Експресивність лактатдегідрогенази у чорноморської креветки Palaemon elegans

Дослідження форм ферменту лактатдегідрогенази у чорноморській креветці Palaemon elegans за допомогою електрофоретичного методу та гістохімічної реакції утворення її продуктів. Характеристика результатів визначення активності досліджуваного ферменту.

Рубрика Биология и естествознание
Вид статья
Язык украинский
Дата добавления 28.09.2024
Размер файла 165,5 K

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

Размещено на http://www.allbest.ru/

Размещено на http://www.allbest.ru/

Експресивність лактатдегідрогенази у чорноморської креветки Palaemon elegans

В.В. Субота, аспірантка,

Одеський національний університет імені І.І. Мечникова

С.А. Петров, д. 6. н., професор

Одеський національний університет імені І.І. Мечникова

О.М. Андрієвський, к. 6. н., доцент,

Одеський національний університет імені І.І. Мечникова

Досліджували активність ферменту лактатдегідрогенази у чорноморської креветки Palaemon elegans. З метою виявлення активності ЛДГ використовували електрофоретичний метод та гістохімічну реакцію утворення її продуктів. Найбільшу експресивність виявлено при приготуванні гомогенату креветки на фосфатному буфері рН 7,4. Виявлено дві форми ферменту. Наведено результати визначення активності досліджуваного ферменту.

Ключові слова: лактатдегідрогеназа, електрофорез, чорноморська креветка Palaemon elegans.

LACTATE DEHYDROGENASE EXPRESSION IN THE BLACK SEA SHRIMP PALAEMON ELEGANS

The activity of lactate dehydrogenase enzyme in the Black Sea shrimp Palaemon ele- gans was studied. In order to detect the activity of LD, the electrophoretic method and the histochemical reaction of the formation of its products were used. The highest expressiveness was found when shrimp homogenate was prepared in a phosphate buffer with a pH of 7.4. Two forms of the enzyme have been identified. The results of determining the activity of the studied enzyme are given.

Keywords:lactate dehydrogenase, electrophoresis, the Black Sea shrimp Palaemon ele- gans.

Ракоподібні відіграють важливу роль в чорноморській екосистемі як складові трофічного ланцюга. Одним із найважливіших показників метаболізму у ракоподібних є активність одного з ферментів енергетичного обміну -- лактатдегідрогенази (К.Ф.: 1.1.1.27), що незмінно приймає участь в адаптаційних процесах.

Креветки є важливим промисловим об'єктом у багатьох країнах. Цінність цього організму визначається наявністю в ньому значної кількості насичених і ненасичених жирних кислот, вітамінів, інших біологічно активних речовин і білків. Значна частина досліджень, проведених на цих ракоподібних, присвячена вивченню вмісту в організмі вищевказаних речовин, методів обробки, способів зберігання і збереження отриманих продуктів [5].

За низьких температур фермент інгібується низькими концентраціями лактату, і навпаки, при більш високих температурах для досягнення інгібування необхідні більш високі концентрації субстрату. Цей механізм, описаний [12], дозволяє креветкам підтримувати високий рівень анаеробного метаболізму при відносно високих температурах.

Дослідження [8, 9] показали, що Palaemon elegans Rathke має більшу толерантність до важкої гіпоксії, ніж P. serratus (Pennant). Толерантність до повністю безкисневих умов у P. elegans була обмежена 4 годинами. Вплив помірної гіпоксії (30 торр) призвів до незначної зміни концентрації L-лактату в крові або в тканинах P. elegans або P. serratus. Однак при екстремальній гіпоксії (10 або 5 торр для P. elegans) спостерігалось прогресуюче збільшення концентрації L-лактату в крові та в тканинах обох видів. Після відновлення нормоксичних умов концентрація L-лактату в крові та тканинах поверталася до нормального рівня спокою швидше у P. elegans, ніжуP. serratus [6].

Раніше було досліджено [7], що показники активності супероксид- дисмутази, глутатіонпероксидази, вміст окисненого глутатіону та каротиноїдів були вищими у чорноморської креветці порівняно з антарктичним крилем Euphasia suberba (Dana, 1850).

За [3], активність лактатдегідрогенази корелюється з інтенсивністю метаболізму в тканинах залежно від температурного режиму.

Метою роботи було визначити експресивність лактатдегідрогенази в тканинах чорноморської креветки.

В задачі дослідження входило: 1) визначити наявність лактатдегідрогенази в тканинах креветки; 2) підібрати умови оптимального екстрагування ферменту; 3) визначити кількісні показники експресивності лактатдегідрогенази чорноморської креветки.

чорноморська креветка фермент лактатдегідрогенази

Матеріал і методика дослідження

Джерелом ферменту лактатдегідрогенази (ЛДГ) слугувала чорноморська креветка Palaemon elegans Rathke (1836) (WoRMS, 2004), вилов якої був здійснений в Одеській затоці 30 березня 2021 р. на Одеському пляжі «Дельфін», широта 46О28'38'', довгота 30О43'57'', температура води 14 ОС, солоність 14 %о. Відразу після вилову біологічний матеріал був заморожений при -10 ОС та в подальшому зберігався до початку дослідження.

Після проведення попередніх досліджень на різних буферах, було обрано фосфатний буферний розчин, так як він показав високу активність ЛДГ. Подальший аналіз проводили для всіх проб саме з використання цього буферного розчину.

Гомогенат готували у співвідношенні 1 : 4 на буферному розчині -- 0,1 М фосфатний (NaH2PO4 * Na2HPO4), рН 7,4. Для цього гомогенат зразка отримували шляхом гомогенізації замороженого матеріалу масою 13,7 г в 54,7 мл буферного розчину протягом 2 хв за допомогою мікро- подрібнювача та подальшого центрифугування при 8 000 g протягом 10 хв.

Далі проводили електрофоретичне дослідження отриманих проб супернатанту в лужних умовах (pH 8,3) з використання апарату OmniPage Tetrad Mini-set (Великобританія), який надає можливість формувати по- ліакриламідно-гелеві блоки розміром 100 мм х 100 мм х 1 мм.

Міграція ферменту проходила в 7,5 % поліакриламідному гелі при силі електричного струму в 100 мА та напруженні 250 V протягом 120 хв. В кожний із слотів заполімеризованого гелю вносили індивідуальні об'єми проб в кількості 20 мкл з попереднім додаванням 10 мкл 60 % розчину сахарози, що містив 0,01 % бромфенолового синього. Як робочий буфер для електрофорезу використовували 0,04 М трис-гліциновий буфер pH 8,3, в якому в подальшому виявляли активність лактатдегідрогенази. Після електрофорезу гелеві блоки інкубували в 25 мл лужного буфера, що містив 12,5 мг лактату літія, 6,5 мг NAD+, 10 мг пара-нітротетра- золієвого синього та 5 мг феназинметасульфату. Інкубація тривала одну годину при +25 °С, що було достатньо для прояву активності ферменту в гелі. Після інкубації гелі промивати дистильованою водою, пакували в поліетиленові файли та сканували з використанням планшетного сканера. Отримані зображення зберігали в форматі ВМР для подальшої комп'ютерної обробки.

Кількісну оцінку отриманих результатів експресивності ферменту проводили в комп'ютерній програмі «АнаИС» після сканування гелевого блока. Це дає можливість отримати цифрові дані щодо експресії молекулярних форм лактатдегідрогенази, їхньої відносної електрофоретичної рухливості, часткового внеску кожної молекулярної форми ферменту в загальну активність та побудувати денситограми та гістограми.

Після отримання необхідних значень оптичної густини ділянок локалізації ферментів і продуктів каталізованих ними реакцій відносну активність (ВА) лактатдегідрогенази розраховували за формулою:

ba=4D°± v-t-k

де D° -- оптична густина, що відображає кількість продукту реакції в окремій фракції в умовних одиницях; V -- об'єм реакційного середовища в області локалізації ферменту гелевому блоці, мл; v -- об'єм аналізованого екстракту, мл; t -- час, за який проходила ферментативна реакція, хв; k -- коефіцієнт переведення відносних одиниць оптичної щільності у молі кінцевого продукту реакції (коефіцієнт розраховується за калібрувальним графіком, що відображає залежність щільності фракцій на денсито- грамі від відомих кількостей продукту реакції).

Питому активність ферменту розраховували за даними відносної активності та концентрації білка в досліджуваній пробі -- ПА = BA / [P], одиниці/мг.

Кількісну оцінку отриманих результатів експресивності ферменту проводили в комп'ютерній програмі «АнаИС» після сканування гелевого блоку.

Рис. 1. Електрофоретичний профіль лактатдегідрогенази чорноморської креветки Palaemon elegans: А -- електрофореграма, В -- денситограма, С -- гістограма оптичної щільності та питомої активності

Статистичну обробку даних, що відображали рівень експресії досліджуваного ферменту, проводили у програмі «Excel». З використанням цієї програми знаходили середні арифметичні величини і їх стандартні відхилення. Відмінності між порівнюваними варіантами вважали достовірними при р<0,05. На основі отриманих даних будували гістограми.

Рис. 2. Електрофоретичний профіль молекулярних форм лактатдегідрогенази чорноморської креветки Palaemon elegans: а -- електрофореграма, b -- денситограма, c -- гістограма оптичної щільності

Результати досліджень та їх обговорення

На рисунку 1 наведені характеристики лактатдегідрогенази чорноморської креветки при приготуванні гомогенату з використанням фосфатного буферу.

Подальші електрофоретичні дослідження проводили саме з використанням екстракту, отриманого на даному буферному розчині (рис. 2).

ТаблицяПоказники ЛДГ чорноморської креветки Palaemon elegans

Екстракт на фосфатному буфері

[P], мг/мл

AD°, од.

ВА, од./мл

ПА, од./мг

1

2,98

1,61

2,291

0,877

2

2,8

1,51

2,148

0,822

Кількість повторностей -- 12. Показники питомої активності наведені в таблиці.

Як видно з рисунку 2, фермент представляє собою дві форми лактатдегідрогенази. Активність першої форми є більш вираженою. В екстрактах були знайдені дві форми, з середньою та високою електрофоретичною рухливістю (Rf = 0,086 та 0,190).

З наведеного рисунку видно, що експресивність лактатдегідрогенази першої та другої форми в середньому складає відповідно 1,61 та 1,51 одиниць. При цьому питома активність форм ферменту досягає відповідно 0,877 та 0,822 одиниць на 1 мг білка.

При співставленні отриманих результатів з даними літератури [1,4] було встановлено, що креветки Litopenaeus vannamei, так само як і чорноморські креветки, мають дві білкові субодиниці. Важливо відмітити, з літературного джерела [10], що температурна адаптація креветок майже не викликає змін активності ЛДГ.

ЛДГ креветки Palaemon serratus [11] також майже не чутлива до змін температури від 10 до 20 °С, активність порівняно з чорноморською відрізняється на 0,1. Активність ЛДГ Litopenaeus vannamei значно перевищує цей показник у чорноморських креветок [2].

Висновки

Приготування екстракту тканини чорноморської креветки (Palaemon elegans) на фосфатному буферному розчині (рН 7,4) забезпечує максимальну екстракцію ферменту лактатдегідрогенази.

Лактатдегідрогеназа у чорноморської креветки (Palaemon elegans), яка здатна перетворювати лактат, представлена двома формами, з різною електрофоретичною рухливістю. Активність першої форми була більш вираженою, з питомою активністю 0,877 одиниць на 1 мг білка.

Відносно висока активність ЛДГ у Palaemon elegans -- 0,877-- 0,877 од./мг білку, порівняно з ЛДГ інших представників креветок, може бути пов'язана з умовами їхнього існування.

Дослідження показали, що чорноморська креветка Palaemon elegans має високу активність ферменту лактатдегідрогенази, що відіграє важливу роль у її метаболічних та адаптаційних процесах. Дослідження активності ЛДГ у чорноморської креветки може мати значення для подальшого вивчення метаболічних процесів та адаптаційних властивостей цього виду, а також для визначення якості креветок як важливого промислового об'єкту.

Список використаної літератури

1. Головина И.В. Особенности активности ферментов энергетического обмена в тканях черноморских моллюсков разной подвижности в норме и при патологии. Мор. биол. журн. 2016. № 1. С.14--23.

2. Duan Y., Wang Y., Zhang J., Xiong D. Elevated temperature disrupts the mucosal structure and induces an immune response in the intestine of white leg shrimp Litopenaeus vannamei (Boone, 1931) (Decapoda: Dendrobranchiata : Penaeidae). J. Crustacean Biol. 2018. Vol. 38, N 5. P. 635--640.

3. Emeretli I.V. Temperature dependence of the lactate dehydrogenase activity in tissues of the Black Sea flatfishes. Hydrobiol. J. 2002. Vol. 38, N 3.

4. Fregoso-Pe^^ri A.A., Valenzuela-Soto E.M., Figueroa-Soto C.G. et al. White shrimp Litopenaeus vannamei recombinant lactate dehydrogenase: Biochemical and kinetic characterization. Protein Expression and Purification. 2017. Vol. 137. P. 20--25.

5. Kim Min-A, Jung Hae-Rim, Lee Yang-Bong et al. Monthly Variations in the nutritional composition of antarctic krill Euphausia superba. Fisheries and Aquatic Sciences. 2014. Vol. 17, N 4. P. 409--419.

6. Madeira D., Mendon3a V., Vinagre C. & Diniz M.S. Is the stress response affected by season? Clues from an in situ study with a key intertidal shrimp. Mar. Biol. 2016. Vol. 163, N 41.

7. Petrov S.A., Andriyevsky O.M., Budnyak O.K. et al. Antioxidant protection system in the tissues of the Antarctic krill Euphausia superba and of the Black Sea shrimp Palae- mon elegans. Hydrobiol. J. 2022. Vol. 58, N 5. P. 78--84.

8. Taylor A.C., Spicer J.I. Metabolic responses of the prawns Palaemon elegans and P. serratus (Crustacea : Decapoda) to acute hypoxia and anoxia. Mar. Biol. 1987. Vol. 95. P. 521--530.

9. Taylor A.C., Spicer J.I. Functional significance of a partial-emersion response in the intertidal prawn Palaemon elegans (Crustacea : Palaemonidae) during environmental hypoxia. Marine Ecology Progress Series. 1988. Vol. 44, N 2. P. 141--147..

10. Thebault M.T. Lactate content and lactate dehydrogenase activity in Palaemon serratus abdominal muscle during temperature changes. J. Comp. Physiol. B 154. 1984. P. 85--89.

11. Thebault M.T., Bernicard A., Lennon J.F. Lactate dehydrogenase from the caudal muscle of the shrimp Palaemon serratus: purification and characterization. Comparative Biochemistry and Physiology. Part B: Comparative Biochemistry. 1981. Vol. 68, N 1. P. 65--70.

12. Thebault M.T., Le Gal Y. Short and long-term temperature adaptation of the muscle lactate dehydrogenase in Palaemon serratus in animals and environmental fitness. Physiological and Biochemical Aspects of Adaptation and Ecology. 1980. Vol. 2. P. 23--35.

Размещено на Allbest.ru

...

Подобные документы

  • Поняття системного дослідження предметів і явищ навколишнього нас миру як частини або елементи певного цілісного утворення. Система як безліч об'єктів разом з відносинами між об'єктами й між їхніми атрибутами. Специфіка системного методу дослідження.

    реферат [26,6 K], добавлен 21.06.2010

  • Історія дослідження і вивчення ферментів. Структура і механізм дії ферментів. Крива насичення хімічної реакції (рівняння Міхаеліса-Ментен). Функції, класифікація та локалізація ферментів у клітині. Створення нових ферментів, що прискорюють реакції.

    реферат [344,3 K], добавлен 17.11.2010

  • Антиоксидантна система як захист проти вільних радикалів. Гістамін:історія вивчення, структура, шляхи синтезу і вивільнення. Визначення активності супероксиддисмутази, каталази, глутатіонпероксидази, вплив на неї наявності гістаміну в нирці щура.

    курсовая работа [1,7 M], добавлен 22.06.2014

  • Характеристика фізико-географічних умов району дослідження. Флора судинних рослин правобережної частини долини р. Малий Ромен, народогосподарське значення та охорона. Використання результатів дослідження в роботі вчителя біології загальноосвітньої школи.

    дипломная работа [48,4 K], добавлен 21.07.2011

  • Біологічне значення стомлення, методи його дослідження. Вивчення біохімічних основ стомлення у підлітків та його діагностування доступними засобами. Виявлення зміни в активності слини учнів внаслідок стомлення під час фізичних та розумових навантажень.

    курсовая работа [116,8 K], добавлен 21.01.2017

  • Фундаментальні принципи, методи, перспективи розвитку і застосування нанотехнологій з використанням мікроорганізмів та продуктів їх життєдіяльності. Виробництво наноматеріалів за допомогою мікроорганізмів, використання їх специфічних властивостей.

    курсовая работа [1,2 M], добавлен 21.01.2016

  • Електрофоретичне розділення нуклеїнових кислот в агарозних гелях. Основні параметри, від яких залежить швидкість міграції нуклеїнових кислот в агарозному гелі. Прилади та буферні розчини для проведення горизонтального електрофорезу, забарвлення ДНК.

    лабораторная работа [251,8 K], добавлен 03.12.2011

  • Дослідження властивостей гіберелінів, групи гормонів рослин, які регулюють ріст і різноманітні процеси розвитку. Характеристика етапів синтезу гіберелінів. Огляд методу зануреного культивування грибів фузарій. Вплив аерації та температури на біосинтез.

    реферат [961,4 K], добавлен 10.01.2014

  • Організація бактеріальних біоплівок та процес їх утворення. Використання атомно силової мікроскопії для дослідження біоплівок, поширення їх у природі та методи штучного вирощування. Стійкість біоплівкових бактерій до дії антибіотиків і стресових чинників.

    реферат [1,7 M], добавлен 25.01.2015

  • Тропическая креветка-богомол. Характерные пятна креветок. Зрительная система рака богомола. Обнаружение объектов против рассеянного света. Схема строения фасеточного глаза насекомого. Цветовое зрение беспозвоночных с восприятием ультрафиолетовых лучей.

    реферат [21,2 K], добавлен 14.10.2014

  • Головні напрями палеоантропологічних досліджень. Визначення біологічного віку, показник віку людини. Зміни, якi відбуваються на довгих трубчастих кістках. Статеві відмінності (диморфізм) виражені в будові таза, та морфології довгих трубчастих кісток.

    реферат [15,1 K], добавлен 29.09.2010

  • Визначення терміну життя білків в організмі. Будова протеасоми як спеціального білкового утворення. Роль убіквіну в процесі утилізації білків. Методи виявлення злоякісних утворень або ослаблення імунної системи клітин. Функціональне призначення лізосоми.

    презентация [111,1 K], добавлен 24.09.2014

  • Гістамін: історія вивчення, властивості, структура, шляхи синтезу і вивільнення. Активність супероксиддисмутази, каталази, глутатіонпероксидази у нирках інтактних тварин. Зміна активності у нирках щура за дії гістаміну у концентраціях 1 та 8 мкг/кг.

    курсовая работа [1,5 M], добавлен 20.07.2014

  • Хромосомна теорія спадковості. Кросинговер та конверсія генів. Хромосомні типи визначення статі. Експериментальне дослідження особливостей успадкування мутацій "white" та "cut" (відповідно "білі очі" та "зрізані крила") у Drosophila melanogaster.

    дипломная работа [1,3 M], добавлен 30.11.2014

  • Дослідження життєвих форм личинок волохокрильців. Особливості загальних життєвих форм комах. Діяльність та будова дорослих особин волохокрильців. Поширеність цих комах та функція в природі. Місце та значення волохокрильців в природному середовищі.

    реферат [1,7 M], добавлен 21.09.2010

  • Стан забруднення атмосферного повітря у Рівненський області. Оцінка екологічного стану озера Басів Кут. Вимоги до якості води і методи гідрохімічних досліджень визначення органолептичних властивостей води. Дослідження якості поверхневих вод озера.

    учебное пособие [739,8 K], добавлен 24.10.2011

  • Таксономічний склад фітопланктону р. Зелена Житомирської області. Чисельність та біомаса водоростевих угруповань річки. Еколого-географічна характеристика фітопланктону досліджуваного об’єкту за індикаторними видами, флористичне зведення водоростей.

    дипломная работа [3,6 M], добавлен 22.01.2015

  • Характеристика ґрунту як середовища проживання мікроорганізмів. Дослідження методів визначення складу мікроорганізмів. Аналіз їх ролі у формуванні ґрунтів та їх родючості. Біологічний кругообіг в ґрунті. Механізм дії мінеральних добрив на мікрофлору.

    реферат [96,7 K], добавлен 18.12.2014

  • Дослідження біологічних особливостей представників класу "Двостулкові молюски", визначення їх значення в природі, житті людини. Характеристика морфологічних, фізіологічних та екологічних особливостей двостулкових молюсків. Особливості систематики класу.

    курсовая работа [5,6 M], добавлен 21.09.2010

  • Огляд результатів дослідження показників об’єму короткочасної пам’яті, рівня переключення уваги та розумової працездатності у волонтерів з контамінованих територій. Формування психофізіологічної організації системи переробки інформації у досліджуваних.

    статья [27,6 K], добавлен 24.04.2018

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.