Топологическое (QSPR) моделирование физических свойств полимерных систем посредством оптимальных дескрипторов

Разработка топологического QSPR моделирования для прогнозирования физических свойств полимеров на основе анализа информации об их структуре с использованием оптимальных дескрипторов. Применение методики расчетов для моделирования параметра Флори-Хаггинса.

Рубрика Физика и энергетика
Вид автореферат
Язык русский
Дата добавления 24.05.2018
Размер файла 138,9 K

Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже

Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.

Дескриптор

rобуч.

rконтр.

DSM(0EC, 1)

0.825

0.783

DSM(1EC, 1)

0.849

0.837

DSM(2EC, 1)

0.863

0.890

DSM(3EC, 1)

0.866

0.864

DSM(0EC, 2)

0.933

0.883

DSM(1EC, 2)

0.940

0.881

DSM(2EC, 2)

0.988

0.985

DSM(3EC, 2)

0.989

0.965

Модель ч12 рассчитывается как:

(10)

n = 52, r = 0.9879, S = 0.121, F = 2021 (обучающая выборка)

n = 53, r = 0.9850, S = 0.123, F = 1666 (контрольная выборка)

Рис. 3. Зависимость рассчитанных значений DSM(2EC, 2) от экспериментальных значений параметра Флори-Хаггинса для обучающей выборки

Рис. 4. Зависимость рассчитанных значений DSM(2EC, 2) от экспериментальных значений параметра Флори-Хаггинса для контрольной выборки

В данной работе проведена оптимизация молекулярного дескриптора DSM(2EC, 2) который показал хорошую корреляцию между химической структурой систем полимер-растворитель и параметром Флори-Хаггинса. Хотя данный дескриптор показал надежные результаты в моделировании параметра Флори-Хаггинса, нами были поставлены опыты в моделировании нижней критической температуры смешения (НКТС) ряда систем синтетический полимер-растворитель. Существуют три группы методов для предсказания НКТС. Первая группа использует модели, которые базируются на чисто теоретических расчетах, используя экспериментальные данные систем жидкость - жидкость или пар - жидкость. Эти методы основаны на экспериментальных данных, для установки корреляций свойства с неизвестными параметрами, в результате они ограничиваются прогнозирующей способностью. Другое приближение использует эмпирические уравнения, которые устанавливают корреляцию НКТС с физико-химическими свойствами, такими как плотность, критические свойства и т.д., но неудобно в том, что эти свойства не всегда определяемы. Предложенный нами подход использует линейные модели для предсказания НКТС с использованием оптимальных дескрипторов, значения которых зависят только от структур молекул растворителя и полимера. Однако о применимости данного подхода можно судить по прогностической способности полученной в ходе расчетов модели.

Моделирование нижней критической температуры смешения систем полимер-растворитель. Устойчивость системы (фазовое равновесие), как правило, определяется степенью термодинамического сродства компонентов, зависит от их химического состава и строения, внешних условий, в частности, от температуры. Фазовое расслоение в полимерной смеси может наступать и с повышением и с понижением температуры. Возможны случаи, когда с возрастанием температуры взаимная растворимость компонентов сначала увеличивается, а затем снова уменьшается. Например, на диаграммах состояния растворов полимеров наблюдается наряду с верхней критической температурой смешения (ВКТС), представляющей собой максимум на кривой, еще и нижняя критическая температура смешения (НКТС) - в минимуме.

В области между ВКТС и НКТС компоненты раствора смешиваются полностью. Взаимное расположение критических температур от характера сил (дисперсионные, полярные и т.д.), действующих между полимером и растворителем; растворимость полимера в одном растворителе с увеличением температуры может повышаться, а в другом снижаться. Поэтому, компьютерный прогноз данной характеристики имеет важное значение для определения устойчивости полимерных растворов.

В настоящей работе поставлены компьютерные эксперименты для получения моделей величин НКТС систем полимер-растворитель на основе оптимизации корреляционных весов локальных инвариантов графов. Была использована база данных из 82 систем, состоящих из 8 полимеров и 47 низкомолекулярных растворителей. Экспериментальные данные были взяты из литературы (Melagraki G., Afantitis A., Sarimveis H., Koutentis P. A., Markopoulos J., Igglessi-Markopoulou O. A novel QSPR model for predicting и (lower critical solution temperature) in polymer solutions using molecular descriptors // J. Mol. Model. - 2007. - Vol. 13. - P. 55-64).

Результаты проведенных компьютерных экспериментов представлены в таблицах 8 и 9. По данным таблиц видно, видно, что наилучшие статистические характеристики при использовании дескриптора для контрольной выборки равно 0,8863, а для дескриптора - 0,6544. Использование дескриптора для построения модели «структура-величина НКТС» показало наиболее лучшую корреляцию предсказанных величин свойств систем контрольной выборки с экспериментальными данными (r=0,8863). Однако при сравнении характеристик моделей, с рассчитанными значениями НКТС, взятых из литературы, показали лучшие (r=0,9497) результаты по сравнению с данными, полученными в ходе собственных расчетов.

Таблица 8. Статистические характеристики модели НКТС, полученные с использованием дескриптора

ЛИ

Обучающая выборка

Контрольная выборка

r

S, oK

F

r

S, oK

F

EC0

0.8131

37.205

90

0.7596

37.04

44

EC1

0.9381

22.132

338

0.8465

28.971

81

EC2

0.9742

14.411

858

0.8863

26.03

117

EC3

0.9815

12.248

1206

0.8472

30.904

81

Таблица 9. Статистические характеристики модели НКТС, полученные с использованием дескриптора

ЛИ

Обучающая выборка

Контрольная выборка

r

S, oK

F

r

S, oK

F

EC0

0.7876

39.382

75

0.5477

46.317

14

EC1

0.8724

31.235

14

0.4811

51.058

10

EC2

0.9596

17.988

535

0.5885

52.151

17

EC3

0.9652

16.712

627

0.6544

61.391

24

Для получения QSPR моделей в литературном источнике использовали программу ChemSar входящую в программный пакет ChemOffice. В качестве дескрипторов описывающих структуру полимера были отобраны следующие дескрипторы: HOMO energy, ShpC, dipole length (DPLL), radius (Rad). Всеобъемлющее описание молекулярной структуры с помощью какого-либо одного дескриптора практически невозможно. Один дескриптор может учесть преимущественно одну особенность электронной или пространственной структуры, либо один вид межмолекулярных взаимодействий. По этой причине описание молекулярной структуры несколькими дескрипторами и построение моделей «структура-свойство», основанных на нескольких независимых переменных, представляется разумным. Простота алгоритма расчета дескрипторов использованных нами, основанного на ОКВЛИ, не требующего длительного машинного времени и большой мощности, представляется перспективным.

Конформационные характеристики полимерных цепей обычно определяются в разбавленных растворах полимеров. Основные типы измерений проводимых в растворах это - измерение вязкости, светорассеяние, рентгеновское рассеяние под малым углом и осмотическое давление. Согласно Бицерано, конформационные характеристики играют ключевую роль в определении свойств растворов полимеров, как в их синтезе (т.е. полимеризация), так и в обработке (отливание пленок из растворов).

Рис. 5. Зависимость экспериментальных от рассчитанных с использованием дескриптора значений НКТС, oК

В частности, характеристическая вязкость [з] полимерных растворов - мера объема, связанного данной массой полимера при разбавлении, в термодинамическом равновесии. Далее, для получения моделей с прогнозирующей способностью, применили ОКВЛИ и сравнили два метода в оценке характеристической вязкости.

Моделирование характеристической вязкости систем полимер-растворитель. Ван Кревелен оценивал различные уравнения для расчета вязкости растворов и вывел следующее эмпирическое уравнение (11) для оценки характеристической вязкости, когда экспериментальные данные не могут быть получены в и условиях:

(11)

В данном уравнении Mcr - критический молекулярный вес, Mv (Mv=2.5х105), - средневязкостная молекулярная масса, К - молярная функция неподвижности, M - молекулярный вес повторяющегося звена повторения, и параметр б определяемый из следующего уравнения:

для abs ?3

для abs >3

где параметр растворимости (д) это

Используя уравнение (11) Ван Кревелен рассчитал характеристическую вязкость для 65 систем полимер-растворитель, с коэффициентом корреляции r2=0.324. Однако, после удаления из систем 7 растворителей, которые могли образовывать водородные связи с полимерами в растворе, соответствующий расчет дал более высокий коэффициент корреляции (r2=0.483). Данное уравнение довольно хорошо работает, в тех случаях, когда полимер имеет тенденцию к высокой кристалличности в объеме. Как недостаток, эти наблюдения были отмечены также Бицерано.

В данной работе предпринята попытка использования ОКВЛИ для построения моделей «структура-свойство» ряда систем полимер-растворитель. Экспериментальные значения характеристической вязкости были взяты из литературы. Как и для моделирования значений НКТР были апробированы 2 дескриптора (4 и 6). Результаты апробаций и полученных в результате статистических характеристик компьютерных моделей характеристической вязкости показаны в таблицах 10 и 11.

Таблица 10 Статистические характеристики модели характеристической вязкости [з], полученные с использованием дескриптора (4)

ЛИ

Обучающая выборка

Контрольная выборка

r

r2

S, дл/г

F

r

r2

S, дл/г

F

EC0

0.6652

0.4424

26.292

21

0.6960

0.4844

19.3295

11

EC1

0.8210

0.6740

20.105

56

0.7085

0.5019

26.0264

12

EC2

0.9001

0.8102

15.34

115

0.5649

0.3191

61.033

6

EC3

0.9589

0.9194

11.515

308

0.7034

0.4947

24.3582

12

Таблица 11. Статистические характеристики модели характеристической вязкости [з], полученные с использованием дескриптора (6)

ЛИ

Обучающая выборка

Контрольная выборка

r

r2

S, дл/г

F

r

r2

S, дл/г

F

EC0

0.6793

0.4614

25.841

23

0.7505

0.5632

199.902

15

EC1

0.6890

0.4747

25.5214

24

0.7672

0.5886

30.1303

17

EC2

0.9088

0.8259

14.6919

128

0.5606

0.3142

62.4552

5

EC3

0.9651

0.9314

9.2223

367

0.6675

0.4455

39.2781

10

Как видно по данным таблиц наилучшие статистические характеристики получены с использованием дескриптора (6), однако при получении моделей НКТР наиболее подходящим был дескриптор (4), что подтверждено расчетом. Далее сравнили подход, разработанный и предложенный нами, с результатами расчетов значений характеристической вязкости по уравнению (11). Проведя расчет коэффициента корреляции для структур, входящих в контрольную выборку, для полученной модели коэффициент корреляции составляет - 0,7672, а для тех же систем по данным работы последний составляет - 0,4061, что заметно хуже модели, полученной с использованием дескриптора (6), на основе ОКВЛИ (табл. 11).

Из данной работы, очевидно, что в настоящее время существует несколько методов выявления связи между строением веществ и их физико-химическими параметрами. Однако, учитывая распространенность в природе и в технологических процессах различных многокомпонентных полимерных смесей, информация о количественной связи «структура-свойство/активность» применительно к многокомпонентным полимерным системам может иметь, по-крайней мере, не меньшее число приложений использования оптимизации корреляционных весов локальных инвариантов графов, чем к однокомпонентным. Апробированный в данной работе подход, в сущности, есть предложение рассматривать смеси полимер-растворитель как пару молекулярных графов, представляющих структуру смеси, аналогично тому, как принято рассматривать структуры органических соединений в виде одного молекулярного графа. Это дает возможность использовать линейный регрессионный анализ, многократно проверенный и давший многочисленные конструктивные результаты для выборок индивидуальных веществ, как инструмент выявления количественных соотношений «структура-свойство» для упомянутых бинарных систем.

Заключение

1. Разработана новая методика для проведения исследований «структура-свойство» на основе оптимальных дескрипторов, рассчитываемых при помощи индексов связности и кодов ближайшего соседства для однокомпонентных систем.

2. Проведено компьютерное моделирование температуры стеклования для полиариленоксидов по предлагаемой методике. На основе статистических данных анализа результатов показано, что модель описывает температуру стеклования полиариленоксидов удовлетворительно с коэффициентом корреляции r=0,9288.

3. Проведено компьютерное моделирование температуры плавления олигофениленов по предложенной методике. На основе статистических данных результатов показано, что модель описывает температуру плавления олигофениленов хорошо с коэффициентом корреляции r=0,9884.

4. Проведено компьютерное моделирование коэффициента распределения октанол-вода с помощью двух локальных инвариантов - расширенной связности и кодов ближайшего соседства, и на основе анализа результатов оптимизации показано, что модель с использованием кодов ближайшего соседства отлично описывает параметр гидрофобности органических соединений с наилучшими статистическими характеристиками (r=0,9966).

5. Разработан подход к моделированию свойств для двухкомпонентных систем, основанный на оптимизации бинарных дескрипторов двух видов для системы мономер и растворитель. В результате моделирования по данному подходу параметра Флори-Хаггинса для 60 систем полимер-растворитель показано, что корреляционная зависимость на основе предлагаемого автором бинарного дескриптора с использованием расширенного индекса первого порядка дает наилучшие статистические характеристики с коэффициентом корреляции r=0,9958.

6. Компьютерный эксперимент по выявлению корреляционной зависимости нижней критической температуры смешения (НКТС) для 82 систем, состоящих из 8 полимеров и 47 низкомолекулярных растворителей, на основе предлагаемого подхода показал, что оптимальные дескрипторы описывают НКТС указанных систем неудовлетворительно с коэффициентов корреляции r=0,8863, что связано со спецификой взаимодействия в исследованных системах полимер-растворитель.

7. Компьютерный эксперимент по выявлению корреляционной зависимости характеристической вязкости для ряда систем полимер-растворитель на основе предлагаемого подхода с использованием двух видов оптимальных дескрипторов показал, что оптимальные дескрипторы описывают характеристическую вязкость указанных систем с коэффициентов корреляции r=0,7672, что заметно лучше, чем результаты, полученные другими авторами. Полученные модели различных характеристик полимерных систем могут быть использованы для предсказания свойств широкого ряда одно- и двухкомпонентных систем полимер-растворитель, расчетным путем, что делает необязательным проведение сложных и дорогостоящих, а иногда просто технически трудоемких экспериментов.

Список опубликованных работ

1. Торопов А.А., Нургалиев И.Н., Воропаева Н.Л., Рубан И.Н., Рашидова С.Ш. QSPR моделирование свойств двухкомпонентных систем полимер-растворитель // "Полимеры-2002": Тез.докл. Респ. конф. -Ташкент, 2002. -С.43.

2. Toropov A.A., Nurgaliev I.N., Voropaeva N.L., Ruban I.N., Rashidova S.Sh. QSPR modeling of Flory-Huggins parameter based on weighting of paths of length two // "Полимеры-2002": Тез.докл. Респ. конф. -Ташкент, 2002. -С.62.

3. Нургалиев И.Н., Балахоненко О.И. QSPR моделирование посредством корреляционного взвешивания локальных инвариантов графов // "Химия и физика высокомолекулярных соединений": Тез.докл. Респ. конф. -Ташкент, 2002. -С. 10-11.

4. Toropov A.A., Nurgaliev I.N., Voropaeva N.L., Ruban I.N., Rashidova S.Sh. On some solved and unsolved problems of nanoparticles // "Nanochemistry: New approaches to creation of polymeric systems with specific properties": International Conference: Abstracts. -Tashkent, 2003. -P.21.

5. Toropov A.A., Balakhonenko O.I., Nurgaliev I.N., Voropaeva N.L., Ruban I.N., Rashidova S.Sh. QSPR-modeling of the Flory-Huggins parameter by correlation weighting of local graph invariant // Revue Roumaine De Chimie. -Вucuresti, 2003. - vol. 48. -№ 3. -P. 821-828.

6. Нургалиев И.Н., Торопов А.А., Рубан И.Н., Рашидова С.Ш. QSPR моделирование физико-химических свойств полимеров на основе "наносегментов" полимера // "Наноматериалы в химии и биологии":Тез. докл. Межд. конфер. -Киев, 2004. -С.73.

7. Ruban I.N., Toropov A.A., Nurgaliev I.N. Nanofragment o polymer molecule as an alternative of the monomer unit in QSPR analysis//«Теоретические аспекты формирования полимерных наноструктур» ":Тез. докл. Межд. конфер. -Ташкент, 2004. -С.25.

8. Торопов А.А., Нургалиев И.Н., Балахоненко О.И., Воропаева Н.Л., Рубан И.Н., Рашидова С.Ш. QSPR моделирование температур стеклования полиариленоксидов // Журнал Структурной Химии. -Новосибирск, 2004. -Т 45. -№ 4. -С. 741-747.

9. Toropov A.A., Nurgaliev I.N., Balakhonenko O.I., Voropaeva N.L., Ruban I.N., S.Sh. Rashidova QSPR-modeling of octanol-water partition coefficient by means of the nearest neighboring codes correlation weighting // Cellulose Chemistry and Technology. - Вucuresti, 2005. -vol. 39. -№ 1-2. -P. 37-48.

10. Рубан И.Н., Торопов А.А., Нургалиев И.Н., Воропаева Н.Л., Рашидова С.Ш. QSPR-моделирование параметра Флори-Хаггинса на основе «наносегментов» полимера // Высокомолекулярные соединения, серия Б. - Москва, 2005. -Т. 47. -№10. -С. 1887-1890.

11. Нургалиев И.Н., Торопов А.А., Кудышкин В.О., Рубан И.Н., Воропаева Н.Л., Рашидова С.Ш. QSPR-моделирование температуры плавления олигофениленов // Журнал Структурной Химии. -Новосибирск, 2006. -Т 47. -№ 4. -С. 368-373.

12. Нургалиев И.Н., Рашидова С.Ш. Моделирование нижней критической температуры смешения ряда двухкомпонентных смесей полимер-растворитель, с использованием дескрипторов, основанных на корреляционных весах // «Получение нанокомпозитов, их структура и свойство»: Матер. Респ. науч.-техн. конф. - Ташкент, 2007. -С. 232.

13. Нургалиев И.Н. Моделирование характеристической вязкости систем полимер-растворитель // Доклады Академии наук РУз. - Ташкент, 2009. -№ 3-4. -С. 82-84.

14. Нургалиев И.Н., Рашидова С.Ш. Топологическое моделирование нижней критической температуры смешения систем полимер-растворитель посредством оптимальных дескрипторов // Узбекский физический журнал. - Ташкент, 2009. -Т 11. -№ 23. -С. 224-229.

Размещено на Allbest.ru

...

Подобные документы

  • Сущность молекулярно-динамического моделирования. Обзор методов моделирования. Анализ дисперсионного взаимодействия между твердой стенкой и жидкостью. Использование результатов исследования для анализа адсорбции, микроскопических свойств течения жидкости.

    контрольная работа [276,7 K], добавлен 20.12.2015

  • Основные виды физических полей в конструкциях РЭС. Моделирование теплового поля интегральной схемы в САПР ANSYS. Моделирование поля электромагнитного поля интегральной схемы, изгибных колебаний печатного узла. Высокая точность и скорость моделирования.

    методичка [4,2 M], добавлен 20.10.2013

  • Изучение теорий каустик, оптических свойств кривых и поверхностей на примере моделирования оптических систем в СКM Maple. Понятие каустики в рамках геометрической оптики, ее образования. Построение модели каустики, написание программных процедур.

    дипломная работа [1,6 M], добавлен 16.06.2017

  • Классификация квантоворазмерных гетероструктур на основе твердого раствора. Компьютерное моделирование физических процессов в кристаллах и квантоворазмерных структурах. Разработка программной модели энергетического спектра электрона в твердом теле.

    дипломная работа [2,2 M], добавлен 21.01.2016

  • Моделирование как одно из средств отображения явлений и процессов реального мира. Основы и необходимые условия физического моделирования. Его использование в экспериментальных исследованиях. Влияние научно-технического прогресса на развитие моделирования.

    реферат [15,2 K], добавлен 21.11.2010

  • Исследование импеданса водной суспензии нанопорошка железа посредством емкостной ячейки. Анализ частотной зависимости импеданса суспензии нанопорошка. Применение плазменного разряда для синтеза наноматериалов и создания технологии стерилизации воды.

    дипломная работа [888,8 K], добавлен 18.07.2014

  • Свойства нанокомпозитных кобальтсодержащих полимерных материалов на основе политетрафторэтилена. Образование наночастиц кобальта при химическом восстановлении имплантированных ионов Co в структуру полимерных мембран на основе политетрафторэтилена.

    дипломная работа [4,6 M], добавлен 13.01.2015

  • Основы теории подобия. Особенности физического моделирования. Сущность метода обобщенных переменных или теории подобия. Анализ единиц измерения. Основные виды подобия: геометрическое, временное, физических величин, начальных и граничных условий.

    презентация [81,3 K], добавлен 29.09.2013

  • Применение моделирования динамики яркостной температуры методом инвариантного погружения и нейронных сетей; решение обратной задачи радиометрии – получение физических данных исследуемого объекта (почв). Обзор моделей нейронных сетей, оценка погрешности.

    курсовая работа [1,5 M], добавлен 11.02.2011

  • Разработка и апробация автоматизированного комплекса расчета виброакустических характеристик торпеды на основе программного продукта AutoSEA2. Влияние способа моделирования воздушного шума двигателя, шума и вибрации редуктора на результаты расчетов.

    курсовая работа [1,1 M], добавлен 27.12.2012

  • Исследование структурных свойств воды при быстром переохлаждении. Разработка алгоритмов моделирования молекулярной динамики воды на основе модельного mW-потенциала. Расчет температурной зависимости поверхностного натяжения капель воды водяного пара.

    дипломная работа [1,8 M], добавлен 09.06.2013

  • Особенности исследования физических свойств сжигания композитных суспензионных горючих. Предназначение и разработка теплогенерирующей установки. Оценка затрат, связанных с использованием композитных суспензионных горючих в зависимости от содержания угля.

    дипломная работа [3,5 M], добавлен 23.12.2011

  • Метод молекулярного моделирования: статистическая механика и ансамбль, метод Монте-Карло, энергия молекулярной системы. Параметры моделирования. Коэффициент Джоуля-Томпсона и инверсное давление. Растворимость газов в полимерах. Фазовые диаграммы.

    дипломная работа [2,4 M], добавлен 14.07.2013

  • Характеристика проблемы анализа и синтеза оптимальных систем автоматического регулирования. Особенности трехимпульсного регулятора питания. Описание к САР на базе оптимального регулятора с учетом внутреннего контура. Моделирование переходных процессов.

    курсовая работа [3,2 M], добавлен 15.04.2015

  • Изучение фотоэлектрических свойств полупроводников для выявления физических закономерностей в различных структурах. Полупроводниковые свойства хлопковых волокон. Рассмотерние особенностей сорта электрических свойств хлопковых волокон "Гульбахор".

    реферат [13,0 K], добавлен 22.06.2015

  • Понятие и сущность физических величин, их качественное и количественное выражение. Характеристика основных типов шкал измерений: наименований, порядка, разностей (интервалов) и отношений, их признаки. Особенности логарифмических и биофизических шкал.

    реферат [206,2 K], добавлен 13.11.2013

  • Описание физических свойств пузырей в жидкости и физических явлений, в которых пузыри принимают участие. Модельный опыт по флотации. "Мягкий" и "твердый" пузырек в жидкости. Газовый пузырек у границы между жидкостями. Закономерности процесса кавитации.

    реферат [3,7 M], добавлен 18.01.2011

  • Применения МД для исследования пластической деформации кристаллов. Алгоритм интегрирования по времени. Начальное состояние для кристалла с дефектами. Уравнение для ширины ячейки моделирования. Моделирования пластической деформации ГПУ кристаллов.

    дипломная работа [556,7 K], добавлен 07.12.2008

  • Понятие потенциометрического эффекта и его применение в технике. Эквивалентная схема потенциометрического устройства. Измерение физических величин на основе потенциометрического эффекта. Датчики, построенные на основании потенциометрического эффекта.

    контрольная работа [674,6 K], добавлен 18.12.2010

  • Применение методов ряда фундаментальных физических наук для диагностики плазмы. Направления исследований, пассивные и активные, контактные и бесконтактные методы исследования свойств плазмы. Воздействие плазмы на внешние источники излучения и частиц.

    реферат [855,2 K], добавлен 11.08.2014

Работы в архивах красиво оформлены согласно требованиям ВУЗов и содержат рисунки, диаграммы, формулы и т.д.
PPT, PPTX и PDF-файлы представлены только в архивах.
Рекомендуем скачать работу.