Квантовохимическое исследование энергетики водородной связи и пространственной структуры конформаций тиопроизводных ацетилацетона

Анализ влияния расчетных базисов в рамках неэмпирического подхода. Расчет структуры конформаций енолизованных форм тиоацетилацетона в одноэлектронных методах. Влияние учета эффекта электронной корреляции на картину энергии конформеров и таутомеров.

Рубрика Химия
Вид статья
Язык узбекский
Дата добавления 10.05.2018
Размер файла 417,2 K

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

Размещено на http://www.allbest.ru/

Размещено на http://www.allbest.ru/

Квантовохимическое исследование энергетики водородной связи и пространственной структуры конформаций тиопроизводных ацетилацетона

Ранее неоднократно изучались строение, конформационные переходы таутомеров 1,3 - дикетонов и их производных различными экспериментальными и теоретическими квантовохимическими полуэмпирическими и неэмпирическими методами [1], [2], [3]. Между тем, наличие такого атома третьего периода, как сера, может оказывать существенное влияние как на сами свойства таутомеров 1,3 - тиокарбонильного соединения, так и на процесс таутомеризации в целом. В частности, помимо енольных форм (V, VI, VII), возможна также енолизация исходного тиодикетона I по атому серы, с образованием тиольных таутомеров II, III, IV (рис. 1).

Рис. 1. Конформации и таутомерные формы тиоацетилацетона

тиоацетилацетон конформер таутомер квантохимический

Вследствие сильной подвижности атома водорода точное измерение различными экспериментальными методами сталкивается с определенными трудностями [3], что делает еще более актуальной задачу теоретического изучения подобного плана тиокарбонильных соединений.

В настоящей работе ставилась задача исследования неэмпирическими методами квантовой химии геометрического строения конформеров тиоацетилацетона, как простейшего представителя 1,3 - тиокарбонильного соединения, связь конформационных форм его таутомеров с энергией водородной связи, а также изучалось влияние расчетного базиса и полученной в ходе различных приближений энергии электронной корреляции на расчетную величину энергии молекулы и ее пространственное строение. Все расчеты проводились в корреляционно-согласованном базисе cc-pVDZ, и улучшенном aug-cc-pVDZ. Для учета корреляционных поправок использовался метод возмущений Меллера-Плессета второго порядка (MP2) и метод функционала электронной плотности (DFT) с применением гибридного функционала B3LYP. Для расчетов использовалась программа MPQC [4] гибридного функционала B3LYP. Для расчетов использовалась программа MPQC [4]

Рис. 2. Структура исходного тиокетона I

Рис. 3. Структура енольного таутомера II

Структуры таутомерных молекул и их конформеров оптимизированные в расчетах b3lyp/cc-pVDZ представлены на рис. 2-8. Для вывода графических моделей использовалась программа Gabedit [5].

Следует отметить, что структурные параметры молекул, полученные в различных методах различаются незначительно, однако видно (табл. 1), что расширение базиса cc-pVDZ до aug-cc-pVDZ приводит к некоторому завышению межатомных расстояний, тогда как расчеты с учетом электронной корреляции напротив приводят к их заметному сокращению.

Рис. 4. Структура енольного таутомера III

Рис. 5. Структура енольного таутомера IV

Рис. 6. Структура енольного таутомера V

Рис. 7. Структура енольного таутомера VI

Таблица 1. Равновесные межатомные расстояния S-O, Е

Базис

I

III

VI

II

V

cc-pVDZ

4,328

2,818

3,076

3,107

3,000

aug-cc-pVDZ

4,364

2,830

3,082

3,108

3,005

MP2/cc-pVDZ

4,362

2,731

3,030

3,024

2,914

B3lyp/cc-pVDZ

4,361

2,711

3,050

2,979

2,909

Рис. 8. Структура енольного таутомера VII

Длина водородной связи в тех таутомерах, где она может образовываться (II и V), также обнаруживает те же тенденции при расширении базиса и учете электронной корреляции (табл. 2). Кроме того, вполне ожидаемо ее увеличение для атома серы, однако оно крайне незначительно, и не превышает 0,1 - 0,15 Е.

Таблица 2. Ддина водородной связи, Е

Связь

cc-pVDZ

aug-cc-pVDZ

MP2/cc-pVDZ

B3lyp/cc-pVDZ

O-H

2,033

2,041

1,818

1,732

S-H

2,136

2,148

1,963

1,957

Из таблицы 3, в которой приведены относительные энергии рассчитанных соединений, видно, что учёт корреляционных эффектов оказывает весьма существенное влияние на результат расчета энергетических характеристик молекул. Так, если расширение числа базисных функций со 142 (базис cc-pVDZ) до 237 (базис aug-cc-pVDZ) приводит к выигрышу порядка 40 - 45 кДж/моль, то энергия корреляции, полученная методом возмущений MP2, составляет более трех с половиной, а метод функционала электронной плотности показывает корреляционную энергию более шести тысяч кДж/моль. Очевидно, что величины такого масштаба не могут не оказывать влияния на качественный результат проводимых расчетов, что и наблюдается при сравнении относительной энергии таутомеров (табл. 4). В частности, одноэлектронные расчеты в базисе cc-pVDZ указывают, что енолизация по по атому серы (структура II) энергетически выгодней енолизации по кислороду (структура V). Улучшение базиса до aug-cc-pVDZ хотя качественно меняет этот результат, однако количественный энергетический выигрыш в этом случае невелик. В то же время, учет энергии корреляции приводит к явному предпочтению енолизации тиокетона по кислороду, а таутомеры VI и VII являются энергетически невыгодными. Также можно видеть, что енолизация по атому серы без образования водородной связи (структуры III и IV) также не приводит к сколько-нибудь значительному энергетическому выигрышу по сравнению с неенолизованой формой (I). К настоящему времени разработано и продолжает разрабатываться [см. напр. 7] множество методов учета электронной корреляции в рамках различных приближений, однако предпочтительность того или иного метода пока может оцениваться только на основе сравнительного анализа с экспериментальными данными.

Таблица 3. Энергия электронной корреляции таутомерных и енольных форм тиоацетилацетона, кДж/моль

Базис

I

II

III

IV

V

VI

VII

cc-pVDZ

6250,5

6261,9

6261,2

6256,3

6281,5

6269,8

6269,8

aug-cc-pVDZ

6207,6

6228,8

6221,2

6218,8

6237,7

6222,0

6225,7

MP2/cc-pVDZ

3572,4

3589,1

3586,1

3587,1

3596,9

3589,2

3590,1

B3lyp/cc-pVDZ

0,0

0,0

0,0

0,0

0,0

0,0

0,0

Несмотря на то, что в виду таких особенностей ab initio расчетов, как учет многоцентровых взаимодействий не существует достаточно строгого метода, позволяющего выделить отдельно двухатомную энергию и энергию связи в частности, тем не менее, расчет в данном случае позволяет сделать приблизительную оценку энергии водородной связи, сравнивая энергию соответствующих таутомеров с водородной связью и без нее. Так, по данным DFT-расчетов конформеры II и III различаются приблизительно на 13 кДж/моль, а V и VI на более, чем 70 кДж/моль (табл. 4). Однако такой неожиданный результат может объясняться не только более высокой прочностью водородной связи S-H, но и относительно невыгодным взаимным расположением других атомов, в частности, близким расположением атомов кислорода и серы и, вследствие этого, их взаимным отталкиванием.

Таблица 4. Относительная молекулярная энергия таутомеров тиоацетилацетона, кДж/моль

Базис

I

II

III

IV

V

VI

VII

cc-pVDZ

11,39

0,00

12,76

15,25

6,48

67,82

50,25

aug-cc-pVDZ

5,78

4,12

10,06

15,10

0,00

57,29

43,45

MP2/cc-pVDZ

11,37

5,25

15,81

24,21

0,00

65,22

48,62

B3lyp/cc-pVDZ

35,89

13,05

26,60

34,00

0,00

72,99

55,45

Таким образом, на основании проведенных исследований можно сделать вывод, что наиболее прочная водородная связь образуется за счет енолизации по кислороду. Расширение расчетного базиса не приводит к качественно новым результатам, тогда как использование методов, учитывающих корреляционные эффекты, приводят к взаимно непротиворечивым результатам, что и обуславливает их предпочтительность для исследования конформационных эффектов карбонильных соединений, содержащих атомы элементов III периода. Полные энергии конформеров и таутомеров тиоацетилацетона также различаются незначительно, что и объясняет легкость переходов между ними.

Список литературы

1. Шокова Э.А. 1,3 - дикетоны. Синтез и свойства / Э.А. Шокова, Дж.К. Ким, В.В. Ковалев // Журнал органической химии. - 2015. - Т. 51. - Вып. 6 - С. 773-847.

2. Иванов Ю.В. Исследование таутомерии иминопроизводных оксиацетофенона неэмпирическими методами / Ю.В. Иванов // Современные проблемы химической науки и образования, Чебоксары, 2012. - 19-20 апреля. - С. 84-85.

3. Кострюкова Т.С. Получение фторированных в-дикетонов / Т.С. Кострюкова, Н.В. Васильев // Вестник Московского государственного областного университета серия «Химия». - - №1. - С. 150-156.

4. The Massively Parallel Quantum Chemistry Program (MPQC), Version 2.3.1 / Curtis L. Janssen, Ida B. Nielsen, Matt L. Leininger, Edward F. Valeev, Joseph P. Kenny, Edward T. Seidl, Sandia National Laboratories, Livermore, CA, USA, 2008.

5. Allouche, A.-R. Gabedit. A graphical user interface for computational chemistry softwares // Journal of Computational Chemistry. - 2011 - №32 - 174-182.

6. Аникин Н.А. Новая аппроксимация DFT для быстрых расчетов био- и наноструктур / Н.А. Аникин, М.Б. Кузьминский // Информационно-вычислительные технологии в науке - 2011, Сб. Тезисов. - М.: 2011 - С. 29-30.

Размещено на Allbest.ru

...

Подобные документы

  • Изучение водородной связи, которая образуется между электроотрицательными атомами, из которых хотя бы один имеет свободную электронную пару. Особенности внутримолекулярной и межмолекулярной водородной связи, анализ ее энергии и органических соединений.

    курсовая работа [301,9 K], добавлен 14.03.2010

  • Анализ химической связи как взаимодействия атомов. Свойства ковалентной связи. Механизм образования ионной связи, строение кристаллической решетки. Примеры межмолекулярной водородной связи. Схема образования металлической связи в металлах и сплавах.

    презентация [714,0 K], добавлен 08.08.2015

  • Определение типа химической связи в соединениях. Особенности изменения электроотрицательности. Смещение электронной плотности химической связи. Понятие мезомерного эффекта. Устойчивость сопряженных систем, их виды. Возникновение циклических соединений.

    презентация [1,8 M], добавлен 10.02.2014

  • Качественные и количественные теоретические оценки влияния растворителей на скорость органических реакций между нейтральными аполярными и биполярными молекулами, а также между простыми неорганическими ионами. Роль водородной связи в химической кинетике.

    курсовая работа [1,0 M], добавлен 09.03.2012

  • Квантово-механическая модель, применяемая для исследования сферического вращения. Понятие одноэлектронных атомов. Компоненты лапласиана в шаровых координатах. Гамильтониан и уравнение Шрёдингера для одноэлектронных состояний и водородоподобного иона.

    курс лекций [567,9 K], добавлен 29.01.2009

  • Приближение самосогласованного поля. Метод оптимизации геометрии. Расчет спектрофизических характеристик молекул. Построение модельных структур различных химических форм полианилина и определение квантовохимическими методами их относительной устойчивости.

    дипломная работа [1,3 M], добавлен 06.01.2016

  • Основные приближения метода потенциалов. Ковалентная связь как вид химической связи, характеризуемый увеличением электронной плотности. Свойства и структура ковалентных кристаллов. Особенности двух- и многоатомных молекул. Оценка энергии связи в металлах.

    презентация [297,1 K], добавлен 22.10.2013

  • Сущность и природа водородной связи. Водородные связи и свойства органических соединений. Метод инфракрасной спектроскопии. Инфракрасное излучение и колебания молекул. Анализ спектральных характеристик растворов пространственно-затрудненных фенолов.

    курсовая работа [1,1 M], добавлен 28.04.2010

  • Методы исследования атомной структуры монокристалла, этапы: отбор образца, определение сингонии параметров ячейки решетки Браве; установление пространственной группы симметрии. Модели структуры диаммониевой и монометиламмониевой солей 5-нитраминтетразола.

    дипломная работа [1,5 M], добавлен 11.02.2012

  • Понятие химической связи как взаимодействия между атомами, приводящее к образованию устойчивой системы, ее энергия и причины возникновения; относительный характер классификации. Знакомство с способами образования ковалентной, ионной и водородной связи.

    презентация [1,3 M], добавлен 27.01.2014

  • Влияние избытка поверхностной энергии на адгезионное взаимодействие наночастиц. Адсорбционный монослой ПАВ. Локальная концентрация и образование островковой наноразмерной структуры. Влияние ПАВ на поверхностные силы и устойчивость лиофобных наносистем.

    контрольная работа [284,0 K], добавлен 17.02.2011

  • Определение понятия и изучение свойств редкоземельных элементов. Характеристика структуры и исследование устойчивости различных форм полуторных оксидов редкоземельных металлов. Европий и влияние метода приготовления оксида на его структуру и свойства.

    курсовая работа [316,9 K], добавлен 29.03.2011

  • Физические свойства и основные структурные типы ионных соединений. Влияние отношения ионных радиусов на устойчивость кристаллической структуры. Определение энергии кристаллической решетки. Влияние размеров ионов на растворимость ионных соединений в воде.

    лекция [946,5 K], добавлен 18.10.2013

  • Влияние природы газа-носителя и его параметров на качество разделения веществ. Основные требования к газу-носителю. Газовая хроматография с применением паров. Природа неподвижной жидкости. Полярные и неполярные соединения. Образование водородной связи.

    реферат [18,5 K], добавлен 10.02.2010

  • Расчет параметров молекулы, состоящей из катиона имидазолия и аниона тетрафторобората с помощью программного обеспечения. Получение структуры молекул, распределение электронной плотности по их поверхности. Расположение критических точек связей.

    контрольная работа [2,8 M], добавлен 24.11.2013

  • Рассмотрение возможности экологизации раздела химии: "Физико-химические свойства водорода" путем внедрения темы: "Альтернативная энергетика". Обзор сведений о водородной энергетике как альтернативном виде энергии. Выбор наилучших форм организации занятий.

    дипломная работа [135,3 K], добавлен 24.12.2009

  • Формирование доменной структуры в блок-сополимерах, термодинамическая несовместимость сегментов различной природы, приводящая к их сегрегации. Процессы формирования структуры типичных полимеров и ее изменения в зависимости от термических воздействий.

    статья [172,5 K], добавлен 03.03.2010

  • Применение тонких полимерных пленок в различных областях техники, изучение их структуры. Исследование термической деструкции методом ИК-спектроскопии. Получение полисилоксановых пленок на поверхности металла методом полимеризацией под действием разряда.

    статья [547,4 K], добавлен 22.02.2010

  • Исследование корреляционной связи примесей бромид-ионов в галитовом отвале; определение коэффициентов корреляции его компонентов. Динамика содержания хлорида натрия, бромид-иона, хлорида магния с увеличением или уменьшением примеси хлорида калия и воды.

    контрольная работа [20,2 K], добавлен 28.05.2012

  • Основы квантовой механики атома. Соотношение де Бройля. Уравнение Шредингера. Ионная (гетерополярная) связь. Расчет энергии ионной связи. Теория ковалентной (гомеополярной) связи. Метод валентных связей. Метод молекулярных орбиталей (МО).

    курсовая работа [152,7 K], добавлен 17.02.2004

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.