Оцінка різноманіття гаплотипів мітохондріальної ДНК населення України
Визначення поліморфізму нуклеотидних послідовностей гіперваріабельного сегмента. Оцінка його впливу на прояв захворювань. Філогенетичний аналіз гаплотипів мітохондріального ДНК вибірки контрольного регіону. З’ясування спорідненості з популяціями Європи.
| Рубрика | Медицина |
| Вид | автореферат |
| Язык | украинский |
| Дата добавления | 29.08.2015 |
| Размер файла | 50,8 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук по специальности 03.00.15 - генетика. - Украинский институт клинической генетики Харьковского государственного медицинского университета, Харьков, 2007.
Диссертация посвящена изучению митохондриальных гаплотипов населения Украины для оценки разнообразия, степени родства популяций и определению влияния генетического фона на проявление митохондриальных заболеваний.
Исследован полиморфизм нуклеотидных последовательностей ГВС I контрольного региона и кодирующей области мтДНК в популяционной выборке украинцев (239 индивидов) и выборке пациентов (50 индивидов) с клинически установленной митохондриальной патологией. Выявлены 102 полиморфных позиции ГВС I мтДНК в популяционной выборке, среди которых наиболее вариабельные - 16093, 16189, 16311, 16362. В выборке пациентов определены 55 полиморфных позиции ГВС I с наиболее вариабельными 16189 и 16294, которые могут повышать скорость обратных мутаций в соседних нуклеотидных позициях, обуславливая, в свою очередь, высокую частоту спорадических случаев митохондриальных заболеваний. В обследованных выборках рассчитаны показатели генетического разнообразия, которые составили: D=0.992±0.0019 и ир=5.19; D=0.990±0.007 и ир=6.13, соответственно. Уровни показателей свидетельствует о высокой генетической гетерогенности и наличии финно-угорского и германского субстратов в современной популяции украинцев, что, вероятно, обусловлено существенной ролью процессов метисации и ассимиляции.
Принимая во внимание значительный полиморфизм гипервариабельных позиций мтДНК и учитывая высокую вероятность его модифицирующего влияния на клиническое течение митохондриопатий, а также характер полиорганных поражений, в выборке пациентов просеквенированы гены тРНК lys и тРНК leu кодирующего региона мтДНК. Выявлены полиморфизмы (21 гомоплазмичная позиция - 13 синонимичных и 8 несинонимичных: 3505A/G Thr>ala, 8448T/C Мet>thr, 8472C/T Рro>leu2, 8584G/A Ala>thr, 8701A/G Thr>ala, 8794C/T His>tyr, 8836A/G Мet>val, 8860G Thr>ala) и обнаружены мутации у пациентов с типами мтДНК, которые определяют гаплогруппы Н (14553С/Т Val>ile ND6) и Х (12706C Phe>leu ND5). Полученные результаты предполагают влияние популяционного генетического фона на интенсивность мутационных процессов и фенотипическую экспрессию заболевания.
Проведен сравнительный анализ частот и структуры гаплотипов мтДНК в популяционной выборке, выборке пациентов и контроле. Результаты показали наличие выраженного европеоидного компонента, представленного соответствующими гаплогруппами (Н, U, J, Т, V, HV, pre-V, I, W, Х, N), суммарная частота которых составила 95.6%. Наибольшая распространенность приходится на гаплогруппы H, U, J, T (72.8%). Также обнаружены единичные типы мтДНК, принадлежащие к азиатским линиям (гаплогруппы A, B, C, D и Z) с частотой 2.0%.
Расчет частот гаплотипов в выборке пациентов продемонстрировал наличие евроспецифичных гаплогрупп: H, pre-V, V, J, T, U, I, W и X, суммарная частота которых составила 86.0%. Азиатские гаплогруппы (А и C) выявлены с частотой 4.0%. Показана высокая частота гаплогрупп U5 (14.0%), Т (16.0%) и Х (8.0%) в обследованной выборке по сравнению с контрольной, что, вероятнее всего, обусловлено гипервариабельностью позиций 16189 и 16294, которые содержатся в основных нуклеотидных мотивах данных гаплогрупп.
С помощью детального филогенетического анализа была получена пространственная структура выявленных гаплотипов мтДНК в исследуемых выборках. Обнаружено сходство с генофондами европейских популяций, свидетельствующее об общности происхождения из единой древнеевропейской популяции. Наличие общих типов мтДНК с финно-угорскими (“саамский мотив” U5b1 16144-16189-16270) и германскими популяциями (16294-16304-16311, 16294-16304, 16274-16304, 16304-16311) обусловлено существенной ролью процессов ассимиляции и метисации в этногенезе украинцев.
Филогенетический анализ гаплотипов в выборке пациентов выявил комбинации популяционных полиморфизмов (субгаплогруппа U5 - 16192 и 16256 в сочетании с 16270) и дополнительные полиморфизмы (гаплогруппа Т - 16193, 16239, 16243 и 16356, U5 - 16193, Х - 16126, 16192, 16294 и 16309), которые не встречались в популяционной выборке и контроле. Полученные результаты позволили предположить, что появление данных полиморфизмов обусловлено повышенной вариабельностью позиций 16189 и 16294. Дополнительные полиморфизмы, выступая в роли генетического фона, могут играть определенную роль в проявлении митохондриальных заболеваний.
Учитывая полученные результаты, предложено включить в алгоритм медико-генетического консультирования пациентов с митохондриальной патологией проведение рестрикционного анализа кодирующего региона мтДНК (скрининг полиморфных сайтов) на соответствуюшие гаплогруппы U5, T и X.
Ключевые слова: мтДНК, гаплотипы мтДНК, полиморфизм мтДНК, гипервариабельные позиции ГВС I мтДНК, генетический фон.
SUMMARY
Gusar V.A. The Estimation of the variety mitochondrial DNA haplotypes in Ukrainian population. - The manuscript.
Thesis for scientific degree of candidate of medical science, speciality 03.00.15 - genetics. - The Ukrainian institute of clinical genetics of the Kharkov state medical university, Kharkov, 2007.
The hypervariable positions of HVS I were determined and the indexes of genetic variety of mtDNA were calculated in the selection of population and selection of patients with mitochondrial pathology. The indexes are testify to high level genetic heterogeneous of population. Frequencies of haplogroups were expected. The phylogenetic relations of mtDNA haplotypes were determined, that specify in the presence of general types mtDNA in Ukrainian population with Finno-Ugric and German populations. The additional polymorphisms (genetic background) of haplogroups U5, T and Х, which in combination with their basic motifs, can play a certain role in the expression mitochondrial diseases.
The keywords: mtDNA, mtDNA haplotypes, polymorphism of mtDNA, hypervariable positions of HVS I mtDNA, genetic background.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Якісний та кількісний склад мікрофлори у хворих з гнійно-запальними захворюваннями щелепно-лицьової ділянки, аналіз впливу різних озонових розчинів на штами мікроорганізмів. Оцінка запропонованого методу лікування та його апробація в клінічних умовах.
автореферат [45,0 K], добавлен 02.04.2009Ретроспективна поширеність дифузного еутиреоїдного та вузлового зоба у дітей Північного регіону України. Оцінка ступеня йодного дефіциту. Сучасні методи профілактики йодної недостатності. Ефективність групової профілактики з використанням води "Йодіс".
автореферат [81,9 K], добавлен 21.03.2009Застосування статинів для лікування хворих на ішемічну хворобу серця. Особливості класифікації статинів, показання до їх застосування та побічні ефекти. Аналіз асортименту статинів та їх доступності для населення на фармацевтичному ринку України.
дипломная работа [990,6 K], добавлен 17.06.2016Ознайомлення з історією виникнення точкового масажу. Вивчення "біологічно активних точок" на тілі людини. Оцінка ефективності впливу точкового масажу на організм людини. Аналіз методів впливу на "біологічно активні точки" та оцінка їх ефективності.
контрольная работа [43,4 K], добавлен 18.06.2015Селеновий статус організму людини. Гігієнічна оцінка вмісту селену в навколишньому середовищі та організмі людини, його вплив на показники здоров’я як наукове обґрунтування розробки профілактичних заходів. Біомоніторинг селену та інших мікроелементів.
автореферат [56,6 K], добавлен 09.03.2009Виявлення генетичної схильності хворих на цукровий діабет 2 типу до раннього розвитку абсолютної інсулінової недостатності, визначення наявності поліморфізму С-Т1858Т гену PTPN22 у хворих та оцінка його патогенетичного значення в еволюції захворювання.
автореферат [82,2 K], добавлен 09.04.2009Мета соціальної медицини та організації охорони здоров'я. Дослідження місця соціальної медицини в системі соціального управління. Вивчення стану здоров'я населення та процесів його відтворення. Аналіз схеми впливу на здоров'я населення факторів ризику.
реферат [29,1 K], добавлен 19.11.2014Вивчення структури первинної інвалідності ВС СБУ та визначення факторів, що впливають на її формування, оцінка видів і ступеня обмеження життєдіяльності. Наукове обґрунтування оптимізації системи профілактики інвалідності і ВС СБУ, її ефективність.
автореферат [29,1 K], добавлен 04.04.2009Вірусна пневмонія (етіологія, патогенез, клінічні прояви), фармакотерапія та оцінка її практичної ефективності. Загальна оцінка лікарських засобів у листках призначень, фармако-економічний аналіз і оцінка потенційних взаємодій. Лікопов’язані проблеми.
курсовая работа [54,5 K], добавлен 15.06.2014Визначення розповсюдженості повної втрати коронки зуба та рівня потреби населення в протезуванні штифтовими конструкціями. Аналіз ортопедичної допомоги хворим з повним дефектом коронкової частини. Оцінка мікротвердості та електроопору кореневого дентину.
автореферат [34,4 K], добавлен 20.02.2009Оцінка стоматологічного стану осіб із хворобами пародонта Донецької області. Лікування генералізованого пародонти ту II-го та III-го ступеня тяжкості з використанням остеопластичних матеріалів, оцінка його клінічної ефективності та розробка рекомендацій.
автореферат [671,3 K], добавлен 02.04.2009Класифікація захворювань з генетичної точки зору. Аналіз теорії про плейотропність генів. Закономірності успадкування Менделя. Виявлення взаємозв’язку між різними групами крові та гонорейними інфекціями. Оцінка нейроінфекцій серед чоловіків та жінок.
статья [22,0 K], добавлен 17.08.2017Висока частота дисгормональних захворювань молочних залоз (ДЗМЗ) у жіночого населення. Фізіологічні процеси, що відбуваються в молочних залозах. Нова концепція репродуктивного здоров'я. Запобігання й лікування ракових захворювань на початкових стадіях.
автореферат [74,3 K], добавлен 12.03.2009Причини та структура травматизму хребта серед населення Європи та України, рівень інвалідизації населення після таких травм. Проведення експериментального аналізу факторів, що впливають на відновлення рухової активності за допомогою інтенсивного тренінгу.
дипломная работа [1,5 M], добавлен 02.12.2010Проблеми ідентифікації громадян України за стоматологічним статусом. Аналіз існуючих підходів до класифікації та систематизації змін стоматологічного статусу з урахуванням можливостей реабілітації пацієнтів із наявними порушенням зубо-щелепового апарату.
статья [18,4 K], добавлен 22.02.2018Вивчення стану питання впливу вірусів на перебіг вагітності жінок у роботах вітчизняних та зарубіжних учених. Токсоплазмоз та краснуха як результат впливу Torch-інфекцій на організм вагітних жінок. Аналіз способів лікування та попередження захворювань.
курсовая работа [64,9 K], добавлен 21.03.2014Характеристика, властивості вітаміну К, історія його відкриття та відомості на сучасному етапі. Поширення в природі вітаміну, оцінка активності та визначення потреби для організму людини. Лікарські засоби на основі кропиви, кукурудзи, грициків, калини.
курсовая работа [79,9 K], добавлен 26.09.2010Аналіз критеріїв ефективності використання фізіотерапевтичних методів лікування у стоматологічній практиці, їх систематизація та оцінка можливості уніфікації підходу їх застосування у різних клінічних ситуаціях. Реабілітація стоматологічних пацієнтів.
статья [25,9 K], добавлен 22.02.2018Аналіз даних якості життя хворих після пахвинної алогерніопластики у віддаленому післяопераційному періоді. Зменшення впливу запальної реакції на структури пахвинного каналу та репродуктивні органи за рахунок попередження контакту полімерного імплантату.
статья [20,5 K], добавлен 07.11.2017Передумови та види кількісних і якісних змін сечі, методика проведення діагностування та спеціальних аналізів. Характеристика захворювань нирок і їх значення в організмі людини. Порядок визначення схеми лікування. Протікання захворювань сечового міхура.
реферат [25,3 K], добавлен 21.11.2009
