 1084-1087.
14. Feng Z, Xinwu L, Liu W, Yong N. Complete genome sequence of a novel Bacillus phage, P59, that infects Bacillus oceanisediminis. Archives of Virology. 2020; 165: 1-5.
15. Gao B, Huang Y, Ning D. Metabolic Genes within Cyanophage Genomes: Implications for Diversity and Evolution. Genes (Basel). 2016; 7: 80-91.
16. Gillis A, Mahillon J. Phages preying on Bacillus anthracis, Bacillus cereus and Bacillus thuringiensis: past, present and future. Viruses. 2014; 6: 26232672.
17. Han S, Xie G, Challacombe F, Altherr R, Bhotika S, Brown N, Bruce D. Pathogenomic sequence analysis of Bacillus cereus and Bacillus thuring- iensis isolates closely related to Bacillus anthracis. J Bacteriol. 2006; 188: 3382-3390.
18. Hemphill E, Whiteley R. Bacteriophages of Bacillus subtilis. Bacteriol Rev. 1975; 39: 257-315.
19. Jean NL, Rutherford TJ, Lowe J. FtsK in motion reveals its mechanism for double-stranded DNA translocation. Proc Natl Acad Sci USA. 2020; 117: 14202-14208.
20. Ji X, Zhang C, Fang Y, Zhang Q, Lin L, Tang B, Wei Y Isolation and characterization of glacier VMY22, a novel lytic cold-active bacteriophage of Bacillus cereus. Virol Sin. 2015; 30: 52-58.
21. Kampf G. Efficacy of ethanol against viruses in hand disinfection. J Hosp Infect. 2018; 98 (4): 331-338.
22. Kazlauskas D, Venclovas C. Computational analysis of DNA replicases in double-stranded DNA viruses: relationship with the genome size. Nucleic Acids Research. 2011; 1: 8291-8305.
23. Kimura K, Itoh Y. Characterization of poly-gamma-glutamate hydrolase encoded by a bacteriophage genome: possible role in phage infection of Bacillus subtilis encapsulated with poly-gamma-glutamate. Appl Environ Microbiol. 2003; 69: 2491-2497.
24. King A, Lefkowitz E, Adams MJ, Carstens EB. Virus Taxonomy. 1st ed. Amsterdam: Elsevier. Press. 2011. 384 p.
25. Klumpp J, Lavigne R, Loessner J, Ackermann W. The SPO1-related bacteriophages. Arch Virol. 2010; 155: 1547-1561.
26. Kong L, Ding Y, Wu Q, Wang J, Zhang J, Li H, Yu S, Yu P, Gao T, Zeng H, Yang M, Liang Y, Wang Z, Xie Z, Wang Q. Genome sequencing and characterization of three Bacillus cereus-specific phages DK1, DK2 and DK3. Arch Virol. 2019; 164: 1927-1929.
27. Kostyk N, Chigbu O, Cochran E, Davis J, Essig J, Do L, Farooque N. Complete Genome Sequences of Bacillus cereus Group Phages AaronPhadgers, ALPS, Beyonphe, Bubs, KamFam, OmnioDeoPrimus, Phireball, PPIsBest, YungSlug and Zainny. Microbiol Resour Announc. 2021; 10: 33.
28. Kunst F, Ogasawara N, Moszer I, Albertini M, Alloni G, Azevedo V, Bertero G, Bessieres P, Bolotin A. The complete genome sequence of the gram-positive bacterium Bacillus subtilis. Nature. 1997; 390: 249-256.
29. Lawrence JG, Hatfull GF, Hendrix RW. Imbroglios of viral taxonomy: genetic exchange and failings of phenetic approaches. J Bacteriol. 2002;184: 4891-4905.
30. Li C, Yuan X, Li N. Isolation and Characterization of Bacillus cereus Phage vB_BceP-DLc1 Reveals the Largest Member of the O29-Like Phages. Microorganisms. 2020; 8: 1750-1760.
31. Liu B, Wu S, Song Q, Zhang X, Xie L. Two novel bacteriophages of thermophilic bacteria isolated from deep-sea hydrothermal fields. Curr Microbiol. 2006; 53: 163-166.
32. Liu X, Wang D, Pan C, Feng E, Fan H, Li M, Zhu L, Tong Y, Wang H. Genome sequence of Bacillus anthracis typing phage AP631. Arch Virol. 2019; 164: 917-921.
33. Lucchini S, Desiere F, Brussow H. Comparative genomics of Streptococcus thermophilus phage species supports a modular evolution theory. J Virol. 1999; 73: 8647-8656.
34. Meijer J, Horcajadas A, Salas M. Phi29 family of phages. Microbiol Mol Biol Rev. 2001; 65: 261-287.
35. Mobberley J, Authement N, Segall M, Edwards A, Slepecky A, Paul H. Lysogeny and sporulation in Bacillus isolates from the Gulf of Mexico. Appl Environ Microbiol. 2010; 76: 829-842.
36. Morgado S, Vicente C. Global in-silico scenario of tRNA genes and their organization in virus genomes. Viruses. 2019; 11: 180-188.
37. Paul H. Prophages in marine bacteria: dangerous molecular time bombs or the key to survival in the seas? ISME J. 2008; 2: 579-589.
38. Porter J, Schuch R, Pelzek J, Buckle M, McGowan S, Wilce C, Rossjohn J, Russell R, Nelson D, Fischetti A, Whisstock C. The 1.6 A crystal structure of the catalytic domain of PlyB, a bacteriophage lysin active against Bacillus anthracis. J Mol Biol. 2007; 366: 540-550.
39. Rodriguez-Valera F, Martin-Cuadrado AB, Rodriguez-Brito B, Pasic L, Thingstad TF, Rohwer F, Mira R. Explaining microbial population genomics through phage predation. Nat Rev Microbiol. 2009; 7: 828-836.
40. Rex A, Etter J, Morris S, Crouse J, McMlain R, Johnson A, Stuart CT, Deming W, Thies R, Avery R. Global bathymetric patterns of standing stock and body size in the deep-sea benthos. Marine Ecology Progress Series. 2006; 317: 1-8.
41. Ritz MP, Perl AL, Colquhoun JM, Chamakura KR, Kuty Everett GF. Complete Genome of Bacillus subtilis Myophage CampHawk. Genome Announc. 2013; 1: 984-997.
42. Rocha EP, Danchin A. Base composition bias might result from competition for metabolic resources. Trends Genet. 2002; 18: 291-294.
43. Sayers W, Barrett T, Benson A, Bolton E, Bryant H, Canese K, Chetvernin V, Church M, Dicuccio M, Federhen S, Feolo M. Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Res. 2012; 40: 13-25.
44. Schilling T, Hoppert M, Hertel R. Genomic Analysis of the Recent Viral Isolate vB_BthP-Goe4 Reveals Increased Diversity of ф29-ЬіЬє Phages. Viruses. 2018; 10: 624-638.
45. Schuch R, Fischetti VA. Detailed genomic analysis of the Wbeta and gamma phages infecting Bacillus anthracis: implications for evolution of environmental fitness and antibiotic resistance. J Bacteriol. 2006; 188: 3037-3051.
46. Shafikhani H, Mandic-Mulec I, Strauch A, Smith I, Leighton T. Postexponential regulation of sin operon expression in Bacillus subtilis. J Bacteriol. 2002; 184: 564-571.
47. Siefert JL, Larios-Sanz M, Nakamura LK, Slepecky RA, Paul JH, Moore ER, Fox GE, Jurtshuk P. Phylogeny of marine Bacillus isolates from the Gulf of Mexico. Curr Microbiol. 2000; 41: 84-88.
48. Simoliuniene M, Tumenas D, Kvederaviciute K, Meskys R, Sulcius S, Si- moliunas E. Complete Genome Sequence of Bacillus cereus Bacteriophage vB_BceS_KLEB30-3S. Microbiol Resour Announc. 2020; 9: 1-3.
49. Stewart CR, Casjens SR, Cresawn SG. The genome of Bacillus subtilis bacteriophage SPO1. J Mol Biol. 2009; 388: 48-70.
50. Willms M, Hoppert M, Hertel R. Characterization of Bacillus subtilis Viruses vB_BsuM-Goe2 and vB_BsuM-Goe3. Viruses. 2017; 9: 146.
51. Xu L, Zhang R, Wang N, Cai L, Tong G, Sun Q, Chen F, Jiao Z. Novel phagehost interactions and evolution as revealed by a cyanomyovirus isolated from an estuarine environment. Environ Microbiol. 2018; 20: 2974-2989.
52. Yee M, Matsumoto T, Yano K, Matsuoka S, Sadaie Y, Yoshikawa H, Asai K. The genome of Bacillus subtilis phage SP10: a comparative analysis with phage SPO1. Biosci Biotechnol Biochem. 2011; 75: 944-952.
53. Yuan Y, Gao M, Wu D, Liu P, Wu Y. Genome Characteristics of a Novel Phage from Bacillus thuringiensis Showing High Similarity with Phage from Bacillus cereus. PLOS ONE. 2012; 7: 143-147.
54. Zhang H, Liu L, He L. Detection and identification of Bacillus cereus susceptible to phage AP631. Chin J Zoonos. 2016; 32: 507-511.
55. Zhao X, Shen M, Jiang X. Transcriptomic and Metabolomics Profiling of Phage-Host Interactions between Phage PaP1 and Pseudomonas aeruginosa. Front Microbiol. 2017; 8: 548-571.
56. Zhonghe X, Yang S, Jeffrey W, Cao Y. Directional mechanical stability of Bacteriophage ф29 motor's 3WJ-pRNA: Extraordinary robustness along portal axis. Science Advances. 2017; 3: 1-8.
57. Zyl J, Nemavhulani S, Cass J, Cowan A, Trindade M. Three novel bacteriophages isolated from the East African Rift Valley soda lakes. Virol J. 2016; 13: 204-228.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Розташування грибів роду та ознаки, покладені в основу систематики. Морфологічні особливості вегетативних та репродуктивних стадій. Біологічні особливості основних видів роду. Джерела інфекції та шляхи їх розповсюдження. Механізми мінливості патогенів.
курсовая работа [1,4 M], добавлен 16.03.2014История и классификация антибиотиков. Их влияние на бактерии рода Bacillus. Интенсивность роста колоний данного микроорганизма при различных концентрациях антибиотика, растворённого в питательной среде. Метод диффузии в агар с использованием желобка.
курсовая работа [1,8 M], добавлен 09.09.2009Бактерії як найдавніші з усіх відомих організмів. Коротка історична довідка про їх появу. Поширення бактерій. Форми бактеріальних клітин. Спірили, бацили, вібріони, стрептококи. Рух бактерій. Монотрихи, лофотрихт, перитрихи. Автотрофи та гетеротрофи.
презентация [7,5 M], добавлен 02.03.2015It was proposed to use the 2H-labeled hydrolysate of RuMP facultative methylotroph Brevibacterium methylicum, obtained from deuterated salt medium dM9 as a substrate for the growth of inosine producing bacterium Bacillus subtilis.
статья [550,4 K], добавлен 23.10.2006Бактерії як велика група одноклітинних мікроорганізмів, які характеризуються відсутністю оточеного оболонкою клітинного ядра. Основні шляхи переносу ДНК у бактерій. Види зелених водоростей та їх екологічне значення. Основні екологічні функції бактерій.
реферат [35,5 K], добавлен 13.01.2010Таксономічний склад і хорологічна характеристика роду Centaurea L. Характеристика особливості рельєфу, кліматичних умов, флори та фауни Чернівецької області. Повний аналіз еколого-ценотичного роду. Цілюща дія та застосування у народній медицині волошки.
курсовая работа [40,1 K], добавлен 29.03.2015Вивчення морфолого-культуральних та фізіолого-біохімічних ознак бактерії Proteus mirabilis; розгляд сфери поширення. Дослідження патогенності та практичного значення; спричинення захворювання сечостатевих органів: простатиту, циститу, пієлонефриту.
курсовая работа [2,6 M], добавлен 26.04.2014Історія вивчення ґрунтових олігохет. Фізико-географічні особливості Малого Полісся. Екологія люмбріцід роду Apporectoidea, їх поширення в Малом Поліссі. Дослідження фауни, екології, хорології ґрунтових олігохет у природних біоценозах Малого Полісся.
дипломная работа [1,6 M], добавлен 12.09.2012Біологічна характеристика та систематичне положення лишайників. Епіфітні лишайники як невід'ємний компонент всіх лісних екосистем. Апотеції леканорового типу. Теоретичні відомості щодо біолого-морфологічної характеристики видового складу роду Калоплака.
курсовая работа [42,0 K], добавлен 31.03.2014Характеристика роду Сомоподібні та наступних родин: арієвих, аспредових, багарієвих, ванделлієвих, калліхтових, кларієвих, косаткових, лорикарієвих, пімелодових, сомів, хакових та шильбових. Опис типових представників відповідних родин сомоподібних.
курсовая работа [2,3 M], добавлен 28.10.2010Ознайомлення з результатами фітохімічного дослідження одного з перспективних видів рослин Українських Карпат - волошки карпатської. Розгляд залежності вмісту досліджуваних біологічно активних речовин від виду сировини. Аналіз вмісту фенольних сполук.
статья [23,3 K], добавлен 11.09.2017Віруси людини і тварин. Родина Adenoviridae: молекулярна маса віріонів, механізм альтернативного сплайсингу. Пневмотропний вірус роду Mastadenovirus. Компоненти віріонів герпесвірусу. Підродина Alphaherpesvirinae, рід Simplexvirus. Віруси бактерій.
курсовая работа [53,5 K], добавлен 06.03.2012Основні джерела антропогенного забруднення довкілля. Вплив важких металів на фізіолого-біохімічні процеси рослин, зміни в них за впливу полютантів. Структура та властивості, функції глутатіон-залежних ферментів в насінні представників роду Acer L.
дипломная работа [950,6 K], добавлен 11.03.2015На основі вивчених еколого-біологічних властивостей рослин водних та прибережно-водних біоценозів проведення визначення стану їхніх ценозів русла річки Сіверський Донець. Визначення видів біоіндикаторів водного середовища, екологічні особливості видів.
курсовая работа [63,9 K], добавлен 07.05.2009Характеристика родини Складноцвітні (Asteraceae). Екологічні особливості. Відмітні ознаки видів роду Matricari. Генетичні типи Ромашки аптечної, екологія і ареал розповсюдження. Ідентифікація різних генетичних типів для отримання високоякісної сировини.
реферат [4,3 M], добавлен 10.03.2009Аэробные спорообразующие бактерии (бациллы), род Bacillus семейства Bacillaceae, их морфолого-физиологические признаки. Санитарно-показательные микроорганизмы. Санитарно-гигиеническая характеристика пищевых продуктов. Возбудители кишечных заболеваний.
контрольная работа [20,4 K], добавлен 10.06.2009Природні умови Буковини. Таксономічний склад і поширення видів роду Tanacetum L. в Україні. Виявлення основних ознак, на підставі яких рід пижмо звичайне (Tanacetum vulgare) може використовуватися в якості лікарських засобів і в народному господарстві.
курсовая работа [50,6 K], добавлен 29.03.2015Віруси настільки малі, що лише в кілька разів перевищують розміри великих молекул білків. Віруси — збудники багатьох хвороб рослин і тварин. У 1917 р. французький вчений Ф. д'Ерелл відкрив віруси бактерій — бактеріофаги (або фаги).
реферат [7,0 K], добавлен 13.05.2007Дослідження морфологічних та екологічних особливостей, фармакологічного застосування пеларгонії. Вивчення способів розмноження, вирощування та догляду за рослиною. Характеристика хвороб та шкідників квітки, методів лікування, використання в озелененні.
дипломная работа [1,5 M], добавлен 29.11.2011Iсторiя iнтродукцiї калини в Українi. Використання калини в народному господарствi. Репродуктивна здатнiсть калини та морфологiчна характиристика культури. Оцінка успішності інтродукції видів роду Viburnum L. в умовах Правобережного Лісостепу України.
курсовая работа [36,3 K], добавлен 19.04.2011
