Конформация молекулы с минимальной энергией образования
Определение конформации с минимальной энергией образования для соединения β-диэтиламиноэтилового эфира п-аминобензойной кислоты. Изменение торсионного угла связи химических элементов с последующей оптимизацией формулы. Оценка общей энергии превращени
Рубрика | Химия |
Вид | лабораторная работа |
Язык | русский |
Дата добавления | 22.12.2022 |
Размер файла | 2,0 M |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
Задание
Выбрать соединение и найти конформацию с самой минимальной энергией образования. Использовать прием, позволяющий менять у исходных соединений торсионный угол, и последующей оптимизацией.
Ход работы
Рисунок 1
Выбрано соединение 2-(diethylamino)ethyl 4-aminobenzoate её CAS: 59-46-1. рис. 2.
В программе Chem3D Pro построено соединение, произведена оптимизация, найдена более устойчивая конформация и измененным торсионным углом.
До оптимизации:
Рис 2. Total energy ~23. 8256 kcal/mol. менее устойчивая конформация при торсионном угле -162,716 град. между O(9)-C(11)-С(12)-N(13)
Первая оптимизация:
Рис. 3. Total energy 22.6217 kcal/mol. устойчивая конформация при торсионном угле -34,105 град. между O(9)-C(11)-С(12)-N(13).
Изменение торсионного угла C(4)-C(8)-O(9)-C(11):
Рис. 4. Total energy 22.6217 kcal/mol. менее устойчивая конформация при торсионном угле 149,245 град. между C(4)-C(8)-O(9)-C(11)
Рис. 5. Total energy 22.6206 kcal/mol. устойчивая конформация при торсионном угле 148,539 град. Между C(4)-C(8)-O(9)-C(11)
конформация торсионный угол энергия
Вывод
С помощью метода изменения торсионного угла, и последующей оптимизации у соединения 2-(diethylamino)ethyl 4-aminobenzoate была найдена более устойчивая конформация. При изменении торсионного угла произошло уменьшение общей энергии, следовательно конечная оптимизированная молекула более устойчива, чем при первой оптимизации. Общая энергия при конечной оптимизации равна 22.5206 kcal/mol.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Строение и схема получения малонового эфира. Синтез ацетоуксусного эфира из уксусной кислоты, его использование для образования различных кетонов. Таутомерные формы и производные барбитуровой кислоты. Восстановление a,b-Непредельных альдегидов и кетонов.
лекция [270,8 K], добавлен 03.02.2009Рассмотрение методов проведения реакций ацилирования (замещение водорода спиртовой группы на остаток карбоновой кислоты). Определение схемы синтеза, физико-химических свойств метилового эфира монохлоруксусной кислоты и способов утилизации отходов.
контрольная работа [182,3 K], добавлен 25.03.2010Типы химической связи: ковалентная, ионная и металлическая. Донорно-акцепторный механизм образования и характеристики ковалентной связи. Валентность и степень окисления элементов. Молекулы химических соединений. Размеры и масса атомов и молекул.
контрольная работа [45,3 K], добавлен 16.11.2010Понятие о биополимерах, структурные компоненты и конформация. Структурная и пространственная организация белков. Схема образования пептидной связи. Нуклеиновые кислоты, первичная и вторичная структура ДНК, полисахариды. Методы исследования биополимеров.
презентация [2,2 M], добавлен 28.05.2013Развитие периодического закона в XX веке. Периодические свойства химических элементов: изменение энергии ионизации, электроотрицательности, эффекты экранирования и проникновения. Изменение величин атомных и ионных радиусов. Общие сведения о неметаллах.
презентация [155,9 K], добавлен 07.08.2015Структурные единицы лигнина. Удаление сахаров и нелигнинных компонентов, разделение катионов. Десульфированные продукты из лигносульфонатов. Модификация лигнина в среде трифторуксусной кислоты. Определение содержания связанной о-аминобензойной кислоты.
дипломная работа [687,4 K], добавлен 13.07.2013Свойства диэтилового эфира малеиновой кислоты. Практическое применение диэтилмалеата - использование в качестве органического растворителя. Методика синтеза. Дикарбоновые кислоты. Реакция этерификации. Механизм этерификации. Метод "меченых атомов".
курсовая работа [585,5 K], добавлен 17.01.2009Анализ химической связи как взаимодействия атомов. Свойства ковалентной связи. Механизм образования ионной связи, строение кристаллической решетки. Примеры межмолекулярной водородной связи. Схема образования металлической связи в металлах и сплавах.
презентация [714,0 K], добавлен 08.08.2015Составление формул соединений кальция с водородом, фтором и азотом. Определение степени окисления атома углерода и его валентности. Термохимические уравнения реакций, теплота образования. Вычисление молярной концентрации эквивалента раствора кислоты.
контрольная работа [46,9 K], добавлен 01.11.2009Возможные виды химических связей элементов. Анализ типов ковалентной связи. Обменный и донорно-акцептовый механизм ее образования. Принцип формирования полярных взаимодействий между атомами неметаллов и расположение связующей их электронной пары.
презентация [136,8 K], добавлен 13.04.2015Химический элемент - совокупность атомов одного вида. Открытие химических элементов. Размеры атомов и молекул. Формы существования химических элементов. Некоторые сведения о молекулярном и немолекулярном строении веществ. Атомно-молекулярное учение.
презентация [33,3 K], добавлен 15.04.2012Брожение и его природа. Изомерные формы виноградной кислоты. Спиртовое брожение как процесс окисления углеводов с образованием этилового спирта, углекислоты и выделением энергии. Процесс образования молочной кислоты. Природа маслянокислого брожения.
реферат [21,1 K], добавлен 21.10.2009Характеристика лекарственных средств производных аминобензойных кислот: номенклатура, свойства, значение в медицине. Требования нормативных документов к качеству эфиров аминобензойной кислоты. Способы получения местноанестезирующих лекарственных средств.
презентация [2,6 M], добавлен 31.10.2013Вычисление скорости омыления эфира при заданной константе для химической реакции. Определение активации реакции и построение графиков зависимости удельной и эквивалентной электрической проводимости растворов. Гальванический элемент и изменение энергии.
курсовая работа [132,3 K], добавлен 13.12.2010Особенности валентности - образования у атомов определенного числа химических связей. Основные типы химической связи: ионная, ковалентная, водородная, металлическая. Виды кристаллов по типу химической связи: ионные, атомные, металлические, молекулярные.
курсовая работа [241,7 K], добавлен 19.10.2013Роль скорости химических реакций, образования и расходования компонентов. Кинетика химических реакций. Зависимость скорости реакции от концентрации исходных веществ. Скорость расходования исходных веществ и образования продуктов. Закон действующих масс.
реферат [275,9 K], добавлен 26.10.2008Обзор истории открытия и исследования нуклеиновых кислот. Описания высокомолекулярного органического соединения, биополимера, образованного остатками нуклеотидов. Комплементарность цепей в ДНК. Особенности образования полимера РНК. Правило Э. Чаргаффа.
презентация [3,0 M], добавлен 05.05.2013Количественная оценка распределения химических элементов. Закономерности в распределении кларков. Изучение спектров звезд. Процессы образование химических элементов. Превращение водорода в гелий. Оценка состава Земли. Кларки элементов для земной коры.
реферат [28,5 K], добавлен 16.05.2013Общая характеристика химических элементов IV группы таблицы Менделеева, их нахождение в природе и соединения с другими неметаллами. Получение германия, олова и свинца. Физико-химические свойства металлов подгруппы титана. Сферы применения циркония.
презентация [1,8 M], добавлен 23.04.2014Структура молекулы, связи атомов и свойства ацетиленов как химических веществ. Особенности получения алкинов термолизом метана и гидрированием углерода в промышленности и реакцией элиминирования в лаборатории. Реакции алкинов с участием тройной связи.
контрольная работа [244,8 K], добавлен 05.08.2013