Эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции в Омской области

Размещено на http://www.allbest.ru//

Размещено на http://www.allbest.ru//

14.02.02. - Эпидемиология

Автореферат

диссертации на соискание учёной степени кандидата медицинских наук

Эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции в Омской области

Горбунова Марина Георгиевна

Омск - 2010

Работа выполнена в Государственном образовательном учреждении высшего профессионального образования «Омская государственная медицинская академия Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию».

Научный руководитель:

доктор медицинских наук, профессор Стасенко Владимир Леонидович

Официальные оппоненты: доктор медицинских наук, профессор Сергевнин Виктор Иванович (г. Пермь)

доктор медицинских наук, доцент

Устюжанин Юрий Викторович (г. Тюмень)

Ведущая организация: Федеральное государственное учреждение науки Нижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора.

Защита диссертации состоится « 27 » декабря 2010 г. в 12 часов на заседании диссертационного совета Д 208.065.03 при ГОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия Росздрава» по адресу: 644043, Омск, ул. Ленина, 12; тел.(3812) 23-13-32.

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Омской государственной медицинской академии.

Автореферат разослан « ___ » ноября 2010 г.

И.о. ученого секретаря диссертационного совета

доктор медицинских наук, профессор В.А. Ширинский

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблемы

Крупные международные исследования свидетельствуют, что от 50 до 80% ежегодно регистрируемых в мире диарейных заболеваний могут быть обусловлены вирусами, ведущее место среди которых принадлежит ротавирусам, вызывающим от 25 до 60% случаев острых кишечных инфекций (Roman E., 2003; Parashar U. et al., 2003; Feeney S.A. et al., 2006). От тяжелой ротавирусной диареи в мире ежегодно умирает до 2 млн. человек, большинство из которых составляют дети первых лет жизни (Bryce J. et al., 2005; Podewils L. et al., 2005; Parashar U. et al., 2006; Santosham M. et al., 2007). Ротавирусная инфекция распространена повсеместно и наносит существенный вред здоровью населения как развитых, так и развивающихся стран, обусловливая прямые и непрямые экономические затраты, оценивающиеся сотнями миллиардов долларов в год (Parashar U. et al., 2003; Fischer T. et al., 2007).

Регистрируемый в Российской Федерации в последние годы рост показателей заболеваемости острыми кишечными инфекциями установленной этиологии обусловлен ротавирусной инфекцией, уровень заболеваемости которой за период 1999-2009 гг. увеличился в 7 раз, а удельный вес в структуре острых кишечных инфекций - с 1,4% до 7,0% (Г.Г. Онищенко, 2010). Истинный уровень заболеваемости ротавирусными гастроэнтеритами выше официально регистрируемого, что объясняется недостаточным на сегодняшний день лабораторным обследованием больных острыми кишечными инфекциями, в том числе детей, на ротавирусы в различных регионах Российской Федерации (Повиличенко И. П., 2005; Мефодьев В.В., 2006; Новикова Н.А., 2007; Жираковская Е.В., 2007; Подколзин А.Т., 2008).

Установлено значительное генетическое разнообразие и изменчивость ротавирусов, географические и сезонные различия циркулирующих генотипов со сменой доминирующих и эпидемически значимых генотипов. В настоящее время идентифицировано 27 Р- и 15 G-генотипов ротавирусов группы А, из них 14 Р- и 10 G-генотипов вызывают острый гастроэнтерит у человека (Gentsch J., 2005; Banyai K. et al., 2007; Macedo C. et al., 2007; Le V. et al., 2008). Проведение мониторинга за циркуляцией ротавирусов разных [P]G-генотипов и знание антигенного спектра ротавирусов, распространенных на той или иной территории, необходимо для создания поливалентной вакцины и оценки уже разработанных вакцин (Santos N., 2005; Vesikari T. et al., 2006; Glass R., 2006; Parashar U., 2006; Dennehy P., 2008).

Проведенные к настоящему времени в нескольких регионах Российской Федерации исследования циркуляции генетических вариантов ротавирусов охватывали только госпитализированных городских жителей (Новикова Н.А., 2007; Жираковская Е.В., 2007; Подколзин А.Т., 2008) и не распространялись на амбулаторных пациентов и жителей сельских территорий. В Омском регионе на момент планирования настоящей работы эпидемиологические и молекулярно-генетические особенности ротавирусной инфекции углубленно изучались рядом авторов лишь применительно к перинатальным центрам в аспекте внутрибольничной инфекции.

Цель исследования

Совершенствование системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции в Омской области с учетом региональных особенностей.

Задачи исследования

Изучить этиологическую структуру и проявления эпидемического процесса острых кишечных инфекций в Омской области за период с 1993 по 2007 гг.

Изучить проявления эпидемического процесса ротавирусной инфекции в Омской области за период с 1993 по 2007 гг. и определить территории риска, группы риска, время риска и факторы риска.

Изучить генетическое разнообразие ротавирусов, циркулирующих на территории Омской области.

Разработать предложения по оптимизации системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции с учетом региональных особенностей.

Научная новизна

В работе продемонстрирована ведущая роль ротавирусов группы А в этиологической структуре острых кишечных инфекций на территории Омской области, представлены новые данные о возрастных и социальных характеристиках поражаемых контингентов, выявлены различия внутригодовой динамики заболеваемости детского и взрослого населения. Проведено ранжирование административных территорий по уровню заболеваемости ротавирусной инфекцией, выявлены сельские районы со стабильно высоким уровнем заболеваемости и установлены причины, его определяющие. Впервые дана оценка роли ротавирусов в формировании вспышечной заболеваемости населения Омской области острыми кишечными инфекциями.

Установлены территориальные, сезонные и возрастные особенности циркуляции различных генотипов ротавирусов группы А в населении г. Омска и сельских районов Омской области. Выявлены штаммы ротавирусов группы А с уникальными геномными характеристиками.

Практическая значимость

На основании проведенных исследований были разработаны предложения по совершенствованию системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции для регионального уровня реализации, позволившие улучшить этиологическую расшифровку острых кишечных инфекций и совершенствовать профилактику ротавирусной инфекции.

По результатам исследований подготовлены:

- Эпидемиологический надзор и контроль ротавирусной инфекции в Омской области : методические рекомендации МР 3.1.1.003-10, утвержденные главным государственным санитарным врачом по Омской области 27.09.2010 г.;

- Эпидемиологический надзор за ротавирусной инфекцией в лечебно-профилактических учреждениях для новорожденных и детей первого года жизни : методические указания МУ 3.1.6.007-04, утвержденные главным государственным санитарным врачом по Омской области 05.05.2004 г.;

«Комплексный план мероприятий по профилактике острых кишечных инфекций, иерсиниозов и вирусного гепатита А на территории Омской области на 2006-2010 гг.», утвержденный Постановлением санитарно-противоэпидемической комиссии Правительства Омской области № 4 от 05.12.2006 г.;

Постановление Главного государственного санитарного врача по Омской области № 7 от 25.05.2010 г. «О профилактике острых кишечных инфекций»; ротавирусный региональный эпидемиологический надзор

«О дополнительных профилактических и противоэпидемических мероприятиях по ротавирусной инфекции», «О лабораторной диагностике ротавирусной инфекции», «О состоянии заболеваемости ротавирусной инфекцией в Омской области в 2007 г. и мерах ее профилактики» - информационно-методические письма № 10564 от 15.12.2006 г., № 775 от 01.02.2007 г., № 3069 от 15.04.2008 г.

В GenBank зарегистрированы 82 нуклеотидные последовательности изолятов ротавирусов группы А, циркулировавших на территории Омской области в 2007-2008 гг.

Материалы исследования и разработанные на их основе региональные методические рекомендации используются в деятельности Управления Роспотребнадзора по Омской области, Федерального государственного учреждения здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в Омской области», в работе лечебно-профилактических учреждений, в учебно-педагогическом процессе кафедры эпидемиологии и кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии, Центра повышения квалификации и профессиональной переподготовки специалистов ГОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия Росздрава».

Положения, выносимые на защиту:

1. Ротавирусы группы А являются ведущими возбудителями острых кишечных инфекций установленной этиологии на территории Омской области. Проявления эпидемического процесса ротавирусной инфекции в Омской области имеют региональные особенности.

2. Циркулировавшие в регионе ротавирусы группы А характеризовались выраженной вариабельностью генотипов в многолетней динамике и в распределении по административным территориям и поражаемым контингентам населения.

3. Приоритетным направлением повышения эффективности эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции в современных условиях следует рассматривать совершенствование подходов к организации и проведению микробиологического мониторинга популяции возбудителя инфекции.

Апробация работы

Диссертационная работа апробирована на совместном заседании проблемной комиссии «Гигиена, экология, эпидемиология, общественное здоровье и здравоохранение» и кафедр эпидемиологии, микробиологии, вирусологии и иммунологии, гигиены с курсом гигиены детей и подростков, медицинской экологии с курсами гигиены питания и радиационной гигиены, общественного здоровья и здравоохранения с курсами истории медицины и биомедицинской этики, медицины труда и профзаболеваний ГОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия Росздрава» (2010).

Основные положения диссертации доложены и обсуждены на:

VII межрегиональной научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения», посвященной 85-летию образования Государственной санитарно-эпидемиологической службы Российской Федерации, Омск, 2007;

26th Annual Meeting of the European Society for Paediatric Infectious Diseases (ESPID), Graz, Austria, 2008;

совместном заседании Омских отделений Национального научного медицинского общества гигиенистов и санитарных врачей и Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов, Омск, 2008;

VIII межрегиональной научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы сохранения здоровья населения Сибири», посвященной 70-летию медико-профилактического факультета Омской государственной медицинской академии, Омск, 2008;

конференциях и совещаниях специалистов здравоохранения регионального и муниципального уровней.

По теме диссертации опубликовано 12 научных работ, из них 2 - в изданиях, рекомендованных Высшей аттестационной комиссией Министерства образования и науки Российской Федерации для публикаций основных положений диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук.

Структура и объем работы

Диссертация изложена на 176 страницах текста компьютерного набора, содержит введение, обзор литературы, материалы и методы исследования, главу собственных исследований, заключение, выводы и практические рекомендации, иллюстрирована 12 таблицами и 42 диаграммами. Список литературы включает 69 источников на русском языке и 126 иностранных источников. Диссертация выполнена в соответствии с планом научно-исследовательской работы Омской государственной медицинской академии, номер государственной регистрации 01.200402778.

СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

Материалы и методы исследования

В работе использованы данные статистических отчетных форм №№ 2, 2-06 (6-96; 6-03; 6-05), 23 (23-06) Управления Роспотребнадзора по Омской области за 1993-2007 гг., регистрационные карты экстренных извещений (ф. 058/у) и карты эпидемиологического обследования очагов ротавирусной инфекции (ф. 257/у), а также данные Территориального органа Федеральной службы государственной статистики о численности различных возрастных групп населения области за 1993-2007 гг.

В исследование были включены 38395 больных острыми кишечными инфекциями, находившихся на амбулаторном или стационарном лечении в лечебно-профилактических учреждениях г. Омска и сельских районов области. Ретроспективный анализ заболеваемости населения ротавирусной инфекцией основан на изучении 10733 случаев манифестной формы инфекции, зарегистрированных с 1993 по 2007 гг., в том числе 6737 случаев в областном центре и 3996 в сельских районах Омской области, а также результатов обследования 11717 контактных лиц из очагов ротавирусной инфекции и 7693 человек, обследованных на антиген ротавирусов с профилактической целью (медицинские работники детских больниц и отделений, родильных домов, работники молокоперерабатывающих предприятий г. Омска и сельских районов Омской области и беременные во второй половине беременности).

С целью выделения антигена ротавирусов из объектов окружающей среды исследованы 542 пробы воды источников централизованного водоснабжения, 31 проба воды источников децентрализованного водоснабжения, 110 проб воды открытых водоемов, 482 пробы сточных вод, 718 проб продовольственного сырья и продуктов питания, 589 смывов с объектов внешней среды.

Для проведения лабораторных исследований материал транспортировался в лаборатории в условиях «холодовой цепи» с последующим хранением при температуре минус 700С. Детекция антигенов ротавирусов проводилась в вирусологической лаборатории Федерального государственного учреждения здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в Омской области» (совместно с к.м.н. Логиновских Н.В.) методом иммуноферментного анализа с использованием тест-систем для выявления антигена ротавируса группы А «Рота - Антиген» НПО «Аквапаст» (г. Санкт-Петербург) и «Ротавирус-антиген-ИФА-БЕСТ» ЗАО «ВЕКТОР-БЕСТ» (г. Новосибирск).

С целью генетической идентификации выделенных ротавирусов образцы фекалий от 250 больных из 27 сельских районов Омской области и г. Омска, содержащие антиген ротавируса группы А, отобранные методом случайной выборки за период с января 2007 г. по май 2008 г., были исследованы методом мультиплексной ОТ-ПЦР в лаборатории разработки средств экстренной профилактики Федерального государственного учреждения науки государственного научного центра вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора Новосибирской области (совместно с д.б.н. Н.В.Тикуновой, к.б.н. Е.В. Жираковской). Работа была выполнена в рамках проекта МНТЦ BTEP 58 / ISTC 2935 р - «Эпидемиология вирусных кишечных инфекций в России: разработка новых подходов для выявления и характеристики возбудителей» (руководитель академик РАМН, д.м.н. В.В. Малеев). Секвенирование трех фрагментов генома, кодирующих структурные белки VP4, VP6 и VP7 ротавирусов, выполнено на автоматическом анализаторе CEQ™2000XL DNA Analysis System (Beckman, США) в ЦКП «Секвенирование ДНК» Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН (г. Новосибирск, совместно с д.б.н. Н.В.Тикуновой, к.б.н. Е.В. Жираковской). Определены нуклеотидные последовательности исследуемых фрагментов генома для 37 изолятов ротавирусов различных генотипов, выявленных в Омской области. Полученные 82 нуклеотидные последовательности зарегистрированы в GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html).

Изучение проявлений эпидемического процесса ротавирусной инфекции на территории Омской области проводилось по следующим параметрам: удельный вес в структуре заболеваемости, уровень, многолетняя и внутригодовая динамика заболеваемости, интенсивность эпидемического процесса в различных территориях и социально-возрастных группах населения.

Количественные данные представлены в виде средних величин (средняя арифметическая, медиана). Для проверки статистических гипотез использовались t-критерий, критерии ч2, ц Фишера при 5% критическом уровне значимости нулевой гипотезы. Направление и сила связи между явлениями определялись с помощью коэффициентов корреляции Пирсона и Спирмена. Для оценки распределения показателей в интервальном ряду применялся метод перцентилей. Обработка данных проводилась с использованием Microsoft Excel 2000 и Statisticа 6.0.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

За период 1993-2007 гг. заболеваемость острыми кишечными инфекциями (ОКИ) на территории Омской области составила 469,3+4,680/0000 и имела умеренно выраженную тенденцию к снижению (Тсн. = - 2,35%; р<0,001), как и заболеваемость ОКИ неустановленной этиологии (231,8+3,300/0000; Тсн. = - 2,26%; р<0,001). Заболеваемость ОКИ установленной этиологии (114,5+2,320/0000) за аналогичный период, напротив, возросла (Тпр. = + 6,87%, р<0,001).

В структуре заболеваемости ОКИ удельный вес верифицированных инфекций составил 50,6+0,50%, в том числе дизентерии - 17,6+0,38%, сальмонеллезов - 8,9+0,28%, ротавирусной инфекции - 7,1+0,26%. С 1993 по 2001 гг. доля ОКИ неустановленной этиологии увеличилась на 13,4% (Тпр. = + 1,57%; р<0,001), а в период 2002-2007 гг. снизилась на 20,8% (Тсн. = - 2,3%; р<0,001).

Многолетняя динамика показателей заболеваемости ОКИ неустановленной этиологии соответствовала таковой при шигеллезах (rS = + 0,78; p<0,001) и сальмонеллезах (rS = + 0,80; p<0,001), что объясняется общностью происхождения заболеваемости указанными инфекциями и/или отнесением неверифицированной части случаев шигеллезов и сальмонеллезов к ОКИ неустановленной этиологии. В период с 2001 года, одновременно с улучшением лабораторной диагностики ротавирусной инфекции, прослежена обратная корреляционная связь между уровнем заболеваемости населения ротавирусной инфекцией и ОКИ неустановленной этиологии (rS = - 0,63; p<0,05).

В структуре ОКИ на территории области доля ротавирусной инфекции возросла с 0,03+0,02% в 1993 г. до 26,4+0,45% в 2007 г., а среди ОКИ установленной этиологии с 0,2+0,11% до 57,4+0,74% соответственно.

В динамике заболеваемость населения Омской области ротавирусной инфекцией увеличилась (Тпр. = + 22,95%; p<0,001) и имела более выраженный темп прироста, чем в целом по РФ (Тпр. по РФ = + 17,41%; рис. 1).

Рис. 1. Динамика заболеваемости ротавирусной инфекцией населения Омской области и Российской Федерации в 1993 - 2007 гг. (на 100 тыс. населения)

Причинами роста заболеваемости населения Омской области ротавирусной инфекцией стало не только истинное увеличение ежегодного числа заболевших, но и регистрационный рост за счет увеличения охвата лабораторным обследованием лиц с подозрением на ОКИ, главным образом, детей в возрасте до 3-х лет: между уровнем заболеваемости ротавирусной инфекцией и количеством обследованных на антиген ротавируса прослежена сильная прямая корреляционная связь (rS = + 0,96, p < 0,001).

Тенденция к росту заболеваемости ротавирусными гастроэнтеритами была выражена как в областном центре, так и в сельских районах Омской области (Tпр. = + 21,26% ; р<0,001, и Tпр. = + 25,69%; р<0,001, соответственно). При этом в г. Омске уровень заболеваемости был в 1,3 раза выше, чем в сельских районах (39,1+1,830/0000 и 28,8+1,730/0000 соответственно; р<0,05). В структуре заболевших ротавирусным гастроэнтеритом на долю городского населения пришлось 62,8%.

С момента охвата диагностическим обследованием на ротавирусную инфекцию заболевших ОКИ во всех административных территориях Омской области (2005 г.), в шести сельских районах (Знаменский, Калачинский, Кормиловский, Омский, Тарский, Усть-Ишимский) и г. Омске среднемноголетние показатели заболеваемости ротавирусной инфекцией существенно превысили среднеобластной показатель.

Одной из причин высокого уровня заболеваемости населения ротавирусной инфекцией в сельских районах послужило неудовлетворительное качество воды, подаваемой населению для питьевых и хозяйственных целей (rS = + 0,457; p=0,009). За период наблюдения в районах области отмечался высокий удельный вес нестандартных проб воды на водопроводах по микробиологическим (22-47%) и санитарно-химическим показателям (22-89%).

Уровень заболеваемости ротавирусной инфекцией населения Омской области определялся в основном заболеваемостью детей. Данные официальной регистрации наиболее адекватно отражают интенсивность эпидемического процесса именно в этой возрастной группе населения. Среднемноголетний показатель заболеваемости в группе детей до 14 лет составил 204,7±7,040/0000 и превысил аналогичный показатель у взрослых в 146 раз (1,4+0,290/0000; р<0,001). В то же время, частота обнаружения антигена ротавируса у детей с подозрением на ОКИ оказалась всего в 3,0 раза выше, чем среди обследованных с диагностической целью взрослых (39,0% против 13,0%), а среди контактных - только в 2,0 раза (17,1% детей и 8,6% взрослых соответственно).

Наибольшими показатели заболеваемости гастроэнтеритами ротавирусной этиологии были у детей первого (1250,1±79,670/0000) и второго (739,7±42,070/0000) года жизни, что позволило отнести их к группам риска.

Среднемноголетние показатели заболеваемости ротавирусной инфекцией различных возрастных групп детей в г. Омске превышали аналогичные показатели заболеваемости детей из сельских районов в 1,5-2,5 раза (p<0,05). В то же время аналогичный показатель у взрослых в сельских районах превысил таковой у взрослого населения г. Омска в 5,4 раза (2,7+0,59 и 0,5+0,220/0000, соответственно, p<0,05).

Выявлены различия в показателях заболеваемости ротавирусной инфекцией детей в возрастной группе 1-2 лет, посещавших и не посещавших дошкольные образовательные учреждения (соответственно 530,6±79,63 и 799,6±48,900/0000; p<0,05), и отсутствие таковых различий у детей 3-6 лет (соответственно 141,7±16,27 и 156,4+19,710/0000; p>0,05).

Среди взрослого населения наиболее высокие показатели заболеваемости отмечались в возрастной группе с 15 до 35 лет (7,8±1,190/0000) и среди лиц 60 лет и старше (3,0±0,870/0000), что согласуется с данными других авторов (Б.Я. Васильев, 2000; О.И. Сагалова, 2009). Полученные результаты подтвердили данные ряда авторов (Б.Я. Васильев, 2000; И.П. Повиличенко, 2006) о том, что группами повышенного риска заболевания ротавирусной инфекцией являются работники детских дошкольных и лечебно-профилактических учреждений. В нашем исследовании заболеваемость этих профессиональных групп была в 2,0-4,5 раза выше заболеваемости прочего взрослого населения (p<0,05).

Во внутригодовой динамике заболеваемости населения ротавирусной инфекцией была выявлена отчетливая зимне-весенняя сезонность (с января по июнь). Активизация эпидемического процесса в холодные месяцы календарного года была характерной для всех возрастных групп населения, однако доля сезонной заболеваемости среди детей в возрасте 1-2 лет (61,1+0,77%) оказалась более значительной, нежели среди детей прочих возрастных групп и взрослых (р<0,05). Сезонный подъем заболеваемости ротавирусной инфекцией детей в возрасте до 6 лет отмечался с января по июнь, тогда как у детей 7-14 лет и взрослых имели место два эпидемических подъема: первый, менее интенсивный, в сентябре-октябре, и второй - с конца января по май (рис. 2).

В зимне-весенний период первыми в эпидемический процесс ротавирусной инфекции вовлекались дети до 1 года, затем взрослые, далее, практически одновременно, дети 1-2 и 3-6 лет, не посещающие дошкольные образовательные учреждения, несколько позднее - дети 3-6 лет, посещающие дошкольные образовательные учреждения, и в последнюю очередь - дети 7-14 лет. Более интенсивный и продолжительный сезонный подъем заболеваемости ротавирусной инфекцией отмечался у детей с 1 года до 2-х лет и детей 3-6 лет, посещающих дошкольные образовательные учреждения.

Рис. 2. Внутригодовая динамика заболеваемости ротавирусной инфекцией в различных возрастных группах населения (по индексам сезонных колебаний, %)

Интенсивность эпидемического процесса ротавирусной инфекции на территории Омской области определялась спорадической заболеваемостью. Доля вспышечной заболеваемости в целом за период наблюдения составила лишь 3,3+0,17%. Тем не менее, за период с 2005 по 2007 гг. (с начала официальной регистрации вспышек ротавирусной инфекции в форме статистической отчетности № 23 «Сведения о вспышках инфекционных заболеваний») 27 из 57 вспышек ОКИ были ротавирусной этиологии, а удельный вес заболевших при этих вспышках составил 5,4+0,28% от общего числа зарегистрированных за эти годы случаев ротавирусной инфекции.

Большая часть случаев групповой заболеваемости ротавирусной инфекцией (21 из 27 эпидемических вспышек) была зарегистрирована в детских дошкольных и лечебно-профилактических учреждениях. Среди населения возникло шесть вспышек ОКИ ротавирусной этиологии, причем все были зарегистрированы в сельских районах и обусловлены повышением активности водного пути передачи возбудителя.

В лечебно-профилактических и дошкольных образовательных учреждениях г. Омска и сельских районов реализовывался преимущественно контактно-бытовой путь вследствие несвоевременного выявления и изоляции первых заболевших и других нарушений санитарно-противоэпидемического режима. Контактно-бытовой характер вспышек был реализован в 21 из 27 случаев групповой заболеваемости, водный - в пяти, пищевой - в одной вспышке.

При исследовании объектов внешней среды антиген ротавируса выявлялся в 7,2+1,95% случаев, в т.ч. в пробах из водных объектов - в 10,0+1,15% случаев (в воде открытых водоемов - в 15,5+3,45%; в воде централизованного и децентрализованного водоснабжения - в 9,0+1,23% и 6,5+4,41% случаев соответственно), в пищевых продуктах - в 7,4+0,98% случаев, в смывах с объектов в дошкольных образовательных и лечебно-профилактических учреждениях - в 5,30,92% случаев, что указывает на разнообразие путей передачи ротавирусов и их роль в распространении ротавирусной инфекции.

В образцах фекалий от заболевших ОКИ антигены ротавирусов обнаруживались у 37,30,96% обследованных, среди контактных лиц в очагах ротавирусной инфекции - в 9,31,04% случаев. Положительные находки у обследованных с профилактической целью здоровых лиц имели место в 4,20,89% случаев. Множественность источников инфекции, в том числе бессимптомное вирусоносительство, в совокупности с высокой контагиозностью и малой инфицирующей дозой являются основной причиной высокого уровня спорадической заболеваемости и в значительной степени определяют очаговость и групповую заболеваемость ротавирусной инфекцией.

Одним из основных направлений эпидемиологического надзора за ротавирусной инфекцией является изучение циркуляции доминирующих штаммов ротавирусов. Среди циркулировавших в 2007 и 2008 гг. на территории Омской области ротавирусов группы А (табл.) преобладали вирусы генотипа G1 (36,0±3,04%).

Таблица

[P]G-комбинации генотипов изолятов ротавирусов группы А, выделенных от больных ОКИ в Омской области в 2007-2008 гг. (абс.; %)

Генотипы	G1	G2	G3	G4	G9	G1+G2	G1+G3	G1+G4	н/т*	Всего	%
P[4]		37				2			1	40	16,0
P[6]				1						1	0,4
P[8]	76		5	74	1	1	1	2	3	163	65,2
P[9]			3							3	1,2
н/т*	14			6					23	43	17,2
Всего	90	37	8	81	1	3	1	2	27	250	100,0
%	36,0	14,8	3,2	32,4	0,4	1,2	0,4	0,8	10,8	100,0

* - нетипируемые изоляты

Вторым по частоте обнаружения был генотип G4 (32,4±2,96%), далее следовали генотипы G2 (14,8±2,25%) и G3 (3,2±1,11%). Среди Р-генотипов доминировал Р[8] (65,2±3,01%). Генотип Р[4] был выявлен в 16,0±2,32% случаев, генотипы Р[6] и Р[9] определялись в единичных изолятах. Часть изолятов не была идентифицирована по G (10,8±1,96%) и Р (17,2±2,39%) генотипам.

Спектр ротавирусов был представлен одиннадцатью [P]G-комбинациями (рис. 3). Преобладали широко распространенные во всем мире генотипы P[8]G1 (30,4±2,91%) и P[8]G4 (29,6±2,89%). Далее следовали генотипы P[4]G2 (14,8±2,25%), P[8]G3 (2,0±0,89%) и P[9]G3 (1,2±0,69%). Генотипы P[4]G2/G1, P[6]G4, P[8]G1/G2, P[8]G1/G3, P[8]G4/G1, P[8]G9 были выявлены в единичных случаях. В то же время, 9,2±1,83% изолятов не были идентифицированы по [Р]G типам, что позволило отнести их к редко встречающимся штаммам ротавирусов.

Рис. 3. Распределение ротавирусов группы А, изолированных от заболевших на территории Омской области в 2007-2008 гг., по [Р]G типам (в %)

Результаты генотипирования позволяют говорить об особенностях в распределении генотипов ротавирусов на территории области. Так, генотип P[8]G1 преобладал в сельских районах (44,1±4,03%), тогда как в г. Омске на его долю пришлось 9,2±2,92% выделенных изолятов (р<0,05). В областном центре доминировал генотип P[8]G4 (51,0±5,05%), в сельских районах частота его выявления составила 15,8±2,96% (р<0,05). Имелись территориальные отличия и в распределении других генотипов ротавирусов. Генотип P[8]G1 в 2007-2008 гг. доминировал в 14 из 32 сельских районов области; в двух сельских районах (Москаленском и Русско-Полянском) превалировал P[4]G2, в Горьковском и Оконешниковском районах - P[8]G4. В девяти сельских районах циркулировали ротавирусы разных генотипов примерно в одинаковом соотношении. В трех сельских районах (Исилькульском, Муромцевском и Называевском) была высока доля нетипируемых изолятов (от 30 до 60%).

В динамике доля генотипа P[8]G1 уменьшилась с 55,6±5,24% в эпидемический сезон 2007 г. до 16,9±2,96% в эпидемический сезон 2008 г. (р<0,05) и, напротив, возросла значимость генотипа P[8]G4 с 10,0±3,16% до 40,0±3,87% (р<0,05). Динамические изменения отмечались и в отношении частоты выявления генотипа P[4]G2 (10,0±3,16 и 17,5±3,00% соответственно).

Выявлены особенности в частоте обнаружения [P]G-генотипов ротавирусов группы А в различных возрастных группах заболевших: генотип P[8]G1 доминировал у детей первого и третьего года жизни, а также среди взрослых; генотип P[8]G4 - в возрастных группах 1-2 г. и 3-6 лет.

Лабораторное обследование больных ОКИ на ротавирусы до недавнего времени проводилось по клиническим и эпидемиологическим показаниям, перечень которых не был четко регламентирован, в связи с чем регистрируемая заболеваемость и учтенное носительство ротавирусов не в полной мере отражали интенсивность эпидемического процесса. Изменение подходов к организации микробиологического мониторинга значительно улучшило расшифровку ротавирусной инфекции в Омской области и позволило выделить территории, группы риска и отследить происходящие изменения в популяции возбудителя и хозяина.

Полученные результаты исследования позволили внести ряд предложений по совершенствованию информационно-аналитической подсистемы эпидемиологического надзора за ротавирусной инфекцией и конкретизировать его схему. Разработанные предложения были оформлены в виде региональных методических рекомендаций (Омск, 2010). Мониторинг циркулирующих генотипов ротавирусов стал важным элементом системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции, необходимым для расшифровки групповой заболеваемости ротавирусной инфекцией и решения вопросов планирования специфической профилактики.

Результаты эпидемиологического анализа позволили определить направления совершенствования и критерии эффективности системы управления эпидемическим процессом ротавирусной инфекции:

разработка единых критериев диагностики ротавирусной инфекции;

упорядочение регистрации и учета, их унификация на различных административных территориях Омской области;

улучшение этиологической расшифровки ОКИ за счет расширения круга лиц, подлежащих обследованию на ротавирусы, а также внедрения новых современных методов идентификации ротавирусов;

предупреждение групповой заболеваемости ротавирусной инфекцией в организованных коллективах и среди населения;

снижение индекса очаговости;

снижение удельного веса заболеваемости, обусловленной влиянием сезонного фактора;

отсутствие случаев летального исхода при ротавирусной инфекции.

ВЫВОДЫ

Структура заболеваемости населения острыми кишечными инфекциями на территории Омской области за период 1993-2007 гг. характеризовалась снижением удельного веса бактериальной дизентерии и сальмонеллезов одновременно с уменьшением доли острых кишечных инфекций неустановленной этиологии. На фоне увеличения охвата населения лабораторным обследованием доля ротавирусной инфекции в структуре острых кишечных инфекций на территории Омской области увеличилась к концу периода наблюдения до 26,3%, определив ее ведущее значение.

Заболеваемость населения ротавирусной инфекцией в динамике характеризовалась выраженной тенденцией к росту (Тпр.= + 22,95%, p<0,001) с большей интенсивностью эпидемического процесса в городе Омске по сравнению с таковой в сельской местности (р<0,05). Территориями риска стали г. Омск и шесть сельских районов Омской области (Знаменский, Калачинский, Кормиловский, Омский, Тарский, Усть-Ишимский).

Во внутригодовой динамике заболеваемости населения области ротавирусной инфекцией была выявлена зимне-весенняя сезонность, при этом выраженный ежегодный сезонный подъем заболеваемости у детей в возрасте до 6 лет отмечался с января по июнь, тогда как у детей 7-14 лет и взрослых имели место два эпидемических подъема: в сентябре-октябре и январе - мае.

Группами риска заболеваемости ротавирусной инфекцией являлись дети первого года жизни (1250,1±79,670/0000), не посещавшие дошкольные образовательные учреждения дети второго года жизни (799,6±48,900/0000), а также работники детских дошкольных образовательных и лечебно-профилактических учреждений, заболеваемость которых была в 2,5-4,5 раза выше (p<0,05) по сравнению с прочими категориями взрослого населения.

Заболеваемость ротавирусной инфекцией населения Омской области носила преимущественно спорадический характер. В то же время, в период с 2005 по 2007 гг. 27 из 57 всех вспышек острых кишечных инфекций были ротавирусной этиологии. При групповой заболеваемости в лечебно-профилактических и дошкольных образовательных учреждениях области реализовывался преимущественно контактно-бытовой путь распространения возбудителя, тогда как среди сельского населения преобладал водный путь.

На территории Омской области циркулировали ротавирусы группы А одиннадцати [Р]G типов с преобладанием в сельских районах генотипа P[8]G1 (44,1% изолятов), в г. Омске - P[8]G4 (51,0% изолятов). За период наблюдения произошла смена доминирующих геновариантов: снизилась доля P[8]G1 с 55,6% в эпидемический сезон 2007 г. до 16,9% в эпидемический сезон 2008 г. (р<0,05) и, напротив, рост P[8]G4 с 10,0% до 40,0% (р<0,05).

Совершенствование подходов к организации микробиологического мониторинга позволило повысить качество эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции в регионе.

СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

Шахова, Т.А. Анализ заболеваемости населения ротавирусной инфекцией в Кировском административном округе г. Омска / Т.А. Шахова, М.Г. Горбунова, В.М. Миленина // Актуальные проблемы обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения : материалы IV межрегион. науч.-практ. конф. с междунар. участием. - Омск, 2003. - Т. 2. - С. 316-318.

Богомолов, О.В. О результатах расследования вспышки острых кишечных инфекций среди населения Калачинского района Омской области / О.В. Богомолов, М.А. Вайтович, М.Г. Горбунова // Актуальные вопросы здоровья населения Сибири: гигиенические и эпидемиологические аспекты : материалы VI межрегион. науч.-практ. конф. - Омск, 2006. - С. 101-106.

Горбунова, М.Г. Актуальные проблемы заболеваемости ротавирусной инфекцией в Омской области / М.Г. Горбунова, О.В. Богомолов, М.А. Вайтович // Актуальные вопросы здоровья населения Сибири: гигиенические и эпидемиологические аспекты : материалы VI межрегион. науч.-практ. конф. - Омск, 2006. - С. 110-112.

Анализ заболеваемости ротавирусной инфекцией и циркуляции ротавирусов разных типов на территории Омской области / М.Г. Горбунова, Н.В. Тикунова, Е.В. Жираковская и др. // Актуальные проблемы обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения : материалы VII межрегион. науч.-практ. конф. с междунар. участием. - г. Омск, 2007 г. - С. 115 -118.

Эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции в Омской области / М.Г. Горбунова, М.А. Вайтович, В.М. Миленина и др. // Материалы IХ съезда всероссийского науч.-практ. общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. - Москва, 2007. - С. 141.

Epidemiological profile of rotavirus infection in Western Siberia, Russia, July 2003 - December 2007: diversity of group A rotavirus genotypes / E. Zhirakovskaya, S. Bodnev, A. Tikunov, M. Gorbunova et al. // 26th Annual Meeting of the European Society for Paediatric Infectious Diseases (ESPID). - 13-17 May 2008. - Graz, Austria. - Р. 402.

Полянская, Н.А. Клинико-эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции у детей раннего возраста / Н.А. Полянская, М.Г. Горбунова // Актуальные вопросы инфекционной патологии : материалы Евро-Азиатского конгресса по инфекц. болезням. - Витебск, 2008. - С. 163.

Роль ротавирусов в этиологической структуре острых кишечных инфекций и клиническая картина гастроэнтеритов, обусловленных ротавирусами генотипа P8G4, у пациентов детского инфекционного стационара / М.Г. Горбунова, Н.А. Полянская, В.Л. Стасенко и др. // Актуальные проблемы сохранения здоровья населения Сибири : материалы VIII межрегион. науч.-практ. конф. с междунар. участием. - Омск, 2008. - С. 203 -205.

Характеристика эпидемического процесса ротавирусной инфекции на территории Омской области в 1993-2007 годах / М.Г. Горбунова, Е.В. Жираковская, Н.В. Тикунова и др. // Сибирский медицинский журнал. - 2008. - Т. 82. - № 7. - С. 113-116.

Эпидемиологическая характеристика и особенности этиологии ротавирусной инфекции в Омской области / М.Г. Горбунова, Н.В. Тикунова, Е.В. Жираковская и др. // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2008. - № 6. - С. 36-39.

Особенности этиологии ротавирусной инфекции в Омской области / М.Г. Горбунова, В.Л. Стасенко, М.А. Вайтович и др. // Актуальные проблемы природной очаговости болезней : материалы всероссийской конф. с междунар. участием. - Омск, 2009. - С. 225 -226.

Ротавирусная инфекция в Омской области / М.Г. Горбунова, В.Л. Стасенко, М.А. Вайтович и др. // Проблемы инфекционной патологии в Уральском регионе : сборник работ III окружной науч.-практ. конф. - Екатеринбург, 2010. - С. 113-118.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ

ОКИ - острые кишечные инфекции

Т пр.(сн.) - темп прироста (снижения) за период

ОТ-ПЦР - обратная транскрипция полимеразной цепной реакции

ЦКП - центр коллективного пользования

Размещено на Allbest.ru

...