Этнические различия в распределении частот генотипов по полиморфным маркерам, ассоциированным с получением стойкого вирусологического ответа при фармакотерапии гепатита С
Оценка распределения частот однонуклеотидных полиморфизмов по маркерам rs12979860 rs8099917 гена ИЛ-28В в бурятской и европеоидной этнических популяциях. Перспективы использования результатов исследования в аспекте фармакотерапии вирусного гепатита С.
| Рубрика | Медицина |
| Вид | статья |
| Язык | русский |
| Дата добавления | 17.04.2022 |
| Размер файла | 102,2 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
Размещено на http://www.allbest.ru/
Бурятский государственный университет имени Доржи Банзарова
Этнические различия в распределении частот генотипов по полиморфным маркерам, ассоциированным с получением стойкого вирусологического ответа при фармакотерапии гепатита С
Тыхеева Наталья Алексеевна,
доцент кафедры фармакологии, клинической фармакологии с курсом биохимии
Етобаева Инна Георгиевна,
доцент кафедры фармакологии, клинической фармакологии с курсом биохимии
Роднаева Ольга Анатольевна,
доцент кафедры фармакологии, клинической фармакологии с курсом биохимии
Капустина Юлия Алексеевна,
старший преподаватель кафедры фармакологии, клинической фармакологии с курсом биохимии
Аннотация
В работе представлены результаты распределения частот однонуклеотидных полиморфизмов по маркерам rs12979860 rs8099917 гена ИЛ-28В в бурятской и европеоидной этнических популяциях. Проведен сравнительный анализ полученных данных с показателями в известных популяциях и рассмотрены перспективы использования результатов исследования в аспекте фармакотерапии вирусного гепатита С.
Ключевые слова: гепатит С; ген ИЛ-28В; противовирусная терапия; популяция; пангенотипные препараты.
Abstract
Ethnic differences in the distribution of frequencies of genotypes by polymorphic markers associated with receiving resistant virological response in case of hepatitis C pharmacotherapy
Natalia A. Tyheeva
Associate Professor of the Department of Pharmacology, Clinical Pharmacology with the Course of biochemistry,
Inna G. Etobaeva
Associate Professor of the Department of Pharmacology, Clinical Pharmacology with the course of Biochemistry,
Olga A. Rodnaeva
Associate Professor of the Department of Pharmacology, Clinical Pharmacology with the Course of Biochemistry,
Yulia A. Kapustina
Senior Lecturer of the Department of Pharmacology, Clinical Pharmacology with the Course of Biochemistry,
The article presents results of frequency distribution of single nucleotide polymorphisms by markers rs12979860 rs8099917 of the IL-28B gene in Buryat and Caucasoid ethnic populations. A comparative analysis of the obtained data with indicators in known populations was carried out and the prospects of using the results of the study in the aspect of pharmacotherapy of hepatitis C were examined.
Keywords: hepatitis C, the gene IL-28B, antiviral therapy.
Введение
Согласно данным ВОЗ на 2018 г. хронической инфекцией гепатита С страдает 71 миллион человек, ежегодно регистрируется 3-4 млн новых случаев заражения [10]. Больных с хроническим гепатитом С рассматривают как группу риска развития цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы, характеризующейся низкими (менее 5%) показателями 5-летней выживаемости. В настоящее время эффективной вакцины против гепатита С не существует, а, следовательно, актуальными являются своевременная современная диагностика и своевременная противовирусная терапия (ПВТ), позволяющая достигнуть устойчивый вирусологический ответ (УВО).
Обновленное руководство ВОЗ 2018 г. рекомендует проводить терапию на основе пангенотипных препаратов прямого противовирусного действия (ПППД). ПППД позволяют излечивать большинство ВГС-инфицированных [12].
Назначение противовирусного лечения зависит от ряда факторов, наиболее значащими из которых являются генетические аспекты. Определение генотипа вируса и генотипирование пациента является основой персонализированной медицины, необходимой для индивидуального подбора противовирусных препаратов, планирования длительности лечения, прогнозирования эффективности, а также расчета дозы противовирусных препаратов.
Так, если планируется противовирусная терапия, в состав которой входят препараты интерферона альфа (ИФН-б) (двойная и тройная с использованием ингибиторов протеазы), целесообразно проводить генотипирование пациента по совокупности аллельных вариантов однонуклеотидных полиморфизмов rs12979860 и rs8099917 в гене ИЛ-28В [12]. Генотип СС в позиции rs12979860 характеризует быстрое развитие УВО у больных европеоидной расы в сравнении с генотипами СТ и ТТ (69%, 33% и 27% соответственно) [4]. У пациентов с генотипом ТТ полинуклеотидной последовательности rs8099917 эффект от проводимой ПВТ был выше по сравнению с генотипами GT и GG. В случае генотипов GT и GG наблюдалось отсутствие ответа на ПВТ у 82% и 100% пациентов [9].
Целью исследования являлось определение частоты встречаемости полиморфизмов гена ИЛ-28В в европейской и бурятской этнических группах.
Материалы и методы
В исследование включено 88 пациентов с ХГС (у всех до начала лечения выявлена РНК ВГС в крови методом ПЦР) среди них 52 женщины и 36 мужчин.
Национальность: европеоиды - 58, буряты - 30.
У всех пациентов, включенных в исследование, проводилось определение полиморфизма rs12979860 (генотипы человека СС, СТ или ТТ) и rs8099917 (генотипы человека ТТ, ТG или GG) гена ИЛ-28В с помощью метода ПЦР.
Статистическую обработку данных производили используя критерий X2 Пирсона, непараметрический метод, который позволяет оценить статистическую значимость различий двух или нескольких относительных показателей. При р>0,05 различия считали статистически незначимыми. Статистически значимыми считали различия при р<0,05.
Основная часть
Исследуемые популяции были прогенотипированы по полиморфным маркерам rsl2979860 (генотипы человека СС, СТ или ТТ) и rs8099917 (генотипы человека TT, TG или GG) гена ИЛ-28В. В результате были получены распределения генотипов в исследуемых группах участников исследования, значения статистически обработаны.
Значение критерия х2 составляет 13.397.
Критическое значение X2 ПРИ уровне значимости р=0.01 составляет 9.21. Связь с полученными данными статистически значима при уровне значимости р<0.01.
Уровень значимости р=0.002.
Распределение частоты генотипов по полиморфному маркеру rsl2979860 в процентном соотношении представлено на рисунке 1.
Частота встречаемости полиморфных вариантов генов ИЛ-28В rsl2979860 и rs8099917 в исследуемых популяциях в сравнении с литературными данными представлена в таблице 1.
Рис. 1
однонуклеотидный полиморфизм маркер гепатит
Распределение частоты генотипов по полиморфному маркеру rs8099917 в процентном соотношении представлено на рис. 2.
Рис. 2
Таблица 1
|
№ |
Популяция |
rs12979860 |
rs8099917 |
|||||
|
СС, % |
СТ, % |
ТТ, % |
ТТ, % |
Т^ % |
GG, % |
|||
|
1 |
Исследуемая группа (европеоиды) |
37,9 |
51,6 |
10,2 |
64,0 |
29,2 |
6,8 |
|
|
2 |
Исследуемая группа (буряты) |
73,3 |
19,9 |
6,8 |
93,3 |
6,7 |
0 |
|
|
3 |
Европеоиды [2] |
36.9 |
51,7 |
11,4 |
59,7 |
35,2 |
5,1 |
|
|
4 |
Монголоиды [5] |
89,6 |
91.7 |
|||||
|
5. |
Население Якутии [8] |
72,2 |
27,8 |
0% |
61,1 |
23,2 |
15,7 |
Частота встречаемости благоприятных вариантов по гену ИЛ-28В rs12979860 СС и СТ составила 37,9% и 51,6% в европеоидной популяции и 73,3% и 19,9% в бурятской популяции соответственно. Частота встречаемости неблагоприятного варианта ТТ в данных популяциях составила 10,2% и 6,8%. Результаты по исследуемой европеоидной популяции не имеют значимых различий с ранее опубликованными данными по европеоидной популяции в России [2], значения частоты встречаемости различных аллелей в бурятской этнической группе имеют определенные различия в сравнении с монголоидами (представителями Монголии) и представителями Якутии [5, 8].
Частота встречаемости аллелей генов rs12979860 и rs8099917 в исследуемых популяциях в сравнении с данными NCBI представлена в таблице 2.
Таблица 2
|
№ |
Популяция |
Частота встречаемости аллелей rs12979860 |
Частота встречаемости аллелей rs8099917 |
|||
|
C |
T |
Т |
G |
|||
|
1 |
Исследуемая группа (европеоиды) |
0,637 |
0,363 |
0,786 |
0,214 |
|
|
2 |
Исследуемая группа (буряты) |
0,833 |
0,167 |
0, 967 |
0,033 |
|
|
Частота встречаемости аллелей по данным NCBI |
||||||
|
3 |
Глобальная |
0,644 |
0,356 |
0,869 |
0,131 |
|
|
4 |
Европа |
0,691 |
0.309 |
0,832 |
0,168 |
|
|
5 |
Эстония |
- |
- |
0,795 |
0,205 |
|
|
6 |
Восточная Азия |
0.92 |
0,08 |
0,924 |
0,076 |
|
|
7 |
Вьетнам |
- |
- |
0.92 |
0.08 |
В сравнении с данными NCBI по встречаемости аллелей генов rs12979860 и rs8099917 в исследуемой европеоидной этнической группе частота встречаемости по Т аллелю гена ИЛ-28В rs8099917 наиболее близка к показателям Эстонии и отличается от таковых в Европе, в бурятской этнической группе значения частот статистически значимо не различаются с представителями Восточной Азии и Вьетнама по варианту гена rs8099917, но обнаружены различия по варианту гена rs12979860.
Так как на этапе планирования ПВТ предсказательное значение полиморфизма гена ИЛ-28В в достижении УВО выше предсказательной силы уровня вирусной нагрузки, стадии фиброза, возраста и пола пациента, предпочтительно включение данного теста в план обследования пациентов перед назначением ПВТ при генотипе 1 ВГС [12]. Кроме того, результат анализа в гене ИЛ-28В полезен в отборе пациентов для назначения двойной схемы ПВТ с включением Пе - гИФН и РБВ или тройной схемы с включением одного из ингибиторов протеазы [10]. Благоприятные генотипы СС и СТ (полиморфизм rs12979860), а также ТТ и ТG (полиморфизм rs8099917) достаточно широко распространены в России среди больных ХГС, при этом частота встречаемости в азиатской популяции, в том числе и бурятской, значимо выше, чем в европеоидной. Это дает основание рассматривать изменение схемы лечения и длительности ПВТ вирусного гепатита С стандартным ИФН-б и РБВ у пациентов с 1 генотипом ВГС при условии отсутствия факторов, определяющих снижение эффективности ПВТ.
Литература
1. Алгоритмы диагностики и лечения в гепатологии / В.Т. Ивашкин и др. М.: МЕДпресс-информ, 2016. 163 с.
2. Возможности персонифицированного подхода к лечению гепатита С на основании разработанных генетических тестов определения варианта полиморфизма гена ИЛ - 28B / А.Н. Козина и др. // Лечащий врач. 2011. С. 39-43.
3. Влияние генетических полиморфизмов гена IL-28B на эффективность противовирусной терапии хронического гепатита С стандартным интерфероном / А.В. Лапшин и др. // Рос. журн. гастроэнтерол., гепатол., колопроктол. 2013. Т. 23. №1. С. 23.
4. Лечение больных хроническим гепатитом С препаратом цепегинтерферон альфа - 2b в сочетании с рибавирином (итоговые результаты рандомизированного сравнительного клинического исследования) / М.В. Маевская и др. // РЖГГК. 2014. №2. С. 53-64.
5. Клинические особенности и эффективность противовирусной терапии хронического вирусного гепатита С у представителей европеоидной и монголоидной рас / С.И. Малов и др. // Казанский медицинский журнал. 2015. Т. 96, №1. С. 27-32.
6. Эффективность и безопасность применения цепегинтерферона альфа-2Ь в составе двойной схемы (цепегинтерферон альфа-2Ь и рибавирин) противовирусной терапии у пациентов с хроническим гепатитом С, генотипами 2 и 3: опыт реальной клинической практики / А.И. Павлов и др. // Журнал инфектологии. 2016. Т. 8 (3). С. 92-99.
7. Реброва О.Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета прикладных программ STATISTICA. М.: МедиаСфера, 2002. 312 с.
8. Частота встречаемости полиморфных вариантов гена il28b и генотипов вируса гепатита С у населения Якутии: клинические исходы / С.И. Семенов и др. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017. №2. С. 86-92.
9. Определение варианта полиморфизма гена интерлейкина 28В как предиктора эффективности противовирусной терапии хронического гепатита С / В.Х. Фалызов и др. // Вестник современной клинической медицины. 2013. Т. 3. Вып.4. С. 30-33.
10. Clinical Practice Guidelines: Management of hepatitis C virus infection. J Hepatol (2013).
11. Genetic factors and hepatitis virus infection / A.J. Tomson // Gastroenterology. 2012. Vol. 142. P. 1335-1339.
12. URL: https://rsls.ru/ru/for-specialists/recommendations/20-recomend-3
13. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.goV/snp/rs12979860#frequency_tab
14. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs8099917
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Географическое распределение генотипов вируса гепатита В. Мутантные формы вируса. Методы современной диагностики инфекции. Выявление клинико-биохимических, иммунологических особенностей хронического вирусного гепатита В у детей с различными генотипами.
магистерская работа [121,5 K], добавлен 31.07.2015Этиология, патогенез и клинические проявления вирусного гепатита А. Основные механизмы и пути передачи гепатита. Лабораторные признаки вирусного гепатита А. Основные клиническое проявления вирусного гепатита В. Профилактика и лечение гепатитов.
презентация [1,7 M], добавлен 26.10.2017Анализ ассоциаций генотипов и аллелей исследованных полиморфизмов с гестозом в популяциях русских и якутов. Оценка ассоциации tagSNPs генов LEP и ACVR2A с развитием клинических форм гесоза в русской и якутской популяциях. Анализ частот гаплотипов.
дипломная работа [2,4 M], добавлен 11.02.2017Инфекционное заболевание печени. Пути передачи вирусного гепатита В. Технология производства и особенности введения вакцин. Экстренная профилактика острого гепатита с желтухой, бессимптомного вирусоносительства до острой печеночной недостаточности.
презентация [271,1 K], добавлен 23.10.2014Понятие и причины гепатита С как наиболее тяжелой формы вирусного гепатита, которую называют еще посттрансфузионным гепатитом, морфология и этиология вируса-возбудителя, его патогенез и этапы развития заболевания. Диагностика и лечение гепатита С.
реферат [27,3 K], добавлен 19.04.2014Современное лечение хронических гепатитов и циррозов печени. Использование различных схем при лечении хронического гепатита (на примере клиник г. Подольска). Динамика показателей активности аминотрансфераз в разных группах больных до и после лечения.
курсовая работа [41,0 K], добавлен 28.09.2015История открытия вирусного гепатита. Резистентность к физическим и химическим факторам. Культивирование и механизм передачи возбудителя. Патогенез, диагностика, методы лечения и профилактики гепатита. Характерные особенности вируса гепатита В, С, Д, Е.
курсовая работа [51,0 K], добавлен 24.06.2011Эпидемиология гепатита А (болезни Боткина), В (сывороточного гепатита), D (дельта-инфекции), С ("ни А ни В" гепатита). Новые вирусы гепатита. Источники инфекций и механизмы заражения. Микробиологическая диагностика, лечение и профилактика гепатита.
презентация [6,8 M], добавлен 23.09.2013Эпидемиология и маркеры вирусного гепатита В, С и кори. Использование тест системы для выявления антител и антигенов. Установление причины развития хронической формы инфекции, выявление особенностей иммунного ответа. Проведение лабораторной диагностики.
дипломная работа [148,4 K], добавлен 10.11.2015Описания воспалительного заболевания печени, возбудителем которого является вирус гепатита C. Исследование источников вируса, инкубационного периода. Клинические особенности гепатита. Лабораторная диагностика. Лечение и профилактика вирусных гепатитов.
презентация [61,8 K], добавлен 19.11.2014Вирусные гепатиты и их возбудители. Функции печени и их недостаточность при гепатитах: белково-синтетическая, пигментный обмен, параметры состояния. Классификация вирусных гепатитов: А, С, D, E, F и G. Характеристика вирусного гепатита В, его отличия.
курсовая работа [84,0 K], добавлен 09.12.2011Проблема вирусного гепатита C, ее актуальность для Абхазии. Строение и свойства вируса, его жизненный цикл. Источник возбудителя и заражения. Условия вирусного гепатита С. Иммунная система микроорганизма. Клиническая картина хронического заболевания.
курсовая работа [1,5 M], добавлен 03.05.2013Вирусные гепатиты (острые и хронические), механизмы и пути их передачи. Возбудители основных форм вирусного гепатита: этиология, клинические признаки и течение болезни. Интерпретация диагностических данных при выявлении маркеров вирусных гепатитов.
реферат [49,2 K], добавлен 18.11.2010Понятие и общая характеристика гепатита А как инфекционного вирусного заболевания, его клинические проявления и симптомы, пути заражения. Методика диагностирования и принципы составления схемы лечения гепатита А. Оценка необходимости вакцинации.
презентация [1,3 M], добавлен 14.03.2017Определение вирусного гепатита. Его возбудитель. Источник инфекции и механизм ее передачи. Распространенность заболевания в популяции. Роль половых контактов в передаче вируса. Клиническое течение и симптомы развивающегося гепатита. Диагностика и лечение.
презентация [2,1 M], добавлен 26.10.2014Исследование особенностей вирусного инфекционного воспалительного заболевания печени. Характеристика признаков, основных симптомов и форм гепатита. Инкубационный период и пути заражения вирусом гепатита. Профилактика вирусных инфекционных заболеваний.
презентация [715,7 K], добавлен 04.12.2014Этиология, эпидемиология, патогенез и источник инфекции гепатита А. Особенности лечения больного. Дифференциальная диагностика вирусного гепатита с лептоспирозом и псевдотуберкулезом. Исследование органов дыхания, кровообращения и пищеварения больного.
история болезни [26,6 K], добавлен 24.09.2012Жировая дистрофия печени. Хронический гепатит. Серологические маркёры вирусного гепатита в разные фазы. Инструментальная диагностика хронического гепатита. Дифференциальный диагноз с циррозом. Дисфункция желчного пузыря. Острый и хронический холангит.
реферат [26,9 K], добавлен 10.01.2009Гепатит C как инфекционное заболевание печени, вызываемое вирусом гепатита С. Особенности заражения, распространения и течение начальной стадии болезни. Симптомы желтушного и безжелтушного периода гепатита С. Группа риска, методы лечения и профилактики.
презентация [56,8 K], добавлен 03.04.2014Изучение особенностей распространения вируса гепатита В, его устойчивости во внешней среде. Исследование механизма развития инфекции, обусловленной вирусом гепатита. Характеристика общих симптомов заболевания, методов профилактики и защиты от вируса.
презентация [1022,5 K], добавлен 22.05.2012
