Главная Коллекция "Revolution" Медицина Особенности спектра патогенных генетических вариантов гена CFTR у больных муковисцидозом из Российской Федерации

Особенности спектра патогенных генетических вариантов гена CFTR у больных муковисцидозом из Российской Федерации

Описание заболевания муковисцидоз. Анализ результатов генотипирования больных из РФ, включавшего определение патогенных генетических вариантов, секвенирование кодирующей последовательности и поиск генных перестроек гена CFTR. Клиническое течение болезни.

Рубрика Медицина
Вид статья
Язык русский
Дата добавления 14.05.2021
Размер файла 42,9 K
рефераты на заказ со скидкой

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

Размещено на http://www.allbest.ru/

Особенности спектра патогенных генетических вариантов гена CFTR у больных муковисцидозом из Российской Федерации

Н.В. Петрова, Е.И. Кондратьева, А.В. Поляков, Р.А. Зинченко, Е.К. Гинтер, Медико-генетический научный центр

Цель исследования. Изучить особенности и разнообразие спектра патогенных генетических вариантов гена СГТК (АВСС7) у российских пациентов с МВ, представленных в Регистре больных муковисцидозом (МВ) Российской Федерации (РФ) 2017г.

Материал и методы. Проанализированы результаты генотипирования, включавшего анализ частых патогенных генетических вариантов, секвенирование кодирующей последовательности, поиск генных перестроек гена СБТЯ, 3096 больных из 81 региона-субъекта Российской Федерации, представленных в Регистре больных МВ в РФ 2017 г.

Результаты. Выявлено 196 патогенных генетических вариантов гена СГТК. Суммарная доля 11 генетических вариантов с.1521_1523(е1СТТ (Б508(Ы), с.54-5940_273+10250ае121кЬ (СБТЯае1е2,3), с.274С>А (Е92К), с.20Ше1Т (2143ае1Т), с.3718-2477С>Т (3849+10кЬС->Т), с.3846С>А (Ш1282Х), с.2052_20531шА (2184шбА), с.1545_1546(е1ТА (1677(е1ТА), с.3909С>С (Ш303К), с.1624С>Т (С542Х), с.413_4ШирТАС (Шйш) составляет 75,6 %. 102 редких вариантов обнаружены однократно, 29 - дважды. Как в спектре, так и по частоте у пациентов в РФ преобладают варианты, приводящие к серьезным нарушениям функции белка СБТК (I, II, III классы). 44 генетических варианта не внесены в базы СБТЮ и СБТК2.

Заключение. На основании данных Регистра 2017 года определены спектр и относительные частоты патогенных вариантов последовательности гена СПК у российских больных МВ; описано их распределение в зависимости от класса и типа. Выявлены генетические варианты, ранее не описанные в базах СБТШ и СБТК2. Полученные результаты могут использоваться для оптимизации генетического консультирования и клинической работы с семьями, отягощенными МВ, а также для дальнейших исследований патогенетической значимости ранее не описанных генетических вариантов гена СЕГЕ. Ключевые слова: муковисцидоз, ген СГТК, спектр патогенных генетических вариантов, российская популяция.

Features of spectrum of pathogenic genetic variants of the cftr gene in patients with cystic fibrosis from the russian federation

N.V. Petrova, E.I. Kondratyeva, A.V. Polyakov, R.A. Zinchenko, E.K. Ginter, Research Center for Medical Genetics

The aim of the research is to study features and diversity of spectrum of pathogenic genetic variants of CFTR gene (ABCC7) in Russian patients with CF presented in the Registry of patients with cystic fibrosis (CF) from the Russian Federation (RF) for 2017.

Material and methods. The following data has been analysed: results of genotyping, including the analysis of frequent pathogenic genetic variants; sequencing of coding order; search for gene rearrangements of CFTR gene; 3096 patients from 81 regions of the Russian Federation represented in the Register of CF patients in the Russian Federation for 2017.

Results. 196 pathogenic genetic variants of CFTR gene were identified. The total share of 11 genetic variants c.1521_1523delCTT (F508del), c.54-5940_273 + 10250del21kb (CFTRdele2,3), c.274G> A (E92K), c.2012delT (2143delT), c.3718-2477C> T (3849 + 10kbC-> T), c.3846G> A (W1282X), c.2052_2053insA (2184insA), c.1545_1546delTA (1677delTA), c.3909C> G (N1303K), c.1624G> T (G542X), c. 413_415dupTAC (L138ins) is 75.6%. 102 rare variants were found once, 29 - twice. In patients from the Russian Federation, both in spectrum and in frequency, variants, leading to serious dysfunction of the CFTR protein function (classes I, II, III) prevail. 44 genetic variants are not included in the CFTR1 and CFTR2 databases.

Conclusion. Spectrum and relative frequencies of pathogenic variants of CFTR gene sequence in Russian CF patients were determined on the basis of Register data for 2017; their distribution depending on class and type was described. Genetic variants that were not previously described in CFTR1 and CFTR2 bases have been identified. The obtained results can be used to optimize genetic consultations and clinical work with families burdened with CF, as well as for further research on pathogenetic significance of genetic variants of CFTR gene that were not previously described.

Key words: cystic fibrosis, CFTR gene, spectrum of pathogenic genetic variants, Russian population.

Введение

Муковисцидоз (МВ) - частое моногенное заболевание, обусловленное патогенными генетическими вариантами гена СВТЯ (АВСС7). Ген СВТЯ содержит 27 экзонов и расположен в регионе 31.1 длинного плеча 7-й хромосомы ^31.1). МВ характеризуется широкой вариабельностью клинических проявлений, в наибольшей степени являющихся следствием многообразия генетических вариантов гена СВТЯ [1]. На сегодняшний день описано более 2200 вариантов последовательности гена СВТВ, как патогенных, так и с неясной клинической значимостью, а также не имеющих клинических последствий [2, 3]. Спектр и частота вариантов последовательности гена СВТЯ значительно различаются в разных странах и этнических группах, что предполагает определенные трудности для разработки региональных протоколов молекулярной диагностики и внедрения достижений таргетной терапии при лечении больных МВ [4].

Значительные достижения в развитии методов и технологий молекулярно-генетического тестирования позволяют в большинстве случаев успешно осуществлять молекулярно-генетическую диагностику МВ. Наибольшую трудность представляет оценка функциональной значимости редких и ранее не идентифицированных генетических вариантов [1].

По состоянию на 31 августа 2018 года на веб-сайте международного проекта СБТБ.2 [2] представлено 334 патогенных вариантов гена СГТБ.. Они приводят к нарушению синтеза белка СБТЯ, транспорта его к апикальной мембране клетки или нарушают его функцию в качестве канала анионов хлора, снижая стабильность или количество молекул белка. В зависимости от влияния на функцию белка СБТБ. мутации подразделяют на 6 основных классов [5]. В ряде случаях класс генетических вариантов не определен. Генетические варианты I, II и III классов приводят к полному или почти полному прекращению функции хлорного канала, и относятся к «тяжелым», тогда как при вариантах УБ классов сохраняется остаточная функция хлорного канала, что позволяет их объединить в группу «мягких» вариантов. «Тяжесть» генетического варианта определяет степень нарушения внешнесекреторной функции поджелудочной железы. «Мягкие» варианты доминируют над «тяжелыми» в отношении панкреатического фенотипа [5].

Целью настоящего исследования является изучение особенностей и разнообразия спектра патогенных генетических вариантов гена СГТЯ у российских пациентов с МВ, внесенных в Регистр больных МВ в РФ 2017 г.

Материал и методы

Материалом исследования являлись данные Регистра больных МВ в РФ 2017 года. В Регистр включены данные о 3096 больных из 81 региона-субъекта Российской Федерации: 3047 живых и 49 умерших. Материалом исследования являлась ДНК больных МВ. Проект Регистр больных муковисцидозом Российской Федерации одобрен Комитетом по Этике ФГБНУ «МГНЦ» 20 декабря 2012 года (председатель Этического комитета - проф. Л. Ф. Курило) и пациенты с муковисцидозом и/или их представители подписывали информированное согласие.

Молекулярно-генетическое тестирование проведено согласно алгоритму консенсуса «Муковисцидоз: определение, диагностические критерии, терапия», раздел «Генетика муковисцидоза. Молекулярно-генетическая диагностика при муковисцидозе» [6]. При генетическом исследовании частых генетических вариантов гена СГТЯ использовалась методика мультиплексной амплификации для выявления ин- серционно/делеционных вариантов, для регистрации точковых нуклеотидных замен - метод аллель-спец- ифичного лигирования с последующей амплификацией или метод рестрикционного анализа. Части больных проведено исследование нуклеотидной последовательности кодирующей области гена CFTR методом прямого автоматического секвенирования по Сенгеру на приборе фирмы Applied Biosystems согласно протоколу фирмы-производителя, либо методом параллельного массового секвенирования (NGS) с последующим подтверждением выявленных изменений секвенированием по Сенгеру. Анализ протяженных перестроек гена CFTR проводили методом количественной MLPA (мультиплексной лигазо-зави- симой амплификации проб).

Оценку патогенности генетических вариантов гена CFTR проводили согласно руководству по интерпретации данных генетических вариантов [7, 8].

Результаты и обсуждение

В Регистре 2017 г. приведены сведения о 3096 больных МВ из РФ. Средний возраст - 12,1±9,4 лет. Средний возраст установления диагноза - 3,1±6,1 года. 47,8% пациентов диагноз установлен в результате неонатального скрининга на МВ.

Молекулярно-генетическое исследование проведено 92,4 % больным. Общая доля идентифицированных мутантных аллелей составила 88,3 %. Оба патогенных аллеля были определены у 80,2 % больных, которым проводилось генетическое исследование, один - у 16,1 %, у 3,7 % больных оба мутантных аллеля не идентифицированы.

Всего выявлено 196 патогенных генетических вариантов гена CFTR. Помимо частых выявлено значительное количество редких вариантов: 102 обнаружены однократно, 29 - дважды в выборке исследованных пациентов. Относительные частоты генетических вариантов гена CFTR среди больных МВ в порядке убывания представлены в таблице 1.

Таблица 1. Патогенные генетические варианты гена CFTR у больных муковисцидозом из РФ

№

Название по cDNA

Название по положению в белке

Традиционное название

Класс

Характер нарушения функции белка

Классификация в базе CFTR2 [9]

Частота (%)

1

c.1521_1523delCTT

p.Phe508del

F508del

II

тяжелый

патогенный

52,8

2

c.54-5940_273+ 10250del21kb

p.Ser18ArgfsX16

CFTRdele2,3

I

тяжелый

патогенный

6,2

3

c.274G>A

p.Glu92Lys

E92K

IV(?)

мягкий

патогенный

3,0

4

c.2012delT

p.Leu671X

2143delT

I

тяжелый

патогенный

2,1

5

c.3718-2477C>T

нет

3849+10kbC->T

V

мягкий

патогенный

2,0

6

c.3846G>A

р.Тгр1282Х

W1282X

I

тяжелый

патогенный

1,9

7

c.2052_2053insA

p.Gln685ThrfsX4

2184insA

I

тяжелый

патогенный

1,8

8

c.1545_1546delTA

р.Туг515Х

1677delTA

I

тяжелый

патогенный

1,8

9

c.3909C>G

p.Asn1303Lys

N1303K

II

тяжелый

патогенный

1,5

10

c.1624G>T

p.Gly542X

G542X

I

тяжелый

патогенный

1,3

11

c.413_415dupTAC

p.Leu138dup

L138ins

IV

мягкий

патогенный

1,2

12

c.262_263delTT

p.Leu88IlefsX22

394delTT

I

тяжелый

патогенный

0,9

13

c.1000C>T

р.Агд334Тгр

R334W

IV

мягкий

патогенный

0,8

14

c.3844T>C

р.Тгр1282Агд

W1282R

II

тяжелый

не описан

0,6

15

c.1397C>G

р^ег466Х

S466X

I

тяжелый

патогенный

0,5

16

c.2657+5G>A

нет

2789+5G>A

V

мягкий

патогенный

0,5

17

c.3587C>G

p.Ser1196X

S1196X

I

тяжелый

патогенный

0,5

18

c.3691delT

p.Ser1231ProfsX4

3821delT

I

тяжелый

патогенный

0,5

19

c.1240_1244delCAAAA

p.Asn415X

1367del5

I

тяжелый

не описан

0,3

20

c.3140-16T>A

нет

3272-16T>A#

V

мягкий

не описан

0,3

21

c.3196C>T

p.Arg1066Cys

R1066C

II

тяжелый

патогенный

0,3

22

c.3816_3817delGT

p.Ser1273LeufsX28

3944delGT

I

тяжелый

не описан

0,3

23

c.3929G>A

р.Тгр1310Х

W1310X

I

тяжелый

не описан

0,2

24

c.2353C>T

р.Агд785Х

R785X

I

тяжелый

патогенный

0,2

25

c.1657C>T

р.Агд553Х

R553X

I

тяжелый

патогенный

0,2

26

c.3484C>T

р.Агд1162Х

R1162X

I

тяжелый

патогенный

0,2

27

c.4004T>C

p.Leu1335Pro

L1335P

IV

мягкий

патогенный

0,2

28

c.489+1G>T

нет

621+1G->T

I

тяжелый

патогенный

0,2

29

c.580-1G>T

нет

712-1G->T

I

тяжелый

патогенный

0,2

30

c.1766+1G>A

нет

1898+1G->A

I

тяжелый

патогенный

0,1

31

c.3883delA

p.Ile1295PhefsX33

4015delA

I

тяжелый

патогенный

0,1

32

c.(743+1_744-1)_ (1584+1_1585-1)dup

нет

CFTRdup6b-10A

I

тяжелый

патогенный

0,1

33

c.1766+1G>C

нет

1898+1G->C

I

тяжелый

патогенный

0,1

34

c.3476C>T

p.Ser1159Phe

S1159F

неизвестно

мягкий

патогенный

0,1

35

c.3717G>A

р.Агд1239Агд

3849G->A

неизвестно

мягкий

патогенный

0,1

36

c.1040G>C

р.Агд347Рго

R347P

IV

мягкий

патогенный

0,1

37

c.252T>A#

р.Туг84Х

I

тяжелый

не описан

0,1

38

c.254G>A

p.Gly85Glu

G85E

II

тяжелый

патогенный

0,1

39

c.2834C>T

p.Ser945Leu

S945L

IV

мягкийй

патогенный

0,1

40

c.3454G>C

р^р1152Н^

D1152H

IV

мягкий

варьирующие клинические проявления

0,1

41

c.3472C>T

р.Агд1158Х

R1158X

I

тяжелый

патогенный

0,1

42

c.349C>T

p.Arg117Cys

R117C

IV

мягкий

патогенный

0,1

43

c.3528delC

p.Lys1177SerfsX15

3659delC

I

тяжелый

патогенный

0,1

44

c.1766+2T>C

нет

c.1766+2T>C

I

тяжелый

не описан

0,1

45

c.1116+1G>A

нет

1248+1G->A

I

тяжелый

патогенный

0,1

46

c.2374C>T

р.Агд792Х

R792X

I

тяжелый

патогенный

0,1

47

c.287C>A

p.Ala96Glu

A96E

неизвестно

мягкий

не описан

0,1

48

c.3475T>C

p.Ser1159Pro

S1159P

неизвестно

мягкий

патогенный

0,1

49

c.3889dupT

p.Ser1297PhefsX5

4016insT

I

тяжелый

патогенный

0,1

50

c.4251delA

p.Glu1418ArgfsX14

4382delA

VI

мягкий

патогенный

0,1

51

c.4364C>G

p.Ser1455Ter

S1455X

VI

мягкий

патогенный

0,1

52

c.(743+1_744-1)_ (1116+1_1117-1)dup

нет

CFTRdup6b,7*

I

тяжелый

патогенный

0,1

53

c.1584+1G>A

нет

1716+1G->A

I

тяжелый

патогенный

0,1

54

c.1585-1G>A

нет

1717-1G->A

I

тяжелый

патогенный

0,1

55

c.1705T>C

р.Туг569Н^

Y569H

неизвестно

мягкий

не описан

0,1

56

c.1735G>T

p.Asp579Tyr

D579Y

неизвестно

тяжелый

не описан

0,1

57

c.223C>T

p.Arg75X

R75X

I

тяжелый

патогенный

0,1

58

c.1127_1128insA

p.Gln378AlafsX4

1259insA

I

тяжелый

патогенный

0,1

59

c.293A>G

p.Gln98Arg

Q98R

неизвестно

мягкий

патогенный

0,1

60

c.3107C>A#

p.Thr1036Asn

неизвестно

мягкий

не описан

0,1

61

c.328G>C

p.Asp110His

D110H

неизвестно

мягкий

патогенный

0,1

62

c.3535_3536insTCAA

p.Thr1179IlefsX17

3667ins4

I

тяжелый

патогенный

0,1

63

c.43delC

p.Leu15PhefsX10

175delC

I

тяжелый

патогенный

0,1

64

c.442delA

p.Ile148LeufsX5

574delA

I

тяжелый

патогенный

0,1

65

c.472dupA

p.Ser158LysfsX5

604insA

I

тяжелый

не описан

0,1

66

c.(273+1_274-1)_ (1679+1_1680-1)del

нет

CFTRdele4-10A

I

тяжелый

патогенный

0,04

67

c.1083G>A#

p.Trp361X

I

тяжелый

не описан

0,04

68

c.1209G>C

p.Glu403Asp

E403D

неизвестно

тяжелый

не описан

0,04

69

c.1219delG#

p.Glu407AsnfsX35

I

тяжелый

не описан

0,04

70

c.1262delC#

p.Thr421IlefsX21

I

тяжелый

не описан

0,04

71

c.1652G>A

p.Gly551Asp

G551D

III

тяжелый

патогенный

0,04

72

c.174_177delTAGA

p.Asp58GlufsX32

I

тяжелый

патогенный

0,04

73

c.1911delG

p.Gln637HisfsX26

2043delG

I

тяжелый

не описан

0,04

74

c.2051_2052delAAinsG

p.Lys684SerfsX38

2183AA->G

I

тяжелый

патогенный

0,04

75

c.2052delA

p.Lys684AsnfsX38

2184delA

I

тяжелый

патогенный

0,04

76

c.2128A>T

p.Lys710X

K710X

I

тяжелый

патогенный

0,04

77

c.2589_2599delAATTTGGTGCT

p.Ile864SerfsX28

2721del11

I

тяжелый

патогенный

0,04

78

c.2988+1G>A

нет

3120+1G->A

I

тяжелый

патогенный

0,04

79

c.3140-26A>G

нет

3272-26A->G

V

мягкий

патогенный

0,04

80

c.3209G>A

p.Arg1070Gln

R1070Q

IV

мягкий

варьирующие клинические проявления

0,04

81

c.3274T>C

p.Tyr1092His

Y1092H

неизвестно

неизвестно

не описан

0,04

82

c.3325delA#

p.Ile1109SerfsX12

I

тяжелый

не описан

0,04

83

c.350G>A

p.Arg117His

R117H

IV

мягкий

варьирующие клинические проявления

0,04

84

c.422C>A

p.Ala141Asp

A141D

неизвестно

мягкий

патогенный

0,04

85

c.4296_4297insGA

p.Ser1435GlyfsX14

4428insGA

VI

мягкий

патогенный

0,04

86

c.53+1G>T

нет

185+1G->T

I

тяжелый

патогенный

0,04

87

c.550delC

p.Leu184PhefsX5

681delC

I

тяжелый

не описан

0,04

88

c.869+2T->G#

нет

I

тяжелый

не описан

0,04

89

c.1086T>G; c.1086T>A

p.Tyr362X

Y362X

I

тяжелый

не описан

0,04

90

c.2978A>C#

p.Asp993Ala

неизвестно

мягкий

не описан

0,04

91

c.831G>A#

p.Trp277X

I

тяжелый

не описан

0,04

92

c.1525G>C#

p.Gly509Arg

неизвестно

неизвестно

не описан

0,04

93

c.580G>A#

p.Gly194Arg

G194R

неизвестно

неизвестно

не описан

0,04

94

c.(?-1)_(1584+ 1_1585-1)del#

нет

CFTRdele1-10A

I

тяжелый

патогенный

0,04

95

c.(53+1_54-1)_(164+1_165-1)del

нет

CFTRdele2A

I

тяжелый

патогенный

96

c.[1075C>A;1079C>A]

p.[Gln359Lys;Thr360Lys]

Q359K/T360K

неизвестно

тяжелый

патогенный

97

c.[1210-12[5];1210-34TG[12]]

нет e

5T;TG12

V

мягкий

варьирующие клинические проявления

98

c.1040G>A

p.Arg347His

R347H

IV

мягкий

патогенный

99

c.115C>T

p.Gln39X

Q39X

I

тяжелый

патогенный

100

c.1163C>T

p.Thr388Met

T388M

неизвестно

мягкий

не описан

101

c.1202G>A или c.1203G>A*

p.Trp401X

W401X

I

тяжелый

патогенный

102

c.1210-12[5]

нет

5T

V

мягкий

варьирующие клинические проявления

103

c.1364C>A

p.Ala455Glu

A455E

V

мягкий

патогенный

104

c.1382G>A#

p.Gly461Glu

G461E

III

неизвестно

не описан

105

c.1393-1G>A

нет

1525-1G->A

I

тяжелый

патогенный

106

c.1438G>A

p.Gly480Ser

G480S

неизвестно

неизвестно

не описан

107

c.1478A>G

p.Gln493Arg

Q493R

неизвестно

неизвестно

не описан

108

c.1487G>A

p.Trp496X

W496X

I

тяжелый

патогенный

109

c.1517T>C

p.Ile506Thr

I506T

II

тяжелый#

не описан

110

c.164+1G>T

нет

296+1G->T

I

тяжелый

патогенный

111

c.1646G>A

p.Ser549Asn

S549N

III

тяжелый

патогенный

112

c.1680-1G>C#

нет

I

тяжелый

не описан

113

c.1704G>T

p.Leu568Phe

L568F

неизвестно

тяжелый

не описан

114

c.1705T>G

p.Tyr569Asp

Y569D

III

неизвестно

патогенный

115

c.1714G>A

p.Asp572Asn

D572N

неизвестно

тяжелый

не описан

116

c.1792A>T

p.Lys598X

K598X

I

тяжелый

не описан

117

c.1795_1796insAAA#

p.Lys598dup

K598ins

неизвестно

неизвестно

не описан

118

c.1811C>T

p.Thr604Ile

T604I*

неизвестно

тяжелый

не описан

119

c.1986_1989delAACT

p.Thr663ArgfsX8

2118del4

I

тяжелый

патогенный

120

c.2053_2054insC

p.Gln685ProfsX84

2185insC

I

тяжелый

патогенный

121

c.2125C>T

p.Arg709X

R709X

I

тяжелый

патогенный

122

c.2491G>T

p.Glu831X

E831X

неизвестно

тяжелый

патогенный

123

c.2551C>T

p.Arg851X

R851X

I

тяжелый

патогенный

124

c.2645G>A

p.Trp882X

W882X

I

тяжелый

патогенный

125

c.2658-2A>G

нет

2790-2A->G

I

тяжелый

не описан

126

c.274-1G>A

нет

406-1G->A

I

тяжелый

патогенный

127

c.274G>T

p.Glu92X

E92X

I

тяжелый

патогенный

128

c.275A>C#

p.Glu92Ala

неизвестно

тяжелый

патогенный

129

c.2909G>A

p.Gly970Asp

G970D

неизвестно

неизвестно

патогенный

130

c.3095A>G

p.Tyr1032Cys

Y1032C

неизвестно

мягкий

варьирующие клинические проявления

131

c.3140-11A>G

нет

3272-11A->G

V

мягкий

не описан

132

c.3197G>A

p.Arg1066His

R1066H

неизвестно

неизвестно

патогенный

133

c.3208C>T

p.Arg1070Trp

R1070W

IV

неизвестно

варьирующие

клинические

проявления

134

c.3229_3230delCT

p.Leu1077ValfsX78

3359delCT

I

тяжелый

не описан

135

c.3304A>T

p.Arg1102X

R1102X

I

тяжелый

патогенный

136

c.3310G>T

p.Glu1104X

E1104X

I

тяжелый

патогенный

137

c.3659delC

p.Thr1220LysfsX8

3791delC

I

тяжелый

патогенный

138

c.3746G>A

p.Gly1249Glu

G1249E

неизвестно

неизвестно

не описан

139

c.3763T>C

p.Ser1255Pro

S1255P

III

тяжелый

патогенный

140

c.3873+1G>T

нет

4005+1G>T

I

тяжелый

не описан

141

c.3893delG#

p.Gly1298GlufsX30

I

тяжелый

не описан

142

c.3963+1G>T

нет

4095+1G->T

I

тяжелый

не описан

143

c.3983T>A#

p.Ile1328Lys

неизвестно

неизвестно

не описан

144

c.409_412delCTCC

p.Leu137TyrfsX15

541del4

I

тяжелый

не описан

145

c.4234C>T

p.Gln1412X

Q1412X

неизвестно

тяжелый

патогенный

146

c.4242+1G>A

нет

4374+1G->A

I

тяжелый

патогенный

147

c.4426C>T

p.Gln1476X

Q1476X

VI

мягкий

не описан

148

c.494delT

p.Leu165X

624delT

I

тяжелый

не описан

149

c.531delT

p.Ile177MetfsX12

663delT

I

тяжелый

патогенный

150

c.532G>A

p.Gly178Arg

G178R

III

тяжелый

патогенный

151

c.55T>G#

p.Trp19Gly

W19G

неизвестно

мягкий

не описан

152

c.613C>T

p.Pro205Ser

P205S

неизвестно

мягкий

патогенный

153

c.79G>T

p.Gly27X

G27X

I

тяжелый

патогенный

154

c.868C>T

p.Gln290X

Q290X

I

тяжелый

не описан

155

c.948delT

p.Phe316LeufsX12

1078delT

I

тяжелый

патогенный

156

c.264_268delATATT

p.Leu88PhefsX21

I

тяжелый

не описан

157

c.3874-2A>G#

нет

I

тяжелый

не описан

158

c.(1679-1 1680+1) (2490+1 2491-1) del((2908+1_2989-1)del] #

нет

CFTRdele12,13; del16A

I

тяжелый

патогенный

159

c.2417A>G

p.Asp806Gly

D806G

неизвестно

неизвестно

не описан

160

c.1210-34T>G#

нет

неизвестно

мягкий

не описан

161

c.1513A>C#

p.Asn505His

неизвестно

неизвестно

не описан

162

c.2435T>A#

p.Leu812X

I

тяжелый

не описан

163

c.3112C>T#

p.Gln1038X

I

тяжелый

не описан

164

c.3232T>A

p.Phe1078Ile

неизвестно

неизвестно

не описан

165

c.451delC#

p.Gln151ArgfsX2

I

тяжелый

не описан

166

c.71_72delinsA#

p.Leu24X

I

тяжелый

не описан

167

c.(2908+1_2909-1)_ (3367+1_3368+1)del#

нет

CFTRdele16-17BA

I

тяжелый

патогенный

168

c.(2988+1_2989-1)_ (3717+1_3718+1)del#

нет

CFTRdele17a-19A

I

тяжелый

патогенный

169

c.3189G>A

p.Trp1063X

W1063X

I

тяжелый

не описан

170

c.1708_1712delTTATT#

p.Leu570ArgfsX17

I

тяжелый

не описан

171

c.353delC#

p.Ser118LeufsX6

I

тяжелый

не описан

172

c.3927_3938delGTGGAGTGATCA#

p.Trp1310_Gln1313del

I

тяжелый

не описан

173

c.4404A>C

p.Lys1468Asn

неизвестно

мягкий

не описан

174

c.2619+1G>A#

нет

I

тяжелый

не описан

175

c.3908delA

p.Asn1303ThrfsX25

4040delA

I

тяжелый

патогенный

176

c.613C>A#

p.Pro205Thr

неизвестно

мягкий

не описан

177

c.1175T>G

p.Val392Gly

V392G

неизвестно

мягкий

не описан

178

c.1528delG

p.Val510PhefsX17

1660delG

I

тяжелый

не описан

179

c.1526G>T#

p.Gly509Val

неизвестно

неизвестно

не описан

180

c.1608delA#

p.Asp537ThrfsX3

неизвестно

тяжелый

не описан

181

c.653T>A

p.Leu218X

L218X

I

тяжелый

не описан

182

c.697C>T

p.Leu233Phe

L233F

неизвестно

неизвестно

не описан

183

c.1679+1634A>G

нет

1811+1,6kbA->G

V

мягкий

не описан

184

c.1580dupA#

p.Glu528ArgfsX40

I

тяжелый

не описан

185

c.1742T>G#

p.Leu581X

I

тяжелый

не описан

186

c.458G>T#

p.Arg153Ile

неизвестно

неизвестно

не описан

187

c.743+2T>A#

нет

c.743+2T>A

неизвестно

тяжелый

не описан

188

c.(868+1_870-1)_ (1116+1_1117-1)del#

нет

CFTRdele7A

I

тяжелый

патогенный

189

c.2963C>G

p.Pro988Arg

неизвестно

мягкий

не описан

190

c.(273-1 274+1) (869+1 870-1)del (1209- 1 1210+1) (1392+1 1393+1)del#

нет

CFTRdel4-7;del9-10A

I

тяжелый

патогенный

191

c.4298A>G#

p.Glu1433Gly

неизвестно

мягкий

не описан

192

c.2493delG#

p.Glu831AspfsX13

I

тяжелый

не описан

193

c.1679+2T>C

нет

I

тяжелый

не описан

194

c.3857T>C

p.Phe1205Ser

F1286S

неизвестно

мягкий

не описан

195

c.(53+1_54-1)_ (1116+1_1117-1)del#

нет

CFTRdele2-7A

I

тяжелый

патогенный

196

c.-593A>G

нет

-461A->G

неизвестно

неизвестно

не описан

Примечание: # - генетические варианты гена CFTR, не зарегистрированные в базах CFTR1 [2] и/или CFTR2 [9]; л - нумерация экзонов согласно традиционной номенклатуре.

Среди 196 выявленных генетических вариантов гена CFTR преобладют миссенс-мутации - 32,14 %, значительную долю составляют делеции/инсерции со сдвигом рамки считывания - 20,41 %; нонсенс-мутации - 21,94 % и нарушение сплайсинга - 16,84 %; Деле- ции/инсерции без сдвига рамки считывания (2,04 %) и промоторные мутации (0,5 %) - относительно редки (табл. 2). Обширные перестройки (CVS) составляют 6,12 %. Следует отметить, что по сравнению с мировыми данными, представленными в проекте CFTR1 [2], разнообразие миссенс-мутаций у российских больных существенно ниже, а нонсенс-мутаций и обширных перестроек - выше, чем в общемировой выборке (табл. 2).

Таблица 2. Распределение генетических вариантов гена CFTR по типу у больных муковисцидозом из РФ в сравнении с мировыми данными (CFTR1)

Тип мутации

Кол-во, n (РФ)

доля, %

Кол-во, n (CFTR1) [2]

доля, % (CFTR1) [2]

Делеции/инсерции без сдвига рамки считывания

4

2,04

42

2,58

Делеции/инсерции со сдвигом рамки считывания

40

20,41

319

19,62

Миссенс

63

32,14

798

49,08

Нарушение сплайсинга

33

16,84

228

14,02

Подобные документы

  • Роль медсестры в лечении больных туберкулезом в сочетании с ВИЧ-инфекцией

    Клиническое течение туберкулеза при ВИЧ-инфицировании. Лечение больных туберкулезом в сочетании с вирусом иммунодефицита человека антимикобактериальными препаратами в субмаксимальных дозах. Особенности сестринского ухода при лечении больных туберкулезом.

    реферат [445,9 K], добавлен 25.03.2017

  • Особенности лечения ишемической болезни сердца у больных хроническими обструктивными заболеваниями легких

    В условиях возрастающего темпа жизни, увеличения частоты патогенных стрессов, неблагоприятной экологической ситуации, клиническая медицина все чаще сталкивается с проблемой роста ишемической болезни сердца и хронических неспецифических заболеваний легких.

    реферат [11,9 K], добавлен 03.11.2005

  • Туберкулема легкого

    Морфологические особенности и классификация туберкулем легкого. Изменения в окружающей легочной ткани. Клиническое течение болезни. Варианты регрессирующего течения туберкулем. Дифференциальная диагностика заболевания. Лечение больных туберкулемами.

    презентация [1,5 M], добавлен 18.03.2012

  • Нейгородегенеративные изменения коры при болезни Альцгеймера

    Пресенильная и сенильная формы болезни Альцгеймера. Клинические симптомы заболевания. Носительство патологического гена и риск развития БА. Ее основные гистологические признаки. Описание механизма нарушения метаболизма предшественника амилоидного белка.

    реферат [558,8 K], добавлен 26.11.2014

  • Муковисцидоз и его лечение

    Наследование муковисцидоза по аутосомно-рецессивному типу. Мутация гена трансмембранного регулятора муковисцидоза. Основные формы муковисцидоза. Уровень иммунореактивного трипсина в сухом пятне крови. Организации диспансерного наблюдения за больными.

    реферат [258,2 K], добавлен 20.12.2016

  • Роль медсестры в лечении больных туберкулезом в сочетании с ВИЧ-инфекцией

    Клиническая картина, течение туберкулеза у больных, его диагностика у ВИЧ-положительных пациентов. Мероприятия для выделения лиц с высоким риском заболевания туберкулёзом на фоне ВИЧ-инфекции. Роль медицинской сестры в лечении больных туберкулезом легких.

    реферат [162,1 K], добавлен 26.06.2017

  • Нарушение познавательных функций у детей, больных эпилепсией

    Общие представления об эпилепсии: описание болезни в медицине, особенности личности больного. Нейропсихология детского возраста. Когнитивные нарушения у детей, больных эпилепсией. Нарушение опосредствованной памяти и мотивационного компонента у больных.

    курсовая работа [40,1 K], добавлен 13.07.2012

  • Полиморфизм гена эндотелиальной NO-синтазы (eNOS) у детей с отягощенным семейным анамнезом по сердечно-сосудистой патологии

    Общая характеристика гена eNOS. Анализ наследственной отягощенности у детей в группе риска по ожирению, по сахарному диабету тип 2 (СД2) и по сердечно-сосудистой патологии. Проведение ПЦР для 4a4b полиморфизма гена эндотелиальной NO-синтазы (eNOS).

    курсовая работа [317,8 K], добавлен 06.07.2011

  • Роль фельдшера в организации и проведении диагностических, лечебных и профилактических мероприятий по борьбе с гипертонической болезнью

    Понятие и причины развития гипертонической болезни. Классификация и клиническая картина проявления гипертонической болезни. Факторы риска у пациентов. Диагностика больных с гипертонической болезнью. Анализ и оценка результатов исследования больных.

    курсовая работа [391,5 K], добавлен 22.04.2016

  • Анализ медико-социальных проблем больных наркоманией

    Определение понятия и раскрытие содержания наркотической зависимости как социально-опасной болезни. Выявление проявлений и оценка синдромов наркотической болезни. Исследование социальных и медицинских признаков больных наркоманией и их профилактики.

    реферат [19,1 K], добавлен 29.09.2011

  • Генные и хромосомные заболевания

    Обзор группы заболеваний, возникающих в результате повреждения ДНК на уровне гена. Болезни нарушения обмена соединительной ткани. Наследственные болезни пуринового и пиримидинового обмена. Клиническая картина и диагностика синдромов Клайнфелтера, Дауна.

    презентация [4,6 M], добавлен 21.10.2014

  • Ишемическая болезнь сердца. Стенокардия (Stenocardia)

    Классификация ишемической болезни сердца. Препараты, применяемые для купирования острого приступа стенокардии. Клиническое течение стенокардии. Клиника приступа стенокардии, оценка тяжести состояния больных, определение прогноза и назначение лечения.

    реферат [183,0 K], добавлен 02.09.2010

  • Личностные особенности больных гипертонической болезнью

    Психологические аспекты, понятие, факторы и причины развития, классификация и клиническая картина проявления гипертонической болезни. Особенности больных, реакция личности на болезнь. Основные принципы психокоррекции личности при гипертонической болезни.

    дипломная работа [144,6 K], добавлен 12.08.2010

  • Генитальный эндометриоз

    Исследование классификации, этиологии, основных симптомов и клинических проявлений эндометриоза. Изучение вариантов локализации гинекологического заболевания. Диагностика генитального эндометриоза. Стандарты лечения больных с эндометриоидной болезнью.

    презентация [175,0 K], добавлен 28.05.2014

  • Совершенствование процесса восстановления речевой функции у больных с афазией в резидуальном периоде заболевания

    Характеристика направлений и методов коррекционно-восстановительной работы по преодолению афазии у больных с последствиями очаговых поражений головного мозга. Применение вспомогательных компьютерных технологий в процессе комплексной реабилитации больных.

    дипломная работа [3,1 M], добавлен 30.10.2017

  • Болезнь Гентингтона

    Заболевание нервной системы. Сочетание прогрессирующего хореического гиперкинеза и психических расстройств. Первое описание симптомов болезни Гентингтона. Генетическое картирование (определение местонахождения) гена, ответственного за хорею Гентингтона.

    презентация [2,3 M], добавлен 15.02.2017

  • Особенности восстановительного процесса в послеоперационный период у пациентов с различными типами восприятия своей болезни

    Типы восприятия своей болезни у послеоперационных больных и взаимосвязь отношения пациента к болезни с особенностями процесса выздоровления. Рекомендации по ускорению процесса выздоровления прооперированных больных с учетом их психологического настроя.

    дипломная работа [143,1 K], добавлен 16.12.2010

  • Влияние травматической болезни в офтальмологии на психоэмоциональное состояние больных и возможности его коррекции средним медицинским персоналом

    Понятие о травме и травматической болезни. Психологическое реагирование на заболевание, типы отношения к болезни. Оценка психологического статуса больных с травмой органа зрения. Роль среднего медицинского персонала в психокоррекционных мероприятиях.

    дипломная работа [190,4 K], добавлен 15.02.2012

  • Гистиоцитоз Лангерганса

    Описание гистиоцитоза из клеток Лангерганса как заболевания, его эпидемиология и классификация, этиология и патогенез. Клиническое течение болезни. Симптомы и основные методы его диагностики. Особенности и основные препараты для лечения патологии.

    презентация [188,9 K], добавлен 07.01.2015

  • Причины заболевания, лечение и профилактика холеры

    Холера как острое заболевание, возникающее в результате бурного размножения в просвете тонкой кишки холерного вибриона. Патогенез, симптомы и течение болезни. Клиническое течение, лечение и неотложная помощь. Профилактика и предупреждение болезни.

    реферат [20,8 K], добавлен 23.01.2011

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.

© 2000 — 2023, ООО «Олбест» Все права защищены