Синтетические молекулярные моторы

Размещено на http://www.allbest.ru/

Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

КАФЕДРА ФИЗИКИ ПОЛИМЕРОВ И КРИСТАЛЛОВ

КУРСОВАЯ РАБОТА ПО ТЕМЕ:

«Синтетические молекулярные моторы»

«Synthetic molecular motors»

Студента 2-ого курса

физического факультета

Долгова Дмитрия Сергеевича

Руководитель: проф., д.ф.-м.н.

Потемкин Игорь Иванович

Москва, 2011 г.

Оглавление

Введение

Молекулярный мотор, осуществляющий поступательное движение

Способы создания направленного движения

Молекулярные пропеллеры

Запирающиеся молекулярные двигатели

Молекулярные моторы основанные на полимерах

Модель

Обсуждение

Заключение

Список литературы

Введение

Молекулярные двигатели -- наноразмерные машины, способные осуществлять вращение при приложении к ним энергии. Главной особенностью молекулярных роторов являются повторяющиеся однонаправленные вращательные движения, происходящие при подаче энергии.

В конце XX века были осуществлены первые попытки создать синтетические молекулярные моторы. Был последовательно синтезирован ряд молекул, в которых один из молекулярных фрагментов может вращаться относительно другого под действием излучения в ультрафиолетовой области.

Это вращение обусловлено серией последовательных конформационных переходов, возбуждаемых излучением. В результате этого, одна из группировок последовательно поворачивается относительно другой так, что полный поворот составляет 360°. Под действием этого излучения повороты повторяются. Время полуповорота составляет 0,005 с.

Экспериментально продемонстрированы молекулярные моторы на примере поведения жидкокристаллических пленок, в которые введены молекулярные моторы.

При воздействии излучения в ультрафиолетовой области спектра (длина волны 365 нм) эти моторы инициировали вращательное движение в пленке. Индикатором этого движения служила стеклянная палочка длиной 28 мкм.

Молекулярный мотор, осуществляющий поступательное движение

Основа данного типа моторов - молекулярные элементы, названные «наношатлами». Это длинные углеводородные цепочки, на которые, как в молекулах ротаксанов, надеты циклические органические молекулы, не соединенные химическими связями с углеводородной цепочкой. За счет тепловых колебаний эти циклы могут хаотически перемещаться вдоль углеводородной цепочки. На ее концах расположены молекулярные группировки, которые удерживают циклическую молекулу. Одна из группировок чувствительна к ультрафиолетовому излучению. Эта группировка в отсутствие излучения обладает большим, чем вторая, сродством к циклическому фрагменту, который присоединяется к ней водородными связями. Когда излучение включается, ситуация меняется и цикл присоединяется к противоположной группировке.

Этими наношатлами была покрыта поверхность золота. Оказалось, что включение излучения меняет смачиваемость этой поверхности. А это, в свою очередь, приводит к перемещению капли жидкости вдоль поверхности.

Это движение в макромасштабах медленное - миллиметровое перемещение происходит за минуты. Но в микромасштабоах по сравнению с размерами шатлов оно составляет гигантскую величину. [3]

Самый известный из молекулярных моторов - это белок миозин, который является ключевым звеном в процессе сокращения наших мышц.

Белки-моторы черпают энергию для механического движения из катализируемой ими реакции гидролиза аденозинтрифосфата (АТФ). Гидролиз одной молекулы АТФ дает энергию, приблизительно равную 14kT. Движение, производимое молекулярными моторами, происходит в определенном выбранном направлении, а не представляет собой случайное блуждание, как это было в случае термодинамического равновесия.

Молекулярные моторы не являются классическими тепловыми машинами. Дело в том, что они напрямую переводят энергию химических реакций в механическую работу, в то время, как тепловые двигатели, созданные человеком, сначала переводят энергию сгорания топлива в тепло, а затем лишь часть этого тепла в механическую работу. Согласно теореме Карно, КПД теплового двигателя меньше 100%. Молекулярные же моторы совершают работу без тепловых потерь, поэтому их КПД теоретически ничем не ограничен и может быть сколь угодно близок к 100%.

Поскольку молекулярные моторы не являются тепловыми машинами, они обратимы. Можно провести аналогию с электромотором, который можно обратить: получить электричество, крутя вал. [2]

Способы создания направленного движения

Существует несколько основных способов создания вращательных движений. Химический способ, основанный на взаимодействии трех триптициновых роторов и хелициновой части, обеспечивал вращение на 120 градусов, но из-за сложностей с его реализацией проект был закрыт. Световой метод, на основе бис-хелицина, также имеет ряд сложностей, например, очень низкую скорость вращения. Также наномасштабные молекулярные роторы приводятся в движение путем резонансного и нерезонансного туннелирования электронов. Одним из актуальных направлений интеграции молекулярных роторов является внедрение двигателей, обнаруженных в живых клетках, в искусственные устройства. [5,6,7,8]

Проект туннельного электростатического наномотора

Молекулярные пропеллеры

Отталкивание молекул воды от поверхности гидрофобного молекулярного пропеллера

Молекулярный пропеллер -- наноразмерное устройство в виде молекулы, способное совершать вращательные движения благодаря своей специфической форме, аналогичной макроскопическим винтам. Молекулярные пропеллеры имеют несколько лопастей молекулярного масштаба, присоединённых к центральному валу, вокруг которого происходит вращение, и отстоящих друг от друга на определённый угол.

Молекулярные пропеллеры были спроектированы научной группой профессора Петра Крала в университете Иллиноиса в Чикаго. Они представляют собой молекулярные лезвия, формируемые на плоских ароматических молекулах на основе углеродных нанотрубок. Молекулярно-динамическое моделирование показывает, что эти пропеллеры могут служить в качестве эффективных насосов для перекачивания жидкости. Их эффективность накачки зависит от химического состава молекулярных лопаток и самой жидкости. Например, если лопасти гидрофобные, то молекулы воды будут от них отталкиваться и пропеллер будет эффективным насосом для данной жидкости. Если лопасти являются гидрофильными, то молекулы воды наоборот будут притягиваться к концам лопастей. Это может значительно уменьшить прохождение других молекул вокруг пропеллера и приостановить перекачку воды. [9,10,11]

Запирающиеся молекулярные двигатели

Голландские ученые разработали молекулярный двигатель, способный запираться при помощи подкисления и отпираться при помощи добавления основания. Таким образом, исследователями был сделан очередной шаг в направлении создания молекулярных машин, которые возможно проконтролировать подобно тем машинам, что мы используем в повседневной жизни.

Бен Феринга с коллегами из университета Гронингена в течение последних нескольких лет сконструировал серию различных молекулярных двигателей, но этот оказался первым, напоминающим запирающийся механизм. Он состоит из единой молекулярной системы, в которой «вращающаяся рука» молекулы является также закупоривающей частью для впадины, образованной кольцом дибензо[24]краун-8. Две части одной молекулы объединены одной двойной углеродной связью.

Как объяснил Феринга, обращение на 360є «вращающейся руки» происходит благодаря воздействию света и тепла, но лишь в том случае, если впадина свободна. Это требует воздействия сильного основания для извлечения протона из NH2+-группы запирающей части, что приводит к разрушению водородной связи, которой всё удерживается в запертом состоянии. «Если вы осветите его светом в запертом состоянии, ничего не произойдёт, но как только вы депротонируете его, он разомкнётся,» - сказал Феринга.

Существует разница между механизмами в макроскопическом и молекулярном мире: тогда как движущиеся части в макроскопических вращающих двигателях имеют угловой момент вращения, вращающее действие на молекулярном уровне состоит из нескольких стадий, каждая из которых имеет свою движущую силу. Другим отличительным признаком является то, что на совершение одного вращения наноразмерному двигателю требуется более чем полчаса, хотя, как Феринда отметил, скорость вращения могла бы быть повышена до микро- или даже до наносекунд. Команда уже создала другие моторы, способные вращаться более чем три миллиона раз в секунду, являющимися, по сути, «наномашинами». [4]

Молекулярные моторы основанные на полимерах

Молекулярные моторы изготавливаются не только из низкомолекулярных соединений с "колесами", "пропеллерами" , но и на основе полимеров, которые могут ползать как змеи.

Рассмотрим прототип молекулярного двигателя с простой внутренней структурой. Т.е., единственная цепочка двухблочного сополимера, состоящая из простых мономерных единиц, способна выполнять направленное рептационное движение, будучи адсорбированной на структурной твердой поверхности. «Рептация» - Змееподобное движение макромолекулы вдоль трубки.

С физической точки зрения, такое направленное движение возможно, если удовлетворяются следующие 3 условия:

1) система получает внешнюю энергию, которая может быть растрачена.

2) у адсорбированной молекулы есть анизотропное молекулярное трение.

3) поверхность обеспечивает направление движения (траекторию).

Проанализируем случай, когда внешние силы действуют только на один из блоков, ведя к его периодической коллапс-реадсорбции.

График 1. Эта ситуация может быть физически реализована, если, например, один из блоков содержит светочувствительные группы, взаимодействие которых может контролироваться светом. Другая возможность вызвать коллапс-реадсорбцию включает воздействие на молекулу различных паров. Опираясь на периодическое варьирование числа адсорбированных мономерных единиц одного из блоков, а следовательно, и силы трения, можно ожидать выполнения второго условия. Наконец, третье условие обеспечивается полосатой структурой поверхности. График 1. Исследования включают метод динамики Ланжевена (LD) и численный анализ упрощенной модели двухблочного сополимера.

Модель

Молекула блочного сополимера имитируется моделью пружины из бусин с потенциалом FENE - взаимодействия и потенциалом Морзе взаимодействий «мономер-мономер».

(1)

где

(2)

Каждая мономерная единица имеет диаметр d=1 и массу m=1. Расстояние сокращения силы для мономерных взаимодействий r=2.5. Цепочка гибкая (т.е. нет ограничений, наложенных на углы связи) и содержит 2 блока разных мономерных типов (А и В). Оба блока имеют одинаковое число мономерных единиц, N=40. Мы рассматриваем случай периодического изменения внешнего поля, действующего только на А-тип мономерных единиц. Он имитируется периодическим изменением параметра е потенциала Морзе, уравнение (1). Мы рассматриваем гармоническое и пилообразное изменение.

где ф - период варьирования внешнего поля, и

Здесь t'- время, прошедшее с начала периода и t0 - время пилообразной максимальной позиции с начала периода.

Поверхность смоделирована плоскими, равномерно расположенными источниками отталкивания (темно-серые полоски графика 1) и потенциалами притяжения (светло-серая полоска), дающимися в

Предполагается, что источники, зафиксированные на плоскости (каждый обладает неограниченной массой). Период решетки совпадает с диаметром мономерной единицы (d=1) и ширина светло-серой полоски w=4. Расстояние сокращения силы для взаимодействия «мономер-поверхность» то же, что и для «мономер-мономер», т.е. r=2.5

Этот метод LD для имитирования динамики системы, принимая во внимание эффекты растворителей. Временной шаг для интегрирования уравнений Ланжевена выбран t=0.003.

Обсуждение

молекулярный мотор движение полимер

Смещение центра масс блочного сополимера в зависимости от времени показано на графике 2.

Эта зависимость получена для случая, когда варьирование параметра е для А-типа мономерных единиц имеет гармоническую форму. Мы берем следующие энергетические параметры (измеренные в единицах kT): е0=5, е=4.9, е=2; и ф=14 000. Видно, что движение центра масс происходит «вперед-назад» с направленным отклонением, и наклон кривой определяет среднюю скорость отклонения. Имитации с пилообразным внешним воздействием показывают похожее поведение с возрастанием величины средней скорости.

Механизм, ответственный за такое движение, зависит от анизотропного трения молекулы: действие силы трения во время этапа 1 (переход от конформации «клубок-клубок», график 1(а), к конформации «глобула-клубок», график 1(б)) сильнее, чем на стадии 2 (переход от «глобула-клубок» к «клубок-клубок», графики 1(б) и 1(с)). Это утверждение можно объяснить следующим образом. Первоначальное состояние молекулы характеризуется полной адсорбцией обоих блоков (2D конформация молекулы), график 1(а). Включение притяжения между А-типом мономерных единиц сначала ведет к двухмерному коллапсу блока А. Этот коллапс сопровождается максимальным трением, потому что все мономерные единицы соприкасаются с поверхностью. Когда мономерные единицы А-типа близки к плотной упаковке в 2D, их постепенная десорбция приводит к формированию трехмерной глобулы. Этот этап коллапса сопровождается меньшим трением, чем 2D коллапс из-за снижающегося числа адсорбированных единиц. Принимая во внимание тот факт, что в ходе коллапса свободный конец блока А и АВ сближаются, можно наблюдать смещение блока В влево, график 1(а) и 1(б). Процесс реадсорбции блока А (этап 2) происходит другим путем. Уменьшающееся притяжение между мономерными единицами А-типа в 3D-глобуле сначала ведет к формированию 3D-клубка, адсорбирующейся позже. Очевидно, 3D-клубок занимает большее пространство, чем 3D-глобула. Поэтому, будучи адсорбированным из свернутого в спираль состояния 3D, блок А достигает удлиненной (первоначальной) конформации, график 1(д), за более короткое время, чем это было бы в случае рассредоточении 3D-глобулы. В результате, воздействие (импульс) трения на этапе 2 слабее по сравнению с этапом 1. Другими словами, этап 1 более сильного трения характеризуется медленным коллапсом сильно адсорбированного блока А, тогда как этап 2 меньшего трения обусловлен быстрым «броском» и дальнейшей адсорбцией блока А.

График 2. Типичная временная зависимость для смещения центра масс двухблочного сополимера.

Альтернативный метод подтверждения возможности направленного двухблочного движения и демонстрирование, что нарушений основных законов не наблюдается, составляет анализ упрощенной (игрушечной) модели. Давайте рассмотрим 2 бусины (названные А и B по именам соответствующих блоков), заключенные на линейной траектории (1D-модель). Химические связи между бусинами смоделированы пружиной с равновесной длиной l и константой пружины k. «Бусина к бусине» взаимодействие, вызванное внешним периодическим полем, также смоделировано пружиной с равновесной длиной l и константой пружины k=k(1-cos (wt))/2) (аналог внешнего поля, вызывающего двухблочную коллапс-реадсорбцию). Опираясь на периодическое с временем варьирование числа адсорбированных А-типа мономерных единиц в течение процесса коллапс-реадсорбции, мы моделируем коэффициенты трения м= м(1+cos(wt))/2 и м= м. Знак cos (wt) смену фазы между трением и внешним полем: трение минимально (разрушен блок А), когда у бусин максимальная энергия взаимодействия (минимальное расстояние между бусинами). Пренебрегая случайными силами, уравнения движения для А и В бусин могут быть записаны следующим образом:

где ха и хв - координаты бусин, х и х, i=A, B обозначают первую и вторую производные соответственно, т.е., скорость и ускорение i-й бусины (масса каждой бусины равна единице). Сила трения, воздействующая на бусину, выбрана пропорционально скорости бусины. Силы эластичности деформированных пружин имеют традиционную форму закона Гука.

Числовое решение уравнения (6) и (7) задает траектории бусин. Показательные кривые, полученные при показаны на графике 3.

Верхняя и нижняя кривые соответствуют смещению передней(А) и задней(В) бусин соответственно.

График 3. Координаты А(сплошная) и В(пунктирная) бусин игрушечной модели по отношению ко времени.

График 4. Проекция эффективной внешней силы f, действующей на центр масс бусин в игрушечной модели как функции времени.

Наклон этих кривых задает среднюю скорость направленного движения. Чтобы прояснить причину направленности движения, подходяще ввести координату центра масс, X=(x+x)/2. Тогда сумма уравнения (6) и (7) может быть записана как:

где выражение с правой стороны обозначает внешнюю силу, действующую на центр масс системы. Определенно, эта сила равняется 0, если коэффициенты трения обеих бусин равны между собой. Проекция силы f от время показана на графике 4 в режиме стационарного движения (после некоторого времени релаксации). Видно, что сила периодически изменяет направление своего воздействия (положительные и отрицательные значения). Однако импульс силы , в одном направлении (темно-серое пространство) сильнее, чем в другом (противоположном) - светло-серое пространство - что обеспечивает направленное отклонение от системы. Поэтому, направленность движения зависит от связи (корреляции) между переменным трением бусин и их переменной энергии взаимодействия.

Используя метод LD, периодическая со временем коллапс-реадсорбция одного из блоков сильно адсорбированного, композиционно симметричного двухблочного сополимера может вызвать направленное движение (рептацию) молекулы. Траектория движения определяется структурой поверхности. Показано, что физической причиной направленности движения является анизотропия силы трения. Числовые подсчеты для упрощенной модели пружины с бусинами сополимера поддерживают результаты компьютерных моделирований (имитирований).

Заключение

В курсовой работе рассмотрены такие типы типы молекулярных моторов, как Молекулярный мотор, осуществляющий поступательное движение, Молекулярные пропеллеры, Запирающиеся молекулярные двигатели, Молекулярные моторы основанные на полимерах. Рассмотрена модель молекулярного мотора базирующего на блок-сополимере.

Список литературы

1. Oleg E. Perelstein, Viktor A. Ivanov, Yury S. Velichko, Pavel G. Khalatur, Alexei R. Khokhlov, Igor I. Potemkin*. Block Copolymer Based Molecular Motor

2. А.Ю. Гроссберг, А.Р. Хохлов. Полимеры и биополимеры с точки зрения физики.

3. Н.Г. Рамбиди. Структура полимеров - от молекул до наноансамблей.

4. Hayley Birch. Locking molecular motors.

5. Джордан Куинн. Синтетические молекулярные моторы.

6. Росс Келли, Харшани и Ричард Сильва. Однонаправленные вращательные движения молекулярных систем.

7. Нагатоши Коимура, Роберт Зижлстра, Ричард Ван Делден, Нобиюки Харада, Бен Ферига. Управляемые светом однонаправленные молекулярные роторы.

8. Явин Викарио, Мартин Вэлко, Айк Миитсма и Бен Феринга. Осуществление настройки вращательных движений в светоуправляемых однонаправленных молекулярных роторах.

9. Б. Вонг и П. Крал. Химически гармоничные наноразмерные пропеллеры в жидкостях.

10. Дж. Васек и Дж. Митчелл. Молекулярные «игрушечные» конструкции: Компьютерная симуляция молекулярных пропеллеров.

11. С. Д. Симпсон, Гр. Маттерстейг, К. Мартин, Л. Герхель, Р. Е. Байер, Х. Дж. Рейдер и К. Мюллен. Наноразмерные молекулярные пропеллеры в циклогидрогенизации полифениленовых дендример.

Размещено на Allbest.ru