Принципы создания информационно-поисковой системы для наследственных болезней органа зрения

Размещено на http://www.allbest.ru/

Учреждение Российской академии медицинских наук Медико-генетический научный центр РАМН

На правах рукописи

Автореферат

диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук

Принципы создания информационно-поисковой системы для наследственных болезней органа зрения

03.00.15 - Генетика

14.00.08 - Глазные болезни

Беклемищева Наталья Алексеевна

Москва - 2009

Работа выполнена в Учреждении Российской академии медицинских наук Медико-генетический научный центр РАМН

Научные руководители: доктор медицинских наук, профессор Дадали Елена Леонидовна

доктор медицинских наук Хлебникова Ольга Вадимовна

Официальные оппоненты:

доктор медицинских наук, профессор Козлова Светлана Ивановна

доктор медицинских наук, профессор Полунин Геннадий Серафимович

Ведущая организация: Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования Московский государственный медико-стоматологический университет

Защита состоится 2009г. на заседании Диссертационного совета Д 001.016.01 при Учреждении Российской академии Медицинских Наук МГНЦ РАМН по адресу: 115478, Москва, ул. Москворечье, д.1.

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Учреждения Российской академии медицинских наук Медико-генетического научного центра РАМН по адресу: 115478, Москва, ул. Москворечье, д.1.

Автореферат разослан 2009 г.

Ученый секретарь диссертационного совета Д 001.016.01 по защите докторских и кандидатских диссертаций, доктор медицинских наук, профессор Р.А. Зинченко.

Общая характеристика работы

Актуальность исследования

Наследственные болезни органа зрения (НБОЗ) - обширная группа генетически гетерогенных заболеваний, для большинства из которых характерно тяжелое течение, приводящее к значительному снижению остроты зрения (Аветисов Э.С., 1987; Еричев В.П., 2000, 2004; Ковалевский Е.И., 1995; Майчук Ю.Ф., 2005; Полунин Г.С., 2007; Хватова А.В., 1987, Aijaz S., 2004; Alward W., 2002; Bermejo E., 1998; Boutboul S., 2006; Chang L., 2006; Cohn A., 2007; Gregory-Evans C., 2004; Kozlowski K., 2000). По данным ВОЗ во всем мире насчитывается около 37 миллионов слепых и 124 миллиона слабовидящих людей (Либман Е.С., 2006). Установлено, что в 70% случаев наступление слепоты возможно предотвратить.

Показано, что не менее 30% заболеваний органа зрения имеют моногенную природу, для большинства этих заболеваний установлена этиология (Бочков Н.П., 1997; Хлебникова О.В., 1998; Шамшинова А.М., 2001; Elder M., 1994). Это способствует совершенствованию их классификационной структуры, определяет возможность точной диагностики и проведения профилактических мероприятий в отягощенных семьях (Гинтер Е.К., 2003; Козлова С.И., 2007; Панова И.Г., 2006; Пантелеева И.А., 1997; Рахманов В.В., 2006; Bermejo E., 1998; Clark G., 2000; Cremers F., 2002). Однако большинство врачей-офтальмологов диагностируют лишь нескольких десятков моногенных НБОЗ, в то время как описано более 200 форм. Это связано, прежде всего, с трудностями получения информации об особенностях клинических проявлений, современных методах диагностики и возможностях профилактики различных генетических вариантов наследственной моногенной патологии глаз. В последние годы опубликован ряд монографий и обзорных статей по наиболее распространенным и значимым НБОЗ, к которым относятся катаракты, дегенерации сетчатки, болезни зрительного нерва и глаукомы (Ionides A., 1999; Francis B., 2000; Pande A., 2000; Mackay D., 2002; Щуко А.Г., 2004; Shiels A., 2007; Cohen D., 2007). Однако до настоящего времени отсутствует источник, позволяющий одновременно получить исчерпывающую информацию об этиопатогенезе, особенностях клинических проявлений, диагностических возможностях общеклинических, дополнительных и лабораторных методов исследования, типах наследования и способах профилактики различных НБОЗ. Отсутствие такой информации может привести к неправильным или несвоевременным диагностике, профилактике и лечению больных.

Одним из способов преодоления разрыва между современными научными достижениями и практической медициной может служить создание компьютерных информационно-диагностических программ для различных групп наследственных заболеваний, обогащенных справочным материалом (и таким образом, выполняющих функцию учебного пособия) и имеющих возможность постоянного обновления и пополнения вновь полученными данными.

Существующие в настоящее время информационно-диагностические программы для наследственных болезней, как правило, не ориентированы на офтальмопатологию, а охватывают широкий круг наследственных синдромов. Недостатками имеющихся программ является отсутствие динамического описания клинической картины заболевания, а также справочных материалов по отдельным классам и группам НБОЗ, что существенно снижает возможность их использования в качестве обучающих систем. Кроме того, англоязычные программы, по понятным причинам, не всегда являются доступными для широкого круга пользователей.

Все это обуславливает актуальность создания информационно-поисковой системы для НБОЗ, ориентированной на отечественного пользователя и включающей всю информацию, необходимую для диагностики и профилактики идентифицированных генетических вариантов.

Цель и задачи исследования

Целью данной работы является совершенствование диагностики и медико-генетического консультирования наследственных моногенных врожденных пороков развития и заболеваний органа зрения на основе создания комплексной информационно-поисковой системы (ИПС).

Для достижения поставленной цели решались следующие задачи:

1. Разработка функциональной структуры и характера информационного наполнения ИПС для моногенных врожденных пороков и наследственных болезней органа зрения.

2. Создание структуры классов, подклассов и каталога нозологических единиц моногенных врожденных пороков и наследственных болезней органа зрения.

3. Формирование словарей-классификаторов клинических, параклинических и молекулярно-генетических признаков, необходимых и достаточных для диагностики широкого круга офтальмопатологии.

4. Разработка структуры унифицированного клинического портрета и иллюстративного материала.

5. Разработка структуры представления справочного материала по отдельным классам НБОЗ и вспомогательного модуля принятия решений для проведения дифференциальной диагностики.

Научная новизна и практическая значимость

Впервые разработана структура автоматизированной информационно-поисковой системы для наследственных моногенных врожденных пороков развития и заболеваний органа зрения, сочетающая в себе функции учебного пособия и диагностической программы и ориентированная на отечественного пользователя. Создана универсальная структура представления клинического портрета различных вариантов наследственной офтальмопатологии, включающая перечень признаков, необходимых и достаточных для осуществления их диагностики. Впервые разработана структура и информационное наполнение справочных материалов и вспомогательного модуля принятия решений, позволяющие оптимизировать процесс дифференциальной диагностики различных генетических вариантов НБОЗ.

Предложенная структура информационно-поисковой системы для наследственных моногенных врожденных пороков развития и заболеваний органа зрения, включающая 207 нозологических единиц, относящихся к 8 классам офтальмопатологии, является основой для создания автоматизированной диагностической программы, ориентированной на широкий круг отечественных клиницистов. Структура предложенной программы является в значительной степени универсальной, имеет возможности расширения и обновления. Использование этой программы врачами-генетиками и офтальмологами позволит сократить продолжительность диагностического поиска и осуществить профилактику возникновения повторных случаев в отягощенных семьях.

Положения, выносимые на защиту

1. Разработана структура информационно-поисковой системы для диагностики и дифференциальной диагностики 8 классов НБОЗ, объединяющих 207 нозологических единиц, представленные 316 генетическими вариантами.

2. Создана структура 6 основных каталогов: классов заболеваний, подклассов заболеваний, нозологических единиц, клинических симптомов, параклинических и молекулярно-генетических признаков, представленная в пяти информационно-диагностических блоках.

3. Созданы словари-классификаторы для 464 клинических, 122 параклинических и 121 молекулярно-генетических признаков, использование которых необходимо и достаточно для осуществления диагностического поиска и дифференциальной диагностики включенных в программу нозологических единиц и клинических вариантов моногенных врожденных пороков развития и заболеваний органа зрения.

4. Разработана универсальная структура представления обобщенного клинического портрета отдельных нозологических единиц, отражающего динамику формирования фенотипа заболевания. Показано, что для осуществления дифференциальной диагностики отдельных генетических вариантов НБОЗ в его структуру необходимо включить следующие разделы: клинические признаки, данные общеклинического офтальмологического обследования (визометрия, биомикроскопия, тонометрия, определение цветового зрения), данные дополнительных офтальмологических методов обследования (кератометрия, периметрия, ультразвуковое исследование, электрофизиологические исследования, флюоресцентная ангиография) и специальные разделы (генетика, этиология, патогенез, профилактика, критерии диагноза).

5. Разработана структура вспомогательного модуля поддержки принятия решения, позволяющего оптимизировать процедуру диагностического поиска для пользователей с различным уровнем подготовленности и придать программе функцию постоянно обновляющегося учебного пособия.

Апробация работы.

Основные результаты диссертационной работы были представлены на IV Съезде Медицинских генетиков (Москва, Россия, 2003); V Съезде Медицинских генетиков (Уфа, Россия, 2005); VIII Съезде офтальмологов России (Москва, Россия, 2005); 14 Научном симпозиуме «Одесса-Генуя» (Одесса, Украина, 2005); Научно-практической конференции «Детская офтальмология, итоги и перспективы» (Москва, 2006); «Ерошевских чтениях 2007» (Самара, Россия, 2007); Научно-практической конференции «Современные проблемы клинической генетики» (Москва, Россия, 2008); 41st European Human Genetics Conference (Vena, Austria, 2009); на семинарах в научно-консультативном отделе МГНЦ РАМН и на общеинститутских семинарах. Работа апробирована и рекомендована к защите на заседании ученого совета МГНЦ РАМН 3 июня 2009 года.

Личное участие автора в получении результатов, изложенных в диссертации. На основе анализа значительного количества научной литературы по систематике, этиологии, патогенезу, особенностях клинических проявлений различных генетических вариантов НБОЗ автором лично разработана структура информационно-поисковой системы (ИПС) для наследственных болезней глаз, каталоги классов, подклассов, нозологических единиц, диагностических критериев. Также автором разработана схема представления клинического портрета и материалов справочных разделов. Значительная часть иллюстративного материала была собрана лично автором при осмотре больных с наследственной офтальмопатологией. Разработан ряд алгоритмов дифференциальной диагностики генетически гетерогенных групп наследственных заболеваний органа зрения. Беклемищева Н.А. сформулировала выводы и опубликовала статьи, отражающие основные результаты диссертационной работы.

Публикации. Результаты диссертационной работы отражены в 16 печатных работах соискателя, в том числе 7 статей опубликовано в журналах, рекомендованных ВАК МОН РФ.

Внедрение результатов работы в клиническую практику. Разработана основа для создания информационно-поисковой (диагностической) компьютерной программы для наследственных болезней органа зрения. Анализ существующих данных и изучение клинико-генетических корреляций позволил разработать Медицинскую технологию МЗ «Клинические особенности и дифференциальная диагностика врожденного амавроза Лебера» (Регистрационное удостоверение №ФС-2006/257, Москва, 2006). Проведённая работа показала, что для оптимизации диагностики и реализации профилактических мероприятий, необходимо внедрение современных данных о генетической природе наследственных заболеваний органа зрения, адаптированных к применению практическими врачами офтальмологами и генетиками.

Структура и объём работы.

Диссертационная работа изложена на 241 странице текста и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, результатов и обсуждения, заключения, выводов, списка литературы и приложений. Данные проиллюстрированы 34 таблицами и 31 рисунком. Список литературы включает 319 источников, из них 254 зарубежных авторов.

Содержание работы

Материалы и методы исследования

Характеристика информационных материалов, использованных при описании клинико-генетических характеристик наследственных болезней органа зрения.

Формирование структуры ИПС по НБОЗ и его информационного наполнения было проведено на основе обобщения большого числа данных отечественных и зарубежных литературных источников, включая информационные источники ИНТЕРНЕТ и данных, обобщающих обширный опыт клинической диагностики наследственных болезней органа зрения в НИИ Глазных болезней им Гельмгольца и МГНЦ РАМН.

При формировании каталогов нозологических единиц была использована информация с сайтов NCBI, а также из оригинальных описаний нозологических форм и обзоров, обобщающих сведения о клинических проявлениях НБОЗ. При создании каталога диагностических признаков в качестве основы была принята структура древа клинических признаков из базы данных Oxford Medical Databases. Каталог генетических маркеров создавали на основе номенклатуры HUGO Сommittee, размещенной на одноименном сайте. При описании структуры генов, их локализации и истории открытия использовали информационные материалы из монографий и статей, посвященных НБОЗ, информацию с молекулярно-генетических баз данных в ИНТЕРНЕТ. При описании динамики формирования клинического фенотипа отдельных нозологических единиц использовался информационный материал отечественных и зарубежных монографий, ИНТЕРНЕТ-сайтов и данные архива историй болезней пациентов, находящихся под наблюдением в НИИ Глазных болезней им. Гельмгольца и научно-консультативного отдела МГНЦ РАМН.

Базу иллюстративного материала при описании клинических портретов отдельных нозологических единиц и справочного материала наполняли фотографиями пациентов, схематическими изображениями результатов параклинических исследований, офтальмоскопическими изображениями, а также схемами патогенеза различных заболеваний органа зрения.

Методические подходы, используемые при формировании информационно-поисковых диагностических систем.

Учитывая, что создаваемая ИПС по диагностике НБОЗ должна быть совместима с уже имеющимися программами по диагностике наследственных болезней нервной системы и наследственных болезней обмена, для обеспечения идентичности алгоритма поиска диагноза нами были использованы те же методические подходы к формированию ее структуры, что и при создании вышеперечисленных программ. Показано, что для оптимального функционирования программ, специализированных для диагностики различных групп наследственных заболеваний, они должны содержать пять основных структурных блоков. (рис.1)

Размещено на http://www.allbest.ru/

Рисунок 1. Структура Информационно-поисковой системы для НБОЗ.

Первый блок системы содержит каталоги диагностических признаков: клинических симптомов, параклинических и молекулярно-генетических признаков; перечень которых зависит от специфики диагностируемой патологии.

Второй блок системы содержит три каталога: классов, подклассов и нозологических единиц.

Третий блок (информационный) состоит из четырех баз данных (БД):

1) диагностических критериев

2) клинических портретов нозологических форм;

3) иллюстративного материала,

4) справочных разделов, в которых содержится не только общая информация по классам, подклассам и группам заболеваний, но и некоторые базовые знания по офтальмологии (схемы строения различных структур глаза, нормальные показатели размеров структур глаза, нормальные показатели некоторых общеклиникических и дополнительных офтальмологических исследований и т.д.).

Наличие этих баз данных позволяет программе осуществлять функцию поисковой системы и справочного или учебного пособия. Функцию учебника придает программе изложение материалов по общепринятому у клиницистов монографическому типу, включение в ее структуру справочных разделов по каждому подклассу заболеваний, а также наличие «виртуального советника», помогающего провести диагностику и профилактику НБОЗ специалистам с различным уровнем подготовки.

Четвертый блок (диагностический) состоит из трех основных разделов:

1) диагностического, с помощью которого осуществляется поиск диагноза на основе заданных пользователем симптомов;

2) дифференциально - диагностического, формирующего - список нозологических единиц для проведения дифференциальной диагностики. Диагностическая функция программы обеспечивается ранжированием нозологических единиц, специализированными каталогами признаков (клинических и параклинических), необходимых и достаточных для диагностики всех включенных в ее состав наследственных заболеваний;

3) вспомогательного модуля поддержки принятий решения, так называемого «виртуального советника», позволяющего осуществлять поддержку пользователя в режиме реального времени в виде диалогов.

Пятый блок (представления материала) состоит из двух модулей - клинического портрета и иллюстративного материала, позволяющих получить полную информацию о фенотипических проявлениях нозологической единицы.

Результаты исследований и их обсуждение.

Структура каталога классов и подклассов наследственных заболеваний органа зрения.

В структуру, предлагаемой нами ИПС включено 8 классов НБОЗ (табл.1). Выделение 7 классов проводилось на основе преимущественной локализации патологического процесса в различных структурах глаза. В отдельный класс выделены первичные изолированные глаукомы, несмотря на то, что причиной их возникновения может быть патология различных анатомических структур глаза. Это связано с наличием характерных клинических проявлений, позволяющих диагностировать эту группу патологии при офтальмологическом осмотре.

Для удобства пользователя отдельные классы моногенных НБОЗ были разделены на подклассы, врожденные пороки развития и наследственные заболевания. Отступления от стандартной схемы было сделано для оптимизации информационной функции программы, и облегчения поиска клинических портретов нозологических единиц по каталогам классов и подклассов. Так, пороки развития, характеризующиеся изменением размеров собственно глазного яблока или его рудиментарным строением, выделены в отдельный класс. Кроме того, класс «Врожденные моногенные пороки развития и наследственные заболевания сетчатки» содержит большое количество нозологических форм, которые характеризуются сочетанным поражением сетчатки и стекловидного тела, поэтому, понадобилось выделение дополнительного подкласса «витреоретинальные дегенерации», что должно облегчить пользователю поиск конкретной нозологической формы в каталоге нозологических форм. Характеристика классов, подклассов и количество нозологических единиц включенных в ИПС представлено в таблице 1.

Таблица 1. Классы и подклассы НБОЗ, выделяемые в структуре ИПС для наследственных болезней органа зрения.

Название класса	Название подкласса	Количество нозологических единиц
Врожденные пороки развития собственно глазного яблока	Врожденные пороки развития собственно глазного яблока.	6
Врожденные пороки развития и наследственные заболевания придаточного аппарата глаза	Врожденные пороки развития придаточного аппарата глаза	7
	Наследственные заболевания придаточного аппарата глаза	1
Врожденные пороки развития и наследственные заболевания роговицы.	Врожденные пороки развития роговицы	8
	Наследственные заболевания роговицы	17
Врожденные пороки развития и наследственные заболевания хрусталика.	Врожденные пороки развития хрусталика.	2
	Наследственные заболевания хрусталика.	33
Врожденные пороки развития и наследственные заболевания сосудистой оболочки.	Врожденные пороки развития сосудистой оболочки глаза.	7
	Наследственные заболевания сосудистой оболочки.	7
Врожденные пороки развития и наследственные заболевания зрительного нерва.	Врожденные пороки развития зрительного нерва	8
	Наследственные заболевания зрительного нерва.	5
Врожденные пороки развития и наследственные заболевания сетчатки.	Врожденные пороки развития сетчатки	3
	Наследственные заболевания сетчатки	87
	Витреоретинальные дегенерации	6
Наследственные глаукомы	Первичные глаукомы, обусловленные врожденными пороками развития переднего отрезка глаза	6
	Первичные открытоугольные глаукомы	4
Всего	16	207

Таким образом, в ИПС все НБОЗ были структурированы в восемь классов и шестнадцать подклассов, наибольшее нозологических единиц содержит подклассы наследственные заболеваний сетчатки, хрусталика и роговицы. С появлением новых данных о клинике, этиологии и патогенезе НБОЗ возможно изменение, дополнение и совершенствование каталога классов и структуры программы.

Структура и принципы формирования каталога нозологических единиц.

Проведенный нами анализ существующих офтальмологических классификаций показал, что в качестве различных нозологических форм зачастую рассматриваются заболевания, обусловленные мутациями в одном и том гене, и являющиеся аллельными вариантами. С другой стороны, различные по этиологии состояния описываются в рамках единой нозологической формы. Таким образом, выраженная генетическая гетерогенность и клинический полиморфизм НБОЗ привели к необходимости введения понятия «нозологическая единица». Нозологическая единица представляет собой патологическое состояние глаза, которое может быть описано в виде отдельного клинического портрета, имеющего специфические диагностически значимые признаки. Следовательно, в качестве нозологической единицы может быть представлен как отдельный генетический вариант, так и несколько генетических вариантов, имеющих идентичные клинические проявления. Количество нозологических единиц в структуре различных классов может отличаться от количества нозологических форм, традиционно выделяемых в практической офтальмологии, а также от количества идентифицированных генетических вариантов.

В связи с этим, для удобства пользователя, в некоторых случаях мы считали целесообразным, приводить описание каждого генетического варианта в виде отдельного клинического портрета, в то время как в других случаях генетически гетерогенное заболевание описывалось в рамках единой нозологической единицы.

Из числа описанных в литературе наследственных изолированных моногенных заболеваний глаза для включения в структуру программы нами сформированы 207 нозологических единиц, представленные 316 генетическими вариантами (табл.2). Для представления заболевания в структуре программы в качестве отдельной нозологической единицы, оно должно было удовлетворять следующим критериям: иметь четко очерченную клиническую картину и/или идентифицироваться в качестве отдельного генетического варианта.

Наибольший разрыв между традиционно выделяемыми клиническими формами и нозологическими единицами в структуре ИПС наблюдается в классах «Моногенные врожденные пороки развития и наследственные заболевания сетчатки» и « хрусталика». Это связано с выраженным клиническим полиморфизмом и генетической гетерогенностью этих классов. Например, выделяемый клиницистами в качестве единой нозологической формы «Врожденный амавроз Лебера» (ВАЛ) является генетически гетерогенной группой заболеваний, обусловленной мутациями в 10 различных генах. На сегодняшний день известно 10 генетических вариантов ВАЛ, которые различаются возрастом манифестации, характером прогрессирования, типом наследования, особенностью изменений картины глазного дна, данными электрофизиологических исследований, а также сочетанием с соматической патологией.

Таблица 2. Сравнительные данные по количеству нозологических единиц НБОЗ, включенных в программу и традиционно выделяемых клиницистами клинических форм наследственных заболеваний органа зрения.

Название класса	Количество традиционно выделяемых нозологических форм	Количество нозологических единиц в структуре ИПДС	Количество генетических вариантов в структуре ИПС
Моногенные врожденные пороки развития собственно глазного яблока	3	6	13
Моногенные врожденные пороки развития и наследственные заболевания придаточного аппарата глаза	7	8	17
Моногенные врожденные пороки развития и наследственные заболевания роговицы	25	25	41
Моногенные врожденные пороки развития и наследственные заболевания хрусталика	24	35	63
Моногенные врожденные пороки развития и наследственные заболевания сосудистой оболочки глаза	9	14	17
Моногенные врожденные пороки развития и наследственные заболевания зрительного нерва	12	13	15
Моногенные врожденные пороки развития и наследственные сетчатки	29	96	117
Наследственные изолированные глаукомы	10	10	33
Всего	119	207	316

Это приводит к необходимости представления отдельных генетических вариантов врожденного амавроза Лебера в структуре ИПС в качестве самостоятельных нозологических единиц. Для оптимизации диагностики такого рода заболеваний нами разработаны диагностические алгоритмы, позволяющие идентифицировать определенный генетический вариант и спланировать профилактические мероприятия в отягощенных семьях. Более подробно алгоритм диагностики различных клинико-генетических вариантов врожденного амавроза Лебера изложен в справочном разделе ИПС (рис. 2).

Рисунок 2. Алгоритм дифференциальной диагностики врожденного амавроза Лебера.

С другой стороны, в ряде случаев, в качестве единой нозологической единицы описывались заболевания, характеризующиеся выраженной генетической гетерогенностью. Такое изложение связано с четко очерченной клинической картиной этого заболевания и отсутствием специфических дифференциально-диагностических признаков, позволяющих идентифицировать каждый генетический вариант. Так, в структуре класса «Наследственные глаукомы» в качестве единой нозологической единицы представлена «Первичная открытоугольная глаукома взрослых», которая включает 9 генетических вариантов, а в структуре класса «Моногенные врожденные пороки развития и наследственные заболевания хрусталика» врожденная задняя полярная катаракта представлена 3 генетическими вариантами.

В программу также включены некоторые четко распознаваемые при клиническом обследовании нозологические единицы, описанные в единичных семьях, моногенная природа которых окончательно не доказана. При появлении новых данных об их этиопатогенезе, они будут добавлены в структуру клинического портрета, что обеспечивается возможностью постоянного обновления программы.

В связи с постоянным появлением новых данных о клинике и этиологии НБОЗ важным является возможность постоянного обновления ИПС и включения в ее структуру вновь выделенных нозологических единиц.

Структура и принципы формирования каталогов диагностических признаков, включенных в ИПС для НБОЗ.

В соответствии с используемой нами структурой программы важным этапом явилось разработка каталогов клинических, параклинических и молекулярно-генетических признаков, содержащихся в первом блоке программы, необходимых и достаточных для постановки диагноза всех, включенных в программу НБОЗ. Для структурирования древа каталога диагностических признаков были использованы принципы иерархической структуры диагностической системы «Лондонская База Данных». Структура древа клинических признаков была изменена и адаптирована для диагностики офтальмологических заболеваний. Это потребовало введение шести иерархических уровней вместо трех, используемых в «Лондонской Базе Данных». Для оптимизации диагностики наследственных НБОЗ нами был разработан уникальный специализированный перечень диагностических признаков, в который были включены 423 клинических, 122 параклинических, 121 молекулярно-генетический признак, а также 41 признак, отражающий общие характеристики заболевания, такие как возраст манифестации, характер течения и т.д. (табл.3).

Таблица 3. Количество диагностических критериев древа каталога признаков.

Название узла 1-го уровня	Количество диагностических критериев
Клинические признаки	423
Параклинические признаки	122
Общие характеристики заболевания	41
Молекулярно-генетические признаки	121

Созданный нами каталог признаков позволяет в процессе диагностического поиска в качестве диагностического маркера вводить не только отдельные признаки, но и целые рубрикаты иерархических уровней. Такой вариант ввода признаков позволяет не только упростить работу пользователя, но и расширить круг анализируемых форм. Кроме того, такой подход может потребоваться для пользователя с различным уровнем офтальмологической квалификации.

Принципы представления клинического портрета наследственных заболеваний органа зрения.

На основе экспертной оценки и тщательного анализа литературных данных нами предложена унифицированная структура представления клинического портрета нозологической единицы, включающая следующие разделы: традиционное для отечественной офтальмологии обозначение нозологической формы с указанием всех синонимов; динамическое описание фенотипических проявлений; результаты общеклинического и дополнительных методов офтальмологического обследования; и специальные разделы: генетика, этиология, патогенез, профилактика, критерии диагноза (рис. 3).

Рисунок 3. Структура представления клинического портрета нозологической единицы.

Выделение именно этих разделов позволяет наиболее полно описать клинико-генетические характеристики каждой нозологической единицы НБОЗ. Кроме того, структура клинического портрета в виде отдельных разделов-рубрикатов позволяет при появлении новой информации проводить модификацию соответствующих разделов без изменения всего клинического портрета. Следовательно, такое структурированное изложение информационного материала делает систему открытой к модификации и обновлению.

Впервые в структуре программы описание отдельной нозологической единицы проводилось в рамках динамического описания фенотипа, позволяющего проследить особенности клинических проявлений заболевания от его манифестации до терминальных стадий. Такое представление клинического портрета необходимо в связи с возможной модификацией клинических признаков НБОЗ по мере прогрессирования заболевания.

Структура иллюстративного материала ИПС для наследственных заболеваний органа зрения. Учитывая, что почти все наследственные заболевания органа зрения имеют своеобразные, характерные особенности клинических проявлений, выявляемые при офтальмологическом обследовании, важной составляющей клинического портрета является представление иллюстративного материала в виде фотографий внешнего вида пациентов, глазного дна, пораженных структур глаз. Например, в разделе «Клиника» клинического портрета нозологической единицы «Ювенильная Х-сцепленная хориодеремия» представлены фотографии глазного дна больных (рис. 4).

Рисунок 4. Глазное дно при дольчатой хориодеремии.

Другой блок иллюстративного материала был представлен в разделе «Справка» в виде схем строения структур глаза, результатов параклинических исследований, схем патогенеза и алгоритмов дифференциальной диагностики (рис.5).

Рисунок 5. Эмбриональное развитие глаза и экспрессия белков.

Таким образом, структура иллюстративного материала состояла из трех рубрикатов: особенности фенотипических проявлений (раздел «Клиника»), данные параклинических методов обследования, алгоритмы диагностики (раздел «Диагностика») и схемы этиопатогенеза (раздел «Патогенез»). Вышеописанная структура иллюстративного материала используется как в клиническом портрете нозологической единицы, так и в «Справке» по различным подклассам НБОЗ. Такое разделение позволяет точнее акцентировать внимание клинициста на каждом этапе диагностики, от первого осмотра пациента до окончательного этапа постановки диагноза.

Характеристика справочного раздела.

Для придания ИПС обучающей функции в ее структуру были включены справочные разделы, обобщающие информационный материал по классам НБОЗ. Если класс включал большое количество форм, четко выделяемых в несколько подгрупп, то описание каждой из подгрупп проводилось в отдельном справочном разделе.

Информация в справочном материале, посвященном отдельному классу наследственных заболеваний органа зрения, представлена по определенной схеме, сходной с таковой при изложении клинического портрета. Для каждого класса НБОЗ приводились принципы систематики нозологических форм, существующие классификации, клинические признаки, общие диагностические критерии, особенности этиопатогенеза, схемы патогенеза, в ряде случаев - алгоритмы дифференциальной диагностики (рис. 6). Это должно помочь пользователю в диагностике и дифференцировании различных нозологических форм одного класса или группы заболевания.

ВПР - врожденный порок развития, ПВГ - первичная врожденная глаукома, ПИГ - первичная инфантильная глаукома, ПОЮГ - первичная открытоугольная юношеская глаукома, ПОУГ - первичная открытоугольная глаукома взрослых, ГНД - первичная открытоугольная нормотензивная глаукома взрослых

Рисунок 6. Алгоритм дифференциальной диагностики моногенных форм первичных наследственных глауком.

Характеристика вспомогательного модуля принятия решения.

В ряде случаев при осуществлении диагностического поиска пользователю приходится проводить дифференциальную диагностику значительного числа нозологических единиц, имеющих сходные клинические проявления. Анализ получаемого дифференциально-диагностического ряда может быть затруднен как в связи достаточным сходством клинических проявлений, так и с различиями подходов к диагностике заболевания врачом-клиницистом и подачей результатов ИПС в виде списка нозологических единиц. Для упрощения анализа дифференциально-диагностического ряда в некоторых отечественных программах («Нейроген») введен вспомогательный модуль принятия решения («виртуальный советник»), который интегрирован с диагностической системой, и позволяет осуществлять поддержку пользователя в виде диалогов в режиме реального времени. При этом происходит анализ вводимых клинических, параклинических и молекулярно-диагностических признаков и дифференциально-диагностический ряд нозологических единиц, выданный системой. Например, при выдаче системой дифференциально-диагностического рядя нозологических единиц, относящихся к нескольким классам НБОЗ, при запросе виртуального советника, он произведет следующие действия: предложит список вопросов, на которые он может ответить, и при выборе пользователем одного из вопросов выдаст ответ в виде текстовой информации (рис. 7).

Рисунок 7. Вспомогательный модуль принятия решений - «Виртуальный советник».

Таким образом, предложенная нами структура ИПС для НБОЗ предоставляет пользователю следующие возможности:

1) просмотр каталога нозологических единиц;

2) просмотр каталогов клинических, параклинических и молекулярно-генетических признаков; нозологический наследственный зрение

3) просмотр клинического портрета отдельных заболеваний;

4) просмотр диагностических критериев каждого заболевания;

5) просмотр иллюстративного материала по каждому заболеванию;

6) выбор характерных симптомов из каталога признаков и ввод их в диагностическую систему в качестве критериев поиска;

7) поиск предполагаемых диагнозов;

8) анализ дифференциально-диагностического ряда нозологических форм виртуальным советником;

9) изучение справочного материала по отдельным классам заболеваний.

Диагностика заболевания начинается с выбора из каталогов диагностических критериев признаков, выявленных в процессе обследования пациента. По совокупности, введенных пользователем признаков, диагностический модуль проводит поиск нозологических единиц, в базе знаний ИПС. После окончания поиска следующий модуль программы формирует дифференциально-диагностический ряд. Если в дифференциально-диагностическом ряду нозологических единиц находятся заболевания с одинаковыми наборами признаков, то ранжирование этих форм осуществляется в зависимости от частот их встречаемости в популяции. При анализе дифференциально-диагностического ряда, пользователь может также обратиться к помощи виртуального советника или просмотреть описания клинических портретов нозологических единиц, а также справочные разделы. Такая структура системы позволяет не только поставить диагноз нозологической единицы, но и повысить уровень знаний врача посредством его знакомства с данными из справочного материала.

Заключение

Моногенные врожденные пороки развития и заболевания органа зрения составляют значительную часть в структуре всей моногенной патологии человека. Большинство заболеваний этой группы характеризуются тяжелым течением, снижением остроты зрения вплоть до слепоты и имеют высокий риск повторного возникновения в отягощенных семьях. В настоящее время накоплен значительный по объему материал об этиопатогенезе большого числа нозологических форм этой группы заболеваний, позволяющий предотвратить появление повторных случаев заболеваний в отягощенных семьях. Эффективность проведение профилактических мероприятий в значительной степени зависит от точности идентификации генетического варианта с использованием молекулярно-генетических методов.

По нашему мнению, ИПС для НБОЗ ориентированная на отечественного пользователя должна осуществлять две основные функции: диагностическую и информационную (обучающую, справочную). Диагностическая функция обеспечивается включением в структуру программы значительного числа клинических, параклинических и молекулярно-генетических признаков необходимых и достаточных для идентификации каждой отдельной нозологической единицы. Учитывая выраженную перекрываемость симптомов отдельных генетических вариантов, при проведении диагностического поиска неизбежно возникнет необходимость в проведении дифференциальной диагностики в ряду предлагаемых программой нозологических единиц. В связи с этим, диагностическая часть ИПС должна включать не только анализ клинических признаков и выдачу дифференциально-диагностического ряда, но и информационный блок, помогающий в постановке диагноза специалистам с различным уровнем подготовки. Информационная функция программы обеспечивается включением в ее структуру ряда вспомогательных разделов в виде справочного материала, «Виртуального советника» с функцией анализа дифференциально - диагностического ряда в режиме реального времени, и иллюстративного материала. Представление справочного и информационного материала должно основываться на нозологическом принципе, являющемся традиционной основой обучения в клинической медицине. Кроме того, каждый клинический портрет должен быть представлен в двойной форме - в виде динамического описания фенотипа (включая иллюстративный материал) и традиционного перечня основных диагностических признаков.

Использование предложенной нами ИПС для НБОЗ в практической работе врачей офтальмологов и генетиков повысит эффективность медико-генетического консультирования и позволит разработать новые подходы к ранней диагностике, профилактике и диспансерному наблюдению этой группы наследственной патологии.

Выводы

1. Анализ клинико-генетических вариантов моногенных врожденных пороков развития и наследственных заболеваний органа зрения позволил разработать систематику и создать функциональную структуру автоматизированной информационно-поисковой системы для НБОЗ, сочетающую в себе диагностические и обучающие функции и ориентированную на отечественных офтальмологов и генетиков. В структуру ИПС включены 207 нозологических единиц (316 генетических вариантов), представленные в виде восьми классов моногенных заболеваний и врожденных пороков развития отдельных структур глаза: придаточного аппарата глаза, собственно глазного яблока, роговицы, хрусталика, сосудистой оболочки, сетчатки, зрительного нерва, а также наследственные изолированные глаукомы.

2. Обеспечение диагностического поиска в ИПС осуществляется включением в программу 6 основных каталогов: классов заболеваний, подклассов заболеваний, нозологических единиц, клинических симптомов, параклинических признаков и молекулярно-генетических признаков, представленных в составе пяти информационно-диагностических блоков.

3. Созданы словари-классификаторы для 464 клинических, 122 параклинических и 121 молекулярно-генетических признаков, использование которых необходимо и достаточно для диагностического поиска и дифференциальной диагностики включенных в ИПС нозологических единиц моногенных врожденных пороков развития и наследственных заболеваний органа зрения.

4. Разработана универсальная структура представления клинического портрета отдельных нозологических единиц, отражающего динамику формирования фенотипа заболевания. Для диагностики и дифференциальной диагностики отдельных генетических вариантов НБОЗ в его структуру необходимо включить следующие разделы: клинические проявления, результаты общеклинических офтальмологических исследований (визометрия, биомикроскопия, тонометрия, определение цветового зрения), результаты дополнительных офтальмологических исследований (кератометрия, периметрия, УЗИ, электрофизиологические исследования, флуоресцентная ангиография), а также, специализированные разделы (генетика, этиология, патогенез, профилактика, критерии диагноза).

5. Необходимым условием обеспечения обучающей функции программы является введение в ее структуру справочных разделов по отдельным классам и подклассам НБОЗ, иллюстративного материала и вспомогательного модуля приятия решений, использование которых позволит осуществлять диагностику НБОЗ в режиме реального времени пользователям с различным уровнем офтальмологических знаний.

Список публикаций

1. Хлебникова О.В., Дадали Е.Л., Беклемищева Н.А. Принципы систематизации и классификационной структуры периферической формы наследственных дистрофий сетчатки. / IV Съезд Мед. Генетиков, Москва, 2003 // Медицинская генетика - 2003. - т.2.- №10- с.445

2. Беклемищева Н.А., Дадали Е.Л., Хлебникова О.В., Угаров И.В. Информационно-поисковая диагностическая система для наследственных моногенных заболеваний органа зрения. / V Съезд Мед. Генетиков, Уфа, 2005 // Медицинская генетика. - 2005. - т.4. - № 4. - с.157

3. Хлебникова О.В., Дадали Е.Л., Беклемищева Н.А. Роль изучения клинико-генетических корреляций в формировании подходов к диагностике, лечению и профилактике наследственных заболеваний органа зрения. / VIII Съезд офтальмологов России. Москва. 1-4 июня 2005 // Сборник статей VIII Съезд офтальмологов России. - 2005. - с. 442.

4. Беклемищева Н.А., Хлебникова О.В., Дадали Е.Л., Угаров И.В. Основы этиопатогенеза наследственных моногенных болезней сетчатки. // Медицинская генетика.- 2005.- т.4.- № 7.- с.300-306

5. Беклемищева Н.А., Хлебникова О.В., Дадали Е.Л., Угаров И.В. Автоматизированная информационно-поисковая диагностическая система для наследственных болезней органа зрения. / «Актуальные вопросы офтальмогенетики» Научно-практическая конференция, Москва, 2005 // Медицинская генетика. - 2005. - т.4. - № 9. - с.420-424

6. Хлебникова О.В., Дадали Е.Л., Беклемищева Н.А., Поляков А.В. Клинико-диагностические аспекты генетической гетерогенности моногенных заболеваний сетчатки / «Дистрофические заболевания органа зрения», 14 Научный симпозиум «Одесса-Генуя», Одесса, сентябрь 2005 // Сборник статей 14 Научного симпозиума «Одесса-Генуя» - с.135-137

7. Хватова А.В., Хлебникова О.В., Беклемищева Н.А. Клинические особенности и дифференциальная диагностика врожденного амавроза Лебера. // Медицинская технология МЗ, Москва, 2005, С.18

8. Гудзенко С.В., Хлебникова О.В., Беклемищева Н.А., Поляков А.В. ДНК-диагностика наследственных абиотрофий сетчатки, обусловленных мутациями в гене АВСА4. // Медицинская генетика. - 2006. - т.5. - № 9. - c.37-40

9. Хлебникова О.В., Дадали Е.Л., Беклемищева Н.А., Угаров И.В. / «Детская офтальмология, итоги и перспективы». Научно-практическая конференция, Москва, 2006 // Сборник статей «Детская офтальмология, итоги и перспективы». - 2006. - c.295-297

10. Хлебникова О.В., Дадали Е.Л., Беклемищева Н.А., Угаров И.В. Преимущества компьютерной программы Офтальмоген в диагностике наследственных болезней органа зрения / «Ерошевские чтения 2007», Самара, 2007 // Сборник статей «Ерошевские чтения 2007» c. 12-15

11. Хлебникова О.В., Дадали Е.Л., Беклемищева Н.А., Кадышев В.В. Клинико-генетические характеристики врожденных пороков развития органа зрения // Медицинская генетика. - 2008. - № 8. - c.9-24

12. Хлебникова О.В., Беклемищева Н.А., Кадышев В.В. Особенности медико-генетического консультирования семей с катарактами / Материалы научно-практической конференции «Современные проблемы клинической генетики», Москва, 2008 // Медицинская генетика. - 2008. - № 12. - c.39-46

13. Гудзенко С.В., Хлебникова О.В., Беклемищева Н.А., Поляков А.В. Дифференциальная диагностика и молекулярно-генетический анализ Х-сцепленной рецессивной хориоретинальной атрофии // Медицинская генетика. - 2009. - № 2. - c.3-11

14. Хлебникова О.В., Кадышев В.В., Беклемищева Н.А. Наследственные изолированные катаракты: особенности клиники, диагностики и профилактики. // Российская педиатрическая офтальмология. - 2009. - № 1. - c.4-8

15. O.V. Khlebnikova, S.V. Gudzenko, N.A. Beklemitcheva, A.V. Polyakov DNA-diagnostics of choroideremia in Russian family / European Human Genetics Conference 2009, may 23-26 2009, Vena //European J. of Hum.Gen. - 2009. - P.316

16. A.V. Polyakov, O.V. Khlebnikova, S.V. Gudzenko, N.A. Beklemitcheva / European Human Genetics Conference 2009, may 23-26 2009, Vena //European J. of Hum.Gen. - 2009. - P.341

Список сокращений

НБОЗ - наследственные болезни органа зрения

ИПС - информационно-поисковая система

ВАЛ - Врожденный амавроз Лебера

ВПР- врожденный порок развития

ПВГ - первичная врожденная глаукома

ПИГ - первичная инфантильная глаукома

ПОЮГ - первичная открытоугольная юношеская глаукома

ПОУГ - первичная открытоугольная глаукома взрослых

ГНД - первичная открытоугольная нормотензивная глаукома взрослых

Размещено на Allbest.ru

...