Математическое моделирование измерительного процесса в оптической компьютерной микрограмметрии и томографии
Проблемы использования классических методов объемных морфологических реконструкций, основанных на анализе серийных срезов. Математическое моделирование определения глубины залегания оптически контрастных структур внутри микроскопического препарата.
Рубрика | Математика |
Вид | статья |
Язык | русский |
Дата добавления | 27.02.2019 |
Размер файла | 627,7 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
Смоленский филиал «Национального Исследовательского Университета «МЭИ»
МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ИЗМЕРИТЕЛЬНОГО ПРОЦЕССА В ОПТИЧЕСКОЙ КОМПЬЮТЕРНОЙ МИКРОГРАММЕТРИИ И ТОМОГРАФИИ
Лещенко А. В.
Научный руководитель
д.м.н., профессор Глотов В. А.
Резюме
математический моделирование оптический микроскопический
Классические методы объемных морфологических реконструкций, основанные на анализе серийных срезов, чрезвычайно трудоемки. Предложена математическая модель измерительного процесса, реализующего алгоритм определения глубины залегания оптически контрастных структур внутри микроскопического препарата.
Ключевые слова: оптическая компьютерная микрограмметрия и томография, глубина залегания структур, математическое моделирование.
Summary
MATHEMATICAL SIMULATION OF THE MEASURING PROCESS IN AN OPTICAL MICROSCOPIC COMPUTER TOMOGRAPHY
Leshchenko A. V.
Classical methods of volumetric reconstructions based on an analysis of serial sections, is extremely time-consuming. A mathematical model of the measuring process that implements the algorithm for determining the depth of the optical contrast of the structures within the histological slice.
Key words: microscopic optical tomography, depth structures, mathematical simulation.
Введение
Точные трехмерные реконструкции и математическое моделирование морфологических структур, расположенных в биологическом пространстве макро-микроскопических анатомических препаратов и гистологических срезов, имеют важное значение для понимания конструкции структурно-функциональных единиц органов и тканей [3, 4]. Предложен алгоритм измерительного процесса, позволяющий одним измерительным приемом определять глубину залегания всех оптически контрастных структур внутри макро-микроскопического и гистологического препарата, попавших в пространство глубины поля зрения объектива микроскопа по отношению к одной из плоскостей, ограничивающих это пространство [1, 2, 3].
Целью настоящей работы явилось математическое моделирование измерительного процесса в оптической компьютерной микрограмметрии и томографии и определение оптимальных конструктивных параметров изделия, реализующего этот алгоритм.
Методика
Сущность измерительного процесса в оптической компьютерной микрограмметии и томографии заключается в следующем [1]. На предметном столике жестко закрепляется макро-микроскопический или гистологический препарат, включается точечный источник света, создающий конически расходящийся пучок лучей, который может находиться в двух положениях. Регистрируются цифровые изображения препарата в каждом положений источника света, смещаемого в плоскости параллельной плоскости препарата на величину s. При просмотре препарата на всю глубину перефокусировка микроскопа осуществляют с шагом m, равным величине глубины резкости объектива микроскопа. Глубину hi залегания i-ой структуры в препарате определяют по формуле:
, (1)
где n = 1,2,3,…, N - номер шага перефокусировки; H - расстояние между плоскостью, в которой расположен источник света, и выбранной поверхностью Pj препарата; li(n) - величина смещения проекции i-ой точки препарата на сопряженной паре изображений на n- м шаге перефокусировки; (j=0,1), где j=0 - при перефокусировке снизу-вверх, j=1 - при перефокусировке сверху-вниз [1].
Алгоритм способа определения глубины залегания дискретных оптически контрастных структур состоит в следующем: 1) микроскопический препарат устанавливают и фиксируют на предметном столике микроскопа и освещают точечным источником света, который можно перемещать на стандартное расстояние s = s1s2 в горизонтальной плоскости, параллельной плоскости предметного столика микроскопа и расположенной на расстоянии H от выбранной поверхности препарата, из положения s1 в положение s2 и обратно; 2) фокусируют микроскоп так, чтобы передняя граница глубины резкости микроскопа совпала с выбранной поверхностью препарата Pj (рис.1). Контроль точности фокусировки проводят путем смещения точечного источника света на стандартное расстояние. При этом дискретные структуры, лежащие на этой поверхности, должны оставаться неподвижными. Получают два сопряженных изображения: одно - из положения точечного источника s1, другое - из положения s2 (рис.1). Проводят перефокусировку микроскопа с шагом m. Повторяют п.3, повторяют п.4 до тех пор, пока не будет просмотрен весь препарат сверху вниз (j=1) или наоборот (j=0). На сопряженных парах изображений находят однозначно дифференцируемые светоконтрастные точки. После их наложения, в каждой сопряженной паре измеряют величины смещений проекций найденных точек l (рис. 1). По формуле (1) определяют глубину залегания h(i) изучаемой структуры в препарате по отношению к верхней поверхности последнего при просмотре сверху вниз (j=1), либо по отношению к нижней поверхности последнего при просмотре снизу вверх (j=0).
Рис. 1 Схема способа. 1 - микроскопический препарат; 2 - микроскоп; 3 - экран
Математическое моделирование проводилось при помощи системы автоматизированного проектирования Mathcad. 15.0. Симуляция измерительного процесса осуществлялась при помощи построения графиков на основе предложенной формулы, далее производился их анализ.
Результаты моделирования измерительного процесса
1. Исследование зависимости li(n)(S), где i=1, n=1; j=0; hi=5 мкм; H=10000 мкм; m=0 мкм; T=10 мкм; L=10 мкм; S=var (в интервале от 1000 до 10000 мкм). Из графика (рис. 2а) видно, что зависимость имеет линейный характер и чем больше смещение источника света S относительно своего первоначального положения, тем больше будет величина смещения проекции изучаемой структуры li(n).
Рис. . а) Зависимость li(1) (S). б) Зависимость li(n)(H)
2. Исследование зависимости li(n)(H), где i=1, n=1; j=0; hi=5 мкм; H=var (в интервале от 1000 до 30000 мкм); m=0 мкм; T=10 мкм; L=10 мкм; S=5000 мкм. Из графика (рис. 2б) видно, что зависимость имеет обратно-пропорциональный характер, т.е. с увеличением расстояния между плоскостью смещения источника света и поверхностью препарата H, уменьшается смещение проекции изучаемой структуры li(n).
3. Исследование зависимости li(n) (S, H), где i=1, n=1; j=0; m=0 мкм; hi=5 мкм; T=10 мкм; L=10 мкм; S=var (в интервале от 1000 до 10000 мкм); H=var (в интервале от 1000 до 30000 мкм). На графике поверхности (рис. 3а) видно, что наибольшие величины смещения проекций изучаемых структур li(n), лежат в области максимальных значений S и минимальных значений H.
Рис. 3 а) Зависимость li(n) (S, H), б) Зависимость li(n) (hi, S)
4. Исследование зависимости li(n),(hi,S), где i=1, n=1; j=0; m=0 мкм; T=10 мкм; L=10 мкм; H=10000 мкм; S=var (в интервале от 1000 до 10000 мкм); hi=var (в интервале от 1 до 10 мкм). На графике поверхности (рис. 3б) видно, что наибольшие величины смещения проекций изучаемых структур li(n) соответствуют наибольшим значениям глубин их залегания hi и наибольшим значениям смещений источника света S.
5. Исследование зависимости li(n) (hi, H), где i=1, n=1; j=0; m=0 мкм; T=10 мкм; L=10 мкм; S=5000мкм; H=var (в интервале от 1000 до 30000 мкм); hi=var (в интервале от 1 до 10 мкм). На графике поверхности (рис. 4) видно, что наибольшие величины смещения проекций изучаемых структур li(n) соответствуют наибольшим значениям глубин их залегания hi и наименьшим значениям расстояний между плоскостью смещения источника света и поверхностью препарата H.
Рис. 4 Зависимость li(n) (hi, H).
Обсуждение результатов моделирования измерительного процесса
Математическое моделирование рассматриваемого измерительного процесса показывает работоспособность метода: при минимальных расстояниях точечного источника света от поверхности препарата H и максимальных значениях смещений точечного источника света S наблюдаются значительные смещения проекций изучаемых структур li(n), залегающих на разных глубинах hi в биологическом пространстве препарата. Полученные результаты доказывают возможность физической инженерной реализации этого измерительного процесса в виде свето-оптической микрограмметрической томографической приставки к обычному световому микроскопу и могут быть положены в основу технического задания (ТЗ) опытно-конструкторской разработки (ОКР) такого изделия.
Выводы
Предложенный принцип регистрации и обработки микроскопических изображений работоспособен и может быть физически реализован в принципиально новом, не имеющем мировых аналогов, устройстве: компьютерном свето-оптическом томографе для макро-микроскопических анатомических препаратов и гистологических срезов, содержащих дискретные однозначно дифференцируемые морфологические структуры.
Литература
1. Патент №1804612 РФ. Способ определения глубины залегания структур в микроскопических препаратах / Глотов В. А. (Патентообладатель - Смоленский государственный медицинский университет).
2. Глотов. В. А. Структурный анализ микрососудистых бифуркаций (Микрососудистый узел и гемодинамический фактор). Смоленск: АО «Амипресс», 1995. 251 с.
3. Глотов В. А. Алгоритм для оптической микроскопической компьютерной микрограмметрии и томографии. Вестник новых медицинских технологий 2002; Т. IX (4): 98-104.
4. Ромейс Б. Микроскопическая техника. М.: Иностранная литература, 1953. С. 209-216.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Операторы преобразования переменных, классы, способы построения и особенности структурных моделей систем управления. Линейные и нелинейные модели и характеристики систем управления, модели вход-выход, построение их временных и частотных характеристик.
учебное пособие [509,3 K], добавлен 23.12.2009Моделирование как метод познания. Классификаций и характеристика моделей: вещественные, энергетические и информационные. Математическая модель "хищники-жертвы", ее сущность. Порядок проверки и корректировки модели. Решение уравнений методом Рунге-Кутта.
методичка [283,3 K], добавлен 30.04.2014Математическое программирование - область математики, в которой изучаются методы решения задач условной оптимизации. Основные понятия и определения в задачах оптимизации. Динамическое программирование – математический метод поиска оптимального управления.
презентация [112,6 K], добавлен 23.06.2013Математическое моделирование динамики биологических видов (популяций) Т. Мальтусом. Параметры и основное уравнение модели "хищник-жертва", ее практическое применение. Качественное исследование элементарной и обобщенной модификаций модели В. Вольтерра.
курсовая работа [158,1 K], добавлен 22.04.2011Свойства, применение и способы получения озона. Строение и виды озонаторов. Моделирование тепловых явлений в озонаторе. Физические законы тепловыделения, теплопроводности и теплопереноса. Расчет построенной модели на языке программирования Pascal.
курсовая работа [284,2 K], добавлен 23.03.2014Особенности математических моделей и моделирования технического объекта. Применение численных математических методов в моделировании. Методика их применения в системе MathCAD. Описание решения задачи в Mathcad и Scilab, реализация базовой модели.
курсовая работа [378,5 K], добавлен 13.01.2016Математическое моделирование задач коммерческой деятельности на примере моделирования процесса выбора товара. Методы и модели линейного программирования (определение ежедневного плана производства продукции, обеспечивающей максимальный доход от продажи).
контрольная работа [55,9 K], добавлен 16.02.2011Рассмотрение основных методов решения школьных задач на движение двух тел в разных и одинаковых направлениях: анализ и синтез, сведение к ранее решенным, математическое моделирование (знаковые, графические модели), индукция, исчерпывающая проба.
презентация [11,8 K], добавлен 08.05.2010Назначение, состав и структура математического обеспечения в автоматизированных системах, формализация и моделирование управленческих решений, этапы разработки. Модели и алгоритмы обработки информации. Характеристика метода исследования операции.
презентация [17,7 K], добавлен 07.05.2011Распределение дискретной случайной величины по геометрическому закону распределения, проверка теоремы Бернулли на примере моделирования электрической схемы. Математическое моделирование в среде Turbo Pascal. Теоретический расчёт вероятности работы цепи.
контрольная работа [109,2 K], добавлен 31.05.2010Математическое моделирование и особенности задачи распределения. Обоснование и выбор метода решения. Ручное решение задачи (венгерский метод), а также с использованием компьютера. Формулировка полученного результата в сопоставлении с условием задачи.
курсовая работа [383,9 K], добавлен 26.05.2010Вводные понятия. Классификация моделей. Классификация объектов (систем) по их способности использовать информацию. Этапы создания модели. Понятие о жизненном цикле систем. Модели прогнозирования.
реферат [36,6 K], добавлен 13.12.2003Сущность моделирования, его главные цели задачи. Конструктивная схема и общее описание исследуемой трансмиссии. Алгоритм реализации задачи и ее программная реализация. Результаты расчета и их анализ. Исследование характеристик полученной модели.
курсовая работа [1,1 M], добавлен 01.01.2014Определения оптимизации схемы планирования эксперимента при работе со швейной машиной. Расчёт коэффициентов уравнения регрессии и выделение значимых коэффициентов прочности ткани и растяжения между лапкой и иглой. Проверка гипотезы адекватности модели.
курсовая работа [1,2 M], добавлен 30.12.2014Основные положения теории математического моделирования. Структура математической модели. Линейные и нелинейные деформационные процессы в твердых телах. Методика исследования математической модели сваи сложной конфигурации методом конечных элементов.
курсовая работа [997,2 K], добавлен 21.01.2014Возникновение и развитие теории динамических систем. Развитие методов реконструкции математических моделей динамических систем. Математическое моделирование - один из основных методов научного исследования.
реферат [35,0 K], добавлен 15.05.2007Решение дифференциального уравнения методом Адамса. Нахождение параметров синтезирования регулятора САУ численным методом. Решение дифференциального уравнения неявным численным методом. Анализ системы с использованием критериев Михайлова и Гурвица.
курсовая работа [398,2 K], добавлен 13.07.2010Построение математической модели технологического процесса напыления резисторов методами полного и дробного факторного эксперимента. Составление матрицы планирования. Рандомизация и проверка воспроизводимости. Оценка коэффициентов уравнения регрессии.
курсовая работа [694,5 K], добавлен 27.12.2021Изучение вопросов применения теории множеств, их отношений и свойств и теории графов, а также математических методов конечно-разностных аппроксимаций для описания конструкций РЭА (радиоэлектронной аппаратуры) и моделирования протекающих в них процессов.
реферат [206,9 K], добавлен 26.09.2010Моделирование случайной величины, распределённой по нормальному закону. Построение доверительных интервалов для математического ожидания и дисперсии, соответствующих доверительной вероятности. Оценка статистических характеристик случайного процесса.
курсовая работа [744,3 K], добавлен 07.06.2010