Взаємодія моделі міоглобінуз лігандами газообміну

Модель міоглобіну і розподіл зарядів на атомах. Заряди певних атомів у залізопорфірині, моделі міоглобіну та його взаємодії з лігандами. Дослідження різних показників серцево-судинної та дихальної систем, сутність питання конкуренції різних газів.

Рубрика Химия
Вид статья
Язык украинский
Дата добавления 15.12.2020
Размер файла 1,7 M

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

Размещено на http://www.allbest.ru/

Взаємодія моделі міоглобінуз лігандами газообміну

Завгородня В. А., Коваленко С. О., Мінаєв Б. П.

Черкаський національний університет імені Богдана Хмельницького

Газообмін для живих організмів - дуже важливий біохімічний процес. При дослідженні різних показників серцево-судинної та дихальної систем постало питання конкуренції різних газів за зв'язування з Fe2+ гема гемоглобіну.

До цього часу ніхто не розглядав можливість зв'язування СО2 із залізом гемоглобіну. Вперше нами прийнята спроба розглянути цей зв'язок. Розрахунки проводилися методом 71ЫРО/1 та РМ3 в програмі Нурег^ет.

Обговорено питання газообміну за участі гемоглобіну. Розраховані потенціальні криві зв 'язування заліза гема з газами СО, СО2 і О2. Вперше показана можливість утворення комплексу для моделі гема з карбон(ІУ) оксидом. Відмічена роль верхніх зайнятих МО залізопорфірину і ліганду в формуванні координаційних зв 'язків і переносу заряду в комплексі гема з СО2. Розглянута роль поляризації зарядів в моделі гема при порівнянні СО2 з іншими газами. міоглобін залізопорфірин газ серцевий

Наші квантово-хімічні розрахунки показили, що СО2 може координуватися до йона заліза в гемоглобіні, хоча його енергія зв'язування значно менша, ніж для комплексу СО з гемоглобіном і становить близько 34,5 ккал/моль.

Ключові слова: гемоглобін, міоглобін, карбон(ІУ) оксид, СО, О2, молекулярні орбіталі, залізопорфірин.

Summary. Zavhorodnia V.A., Kovalenko S.O., Minaiev B.P. Interaction of Myoglobin

Model with Ligands of Gas Exchange

Introduction.Gas exchange for living organisms is a very important biochemical process.

Hemoglobin blood - imioglobin plays a leading role in him, located in the muscle fibers. In the study

of various indicators of the cardiovascular and respiratory systems, the question arose about the competition of different gases for binding to Fe2+ haem haemoglobin.

Purpose.Until this time, nobody considered the possibility of binding of СО2 to iron of haemoglobin. For the first time, we have taken an attempt to consider this connection.

Methods.Calculations were made using ZINDO / 1 and PM3 methods in the HyperChem program.

Results. The issue of gas exchange with participation of haemoglobin is discussed. The potential curves of haem iron binding with CO, СО2 and О2 gases are calculated. The possibility of forming a complex for the haem model with carbon (IV) oxide is shown for the first time. The role of the upper occupied MO of iron-phosphorus and ligand in the formation of coordination bonds and charge transfer in the complex of haem with СО2 is determined. The role of charge polarization in the haem model is considered comparing СО2 with other gases.

Conclusion. Our quantum-chemical calculations show that СО2 can be coordinated with the iron ion in haemoglobin, although its binding energy is significantly less than that for the CO complex with haemoglobin and is about 34.5 kcal / mol.

Key words: haemoglobin, myoglobin, carbon (IV) oxide, CO, О2, molecular orbitals, iron- porphyrin.

Постановка проблеми та аналіз останніх публікацій

Споживання атмосферного кисню живими організмами - найважливіший біохімічний процес. Кисень транспортується гемоглобіном еритроцитів від альвеол легень до м'язів і утримується у м'язах міоглобіном. Відомо, що молекула гемоглобіну складається з чотирьох субодиниць (дві а- і дві Р-субодиниці), які містять, відповідно, по 141 і 146 амінокислотних залишків, специфічно вкладених навколо плоского залізовмісного кільця гему - феропротопорфірину [1]. У центрі гему міститься йон заліза Fe2+, який утворює два ковалентні і два донорно- акцепторні зв'язки з атомами азоту пірольних кілець. Але всі ці 4 зв'язки Fe-N майже рівноцінні, тому внесок резонансних структур приблизно однаковий.

Це підтверджує розрахунок молекулярних орбіталей (МО) залізопорфірину (Рис.1), проведений нами по методу 2ШОО/1 [2]. Верхня зайнята молекулярна орбіталь (ВЗМО) має енергію -4.725 еВ (Рис. 2) і змінює знак при відображенні в трьох площинах симетрії молекули. Як видно з рис. 1.б друга із зайнятих орбіталей (помічена червоним на Рис. 2) має величезний вклад від атома заліза, а верхня зайнята молекулярна орбіталь не має такого вкладу (Рис.1 а.)

Координаційне число атома заліза, який входить до складу гема, дорівнює 6, тому він може утворювати ще два координаційні зв'язки, які орієнтовані перпендикулярно до площини гема. Один з них зайнятий імідазольною групою гістидинового залишку, що входить до складу глобіну, інший - не заміщений, або заміщується лігандом О2, СО або N0.

Рис. 2. Частина схеми рівнів енергії молекулярних орбіталей (МО) молекули залізопорфірину (Бе-Р) і комплексів Бе-Р-СІ та Бе-Р-СІ-СО2 відповідно. Показано ряд верхніх зайнятих і нижніх вакантних МО.

Рис. 3. Модель міоглобіну і розподіл зарядів на атомах. Замість амінокислотного залишка білка використано аніон хлору. Заряд всього комплексу дорівнює -1.

Сумарний спін моделі залізопорфірину дорівнює нулю (синглетний основний стан), що співпадає з експериментальними дослідженнями кінетики зв'язування всіх лігандів з гемом [3]. Відомо, що залізо в гемоглобіні та міоглобіні має сумарний електронний спін, який дорівнює два (8=2). Але в процесі зв'язування СО і О2 з гемом завжди виходить сумарний спін рівний нулю. Тому в розрахунках комплексів гема з дослідженими газами ми і застосовували сумарний спін синглетного стану (8=0). Замість імідазольної групи гістидинового залишку для моделювання гему використали спрощену модель, де ставили аніон СІ", який має парне число електронів, спін рівний нулю і добре моделює діамагнітні молекули амінокислотних залишків [4].

Як видно з рис. 3 модель порфіринового кільця залишається плоскою і аніон хлору несе на собі заряд -0.661 е, тобто частина електронної густини з хлору переходить в кільце. Щодо заряду атома заліза, що входить до складу ферумпорфірину, Бе2+ - так прийнято вважати у фізіології згідно класичним уявленням. Унашій роботі, з точки зору квантової хімії, Fe має заряд 0,089 в молекулі залізопорфірину, що визначили використовуючи емпіричні методи РМ3 та ZINDO/1. Тобто за рахунок йона заліза іде сильний перерозподіл електронної густини в системі гемоглобіну; майже дві одиниці заряду переходять з органічної частини гему на атом заліза і він стає навіть нейтральним.

Вільну шосту координаційну позицію біля атома заліза в гемоглобіні зазвичай займають молекули газів, які беруть участь в газообміні крові. Залежно від типу молекули ліганду (О2, СО, N0, Н^) утворюються оксигемоглобін (НЬ02), карбоксигемоглобін (НЬСО), нітрозогемоглобін (№N0) та сульфгемоглобін ^НЬ). Зміна ліганду в молекулі гемоглобіну супроводжується зміною як магнітних властивостей, так і просторової будови молекули [ 5, 6].

Оксигемоглобін - це результат взаємодії гемоглобіну з молекулярним киснем, при якому перенесення електрона на кисень відбувається не від заліза, а від імідазольного кільця проксимального гістидину. Спираючись на значення сумарного заряду молекули, О2 утворює з Fe2+ слабкі іон-дипольні зв'язки. У комплексах гема з киснем, орбіталі атомів ліганда дають невеликий внесок у верхню заповнену і нижню вакантну орбіталі [7]. При взаємодії О2 з ферумпорфірином статистика спінових станів є очевидною: виділяють три абсолютно різних шкали часу для рекомбінації. Приблизно третина фотолізованного 02 зв'язується за пікосекундною шкалою (3 пс), ще одна третина об'єднується в наносекунду і частина - це відносно повільний бімолекулярний процес. Бімолекулярна фаза має на увазі статистичний розподіл лігандів 02, які виходять в розчинник. Вважають, що взаємодія гему як з О2, так і з NO базується на дистальному підході, тобто двохатомний ліганд коливається в потенціальній ямі біля атома заліза з певною частотою. Обидва ці ліганди мають зв'язаний проміжний стан, на відміну від СО [3]. Ці проміжні стани можуть мати різні сумарні спіни ^=1, S=2, S=3 для О2; S=1/2, S=3/2 для NO). Переходи з основного в проміжні стани, викликані спін-орбітальною взаємодією в йоні заліза, обумовлюють складну кінетику рекомбінації О2 і N0 лігандів з гемом [3, 4].

Взаємодія молекулярного кисню з вільним гемом призводить до необоротного окислення атома заліза (у фізіологічних умовах), при якому Fe2+ переходить в Fe3+, тобто утворюється метгемоглобін. Перехід з одного стану в інший вимагає певного часу, протягом якого система проходить через кілька нерівноважних станів, які помітно відрізняються за своїми фізичними і хімічними властивостями від рівноважних [8]. Однак розподіл заряду в комплексах гемоглобіну з О2, СО, N0, СО2 та іншими молекулярними газами ми обговоримо пізніше при аналізі результатів наших квантово-хімічних розрахунків.

У молекулі дезоксигемоглобіну залізо не знаходиться в площині порфіринового кільця, що підтверджується нашими квантово-хімічними розрахунками. З шести 3d-електронів окремого йона заліза Fe2+ два електрони спарені на одній з нижчих d-орбіталей, їх спінові моменти S=2. Схожа ситуація спостерігається в залізопорфірині. Магнітний момент гему в цьому стані дорівнює ~ 5,5 Борівського магнетона (БМ), а спектр поглинання в зеленій області має характерну смужку з довжиною хвилі в максимумі поглинання ~ 556 нм. Приєднання кисню веде до значних змін. Атом заліза в оксигемоглобіні лежить практично в площині порфіринового кільця. Всі шість d-електронів спарені на трьох нижчих рівнях d-орбіталей, S=0, тому оксигемоглобін діамагнітний [9].

Структурні зміни в активному центрі призводять до значних змін просторової структури всього білка. Перехід від Т до R форми супроводжується поворотом однієї субодиниці щодо іншої на 12-15°, що призводить до збільшення «кишень», в яких знаходяться геми. Ці структурні зміни ініціюються приєднанням першої молекули 02 до одного з вільних гемів і поширюються на всю глобулу. Саме тому в рівноважній суміші завжди присутні тільки Т і R форми [5, 10, 11]. Доведено [12], існування каналів міграції двоатомних лігандів через ксенонові сайти в ізольованих а і в ланцюгах гемоглобіну. а ланцюг, на відміну від Р ланцюга, має більш ніж один канал виходу з білка і, відповідно, більш складну структуру взаємопов'язаних порожнин.

У первинному доцінговому місці СО може перебувати в двох протилежних орієнтаціях, що характеризуються дублетом інфрачервоних смуг (В1- та В2-смуги). В1-смуга визначає орієнтацію монооксиду вуглецю, в якій вуглець спрямований в напрямку заліза гема [13]. Контроль зв'язування СО і О2 в міоглобіні регулюється дистальним залишком гістидину через стеричні та Н-зв'язуючі взаємодії [14].

НЬСО не здатен приєднувати кисень і брати участь в його транспортуванні, оскільки відповідна валентність Феруму є зайнята. Швидкість утворення карбоксигемоглобіну прямо пропорційна концентрації монооксиду вуглецю в повітрі. Спорідненість гемоглобіну до СО в 200-300 разів більша, ніж до О2, хоча приєднання чадного газу до НЬ відбувається в 10 разів повільніше. Також СО зв'язується з атомом заліза повільніше ніж NO, це однофазний процес, кінетика рекомбінації - моноекспоненційна [3]. При зв'язуванні монооксиду вуглецю з одним із чотирьох атомів заліза гемоглобіну збільшується спорідненість до кисню інших трьох Fe2+, в результаті чого кисень важче віддається тканинам[15].

Швидкість дисоціації СОНЬ залежить виключно від парціального тиску кисню у вдихуваному повітрі (ефект «витіснення»). Період напіврозпаду (Т1/2) карбоксигемоглобіну при нормальному диханні складає близько 5,3 години, при вдиханні 100% кисню під тиском 1 атм. - до 1,3 години, при 3 атм. - до 0,4 години, а при додатковому введенні СО2 - до 12 хвилин за рахунок додаткової стимуляції дихального центру [16]. Зміцнення зв'язування СО з йоном Fe2+ пов'язане з вищою нуклеофільною здатністю атома вуглецю порівняно з атомом кисню.

Найважливіша роль транспорту СО2 також належить дихальним пігментам, зокрема гемоглобіну. Відомо, що карбон(ГУ) оксид, який утворюється у тканинах, присутній у крові в таких формах: гідрату -- Н2СО3 (10%), бікарбонату -- NaHCO3 та КНСО3 (70%), карбгемоглобіну -- НЬСО2 (20%). В загальному балансі транспорту СО2пряма роль гемоглобіну, як переносника, відносно невелика. На відміну від кисню, що зв'язується залізом простетичної групи, СО2 зв'язується білковою частиною молекули гемоглобіну - її вільними амінними групами, у вигляді карбамінових сполук:

Шад + ТО2 = HbNHCOOH = HbNHCOO" + И+.

Приєднання й відщеплення СО2 відбувається надзвичайно швидко, без участі якого-небудь ферменту й проміжного утворення Н2СО3. Крім гемоглобіну, інші білки плазми крові, як буферні речовини, також беруть участь у транспорті вуглекислоти, однак роль гемоглобіну важлива насамперед тому, що його кількість у крові переважає.

Хоча гемоглобін бере участь у транспорті вуглекислоти не тільки прямим, але й непрямим шляхом. Частина СО2, реагуючи з водою, утворює нестійку, слабко дисоційовану вугільну кислоту: СО2 + Н2О = Н2СО3 = Н+ + НСО3[17]. Ця реакція в крові протікає повільно. В еритроцитах її швидкість збільшується приблизно в 10 тисяч разів ферментом карбоангідразою. Це внутрішньоклітинний фермент. Тому реакція гідратації з високою швидкістю здійснюється в еритроцитах після того, як С02 дифундує туди з плазми крові [18].

Карбон (IV) оксид вступає у взаємодію із солями слабших засебе кислот, а саме, з натрієвими солями білків плазми та із калієвими солями гемоглобіну в еритроцитах. Як сильніша кислота він приєднує до себе лужні іони, а іон білка утворює із іоном водню малодисоціюючу кислоту: Н2СО3 + №НЬ = КаИС03 + Н"НЬ. Оскільки в капілярах оксигемоглобін, віддаючи кисень, перетворюється в гемоглобін, що є більш слабкою кислотою в порівнянні з оксигемоглобіном, і парціальний тиск СО2 тут великий, концентрація НСО3 зростає і реакція йде зліва направо, тобто у бік зв'язування вуглекислоти. У легенях же, де гемоглобін, приєднуючи кисень, перетворюється в оксигемоглобін, тобто в кислоту приблизно у 70 разів сильнішу, ніж гемоглобін, відбувається зв'язування частини тих лужних металів, які перед тим були зв'язані з вуглекислотою. С02, який таким шляхом витісняється, підвищує парціальний тиск розчиненої в крові вуглекислоти, що призводить до виділення її із крові в органи дихання. Саме цим пояснюється й більш низьке положення кривої дисоціації вуглекислоти в артеріальній крові в порівнянні з венозною. Таким чином, гемоглобін відіграє важливу роль у транспорті С02, як одна з найважливіших буферних речовин, які зв'язують значні кількості карбон(^) оксиду, утворюваної в результаті окисних процесів, та охороняють рідини від закислення.

Відомо, що концентрація іонів хлору в плазмі приблизно вдвічі більша, ніж в еритроцитах, незважаючи на те, що іони хлору легко проникають через клітинну оболонку. Крім того, при проходженні крові через легеневі капіляри та видаленні при цьому із крові вуглекислоти частина іонів хлору переміщається з еритроцитів у плазму, тобто з місць із меншою концентрацією в місця з більшою концентрацією, всупереч звичайним законам дифузії. Це переміщення іонів хлору має безпосереднє відношення до транспорту СО2. Оскільки концентрація буферних солей вища в еритроцитах, ніж у плазмі, то при проходженні крові через капіляри вуглекислота проникає в еритроцити й реагує із солями гемоглобіну, утворюючи бікарбонати К та № у більшій кількості, ніж у плазмі [19]. Внаслідок цього підвищення концентрації НСО3 в еритроцитах у порівнянні із плазмою, тобто порушення іонної рівноваги, частина НСО3 переходить із еритроцитів у плазму. Але однобічна дифузія аніонів бікарбонату порушила б умови електричної нейтральності, оскільки позитивно заряджені іониКі № не здатні дифундувати з еритроцитів у плазму. У результаті такого обміну НСО3 і С1", значна частина іонів бікарбонату, що утворилися усередині еритроцитів, дифундує в плазму, тобто тим самим підвищується роль плазми в транспорті вуглекислоти [18].

Останнім часом у теоретичній молекулярній біології все більшого значення набувають квантово-хімічні методи, оскільки саме електронні аспекти процесів, що протікають в біологічних системах, привертають увагу дослідників. Але, на жаль, розрахунки електронної структури комплексів гема з лігандами зустрічаються в літературі нечасто і автори, в більшості випадків, не роблять спроб пов'язати отримані результати з біологічними властивостями досліджуваних об'єктів. Вище був наведений аналіз кінетики рекомбінації О2, СО і N0 проведений на основі квантово-хімічних розрахунків Франценом [3].

Мета

До цього часу ніхто не розглядав можливість зв'язування СО2 із залізом гемоглобіну. Вперше нами прийнята спроба розглянути цей зв'язок.

Матеріали та методи

Розрахунки проводилися методом ZINDO/1 та PM3 в програмі Нурег^ет [20].

Результати та обговорення

Оптимізація геометрії комплексу дала структуру, яка показана на Рис. 4: ВЗМО молекули СО2 має чітко виражену структуру (не залежно від методу розрахунку), яка визначається виключно молекулярною симетрією. В точковій групі Б«* молекулярна орбіталь є парною відносно інверсії в центрі молекули і змінює знак при відображенні у будь яких площинах, що проходять через ядро. Тому дана орбіталь двічі вироджена і не може мати вклад від центрального атома карбону (Рис. 5). Таким чином центральний атом СО2 молекули не дає ніякого вкладу у ВЗМО. Самі ВЗМО приймають найбільшу участь в координаційній взаємодії з йонами Fe2+ гемоглобіну. Тому, що з ВЗ МО електрони можуть лише переходити з молекули СО2 на іон заліза, утворюючи координаційні зв'язки донорно-акцепторного типу.

Рис. 4. Модель комплексу міоглобіну з СО2

Рис. 5. Одна із двічі вироджених ВЗМО карбон (IV) оксиду лё.

Оскільки йон Бе2+ в гемі практично компенсує свій позитивний заряд за рахунок притоку електронів з порфіринового кільця, а центральний атом СО2 молекули являється сильним електрофілом (через позитивний заряд +0,52), то ми припускаємо координування Бе з карбон(^) оксидом за рахунок атома Карбону. Це підтверджує вигляд ВЗМО типу молекули СО2 (Рис. 5). В силу своєї симетрії, орбіталь не може мати ніякого вкладу від центрального атома Карбону. А оскільки на ній «знаходяться» 4 електрони, то це приводить до сильної нестачі електронної густини на центральному атомі. ВЗМО бере учать в переносі електронів на Бе2+ і тому бере учать у формуванні координаційного зв'язку Бе-СО2. Отже можна також припустити, що координація буде проходити по крайньому атомі Оксигену, а не по атомі Карбону.

Нами проведені також розрахунки молекули залізопорфірину методом РМ3 з повною оптимізацією геометрії. Розраховані також всі частоти ІК коливань, які виявилися реальними (позитивними), що свідчить про справжній мінімум на гіперповерхні потенційної енергії. Порфіриновий каркас дуже чутливий до самого йона Бе. Якщо цинкум порфірин або дианіон порфіринового кільця отримуємо плоскими в методі РМ3, то при введенні йона Fe порфіринове кільце згинається у вигляді сідла, що являється артефактом метода РМ3 (це один з рідкісних випадків, коли метод РМ3 неправильно описує координаційний зв'язок з органічним лігандом, але енергія взаємодії Fe з СО, N0, 02 та іншими молекулами в методі описується розумно).що добре збігається з результатами інших розрахунків, отриманих більш точним методом

ББТ [3], а мінімум спостерігається в районі 2,1 А. Нами вперше припущено утворення комплексу між СО2 і моделлю гема (Рис.4.) з досить міцним координаційним зв'язком. Але не таким міцним, як у випадку з СО. Глибина мінімуму для СО2 є меншою, ніж для СО і становить близько 34,5 ккал/моль, що однак є досить значною і може свідчити про можливість утворення комплексу гема з СО2. Мінімум спостерігається на відстані 2,3 А.

Для визначення повної енергії ферумпорфірину з різними лігандами (О2, СО2, N0 та СО) застосовували метод 2Г№00/1. Для цього змінювали довжину звязку Fe-C (Бе-0) від 1 А до 3,5 А (Рис. 6).

Рис. 6. Залежність повної енергії (ккал/моль) від відстані (А) між атомом заліза в моделі міоглобіну та лігандом (СО2, СО, О2).

На Рис.6. при малих відстанях між Fe та СО, О2 і СО2 (від 1 до 1,5 А) енергія зростає, що говорить про сильне відштовхування на короткій відстані. Із рисунків видно також, що на потенційній кривій спостерігається перший мінімум в районі 2,5 А для комплексу ферумпорфірину та О2, що цілком розумно співпадає з іншими теоритичними та експерементальними даними і відповідає стійкому комплексу. Глибина мінімуму дорівнює 12,94 ккал/моль, що також відповідає розумним межам [3,4]. При подальшому збільшенні відстані між лігандом і моделлю гема спостерігається спочатку ріст енергії, а потім вихід на дисоціативну межу. Це пов'язане з тим, що віддалення молекули, наприклад СО або О2 від Fe гема, уже не впливає на зв'язування цих частин. Глибина мінімуму для СО значно більша ніж для кисню (55,24 ккал/моль),

Таким чином наші квантово-хімічні розрахунки показили, що СО2 може координуватися до йона заліза в гемоглобіні, хоча його енергія зв'язування значно менша, ніж для комплексу СО з гемоглобіном.

Варто зазначити, що ВЗМО та ВЗМО-1 комплексу гема із карбон(ІУ) оксидом (Рис. 7.а. та 7.б.) майже не відрізняються від таких у залізопорфірині (рис.1.а. та 1.б.). Структура орбіталей майже не змінилася, хоча спостерігається незначне зменшення електронної густини на ВЗМО-1 для пірольних кілець. З'являються невеликі електронні хмари на обох атомах Оксигену молекули СО2. Позитивний заряд на атомі заліза в комплексі гема з СО2 є найбільшим в порівнянні з іншими лігандами (Табл. 1), при цьому заряд на хлорі стає найменшим. Тобто при зв'язуванні гема з СО2 змінюється зв'язок з білковим залишком. Відбувається також додаткова поляризація в порфіриновому кільці.

Рис.7.а.ВЗМО комплексу моделі міоглобіну з СО2.

Рис. 7.б. ВЗМО-1 комплексу моделі міоглобіну з СО2

Таблиця 1

Заряди певних атомів у залізопорфірині, моделі міоглобіну та його взаємодії з лігандами

^^^^комплекс

йон

Fe-P

Fe-Cl-P

Fe-Cl-P-O2

Fe-Cl-P-CO

Fe-Cl-P-CO2

Fe

-0.01

0.089

0.131

0.139

0.172

Cl

-

-0.661

-0.525

-0.505

-0.457

O

-

-

0.015

-0.01

-0.052

-0.270

-0.275

C

-

-

-

0.071

0.549

N1

-0.22

-0.195

-0.197

-0.211

-0.208

N2

-0.19

-0.195

-0.204

-0.213

-0.154

N3

-0.22

-0.195

-0.201

-0.203

-0.216

N4

-0.19

-0.195

-0.196

-0.204

-0.15

З таблиці 1 видно, що ліганди О2, СО та СО2в комплексі мають майже нульовий заряд (0,005; 0,019 та 0,004 відповідно). Вони впливають на модель міоглобіну таким чином, що заряд на йоні СІ зменшується, а на Бе - збільшується.

Важливо відмітити, що перший збуджений стан в комплексі СО2з гемом є триплетним, який має високу енергію, як і в молекулі СО. Тому можна припустити, що кінетика зв'язування і дисоціації СО2з гемом буде моноекспоненціальною, як і для чадного газу.

Висновки

Обговорено питання газообміну за участі гемоглобіну. Розраховані потенціальні криві зв'язування заліза гема з газами СО, СО2 і О2. Вперше показана можливість утворення комплексу для моделі гема з карбон(ІУ) оксидом. Відмічена роль верхніх зайнятих МО залізопорфірину і ліганду в формуванні координаційних зв'язків і переносу заряду в комплексі гема з СО2. Розглянута роль поляризації зарядів в моделі гема при порівнянні СО2 з іншими газами.

Література

1. Зинчук В.В., Степуро Т.Л. NO-зависимые механизмы внутриэритроцитарной регуляции сродства гемоглобина к кислороду: монография. ГрГМУ: Гродно, 2016. 176 с.

2. Anderson W.P., Edwards W.D., Zerner M.C. Calculated spectra of hydrated ions of the first transition- metal series. Inorganic chemistry. 1986. №25. Р. 2728-2732. doi:10.1021 / ic00236a015

3. Franzen S. Spin-dependent mechanism for diatomic ligand binding to heme. Proceeding of the National

Academy of Sciences of the United States of America. 2002.№26.Р.16754-16759.

www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.252590999

4. Мінаєв Б.П., Мінаєва В.О., Обушко О.М., Говорун Д.М. Досліджування моделей зв'язування кисню гемомза допомогою функціонала густини. Біополімери і клітина. 2009. №4. С. 298-330. http://dx.doi.org/10.7124/bc.0007E9

5. Дудок К., Білий Р., Федорович А. Дослідження лігандних форм гемоглобіну методом електронної оптичної спектроскопії. Вісник Львівського університету. 2002. №29. С. 32-38.

6. Пількевич Н.Б., Раздайбедін В.М., БоярчукО.Д. Гемоглобін: структура, біохімія та патологія: навчальний посібник для студентів вищих навчальних закладів. Луганськ: Альма-матер, 2007. 90с.

7. Романова Т. А., Краснов П. О., Аврамов П. В. Электронная структура комплексов гема гемоглобина с лигандами и динамика их атомного остова при физиологической температуре.Исследовано вРоссии.2001. №70. С.781-791.

8. Takashi Yonetani, SungIck Park, Antonio Tsuneshige, Kiyohiro Imai, Kenji Kanaori. Global Allostery Model of Hemoglobin. Modulation of O2 affinity, cooperativity, and bohr effect by heterotropic allosteric effectors. The American Society for Biochemistry and Molecular Biology. 2002. P. 1-52. doi: 10.1074/jbc.M203135200

9. Минаев Б.Ф. Спин-катализ в процессах фото- и биоактивации молекулярного кислорода. Український біохімічний журнал. 2009. №3. С.21-45.

10. Лепешкевич С.В., Позняк А.Л., Джагаров Б.М. Влияние ионов цинка на геминальные и бимолекулярные стадии реакции оксигенации миоглобина лошади. Журнал прикладной спектроскопии. 2005. №5. С. 670-677.

11. Сергунова В.А., Манченко Е.А., Гудкова О.Е. Гемоглобин: модификации, кристаллизация, полимеризация (обзор).Общая реаниматология.2016. №12(6). С.49-63. Doi: 10.15360/1813-97792016-6-49-63

12. Лепешкевич С.В., Гилевич С.Н., Пархоц М.В., Джагаров Б.М. Миграция молекулярного кислорода и оксида углерода через ксеноновые сайты в изолированных цепях гемоглобина человека. elib.bsu.by. 2016. С.120-122.

13. Nienhaus K., John S. Olson, Stefan Franzen, G. Ulrich Nienhaus. The Origin of Stark Splitting in the Initial Photoproduct State of MbCO.Journal of the American chemical society,2005. №127 (1). Р. 40-41 DOI: 10.1021/ja0466917

14. De Angelis F., Andrzej A. Jarz^cki, Roberto Car, Thomas G. Spiro. Quantum chemical evaluation of protein control over heme ligation: CO/O2 discrimination in myoglobin. Journal Physical Chemistry B. 2005. №109 (7). P. 3065-3070. DOI: 10.1021/jp0451851

15. Толкач П.Г., Башарин В.А., Гребенюк А.Н. Механизмы нейротоксического действия оксида углерода (обзор литературы). Биомедицинский журнал. 2014. №.15. С.142-154.

16. Фаткуллин К.В., Гильманов А.Ж, Костюков Д.В. Клиническое значение и современные методологические аспекты определения уровня карбоксии метгемоглобина в крови.Практическаямедицина. 2014. №3(79). С.17-21.

17. Дроговоз С. М., Штрыголь С. Ю., Кононенко А. В., Зупанец М. В., Левинская Е. В. Физиологические свойства СО2 - обоснование уникальности карбокситерапии. Медична та клінічна хімія.2016. №1. С. 112-116. DOI 10.11603/mcch.2410-681X.2016.v0.i1.6203

18. Дроговоз С. М., Штриголь С. Ю., Кононенко А. В., Зупанец М. В., Штробля А. Л. Механизм действия карбокситерапии. Фармакологія та лікарська токсикологія.2016. № 6 (51). С.12-20. DOI:https://doi.org/10.24959/ubphi.18.192

19. Артюхов В.Г., Путинцева О.В., Калаева Е.А., Савостин В.С. Гемоглобин человека в условиях воздействия различных физико-химических агентов (монография). Международный журнал экспериментального образования. 2015. № 10. С. 113-115.

20. http://test.kirensky.ru/books/book/Program%20HyperChem/chapter 01 .htm

References

1. Zinchuk V.V., Stepura T.L. (2016). NO-dependent mechanisms of intra-peritocitric regulation of the af finity of hemoglobin to oxygen: a monograph. GrGMU: Grodno. 176 (in Rus ).

2. Anderson W.P., Edwards W.D., Zerner M.C. (1986). Calculated spectra of hydrated ions of the first transition-metal series. Inorganic chemistry, 25, 2728-2732. DOI:10.1021 / ic00236a015

3. Franzen S. (2002). Spin-dependent mechanism for diatomic ligand binding to heme. Proceeding of the

National Academy of Sciences of the United States of America, 26,16754-16759.

www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.252590999

4. Minaev B.P., Minaeva V.O., Obushko O.M., Govorun D.M. (2009). Investigation of models of oxygen binding by hemum using density functional. Biopolimery i klityna [Biopolymers and cell], 4, 298-330 (in Ukr).http://dx.doi.org/10.7124/bc.0007E9

5. Dudok K., Bilyi R., Fedorovich A. (2002). Research of ligand forms of hemoglobin by the method of electronic optical spectroscopy. VisnykLvivskoho universytetu [News of Lviv University], 29, 32-38 (in Ukr).

6. Pilkevich N. B., Razaybedin V.M., Boyarchuk O.D. (2007). Hemoglobin: structure, biochemistry and pathology: a manual for students in higher education. Lugansk: Alma mater, 90 (in Ukr).

7. Romanova T. A., Krasnov P. O., Avramov P.V. (2001). The electronic structure of hemoglobin complexes with ligands and dynamics of their atomic core at physiological temperature. Yssledovano v Rossyy [Investigated in Russia], 70, 781-791 (in Rus ).

8. Takashi Yonetani, SungIck Park, Antonio Tsuneshige, Kiyohiro Imai, Kenji Kanaori. (2002). Global Allostery Model of Hemoglobin. Modulation of O2 affinity, cooperativity, and bohr effect by heterotropic allosteric effectors. The American Society for Biochemistry and Molecular Biology. 2002. 1-52.

doi: 10.1074/jbc.M203135200

9. Minaev B.F. (2009). Spin-catalysis in photocatalysis and bioactivation processes of molecular oxygen. Ukrainskyi biokhimichnyi zhurnal [Ukrainian biochemical journal], 3, 21-45 (in Rus ).

10. Lepeshkevich S.V., Poznyak A.L., Dzhagarov B.M. (2005). Influence of zinc ions on the geminal and bimolecular stages of the oxygenation reaction of myoglobin horse. Zhurnal prykladnoi spektroskopii [Journal of Applied Spectroscopy], 5, 670-677 (in Rus ).

11. Sergunova V.A., Manchenko E.A., Gudkova O.E. (2016). Hemoglobin: modifications, crystallization, polymerization (review).Obshchaia reanymatolohyia [General reanimatology], 12 (6), 49-63 (in Rus ). doi: 10.15360/1813-9779-2016-6-49-63

12. Lepeshkevich C.V., Gilevich S.N., Parhots M.V., Dzhagarov B.M. (2016). Migration of molecular oxygen and carbon monoxide through xenon sites in isolated human hemoglobin chains. Elektronna biblioteka derzhavnoho biloruskoho universytetu [Electronic Library of the State Belarusian University], 120-122 (in Rus ).

13. Nienhaus K., John S. Olson, Stefan Franzen, G. Ulrich Nienhaus. (2005). The Origin of Stark Splitting in the Initial Photoproduct State of MbCO.Journal of the American chemical society, 127 (1), 40-41 doi: 10.1021/ja0466917

14. De Angelis F., Andrzej A. Jarz^cki, Roberto Car, Thomas G. Spiro. (2005) Quantum chemical evaluation of protein control over heme ligation: CO/O2 discrimination in myoglobin. Journal Physical Chemistry B, 109 (7), 3065-3070. doi: 10.1021/jp0451851

15. Tolkach P.G., Basharin V.A., Grebenyuk A.N. (2014). Mechanisms of neurotoxic action of carbon monoxide (review of literature). Byomedytsynskyi zhurnal [Biomedical Journal], 15, 142-154 (in Rus).

16. Fatkulin K.V., Gilmanov A.Zh., Kostyukov D.V. (2014). Clinical significance and modern methodological aspects of determining the level of carboxy of methemoglobin in the blood. Praktycheskaia medytsyna [Practical medicine], 3 (79), 17-21 (in Rus ).

17. Drogovoz S.M., Strigol S. Yu., Kononenko A.V., Zupanets M.V., Levinskaya Ye.V. (2016). Physiological properties of CO2 - a rationale for the uniqueness of carboxytherapy. Medychna ta klinichna khimiia [Medical and Clinical Chemistry], 1, 112-116 (in Rus ). doi :10.11603 / mcch.2410-681X.2016.v0.i1.6203

18. Drogovoz S. M., Strigol S. Yu., Kononenko A.V., Zupanets M.V., Shtroblya A.L. (2016). Mechanism of action of carboxytherapy. Farmakolohiia ta likarska toksykolohiia [Pharmacology and drug toxicology], 6 (51), 12-20 (in Rus ). doi:https://doi.org/10.24959/ubphi.18.192

19. Artyukhov V.G., Putintseva O.V., Kalayeva E.A., Savostin V.C. (2015). Human hemoglobin under the influence of various physical and chemical agents (monograph). Mezhdunarodnui zhurnal эksperymentalnoho obrazovanyia [International Journal of Experimental Education], 10, 113-115 (in Rus).

20. http://test.kirensky.ru/books/book/Program%20HyperChem/chapter 01 .htm

Размещено на Allbest.ru

...

Подобные документы

  • Розгляд систем зі змішаним титруванням. Розробка методичних принципів поєднання одночасних титрометричних реакцій різних типів в єдиному титрометричному акті, виявлення переваг такого поєднання. Послідовні та одночасні титрометричні реакції різних типів.

    статья [141,8 K], добавлен 31.08.2017

  • Класифікація хімічних елементів на метали і неметали. Електронні структури атомів. Електронегативність атомів неметалів. Явище алотропії. Будова простих речовин. Хімічні властивості простих речовин. Одержання неметалів. Реакції іонної обмінної взаємодії.

    курс лекций [107,6 K], добавлен 12.12.2011

  • Обчислення вибіркових характеристик хімічних елементів, перевірка на випади, кореляційний аналіз. Побудова регресійної моделі сталі. Опис значимості коефіцієнтів рівняння. Рекомендації щодо підвищення властивостей з використанням математичної моделі.

    контрольная работа [1,4 M], добавлен 19.04.2015

  • Елементи-метали в періодичній системі. Схема утворення енергетичних зон при збільшенні числа внутрішніх атомів. Кристалічна структура металів. Взаємодія металів з кислотами-неокисниками. Принципи промислового одержання металів. Сутність поняття "сплав".

    лекция [610,2 K], добавлен 12.12.2011

  • Залежність магнітної сприйнятливості різних речовин від температури. Ядерний магнітний момент. Додатні значення магнітної сприйнятливості парамагнітних матеріалів. Магнітні властивості електронів, ядер, атомів. Природа діа-, пара- і феромагнетизму.

    реферат [420,2 K], добавлен 19.12.2010

  • Значення і застосування препаратів сполук ртуті у сільськогосподарському виробництві, в різних галузях промисловості та побуті. Фізичні і хімічні властивості сполук ртуті. Умови, що сприяють отруєнню. Клінічні симптоми отруєння тварин різних видів.

    курсовая работа [34,2 K], добавлен 19.06.2012

  • Розподіл катіонів на рупи за сульфідною та за кислотно-лужною класифікацією. Класифікація аніонів за розчинністю солей барію і срібла. Вивчення реакцій на катіони. Аналіз суміші катіонів різних аналітичних груп. Проведення аналізу індивідуальної речовини.

    методичка [1,3 M], добавлен 04.01.2011

  • Сірчана кислота як один з основних багатотоннажних продуктів хімічної промисловості, її застосування в різних галузях народного господарства. Взаємодія сірчаної кислоти з металами та неметалами, солями та водою. Сировина для виробництва сірчаної кислоти.

    реферат [32,0 K], добавлен 11.11.2010

  • Місце елементів-металів у періодичній системі Д.І. Менделєєва, будова їх атомів. Металевий зв’язок і кристалічна гратка. Загальні фізичні властивості металів, їх знаходження у природі. Взаємодія лужного металу з водою. Реакція горіння кальцію в повітрі.

    презентация [638,5 K], добавлен 19.11.2014

  • Дослідження сутності хімічного реактора - апарату, у якому здійснюються хімічні процеси, що поєднують хімічні реакції з масо- і теплопереносом. Структура математичної моделі хімічного реактора. Причини відхилення реальних реакторів від моделей РІЗ та РІВ.

    реферат [520,1 K], добавлен 01.05.2011

  • Цинк як життєвоважливий мікроелемент для всіх вищих організмів. Характеристика марганцю, його значення. Йод – елемент, що міститься у всіх тканинах людини. Біологічна роль кобальту. Бром – постійна складова частина різних тканин організму людини і тварин.

    реферат [20,3 K], добавлен 01.12.2010

  • Вітамін К3 у водних розчинах. Конденсація толухінона і бутадієну. Активування перекису водню. Нафтохінон та його похідні. Мостикові сполуки на основі нафтохінону. Взаємодія надкислоти з метилнафтиліном. Утворення надкислоти при кімнатній температурі.

    дипломная работа [2,9 M], добавлен 16.09.2011

  • Фізичні, хімічні та термодинамічні властивості фосфору, характерний ступінь його окислення. Отримання фосфору, застосування та біологічна роль. Форми розподілу потенціалу, поля та заряду в широкозонних напівпровідниках при різних умовах поляризації.

    реферат [308,4 K], добавлен 24.09.2012

  • Поняття процесу моделювання, особливості його застосування в сфері хімічних технологій. Типи моделей та засоби їх складання. Завдання, що вирішуються на основі математичних моделей хімічних реакторів. Побудова математичної моделі каталітичного реактора.

    дипломная работа [632,9 K], добавлен 18.02.2012

  • Рідкоземельні елементи і їхні властивості та застосування, проблема визначення індивідуальних елементів, спектрометричне визначення компонентів, реагент хлорфосфоназо. Побудова графіків залежності світопоглинання та складання різних систем рівнянь.

    дипломная работа [425,0 K], добавлен 25.06.2011

  • Методи уловлювання діоксиду вуглецю з димових газів котельної. Очищення водними розчинами етаноламінів. Фізична абсорбція органічними розчинниками. Вибір схеми автоматичного контролю і регулювання технологічного процесу регенерації насиченого карбоната.

    дипломная работа [2,2 M], добавлен 28.05.2014

  • Основні положення атомно-молекулярного вчення. Періодичний закон і система хімічних елементів Менделєєва. Електронна теорія будови атомів. Характеристика ковалентного, водневого і металічного зв'язку. Класифікація хімічних реакцій і поняття електролізу.

    курс лекций [65,9 K], добавлен 21.12.2011

  • Види структур сплавів, схема розподілу атомів у гратах твердих розчинів. Залежність властивостей сплавів від їх складу. Основні методи дослідження та їх характеристика. Зв’язок діаграми стану "залізо-цементит" із властивостями сталей, утворення перліту.

    курсовая работа [2,3 M], добавлен 15.02.2011

  • Дослідження явища хімічних зв’язків - взаємодії між атомами, яка утримує їх у молекулі чи твердому тілі. Теорія хімічної будови органічних сполук Бутлерова. Характеристика типів хімічного зв’язку - ковалентного, йодного, металічного і водневого.

    презентация [950,3 K], добавлен 17.05.2019

  • Обзор літератури що до четвертинних амонієвих солей, їх хімія та особливості до реакційної здатності. Види випробувань даної сполуки: вимірювання температури топлення, розчинення у різних рідинах. Засоби використання солі, її властивості і зберігання.

    курсовая работа [200,7 K], добавлен 11.05.2009

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.