О молекулярном механизме биологической активности апигенина
Исследования взаимодействия молекулы апигенина с молекулой фосфатидилхолина методами спектроскопии ЯМР и квантовой химии. Изменение конформационных состояний молекулы лецитина при формировании комплекса с апигенином, вызывающих образование кинков.
Рубрика | Химия |
Вид | статья |
Язык | русский |
Дата добавления | 02.12.2018 |
Размер файла | 299,5 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
О молекулярном механизме биологической активности апигенина
Введение
Молекула апигенина является представителем обширным группы флавоноидов - соединений растительного происхождения. В последние годы интерес к этой группе соединений резко возрос в связи с установленным все расширяющимся рядом видов проявляемой ими биологической активности [1-3]. К настоящему времени выделено из природных источников и произведено идентификация свыше шести тысяч молекул из группы флавоноидов, у которых установлено больше сорока видов биологической активности [4].
Особый интерес исследователей к апигенину обусловлен обнаруженной его способностью подавлять развитие клеток новообразований в тканях организма, его противоаллергические свойства нашли в ряде случаев практическое применение [4, 5]. Быстро растущий интерес к этому соединению обусловлен его способностью оказывать влияние на проницаемость стенок капилляров.
Апигенин - сложное полифенольное соединение, включающее три шестичленных цикла, допускающее различные внутримолекулярные взаимодействия и изменения его конформационных состояний и электронного строения при межмолекулярных взаимодействиях [6, 7] (рис. 1).
Ранее было показано, что апигенин при взаимодействии с клеточным фосфатидилхолином образует комплексы посредством связи р-системы электронов кольца C и холиновой группы лецитина, сопровождающиеся изменением электронного строения и конформаций лецитина [8-10]. Биологические функции молекул принято считать закодированными в структуре молекулы [11, 12]. Широкий набор видов биологической активности дает возможность предположить, что взаимодействие апигенина с другими биологическими молекулами сопровождается изменениями и в апигенине. В настоящем сообщении представлены результаты исследований изменений электронного строения и структуры апигенина и клеточного лецитина при их взаимодействии.
Экспериментальная часть
В экспериментах использовался лецитин, полученный по способу, описанному в работе [11]. Очистка препарата производилась методом колоночной хроматографии. Чистота препарата проверялась по спектрам ЯМР. В работе использовались стандартные образцы апигенина фирмы Aldrich.
Растворы лецитина имели концентрацию 0.005 М, концентрация тригидрооксифлавона менялись по условиям эксперимента. Спектры регистрировались при относительно низких значениях концентрации лецитина из-за возникновения мицелл, приводящих к уширению спектральных линий и снижению точности измерений. Спектры ЯМР 1H и 13С записаны на импульсном спектрометре Bruker Avance III с рабочей частотой 500.13 мГц (1Н) и 125.47 мГц (13С) с использованием 5 мм датчика с Z-градиентом РАВВО при постоянной температуре образца 298 К. Химические сдвиги в спектрах ЯМР 13С, 1H приведены в м.д. относительно сигнала внутреннего стандарта тетраметилсилана (ТМС). Задержка между импульсными последовательностями устанавливалась для достижения полной релаксации. С целью увеличения цифрового разрешения применялось дополнение нулями и умножение Фурье-образа спектра на экспоненциальную функцию (1b = 0.1 Гц для 1Н и 1 Гц для 13С). Спектры ЯМР 13С с подавлением протонам (WALTZ-16) были зарегистрированы при следующих условиях: спектральное окно 29.8 кГц, количество точек - 64 К, длительность возбуждающего им-пульса (30°) - 3.2 мкс, релаксационная задержка - 2с. количество прохождений - 256. Редактирование спектров ЯМР 13С проводилось на основании экспериментов DEPT-90 и DEPT-135. Длительность импульса, регенерирующего поперечную намагниченность, выбиралась 6 мкс (DEPT-90) и 9 мкс (DEPT-135), рефокусирующая задержка 1/2J = 3.5 мс, 64 К точки накоплены в течение 64 прохождений, спектральное окно- 29.8 кГц, экспоненциальное уширение линий - 1 Гц.
Двумерные спектры зарегистрированы в стандартных режимах многоимпульсных последовательностей программного обеспечения прибора. Спектры gsCOSY зарегистрированы со следующими параметрами: размер матрицы 4 К на 512 экспериментов при спектральном окне 5.0 кГц, при обработке использовалась синусоидальная-колоколообразная взвешивающая функция для F1 и F2 проекций (ssb = 2), gsHSQC спектр (hsqcetgp[4], размер матрицы 2К на 256 экспериментов, 5.0 кГц для F2-проекции и 27.7 кГц - для F1) зарегистрирован с задержкой d 4 оптимизированной под наблюдение JCH = 145 [15].
Результаты и их обсуждение
В работе [12] было показано, что в растворах клеточного фосфатидидхолина с апигенином возникают комплексы за счет взаимодействия -системы электронов кольца С тригидрооксифлавона с холиновой группой лецитина и определены изменения электронного строения и конформационных состояний лецитина. Очень широкий круг видов биоактивности разной природы и достаточно сложное строение молекулы апигенина обусловили предположение о возможности дополнительных типов комплексов, сопровождающихся изменениями и в апигенине. Внимательный анализ спектров от ядер 13С в области слабого поля показал изменения спектральных линий, соответствующих ядрам атомов углерода, образующих двойную связь в углеводородной цепи молекулы лецитина. Сигнал от ядра С(10) с химическим сдвигом 130.0472 м.д. смещается в сторону сильного поля на 0.045 м.д.
Одновременно под влиянием апигенина происходит полное разрешение практически слившихся линий от ядер С(9) и С(10), образующих двойную связь (рис. 2).
Зарегистрированные двумерные С, Н спектры дали возможность установить и произвести идентификацию связи атомов водорода апигенина с атомами углерода, образующими двойную связь в углеводородной цепи лецитина. В частности, как видно из рис. 3 слабо заметный кросс пик обусловленный ядром С(10) с химическим сдвигом 130.002 дублетом линий от Н(3) и H(5) с сдвигом 7.034 и 7.005 показывает возникновение комплекса.
Значение энергии комплексообразования, полученное из расчетов методом PDF состав-ляет 4.3 ккал/моль и в несколько раз меньше энергии комплекса кольцо С апигенина и с холиновой группой лецитина. Образование этого типа комплекса сопровождается изме-нением конформационного состояния углеводородной цепи лецитина. Участок углеводород-ного хвоста, находящийся в транс состоянии, переходит в гош-конформацию. Переход в гош-конформацию повышает общую энергию комплекса на 3.12 ккал/моль, но потенциальный барьер, разделяющий эти два состояния, имеет значение 20.1 ккал/моль и является достаточно высоким, что видно из наблюдаемой полуширины спектральных линий от ядер атомов, входящих в двойную связь. Такой переход приводит к возникновению кинков в клеточной мембране, следовательно, дополнительных каналов обмена веществ Квантово-химические расчеты, полученные методом PDF B3LYP/6-31 (2d,P) хорошо согласуются с результатами эксперимента. Возникновение комплекса приводит к небольшому изменению населенности s орбиталей Н(2) и Н(6) на 0.002 и 0.0018 соотвественно, как видно из рис. 3, они остаются сливающимися и смещаются в сторону сильного поля как вытекает из рас-четных данных. Полученные значения структурных данных показывают, что атом кисло-рода в кольце В апигенина выходит из плоскости на 0.18 Е и молекула приобретает новую пространственную структуру. Таким образом, можно считать, одной из причин, влияющих на проницаемость клеточных мембран, является образование кинков в углеводородной цепи лецитина.
Литература
апигенин фосфатидилхолин лецитин
1. M.S. Setchenkov, S.I. Usmanova, R.S. Nasibullin. Complexing of some biologically active molecules with phosphatidylcholine. Russian physics journal. 2009. Vol.52. No.4. P.417-420.
2. G.R.A. Hunt, K.A. Jawaharlal. H-NMR investigation of the mechanism for the ionophore activity of the bile salts in phospholipid vesicular membranes and the effect of cholesterol. Biochim. Biophys. Acta 501. 1980. P.678-684
3. Нусратуллин В.М., Сетченков М.С., Усманова С.И., Насибуллин Р.С. Исследование изменений комплекса 3,2,3,5,7,-пентагидроксифлавон-фосфатидилхолин в водной среде. Бутлеровские сообщения. 2009. Т.18. №7. С.60-62.
4. Усманова С.И., Фахретдинова Е.Р., Насибуллин Р.С. Некоторые структурные параметры и электронное строение комплекса 5,7,3',4',-тетраоксифлавонола-3-рутинозида с фосфатидилхолином. Химическая физика и мезоскопия. 2011. Т.13. №2. С.281-284.
5. R.S. Nasibullin., T.I. Nikitina, Yu.G. Afanaseva. Complex of 3,5,7,3',4'- pentahedroxyflavanol with phosphatidylcholine et al. Pharmaceutical Chemistry Journal. 2002. vol.36. No.9. P.492-495.
6. Насибуллин Р.С., Сетченков М.С., Усманова С.И. Комплекс рутина с фосфатидилхолином. Бутлеровские сообщения. 2005. Т.7. №3. С.1-2.
7. Сетченков М.С., Усмвнова С.И., Нусратуллин В.М., Насибуллин Р.С. (31)Р спектроскопические исследования комплексообразования рутина с фосфатидилхолином. Бутлеровские сообщения. 2011. Т.25. №6. С.63-65.
8. Yu.G. Afanas'eva, E.R. Fakhretdinova, L.V. Spirikhin, R.S. Nasibullin. Pharmaceutical Chemistry Journal. 2007. Vol.41. No.7. C.354-356. Mechanism of interaction of certain flavonoids with phosphatidylcholine of cellular membranes.
9. B.H. Havsteen. The biochemistry and medical significance of the flavonoids. Pharmacol. Ther. 96. 2002. P.67-202.
10. Bozena Pawlikovska-Pawlega, Lucjan E. Misiak, Barbara Zaezyka, Roman Paduch, Antoni Gawron, Wieslaw I. Gruszecki dipalmitoylphosphatidylcholine liposomes. Biochimika et Biophysika Acta. 1828 2013. P.518-527.
11. J. Gabrielska, M. Gagos, J. Gubernator, W.I. Gruszecki. Binding of antibiotic amphotericin B to lipid membranes: a 1H NMR study, FEBS Lett. 580. 2006. P.2677-2685.
12. J. Gabrielska, W.I. Gruszecki. Zeaxanthin (dihydroxy-в-carotene) but not в-carotene rigidifies lipid membranes: a 1H NMR study of carotenoid-egg phosphatidylcholine liposomes. Biochim. Biophys. Acta 1285. 1996. P.167-174.
13. I.C. Jones, G.R.A Hunt. A31P- and 1H-NMR investigation into the mechanism of bilayer permeability induced by the action of phospholipase A2 on phosphatidylcholine vesicles. Biochim. Biophys. Acta 820. 1985. P.48-57.
14. M. Terasaki, L. Jaffe. Organization of the sea urchin egg endoplasmatic reticulum and its reorganization at fertilization. J. Cell Biol. 114. 1991. P.929-940.
15. A.L. Davis, J. Keeler, E.D. Laue, D. Moskau. J. Magn. Reson.1992. Vol.98. No.1. P.207.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Неорганические продукты естественного происхождения. Кристаллографические исследования при низкой температуре. Базовая структура высокотемпературных сверхпроводников. Строение неорганической молекулярной системы. Необычные молекулы и твердые тела.
статья [554,3 K], добавлен 04.01.2013Влияние гидроксидов d-металлов на электрохимические характеристики и скорость диссоциации молекулы воды в биполярной мембране. Методы исследования: вольт-амперометрия, частотный спектр электрохимического импеданса. Расчёт эффективных констант скорости.
дипломная работа [1,9 M], добавлен 30.12.2014Электронная модель молекулы. Теория отталкивания электронных пар валентной оболочки. Реакционная способность молекул. Классификация химических реакций. Степени свободы молекулы, их вращательное движение. Описание симметрии колебаний, их взаимодействие.
презентация [230,6 K], добавлен 15.10.2013Характеристика строения атома. Определение числа протонов, электронов, нейтронов. Рассмотрение химической связи и полярности молекулы в целом. Уравнения диссоциации и константы диссоциации для слабых электролитов. Окислительно-восстановительные реакции.
контрольная работа [182,3 K], добавлен 09.11.2015Графическое представление молекул и их свойств - теория графов в химии. Методы расчета топологических индексов. Кодирование химической информации. Оценка реакционной способности молекул. Анализ связи между топологией молекулы и свойствами соединения.
реферат [313,2 K], добавлен 09.12.2013Сопоставление молекулы с группой симметрии. Установление полной симметрии молекулы и классификация атомов на эквивалентные. Матричное произведение исходных представлений. Соответствие преобразованию симметрии некоторой матрицы. Примеры набора матриц.
реферат [41,1 K], добавлен 13.07.2009Блок-схема синтеза дендримеров и основные составляющие молекулы. Схема синтеза перфторированного полифенилгермана. Рассмотрение химии комплекса "гость-хозяин". Константы связывания между дендримерами виологена и СВ7 в нейтральном и кислом растворах.
презентация [1,1 M], добавлен 02.12.2014Понятие аммиакатов, их использование в химическом анализе. Характеристика и свойства азота, строение молекулы. Степени окисления азота в соединениях. Форма молекулы аммиака. Проведение эксперимента по исследованию свойств аммиакатов, меди, никеля.
курсовая работа [237,1 K], добавлен 02.10.2013Рассмотрение лекарственных препаратов, содержащих ибупрофен. Преимущества и недостатки ибупрофена. Основные квантово-химические свойства молекулы ибупрофена. Распределение электронной плотности внешних валентных электронов в молекуле ибупрофена.
презентация [2,2 M], добавлен 18.03.2018Свойства воды как наиболее распространенного химического соединения. Структура молекулы воды и атома водорода. Анализ изменения свойств воды под воздействием различных факторов. Схема модели гидроксила, иона гидроксония и молекул перекиси водорода.
реферат [347,0 K], добавлен 06.10.2010Расчет параметров молекулы, состоящей из катиона имидазолия и аниона тетрафторобората с помощью программного обеспечения. Получение структуры молекул, распределение электронной плотности по их поверхности. Расположение критических точек связей.
контрольная работа [2,8 M], добавлен 24.11.2013Распространение воды на планете Земля. Изотопный состав воды. Строение молекулы воды. Физические свойства воды, их аномальность. Аномалия плотности. Переохлажденная вода. Аномалия сжимаемости. Поверхностное натяжение. Аномалия теплоемкости.
курсовая работа [143,0 K], добавлен 16.05.2005Квантово-химический расчет термодинамических данных при полной оптимизации геометрии и оценка количественного содержания наиболее стабильных таутомерных форм молекулы нитрогуанидина при стандартных условиях в газовой фазе с помощью программы GAUSSIAN-03.
курсовая работа [937,6 K], добавлен 08.06.2012Химический элемент - совокупность атомов одного вида. Открытие химических элементов. Размеры атомов и молекул. Формы существования химических элементов. Некоторые сведения о молекулярном и немолекулярном строении веществ. Атомно-молекулярное учение.
презентация [33,3 K], добавлен 15.04.2012Роль физической химии и хронология фундаментальных открытий. Экспериментальные основы квантовой механики. Корпускулярно-волновая природа излучения. Волны материи и простейшие полуклассические модели движений. Квантование энергии частицы и формула Бора.
реферат [38,0 K], добавлен 28.01.2009Строение фосфолипидов, их функциональная роль в клетке. Построение градуировочного графика для определения фосфатидилхолина методом тонкослойной хроматографии. Расчет изотерм сорбции. Влияние кислотности среды на пространственную ориентацию молекул.
дипломная работа [1,3 M], добавлен 13.07.2015Возможности применения химической реакции в виде звуковых колебаний. Состав для покрытия автомобилей, который изменяет цвет в зависимости от скорости автомобиля. Метод упаковки-введения-распаковки молекулы ДНК без повреждения клеточной мембраны.
контрольная работа [22,0 K], добавлен 27.12.2010Главные положения классической теории химического строения молекулы. Характеристики, определяющие ее реакционную способность. Гомологический рад алканов. Номенклатура и изометрия углеводородов. Классификация кислородосодержащих органических соединений.
презентация [2,8 M], добавлен 25.01.2017История получения аммиака. Строение атома азота. Образование и строение молекулы аммиака, ее физико-химические свойства. Способы получения вещества. Образование иона аммония. Токсичность аммиака и его применение в промышленности. Реакция горения.
презентация [3,9 M], добавлен 19.01.2014Пути познания и классификация современных наук, взаимосвязь химии и физики. Строение и свойства вещества как общие вопросы химической науки. Особенности многообразия химических структур и теория квантовой химии. Смеси, эквивалент и количество вещества.
лекция [759,9 K], добавлен 18.10.2013