Моніторинг, прогнозування та закономірності розповсюдження вірусів рослин в біоценозах України
Вивчення розповсюдженості фітовірусів різних таксономічних груп (Tobamo-, Luteo-, Pоtex-, Hordei-, Cucumovirus, Clostero-, Potyviridae) в біоценозах різних екологічних регіонів України. Впровадження методу атомно-силової мікроскопії для дослідження.
Рубрика | Биология и естествознание |
Вид | автореферат |
Язык | украинский |
Дата добавления | 24.02.2014 |
Размер файла | 66,8 K |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
Размещено на http://www.allbest.ru/
ІНСТИТУТ МІКРОБІОЛОГІЇ ТА ВІРУСОЛОГІЇ
ім. Д.К. ЗАБОЛОТНОГО
НАЦІОНАЛЬНОЇ АКАДЕМІЇ НАУК УКРАЇНИ
УДК 578.1
прогнозування та закономірності розповсюдження вірусів рослин в біоценозах україни
03.00.06 - вірусологія
Автореферат
дисертації на здобуття наукового ступеня доктора біологічних наук
Поліщук Валерій Петрович
Київ - 2000
Дисертацією є рукопис.
Робота виконана в Київському національному університеті імені Тараса Шевченка
Науковий консультант: доктор біологічних наук, професор БОЙКО Анатолій Леонідович Київський національний університет імені Тараса Шевченка, завідувач кафедрою вірусології
Офіційні опоненти: - доктор біологічних наук, старший науковий співробітник Щербатенко Іван Степанович Інститут мікробіології та вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України, завідувач відділу фітопатогенних вірусів
доктор біологічних наук, професор Мітрофанова Ольга Володимирівна Державний Нікітській ботанічний сад УААН, завідувач відділу біотехнології
доктор біологічних наук, професор співробітник Радавський Юрій Леонідович Інститут біоорганічної хімії та нафтохімії НАН України, завідувач відділу структури та функцій білків та пептидів
Провідна установа: Інститут захисту рослин УААН
Захист відбудеться “ 18 ” жовтня 2000 р. о 10 годині на засіданні спеціалізованої вченої ради Д 26.233.01 Інституту мікробіології та вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України за адресою: 252143, м. Київ, вул Заболотного, 154
З дисертацією можна ознайомитись у бібліотеці Інституту мікробіології та вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України (252143, м. Київ, вул Заболотного, 154).
Автореферат розісланий “ 15 ” вересня 2000 р.
Вчений секретар
спеціалізованої вченої ради Пуріш Л.М.
Поліщук В.П. Моніторинг, прогнозування та закономірності розповсюдження вірусів рослин в біоценозах України. - Рукопис.
Дисертація на здобуття наукового ступеня доктора біологічних наук за спеціальністю 03.00.06 - вірусологія. Київський національний університет імені Тараса Шевченка, Київ, 2000.
Робота присвячена вивченню розповсюдженості фітовірусів різних таксономічних груп (таких як Tobamo-, Luteo-, Pоtex-, Hordei-, Cucumovirus, Clostero-, Potyviridae) в сільськогосподарських рослинах, бур'янах, дикоростучих рослинах та ґрунті різних екологічних регіонів України.
Експериментально обґрунтовано та запропоновано методику оцінки розповсюдження вірусів рослин на основі комплексної діагностики рослин-предикторів.
Результати роботи дозволяють розглянути та сформулювати закономірності впливу забруднення довкілля полютантами (такими як важкі метали) на фітовіруси: опосередкований вплив на ґрунт та рослину змінює середовище і для розвитку вірусів, що може призводити до зміни інфекційності вже відомих патогенів та, можливо, виникнення нових, більш шкодочинних штамів вірусів.
Описано новий РНК-вмісний бациловидний вірус, що уражує цукрові буряки та належить до родини Rhabdoviridae і має розміри 38 х 300 нм.
В умовах закритого ґрунту показано значну розповсюдженість ВМЦ та ВКПО. Проведена їх ідентифікація за допомогою отриманих моноклональних антитіл.
Створена комп'ютерна база даних розповсюдження фітовірусів на території України та система управління базами даних є необхідною умовою для фітосанітарної оцінки агроценозів та вироблення стратегії прогнозування і запобігання епідемій (епіфітотій) вірусів рослин.
Досліджена можливість бездеградаційної дистанційної експрес-діагностики вірусних хвороб рослин яка може бути основою для створення нового покоління методів діагностики фітовірусних інфекцій на великих територіях. Впровадження методу атомно-силової мікроскопії дозволяє дати відповідь на питання про тонку поверхневу структуру віріону та повніше зрозуміти зв'язок між фізико-хімічними та біологічними властивостями вірусів. фітовірус таксономічний біоценоз мікроскопія
Ключові слова: фітовірус, розповсюдження, циркуляція, частота виявлення, база даних, прогнозування, бездеградаційна експрес-діагностика, техногенне навантаження, предиктори, атомно-силова мікроскопія.
Полищук В.П. Прогнозирование и закономерности распространения вирусов растений в биоценозах Украины. - Рукопись.
Диссертация на соискание научной степени доктора биологических наук по специальности 03.00.06 - вирусология. Киевский национальный университет имени Тараса Шевченко, Киев, 2000.
Работа посвящена изучению распространенности фитовирусов разных таксономических групп (таких как Tobamo-, Luteo-, Pоtex-, Hordei-, Cucumovirus, Clostero-, Potyviridae) в сельскохозяйственных растениях, сорняках, дикорастущих растениях и грунте различных экологических регионах Украины.
Экспериментально обосновано и предложено методику оценки распространения вирусов растений на основе комплексной диагностики растений-предикторов.
Результаты роботы позволяют рассмотреть и сформулировать закономерности влияния загрязнения окружающей среды полютантами (такими как тяжелые металлы) на фитовирусы: опосредованное влияние на грунт и растения изменяет среду и для развития вирусов, что может приводить к изменению инфекционности уже известных патогенов и, возможно, возникновению новых, более вредоносных штаммов вирусов.
Описано новый РНК-содержащий бациловидный вирус, который поражает сахарную свеклу, относится к семейству Rhabdoviridae размером 38х300 нм.
В условиях закрытого грунта показано значительную распространенность ВМЦ и ВКПО. Проведена их идентификация с помощью полученных моноклональных антител.
Созданная компьютерная база данных распространения фитовирусов на территории Украины и система управления базами данных является необходимым условием для фитосанитарной оценки агроценозов и разработки стратегии прогнозирования развития эпидемий (эпифитотий) вирусов растений.
Исследована возможность бездеградационной экспресс-диагностики вирусных заболеваний растений, которая может быть основой для создания нового поколения методов диагностики фитовирусных инфекций на больших площадях. Предложенный метод атомно-силовой микроскопии позволяет ответить на вопрос о тонкой поверхностной структуре вириона и полнее понять связь между физико-химическими и биологическими свойствами вирусов.
Ключевые слова: фитовирус, распространение, циркуляция, частота встречаемости, база данных, прогнозирование, бездеградационная экспресс-диагностика, техногенная нагрузка, предикторы, атомно-силовая микроскопия.
Polischuk V.P. Forecasting and spreading features of plant viruses in biocenoses of Ukraine. - Manuscript.
Thesis for Dr. Sci (Biol) by speciality 03.00.06 - Virology. Kyiv National University by Taras Shevchenko, Kyiv, 2000.
Thus, for the first time both plants and soils are investigated not only as eservoirs of virus infections but also as reservoirs of their traces - antigens.
Viruses that are transferred by soil and maintain there infectious traits (Furoviridae, Nepoviridae, Tobamoviridae, Cucumoviridae etc) have been intensively studied only recently, whilst epidemiology of viruses that are transferred by vectors are well established in the last decades (130).
As it was mentioned in literature, the classical approach to investigation of soil viruses is based predominantly on their biological characteristics; for other viruses, with no proven record of transfer by soil (and maintenance of their infection traits) this approach is not normally used. The proposed work demonstrates a possibility of using the information on presence of viral antigens in soil (even if these viruses are not transferred by soil) for general evaluation of phyto-sanitary conditions, which can help to predict development of viral diseases and prevent possible losses.
This is the first study to localise phyto-virus antigens in the agricultural plants, weeds, wild plants and soils from different ecological regions of Ukraine and to show that virus concentrations depends upon soil characteristics of agro- and biocenosis (mechanical structure, physical and chemical parameters), antropogenic pressure and general phyto-sanitary state of cenosis. Levels of the virus antigens are found to be variable in different regions which proves their uneven distribution on the territory of Ukraine and necessity for targeted action to prevent crop losses in the particular cenosis.
Level of fluctuation for the phytoviral antigen concentrations in the different seasons depends upon plant species that are cultivated and should be taken into account both in the planning of crop rotations and in the prediction of disease spreading. Continuos investigation of circulation of phytoviruses in agrocenoses will permit (after considering weather data, biology of crops and agents) precise prediction of spreading of the disease with an aim to reduce crop yield losses. Computer data base are extremely important for such predictions and should be introduced for evaluation of phyto-sanitary status of agrocenosis (with further expanding to include other pests and disease agents such as insects, nematodes, bacteria, fungi etc).
On the basis of data from this research it is possible to conclude that presence of plant viruses in different ecological conditions of Ukraine does not depend upon antropogenic pressure (specifically upon concentration of heavy metals). Both in ecologically safe Volinskij region (Sadskij National park) and in region with increased antropogenic pressure (Charkiv region, Zmievskaya power station) viruses' spectra are not different, but their emergence frequencies and antigen concentrations are much higher in agrocenosis with heavy antropogenic pressure.
Such trend can be seen not only on crops (this may be explained by using of not-resistant crop varieties), but, what is much more important, in biocenoses - plots with no human interference. In these “wild” cenoses virus antigens have been detected in low levels and regularity which has not change year by year. It is possible that such constancy of the virus presence in natural cenoses may be an indirect proof of the virus role in maintenance of system stability and elimination of “foreign to such system” species.
From the results of this work it is possible to establish regular effects of environmental contamination (such as by heavy metals) on phytoviruses: - contamination of soil and plants results in the modified conditions for virus development, that may lead to changes in virulence of known pathogens and creation of new more aggressive forms of viruses. The differences in the (quantity and quality) composition of phytoviruses at the contaminated areas of Chernobyl power station may be explained both by the reduction of immune reactions of plants that are growing under radioactive pollution and by the higher virulence of viruses.
Potential for non-destructive remote express diagnostic of viruses shown in this research may be a step towards the establishment of a new generation methods for phytoviruses diagnostic at the large territories. Also method of “atom-power” microscopy may help to answer the question about detail surface structure of viroids and help to understand a link between physical, chemical and biological properties of viruses.
Because the antropogenic pressure to environment tend to grove (not to decline) in future and new crops (including genetically modified) will enter agrocenoses, a problem of ecological balance in them will become more important in future as well as more acute become an issue of prevalence and harmfulness of phytoviruses.
Key words: phytovirus, spreading, circulation, detection frequency, database, prognozing, degradationless express-diagnostics, technogenic pressure, predictors, atomic force microscopy.
Загальна характеристика роботи
Актуальність. Протягом останнього часу в фітовірусології спостерігається значний інтерес до розвитку досліджень на популяційному та еколого-популяційному рівні, і ця тенденція є загальною для багатьох традиційно молекулярно-біологічних дисциплін (Бойко, 1990). Значні успіхи у фітовірусології, такі як розшифровки структури генів, білок-білкової та нуклеїнова кислота-білкової взаємодії, встановлення амінокислотних послідовностей та тривимірної будови структурних та регуляторних вірусних білків та ін. контрастують з нашими знаннями відносно поведінки вірусів рослин у природних умовах. Нове покоління діагностичних методів для визначення наявності фітовірусів (таких як ІФА, РІА, DELFIA, RIPA, ПЛР, ЛЛР, та ін.) дало змогу на новому рівні вивчати розповсюдженість фітовірусів у навколишньому середовищі. Актуальність даного питання полягає як в його фундаментальності, так і в практичному значенні. Визначення ареалу розповсюдженості, механізмів передачі, кола рослин-господарів, реакції на зміни оточуючого середовища дають можливість не тільки більш повно характеризувати того чи іншого представника царства Vira, але і прогнозувати появу та розвиток вірусних хвороб і правильно виробляти стратегію і тактику боротьби з ними - запровадження стійких сортів, цілеспрямовану боротьбу з резервантами та переносниками, отримання безвірусного посадкового матеріалу та ін. (Щербатенко, 1996). Перспективними у цьому напрямку є моделювання розвитку хвороб рослин. Однак для більшості вірусних хвороб, на відміну від фітопатогенних грибів та бактерій, адекватні моделі практично відсутні (Nelson, 1999). Віруси, які передаються через ґрунт і зберігають свої інфекційні властивості (Furoviridae, Nepoviridae, Tobamoviridae, Cucumoviridae та ін.) досить інтенсивно вивчалися тільки останнім часом, тоді як епідеміологічне вивчення вірусів, що передаються за допомогою векторів, розвивається швидкими темпами протягом останніх десятиріч (Шпаар, 1995). Класичний підхід до вивчення вірусів у ґрунті передбачає вивчення в першу чергу їх біологічних характеристик; інші віруси, для яких передача через ґрунт та зберігання інфекційних властивостей не доведена, залишаються поза увагою такого підходу (Koenig, 1994). В той же час можливість використання інформації про знаходження того чи іншого антигену вірусу в ґрунті (навіть якщо цей вірус і не може передаватися через ґрунт) може бути використаною для загальної оцінки фітосанітарного стану з точки зору наявності вірусних інфекцій та для прогнозування розвитку вірусних хвороб і попередження втрат від них.
Збільшення антропогенного тиску на навколишнє середовище приводить до фізіологічних змін у рослин та їх угрупувань (Гуральчук Ж.З., 1994; Andren O. et all, 1998), що в свою чергу прямо чи опосередковано відбивається на властивостях вірусів рослин. Встановлення можливих взаємозв'язків між наявністю вірусних антигенів в культурних та дикоростучих рослинах, ґрунті є дійсно необхідним для розуміння процесів розповсюдження вірусів рослин та циркуляції їх в ценозах.
Важливим для вивчення шляхів розповсюдження фітовірусів є знання їх взаємодії з представниками дикої флори та бур'янами, що стало предметом детального вивчення тільки в останній час (Stevens M. et all, 1994). Для встановлення взаємозв'язків між вірусами, культурними рослинами, бур'янами, переносниками, ґрунтом потрібно враховувати багато факторів (біологію збудника та хазяїна, умови зовнішнього середовища тощо) та оперувати даними про ці фактори. Існуючі на сьогодні спроби комп'ютеризувати моделі часового та просторового розповсюдження збудників хвороб рослин стосуються в першу чергу інфекційних агентів бактеріального та грибкового походження(Bosch F. et all,1999), для фітовірусів такі моделі практично відсутні (Anderson P.K., 1999). Актуальність створення комп'ютерних моделей та баз даних обумовлена великим обсягом інформації, що має тенденцію збільшуватися з кожним роком (Campbell C.L., Madden L.D., 1990). Всі вище перераховані проблеми не можуть бути вирішені без можливості оперативного одержання об'єктивної інформації (надійної діагностики вірусних інфекцій). Перспективним та актуальним з цієї точки зору можна вважати методи дистанційної діагностики, що базуються на спектральних параметрах рослин та можуть бути отримані за короткий час на значних площах (Шадчина Т.М., Колинько О.А., 1993). В той же час застосування новітніх методів растрової мікроскопії, таких як атомно-силова мікроскопія (АСМ), відкриває нові можливості як для діагностики, так і для отримання принципово нової інформації про структуру і функції вірусів та їх популяцій.
Оскільки техногенне навантаження на природне середовище в найближчому майбутньому буде скоріш зростати, ніж зменшуватися, а в агроценози будуть приходити все нові й нові, в тому числі і генетично модифіковані, культурні рослини, проблеми екологічного балансу в агроценозі будуть набувати все більшого значення, і питання розповсюдження фітовірусних інфекцій та їх шкодочинності в майбутньому може розглядатися як одне з найгостріших.
Зв'язок роботи з науковими програмами, планами, темами. Наукові дослідження по темі виконано відповідно проектів “Розробка комплексної еколого-економічної оцінки території України та системи оптимізації сільськогосподарського виробництва з урахуванням природно-ресурсного потенціалу та еколого-токсикологічної ситуації”, “Науково-методичні основи екотоксикологічного моніторингу. Підрозділ: Вірусні інфекції” (№ держреєстрації 01.196U012976), “Оцінка агроценозів в різних екологічних регіонах України на ураженість фітовірусними інфекціями” (ДКНТ, № 03.11.1/74), “Створення технології оздоровлення сільськогосподарських рослин з метою підвищення їх продуктивності” (№ 03.01.12/110-92) .
Мета і завдання дослідження. На основі багаторічних обстежень біоценозів різних екологічних регіонів України дати оцінку розповсюдженості основних фітовірусних інфекцій, виявити їх закономірності та обґрунтувати можливості прогнозування розвитку епіфітотій.
У відповідності з поставленою метою було необхідно виконати такі завдання:
- вивчити біологічні властивості та провести діагностику 16 основних шкодочинних фітовірусів, які відносяться до різних таксономічних груп у різних регіонах України;
- проаналізувати динаміку чисельності поширених вірусів рослин в обстежених ценозах із використанням сучасних вірусологічних методів;
- дослідити взаємозв'язки між збудниками вірусних захворювань та їх можливими резервуарами, такими як одно-, дворічні та багаторічні бур'яни, ґрунт;
- створити базу даних та комп'ютерну модель для прогнозування розвитку вірусних хвороб рослин у динаміці репродукції патогенів;
- вивчити взаємозв'язок між екологічним станом конкретного ценозу та розповсюдженістю фітовірусних інфекцій у регіонах, розглянути можливі механізми їх взаємодії;
- вивчити біологію збудників рослин закритого ґрунту на моделі орхідних та розробити технологічну схему отримання оздоровленого безвірусного посадкового матеріалу;
- на основі спектральних методів відбиття розробити модельну систему дистанційної бездеградаційної експрес-діагностики РНК-вмісних вірусів у динаміці їх взаємодії з різними видами рослин.
Наукова новизна одержаних результатів. Вперше проведена якісна та кількісна оцінка агроценозів та природних екологічних ніш України на наявність шкодочинних вірусів сільськогосподарських культур на основі імуноферментного аналізу з урахуванням біологічних, молекулярних та антигенних властивостей патогенів. Розкрито взаємозв'язок між частотою знаходження антигенів фітовірусів у культурних рослинах, бур'янах і ґрунті та вірогідністю розповсюдження тієї чи іншої вірусної хвороби в наступні роки. Створено комп'ютерну базу даних із застосуванням Microsoft Access-2 та на її основі вперше створено систему управління базами даних по аналізу розповсюдженості фітовірусів у культурних рослинах, бур'янах, ґрунті в різних агроценозах України. Показано можливість застосування багатофакторного комп'ютерного аналізу для коротко-, середньо- та довгострокових прогнозів розвитку вірусних захворювань. Встановлена залежність розповсюдження фітовірусних інфекцій від антропогенного навантаження на агро- чи біоценоз. Експериментально обґрунтовано та запропоновано методику оцінки можливості розповсюдження фітовірусних інфекцій на основі комплексної діагностики рослин та застосування комп'ютерної бази даних.
Виявлено нові види рослин-резерваторів для деяких вірусів, такі як талабан польовий (Thlaspi arvense) для вірусу слабкого пожовтіння буряку (ВСПБ) та костриця лучна (Festuca pratensis) для вірусу жовтої карликовості ячменю (ВЖКЯ). Описано новий РНК-вмісний бациловидний вірус, що уражує цукрові буряки.
Розроблено технологічну схему контролю для отримання високоякісного безвірусного посадкового матеріалу орхідей мікроклональним розмноженням на основі створення здорових рослин-донорів.
Показано відмінності в спектрах відбиття світла між інфікованими та контрольними рослинами. Показана можливість використання спектральних параметрів для бездеградаційної дистанційної експрес-діагностики вірусних хвороб рослин в різних умовах їх вирощування.
Розроблено новий спосіб візуалізації віріонів методом атомно-силової мікроскопії (АСМ).
Практичне значення одержаних результатів. Експериментально обґрунтовано та запропоновано методику оцінки можливості розповсюдження фітовірусних інфекцій на основі комплексної діагностики рослин; виявлено нові види рослин-резерваторів для деяких вірусів; розроблено технологічну схему контролю для отримання високоякісного безвірусного посадкового матеріалу орхідей мікроклональним розмноженням; показано відмінності в спектрах відбиття між інфікованими вірусами та здоровими рослинами та можливість застосування спектральних параметрів для бездеградаційної дистанційної експрес-діагностики вірусних хвороб рослин у різних умовах їх вирощування; модифіковано методику обстеження ґрунтів на вірусоносійство за допомогою імуноферментного аналізу (ІФА), що дозволяє швидко та ефективно проводити детекцію антигенів фітовірусів в ґрунтах та ґрунтових водах.
На основі досліджень обґрунтовано стратегію оцінки та створено карту розповсюдженості фітовірусів у ґрунтах у досліджених регіонах України. Її використання дозволяє простежити кореляцію між виявленням антигенів вірусів в рослинах та ґрунті та техногенним навантаженням довкілля іншими полютантами.
Створено рекомендації для сільськогосподарських дослідних станцій та станцій захисту рослин для запобігання втрат врожаїв від вірусних інфекцій.
Особистий внесок здобувача. Автором запропонована ідея роботи. Мета і завдання досліджень сформульовані автором особисто. Відбір зразків рослин та ґрунту з різних екологічних регіонів України, виділення та накопичення вірусів, проведення імуноферментного аналізу, електронна, імуноелектронна мікроскопія, аналіз і узагальнення отриманих результатів, побудова комп'ютерного банку даних були виконані автором особисто та за участю аспірантів і співробітників на базі кафедри вірусології Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Проведення досліджень спектральних характеристик відбиття листя та протопластів проводилося на базі Інституту фізіології рослин та генетики НАНУ за участю д.б.н. Т.М.Шадчиної.
Дослідження фізико-хімічних властивостей грунтів проводилися в лабораторії оцінки якості сільськогосподарської продукції Інституту агроекології та біотехнології УААН разом з Саженюком А.Д. та Харківським Інститутом агрохімії та ґрунтознавства УААН .
Дослідження вірусів в умовах закритого ґрунту та in vitro проводилися на базі Центрального республіканського ботанічного саду за участю к.б.н. А.М. Лаврентьєвої.
Дослідження за допомогою АСМ проводилися в Інституті напівпровідників НАНУ за участю к.б.н. Бекетова Г.В.
Апробація результатів дисертації. Матеріали роботи доповідались на: Міжнародній конференції “Фундаментальні та прикладні аспекти фітовірусології” (Ялта, Україна, травень 1994); Міжнародному симпозіумі “75 років фітопатологічних досліджень в Асершлебені” (Асершлебен, Німеччина, червень 1995); Всеросійському з'їзді “Защита растений в условиях реформирования агропромышленного комплекса: экономика, эффективность, экологичность” (Санкт-Петербург, Росія, грудень 1995); 10 Міжнародному Конгресі по вірусології (Єрусалим, Ізраіль, серпень 1996); 1-му Європейському фікологічному конгресі (Кьольн, Німеччина, серпень 1996); Європейському симпозіумі “Аерокосмічна дистанційна діагностика” (Лондон, Великобританія, вересень 1997); Міжнародній конференції “Лютеовіруси” (Чіренчестер, Великобританія, березень 1997); Міжнародному регіональному семінарі “Охорона довкілля” (Ужгород, травень 1997); Конференції “Збереження біорізноманітності в Україні” (Канів, жовтень, 1997); Міжнародній конференції “Пути решения проблем и перспективы развития биотехнологии в декоративном садоводстве и плодоводстве” (Крим, Ялта, вересень 1997); 2 Міжнародній конференції “Біоресурси та віруси” (Київ, вересень 1998); 4 Міжнародному Симпозіумі “Забруднення навколишнього середовища в Центральній та Західній Європі” (Варшава, Польща, вересень 1998); 16 Всесвітньому Конгресі з ґрунтознавства (Монпельє, Франція, серпень 1998), 7 Міжнародному симпозіумі з епідеміології вірусів рослин (Алмерія, Іспанія, квітень, 1999); 11 Міжнародному конгресі з вірусології (Сідней, Австралія, серпень 1999).
Публікації. За матеріалами дослідження опубліковано 48 робіт, з них 23 - статті у наукових журналах, 25 - матеріали конференцій.
Структура і об'єм роботи. Дисертація складається із вступу; огляду літератури, в якому здійснено аналіз сучасного стану досліджень в області епідеміології вірусів рослин, прогнозування виникнення епіфітотій та закономірностей розповсюдження фітовірусів; опису об'єктів та методів досліджень, п'яти експериментальних розділів; висновків; списку цитованої літератури та трьох додатків. Останні включають карти районів відбору зразків, візуальні симптоми хвороб на рослинах та дослідних полях, схеми циркуляції досліджуваних вірусів. Робота викладена на 288 сторінках машинописного тексту, включає 32 таблиці та 76 рисунків. Список цитованої літератури нараховує 515 найменувань, з них 382 іноземних.
Основний зміст роботи
Відбір та аналіз зразків. Загальний стан поля обстежувався методом рендомізованого польового експерименту за такими параметрами: фаза розвитку рослин в онтогенезі, вид рослини, стан посiвiв, кiлькiсть рослин-бур'янiв, відсоток рослин з симптомами вiрусних захворювань. Для обстеження поля цукрового буряку вибиралися три дiлянки площею 100 м2, де підраховувалась кiлькiсть рядкiв, кiлькicть рослин у кожному рядку i кiлькiсть рослин з симптомами вiрусних захворювань на листкових пластинках у кожному рядку. Пiдрахунок інших культур, якi мали симптоми вiрусного ураження, проводився: кукурудзи, соняшнику (по три дiлянки площами 100 м2); пшеницi - три дiлянки площею 1 м2. Також реєстрували симптоми, якi переважали.
Для досліджень розповсюдження вірусів з полів сільськогосподарських культур (таких як злакові, цукровий буряк, картопля) та необроблюваних ділянок (заповідників, балок та ін.) відбирали зразки культурних рослин, супутніх бур'янів та ґрунту в трьох повторах з трьох точок методом рендомізованого польового експерименту та вносили в стерильний пакет для подальших досліджень.
Дослідження проводилися в чотирьох регіонах України, таких як: Волинська область (Шацький Національний парк); Київська область (Богуславський полігон), Харківська область (район Зміївської ДРЕС) та Одеська область (район Комінтерново).
Після відбору зразки ґрунту гомогенізували з буфером (0,01М фосфатно-сольовим буферним розчином (ФСБР), рН 7,2-7,4) в шутель-апараті протягом ночі. Потім проводили виділення та очистку вірусу. Для цього розчинений у буфері зразок рослин або ґрунту піддавали серії центрифугувань: низькошвидкісне центрифугування на центрифузі РС-6 (5000 g, 20 хв); одержаний надосад піддавали високошвидкісному центрифугуванню на центрифузі фірми “Beckman” (70000 g, 60 хв), після чого одержаний осад ресуспендували в буфері. Частину отриманого матеріалу використовували для зараження рослин-індикаторів, а частину - для досліджень за допомогою ІФА та електронної мікроскопії (ЕМ). Проби з рослин-індикаторів відбиралися для імуносорбентної електронної мікроскопії (ІСЕМ) та ЕМ.
Біологічні властивості вірусів вивчали за допомогою спектру загальноприйнятих рослин-індикаторів, таких як: Chenopodium amaranticolor (некротична реакція для типового штаму ВТМ), Datura stramonium, Nicotiana tabacum cv. Samsun (некрози та деформації для ВТМ), N. glutinosa (некротична реакція для ВТМ), N. tabacum cv. Trapeson (системна реакція), N. debneyі (системна реакція), N. sylvestris L (системна реакція) та Plantago major L. (некротична реакція для подорожникових штамів ВТМ), Triticum durum, Lycipersicon esculentum, Capsicum annum, Agropiron repens, Gomfrena globosa та ін. Ураження проводили механічно для таких вірусів як ВТМ, ВОМ, ХВК, УВК, ВШМЯ. Матеріал інокулювали за допомогою абразиву (карборунд) з концентрацією вірусного препарату в діапазоні 50-200 мкг/мл у 0,1М ФСБР, рН7,4 у трьохкратному повторенні на стадії чотирьох справжніх листків.
Накопичення ВТМ здійснювали на рослинах Nicotiana tabacum сорт Самсун. Виділення вірусного матеріалу проводили за модифікованою нами методикою шляхом гомогенізації свіжозаморожених інфікованих рослин в 0,1М калій - фосфатному буфері, pН7,4 з додаванням 0,01М Na2SO3, освітленням вірусного екстракту хлороформом у співвідношенні 1:7 та подальшим низькошвидкісним центрифугуванням 20 хв при 4 тис. об/хв на центрифузі РС-6. Концентрацію препарату проводили за допомогою інкубації надосадової рідини на магнітній мішалці з додаванням 5% поліетиленгліколю 6000 (“Serva”, США) та 1,2% NaCl протягом 60 хв при 4 0С. Після інкубації матеріал центрифугували при 10 тис об/хв протягом 15 хв. Осад ресуспендували в 0,01М калій-фосфатному буфері, рН7,4 з подальшим високошвидкісним центрифугуванням його в режимі 30 тис. об/хв - 1,5 год на центрифузі “Beckman”, ротор SW-40. Осад відбирали, знову ресуспедували в 0,01М калій-фосфатному буфері та проводили центрифугування в градієнті сахарози при 30 тис. об/хв протягом 2,5 год у тому ж роторі. Осад ресуспендували в 0,01М тріс-НСІ буфері, рН7,6 та діалізували протягом ночі при 4 0С проти того ж буферу. При роботі з вірусним матеріалом використовували буфери, що не містять солей натрію для зручності подальшого виділення нуклеїнової кислоти та білку. Концентрацію вірусу визначали спектрофотометрично за формулою:
С = А260N/Ке
Де С - концентрація вірусу в мг/мл,
А260 - екстинкція при довжині хвилі 260 нм,
N - розведення вірусного препарату,
Ке - коефіцієнт екстинкції, що для ВТМ становить 2,7.
Для отримання числових результатів на стадії обробки польових зразків використовували непрямий метод das-ELISA (Гнутова, 1993).
Для його проведення використовували антитіла, специфічні до 18 вірусів.
Перелік специфічних антитіл, які були використані в роботі
Аналіз проводили в 96-лункових планшетах (“Labsystems”, Фінляндія).
Крім того, використовувався tas-ELISA (triple antibody sandvich), який проводили за загальноприйнятою методикою. Як антивидові використовували антитіла, мічені пероксидазою з хрону та лужною фосфатазою.
Для вивчення морфології вірусів застосовувалися трансмісійні електронні мікроскопи JEM-1200 (JEOL, Японія) JEM-100B (JEOL, Японія), ЕМ-75, ЕМ-125 (Суми, Україна) з негативним контрастуванням вірусних часточок. Для виготовлення плівок-підкладок використовували 0,2% розчин формвару (полівінілформальдегіду) в хлороформі. Для негативного контрастування зразків використовували 2% розчин фосфорновольфрамової кислоти (ФВК) рН7-7,4 та 2% розчин уранілацетату (Миронов, 1994).
Електрофорез досліджуваних зразків проводили за Laemmli з використанням 14% розділяючого поліакриламідного гелю та 5% концентруючого гелю.
Для вивчення впливу важких металів на перебіг вірусної інфекції проводили серію експериментів на рослинах Nicotiana tabacum та Datura stramonium та (з ВТМ та ХВК відповідно). Рослини піддавали сукупній дії вірусів та солей важких металів (Ni, Zn, Pb, Cu), в концентраціях, визначених експериментально в ґрунтах Харківської області.
Вимірювання спектрів відбиття та поглинання у інфікованих рослинних тканин. Для лабораторних досліджень відбиття світла рослинами використовували оснащений інтегруючою сферою двопроменевий реєструючий спектрофотометр СФ_10. Для приготування зразків використовували середні частини листків. Швидкість розгортки складала 90 нм/хв. Відтворюваність запису одного й того ж зразка по абсцисі (довжина хвиль) складала 1 нм, по ординаті (коефіцієнт відбиття) - 0,3%.
Результати у цифровому вигляді паралельно передавались на ЕОМ, сполучену із спектофотометром СФ_10. За допомогою ЕОМ проводили математичну та статистичну обробку результатів (Кочубей и др., 1990).
Визначення концентрації хлорофілу у витяжках проводили спектрофотометрично. Вміст хлорофілу розраховували за формулою:
C = D652V/34.5S
де D652 - оптична густина при довжині хвилі 652 нм;
V - об'єм одержаного екстракту, мл;
S - площа висічки, дм2;
34.5 - сталий коефіцієнт.
При ААС для переведення зразку в розчин застосовували способи, які використовуються при аналізі мінеральної сировини.
Дослідження морфології виконувались на атомно-силовому мікроскопі (Nanoscope D 3000, Digital Instruments, USA). У дослідах використовували вірус тютюнової мозаїки, який мав концентрацію 0,8 мг/мл. Краплину розчину (25 мкл) наносили на свіжосколоту слюду, через 20-30 хв препарат промивали водою та поступово висушували на повітрі в закритій чашці Петрі. В іншій модифікації препарат наносили на слюду, витриману 10 с в 0,2% розчині формвару (полівінілформальдегіду ) в хлороформі.
Коротка характеристика бази даних і програм їх аналізу. В процесі обробки структури даних їх типи змінюються, таким чином, вони потребують нової структури для свого збереження. Структурами, що зберігають дані, є таблиці. В таблиці “Ukraine” зберігаються необроблені дані, тобто детальні описи всіх зразків, результати ІФА і т.п. При семантизації цих даних отримували нову структуру (масив) даних: замість цифрових даних ІФА - дані логічного формату типу “Так / Ні”, причому дані контролів відсівалися і в подальшому не приймали участь в ієрархії об'єктів.
Модуль “UpDate_Table” містить процедуру автоматизації введення даних та перевірки їх синтаксичної вірності (наприклад, забороняє вводити у комірку числового значення символьні дані).
Основну роботу по введенню, відбору, обробці даних виконують форми. Форма - це складний об'єкт, що містить власне форму та пов'язаний з нею модуль - сукупність процедур та функцій на “Access Basic”, що беруть участь у обробці даних форми.
“AreaSelect” - пропонує обрати: роботу із необробленими даними; обробку семантизованих (логічних) даних та відкриває форми “Plate”; “Area”.
“Choice” - пропонує обрати вид роботи: відкрити об'єкт звіту, редагувати та друкувати його або відкрити форму “AreaSelect” (якщо передбачається робота з необробленими даними).
“Plate” - головна форма, статично пов'язана із об'єктом, забезпечує введення, сортування, перевірку синтаксису, пошук, друк, редакцію даних та поновлення (“Update”) даних таблиці “Ukraine”. Відкриває форму “AreaSelect”.
“Area” - форма, статично пов'язана з таблицею “Ukraine”, модуль цієї форми, базуючись на її даних створює (поновлює) таблицю “Tkriterium”, тобто займається обробкою даних ІФА. Форма враховує кількість контролів, що потрібно брати до уваги, сортує, друкує, редагує дані таблиці “Tkriterium”. Відкриває форму “SearchCompound” або “AreaSelect”.
“SearchCompound” - створює нові об'єкти. Модуль цієї форми завантажує ключові слова з таблиці “KeyWords” і при потребі їх поновлює; динамічно зв'язує форму з новими об'єктами; за допомогою метода OLE (Object Linking & Embeding - зв'язування та будова об'єктів) інкрустує форму об'єктами “CompoundForm” або “LastForm”, поновлює в них дані, поновлює власні дані, сортує, редагує, поєднує, відбирає, групує, друкує власні та інкорпоровані дані. Відкриває об'єкт звіту (що в свою чергу відкриває інкрустований) об'єкт запиту, що в свою чергу відкриває об'єкт “LastTable”) або форму “Plate”.
Форми, що лишились не описані, виконують деякі внутрішні функції (поєднання об'єктів, роблять користування базою більш зручним та зрозумілим). Звіт - об'єкт, що статично пов'язаний з об'єктом запиту, групує та готує дані до друку.
Запит - спеціалізована структура (об'єкт) описана мовою SQL. Робить запит до таблиці “LastTable” і вертає віртуальний об'єкт, що містить всі унікальні записи таблиці. Цей об'єкт далі використовують форма “LastTable” та звіт “LastTableReport”.
Макроси виконують послідовний набір нескладних команд, в тому випадку, коли стандартними засобами це зробити неможливо, а використання SQL або Access Basic недоцільно.
Модулі утримують процедури та функції на Аccess Basic та SQL - аналоги. З цими процедурами пов'язані всі арифметичні операції, операції сортування, групування, редагування і т.п.
Моніторинг вірусних захворювань сільськогосподарських культур в агроценозах регіонів України
Першим етапом нашої роботи було обстеження областей України для порівняльної оцінки ризику розповсюдження фітовірусних епідемій в залежності від конкретних характеристик регіону.
У кожній області обстежувалися від 10 до 15 полів з сільськогосподарськими культурами та супутніми бур'янами. Зведені дані статистичної обробки результатів візуальної оцінки посівів цукрового буряку. Встановлено, що 15-76% рослин цукрових буряків мають симптоми вірусних або вірусоподібних захворювань.
Аналіз результатів дослiджень впродовж декількох польових сезонів дає можливiсть розглянути деякi факти збереження i розповсюдження вiрусiв, що уражують сiльськогосподарськi культури. Порівнюючи результати детектування антигенів вірусів у культурних рослинах (агроценоз) та диких рослинах (біоценоз) досліджуваних аграрних регіонів та наявність їх у ґрунтах, відмічається взаємозв'язок між знаходженням антигенів у ґрунті та рослині: ХВК, УВК, ВМБ, ВШМЯ, ВТМ - у Волинській області; ХВК, УВК, ВМБ, ВСПБ, ВТМ, ВОМ, ВЖКЯ, ВШМЯ - у Київській області; ХВК, УВК, ВМБ, ВЖКЯ, ВШМЯ, ВТМ - у Харківській області. Розглядаючи ці результати в динаміці, звертає на себе увагу факт не тільки кореляції між знаходженням антигенів вірусів в ґрунті та рослині, але й деякі закономірності динаміки виявлення вірусів у ґрунті. Так, наприклад, на полі під картоплею (Б-6) ХВК детектувався тільки на рослинах, у ґрунті не виявлявся, що могло бути пов'язане з ранніми етапами онтогенезу рослини (під час відбору зразків). У наступні роки антигени цього вірусу вже детектувалися в ґрунті, не дивлячись на те, що на полі вирощувалася пшениця. Однак в тих ценозах, які не використовувалися під сільськогосподарські угіддя (Б-5 - екологічна балка), відбувалося більш-менш стабільне детектування вірусів, як у рослинах, так і в ґрунті.
Такий патоген, як вiрус смугастої мозаїки пшеницi, детектувався у Волинськiй, Київській та Одеській областях як у ґрунті, так i на пшеницi; у Харківській області тільки на пшениці. Спiвпадає з лiтературними даними той факт, що вірус огіркової мозаїки зустрічається в ґрунті (у Харкiвськiй, Одеській та Київськiй областях).
На полях пiд цукровим буряком виявлялася зовсiм iнша картина. В Харкiвськiй та Київській областях частіше всього зустрічався вірус жовтяниці буряку, антиген якого детектувався як в рослинах, так і в ґрунті. На полях Харківської областi крiм антигенів вірусу жовтяниці буряку вiдмiчено також вiрус мозаїки буряку, вiрус слабкого пожовтiння буряку та вiрус штрихуватої мозаїки ячменю (або серологiчно близький до нього). Слiд вiдмiтити, що практично всi обстеженi поля цукрового буряку в Харкiвськiй областi є зволожуваними. Характерно, що цi ж вiруси детектувалися i на цукровому буряку, однак фактiв передачi вірусу мозаїки, жовтухи та слабкого пожовтіння буряку через ґрунт в лiтературi не зустрiчається. Якщо порiвнювати в цiлому, то Харкiвська область знову звертає на себе увагу наявнiстю вiрусiв цукрового буряку в “диких” ценозах, що може мати зв'язок з загальним забрудненням середовища. Загалом якраз у Харкiвськiй областi в обстежених “диких” ценозах найширше представленi вiруси рослин.
При дослiдженнi бiоценозiв Волинської областi також спостерігалась кореляцiя мiж наявнiстю вiрусiв у рослинах та ґрунті. Були одержанi позитивнi результати IФА в окремих точках на віруси жовтяниці та мозаїки буряку, Y-вірус картоплі та вірус тютюнової мозаїки. Однак деякі вiруси зустрiчалися або тiльки в рослинах, або тiльки в ґрунті в залежностi вiд мiсця вiдбору зразків. Антиген вірусу слабкого пожовтіння буряку був дiагностований тiльки в ґрунті.
Обстеження лiсостепових зон Одеської областi, якi не використовуються для сiльськогосподарських потреб, виявило слабку кореляцію мiж знаходженням вiрусiв в рослинах та ґрунті. Виявленi вiруси знаходились, в основному, тiльки в рослинах (Y-вірус картоплі, вірус мозаїки буряку, вірус тютюнової мозаїки). Цi вiруси накопичуються в лободi (Chenopodium album L.), лопуху (Arctium lappa L.), кульбабi (Taraxacum officinale Wigg.), що співпадає з літературними даними. В осотi (Cirsium arvense L.) жоден з вiрусiв, дiагностика яких проводилася, не був виявлений, а в ґрунті був виявлений тiльки антиген вiрусу жовтяницi буряку.
При електронномікроскопічному вивченні ізолятів вірусів, отриманих з досліджених агроценозів, за морфологією та розміром вірусні частки практично не відрізнялися між собою та від стандартних показників, що підтверджується також і даними седиментаційного аналізу.
Оскільки з одного боку віруси детектуються в сільськогосподарських рослинах, а з другого боку в ґрунті, стає можливим використовувати факти наявності антигенів тих чи інших вірусів як для загальної оцінки агроценозу, так і для прогнозування можливостей розвитку вірусних захворювань рослин в наступні роки. Як приклад, можна розглянути точку Б-2 в Київській області. В перший рік досліджень ВЖКЯ та ВШМЯ детектуються як в ґрунті, так і в рослинах кукурудзи, причому в ґрунт ці віруси могли потрапити з попередньо вирощуваних рослин (в даному випадку це кукурудза гібридна). Виходячи з біології збудників ВЖКЯ (група лютеовірусів) та ВШМЯ (група гордеівірусів), ми не можемо припустити інфікування рослин через ґрунт. Так, ВЖКЯ має широке коло господарів з родини Gramineae, передається за допомогою попелиць персистентним шляхом, не розмножується у цьому векторі, не передається трансоваріально, не передається механічно (в тому числі й через ґрунт), не передається контактом між рослинами, не передається насінням та пилком. Передача до нових рослин-господарів відбувається за рахунок попелиць Rhopalosiphum maidis. Rh. padi, Myzus persicae та ін. В свою чергу ці попелиці в умовах температурного режиму досліджуваних регіонів (абсолютний мінімум температури січня - 32-41°С) зимують виключно в стадії яєць, а не імаго (дорослої особини), таким чином передавати лютеовіруси в умовах України попелиці можуть тільки в разі прямого контакту з резервуарами вірусних інфекцій (багаторічні бур'яни або дерев'янисті рослини), оскільки віруси не можуть передаватися через яйця. При сприятливих погодних умовах розвитку цих векторів можуть відбуватися масові ураження чутливих сільськогосподарських посівів, що в свою чергу призводить до значних економічних збитків. Однак, як було сказано вище, при рості, розвитку рослин та при збиранні врожаїв віруси та (або) їх антигенні детермінанти можуть слугувати сигналом про наявність стійкої циркуляції цього вірусу в даному агроценозі, даючи змогу прогнозувати несприятливий розвиток подій та запобігати цьому. Розглядаючи цей агроценоз в динаміці, ми можемо бачити, що після того, як вірус детектувався в рослинах (кукурудза) і ґрунті, на наступний рік при висіві цукрових буряків вірус детектувався тільки у ґрунті. І дійсно, виходячи з літературних даних та власних експериментів, відомо, що ВЖКЯ не уражує цукрові буряки, маючи вузьке коло господарів з родини Gramineae, хоча існує багато спільних для цукрових буряків та пшениці шкідників - векторів цих вірусів (Rhopalosiphum padi, Myzus persicae, Acyrtosiphon dirhodum, Macrosiphum avenae та ін). Однак дослідження наступного року (коли висіяли пшеницю) показали наявність ВЖКЯ тільки на рослинах пшениці, що якраз і є доказом можливості використання детекції антигенів в ґрунті, як прогнозуючого фактору розвитку інфекції в залежності від сівозмін та погодно-кліматичних умов.
На Волині в точці В-6 антигени ХВК детектувалися в ґрунті, коли вирощували пшеницю (перед цим була картопля), і наступного року при культивуванні картоплі вона була інфікована цим вірусом. ХВК належить до групи потексвірусів, уражує багато сільськогосподарських та диких рослин з 16 родин. Передається контактом між рослинами, механічно, не передається за допомогою векторів. Може передаватися насінням бур'янів, а також зооспорами збудника рака картоплі (Synchiytrium endobioticum). У деяких випадках картопля може уражуватись через коріння ХВК. Не передається пилком. Тож цілком природно, що вірус може інфікувати рослини картоплі, які будуть висаджені в контамінований ХВК ґрунт, або безпосередньо через корені, або при контакті бур'янів-резерваторів та культурних рослин, або за допомогою векторів-комах, що могли інфікуватися з супутніх бур'янів, і такий перебіг подій можливо прогнозувати та попереджувати шляхом своєчасної детекції антигенів вірусів.
У точці Х-1 (Харківська область) ми можемо простежити “міграцію” антигену ВМБ (група потівірусів). У перший рік досліджень антигени ВМБ детектувалися тільки на цукрових буряках (попередня культура - пшениця). Наступного року антиген ВМБ визначаєтьсяє і у ґрунті, і в сільськогосподарських рослинах (в даному випадку капусті). Виходячи з біології збудника відомо, що ВМБ уражує рослини 13 родин, в тому числі і Brassicaceae. Вірус передається неперсистентно більш ніж 28 видами попелиць, механічною інокуляцією; за допомогою щеплень; не передається контактом між рослинами; насінням та пилком. Через дуже широке коло рослин-резерваторів (в більшості бур'янів) існує велика ймовірність попадання вірусних антигенів в ґрунт з рослинними залишками. Наступного року при посіві пшениці вірус детектувався тільки в ґрунті. Взагалі для потівірусів не доведена передача через ґрунт, але, як видно з проведених досліджень, ґрунт може виступати одним з найперших факторів визначення можливої циркуляції цих вірусів при короткострокових прогнозах.
При культивуванні кукурудзи протягом всього періоду досліджень вірусні антигени представлені дуже широко в перший рік мають тенденцію до збільшення протягом наступних двох років. Це може бути пов'язане з погіршенням санітарного стану посівів та збільшенням контамінації вірусами ґрунту. Антигени ВШМЯ у 1994 році детектувалися в рослинах кукурудзи; в 1995 - тільки в ґрунті; в 1996 - і в рослинах, і в ґрунті. Такий патоген, як ВШМЯ, належить до групи гордеівірусів. Він може уражувати рослини з 3 родин, таких як Chenopodiaceae, Gramineae та Solanaceae. Передається механічною інокуляцією, за допомогою насіння (до 90-100%), пилком на рослини, які запилюються. З рослинами або пилком вірус та/або антиген може потрапляти у ґрунт та підтримувати епідемічний ланцюг.
На прикладі ВТМ та ВЖКЯ показано, що концентрація вірусних антигенів у рослинах та ґрунті залежить також і від зміни культурних рослин в агроценозах, в той час як у природних ценозах цей рівень концентрації знаходиться на більш менш постійному рівні.
Роль супутніх рослин (бур'янів та дикоростучих) та ґрунту у предикції фітоепідемій. Зв'язок фітовірусного навантаження агро- та біоценозів із забрудненням довкілля полютантами техногенної природи
У результаті обстежень агроценозів України на вміст антигенів вірусів серед бур'янів методом ELISA було встановлено, що практично всі бур'яни в агроценозах давали позитивні результати на ті чи інші вірусні антигени. Наприклад, вірус мозаїки цукрового буряку ідентифікувався на Cirsium arvensis, Amaranthus caudatus, Chenopodium gybridum, Ch. album, Ch. rubrum, хоча і з різною частотою. Приймаючи до уваги отримані результати, як предиктор розповсюдження цього вірусу в агроценозі можуть бути використані Cirsium arvensis та Amarantus caudatus, які чутливі до більш вузького спектру вірусів, ніж інші перераховані бур'яни.
Аналогічно визначався вміст антигенів ХВК, ВШМЯ та ВЖКЯ в бур'янах досліджуваних регіонів.
Виявлено, що акумуляція ХВК на Convolvulus arvensis, може впливати на розповсюдження даної інфекції, так як C. arvensis є резервантом даного вірусу на території агроценозу завдяки своїй чутливості до даного вірусу та є багаторічною рослиною. Циркуляція вірусу жовтяниці цукрового буряку пов'язана з наявністю в агроценозі Cirsium arvensis, а для вірусів штрихуватої мозаїки ячменю та жовтої карликовості ячменю важливим є факт присутності на посівах Elytrigia intermedia та Phleum pratence.
Аналіз отриманих результатів також показав як різну частоту виявлення ВСПБ, ВЖКЯ, ВСЛК в обстежених агроценозах, так і залежність цієї величини від зміни культурних рослин-господарів та їх фітосанітарного стану. Частота виявлення розраховувалась як співвідношення позитивних результатів ІФА усіх зразків з ценозу до загальної кількості протестованих зразків. Найбільше у відсотковому відношенні як ВЖКЯ, так і ВСПБ, зустрічалося в агроценозах Харківської області (до 60% порівняно з 30% в Одеській, 20% в Київській та 15% у Волинській) для ВЖКЯ, приблизно такий самий рівень відзначався і для ВСПБ (70, 20, 15, 0% відповідно). ВСЛК діагностувався тільки епізодично в супутніх бур'янах. Це, скоріше за все, пов'язано з відсутністю картоплі в змінах культурних рослин-господарів обстежених агроценозів. Однак у Волинській області на експериментальних полях, де всі три роки висаджувалась картопля, вірус ідентифікувався в усіх зразках картоплі та бур'янах-резервантах (Amaranthus albus L., Solanum nigrum L.). За результатами досліджень двох різних агроценозів Харківської та Київської областей можна відзначити залежність частоти вияву вірусів від зміни культурних рослин-господарів та наявності тих чи інших супутніх бур'янів. Так для ВЖКЯ резервантами можна вважати Elytrigia intermedia N., Chenopodium album L., що здатні навіть після сівозміни (цукрових буряків) призвести до нового циклу поширення вірусу (вже на озимій пшениці). Для ВСПБ такими резервантами можуть виступати Senesio vulgaris L., Chenopodium amaranticolor L. та Datura stramonium L. Особливо слід відзначити реєстрацію (як електронномікроскопічним, так і імуноферментним аналізом) високої концентрації вірусу слабкого пожовтіння буряку в талабані (Thlaspi L.). Талабан польовий (T. arvensis) і талабан ранній (T. praecox) широко зустрічаються як у вигляді бур'янів на полях цукрового буряку, так і в необроблюваних ділянках ландшафту. Важлива роль талабану як резерватора вірусних інфекцій витікає з того, що це дворічна (T. arvensis), або багаторічна (T. praecox) рослина; таким чином талабан виступає підтримувачем безперервної циркуляції ВСПБ в агроценозах. У світовій літературі дані про Thlaspi L. як чутливого або безсимптомного господаря представників родини Luteoviridae нами не були знайдені.
...Подобные документы
Історія дослідження покривів земноводних. Порівняльно-анатомічне дослідження щільності інфраепідермальних капілярів у шкірі земноводних різних екологічних груп в залежності від місця їх проживання. Еколого-морфологічний аналіз досліджуваних видів.
научная работа [2,8 M], добавлен 12.03.2012Історія еволюційного розвитку та систематика Голонасінних. Особливості анатомічної будови хвойних рослин України. Морфологічна будова представників хвойних. Дослідження впливу різних екологічних факторів на анатомічну та морфологічну будову хвойних.
курсовая работа [11,5 M], добавлен 04.06.2014Характер зміни вмісту нітратів у фотоперіодичному циклі у листках довгоденних і короткоденних рослин за сприятливих фотоперіодичних умов. Фотохімічна активність хлоропластів, вміст никотинамидадениндинуклеотидфосфату у рослин різних фотоперіодичних груп.
автореферат [47,7 K], добавлен 11.04.2009Характеристика та відомості про віруси. Функціональні особливості будови та експансії геному фітовірусів. Регенерація рослин з калюсу. Патогенез та передача вірусних інфекцій. Роль вірусів в біосфері. Мікрональне розмноження та оздоровлення рослин.
учебное пособие [83,6 K], добавлен 09.03.2015Шляхи розповсюдження вірусів рослин в природі та роль факторів навколишнього середовища. Кількісна характеристика вірусів рослин. Віруси, що ушкоджують широке коло рослин, боротьба із вірусними хворобами рослин. Дія бактеріальних препаратів і біогумату.
курсовая работа [584,5 K], добавлен 21.09.2010Дослідження мікрофлори повітря та води. Загальна характеристика родини Herpesviridae. Будова і властивості герпес-вірусів. Реплікація герпес-вірусів. Групи крові та інфекційні захворювання. Нова вакцина проти вірусу герпесу. Екологічні зони України.
научная работа [1,3 M], добавлен 03.11.2015Молекулярна структура та фізіологічні властивості води. Термодинамічні показники водного режиму рослин. Процеси надходження і пересування води в рослині. Коренева система як орган поглинання води. Особливості водного режиму у різних екологічних груп.
курсовая работа [52,6 K], добавлен 25.12.2013Організація бактеріальних біоплівок та процес їх утворення. Використання атомно силової мікроскопії для дослідження біоплівок, поширення їх у природі та методи штучного вирощування. Стійкість біоплівкових бактерій до дії антибіотиків і стресових чинників.
реферат [1,7 M], добавлен 25.01.2015Історія вивчення ґрунтових олігохет. Фізико-географічні особливості Малого Полісся. Екологія люмбріцід роду Apporectoidea, їх поширення в Малом Поліссі. Дослідження фауни, екології, хорології ґрунтових олігохет у природних біоценозах Малого Полісся.
дипломная работа [1,6 M], добавлен 12.09.2012Вивчення царства грибів, різних за способом життя, будовою і зовнішньому вигляду. Дослідження подібності грибів до рослин і тварин. Аналіз будови та способів розмноження. Характеристика особливостей паразитичних, сапротрофних та сімбіотичних організмів.
презентация [1,3 M], добавлен 23.04.2013Аналіз сучасного стану епідеміології вірусів вищих рослин. Основні терміни та методи оцінки хвороб рослин. Загальна характеристика та особливості мозаїчного вірусу. Шляхи розповсюдження та заходи боротьби з вірусом зморшкуватої мозаїки квасолі в природі.
курсовая работа [385,2 K], добавлен 21.09.2010Дослідження структурної організації зоопланктонних угруповань річкової ділянки літоралі Каховського водосховища в літній період. Встановлення видового складу, представленості таксономічних груп, вивчення динаміки чисельності та біомаси зоопланктону.
статья [615,9 K], добавлен 19.09.2017Значення риб у водних біоценозах. Аналіз основного видового складу риб р. Случ. Характеристика природно-кліматичних умов району дослідження. Характеристика риб рядів окунеподібні, коропоподібні, щукоподібні. Особливості біології риб та їх поширення.
курсовая работа [2,0 M], добавлен 08.02.2015Фази вегетації рослин. Умови росту й розвитку рослин. Ріст та розвиток стебла. Морфологія коренів, глибина і ширина їхнього проникнення у ґрунт. Морфогенез генеративних органів. Вегетативні органи квіткових рослин. Фаза колосіння у злаків і осоки.
курсовая работа [64,0 K], добавлен 22.01.2015Характеристика шкідників і збудників захворювань рослин та їх біології. Дослідження основних факторів патогенності та стійкості. Аналіз взаємозв’язку організмів у біоценозі. Природна регуляція чисельності шкідливих організмів. Вивчення хвороб рослин.
реферат [19,4 K], добавлен 25.10.2013Колообіг азоту та вуглецю як основні біогеохімічні цикли, які відбуваються у наземних еко- і агроекосистемах. Вплив різних типів сівозміни та виду органічних добрив на нормовані параметри азото-вуглецевого обігу в агроценозах Лісостепу України.
статья [229,5 K], добавлен 10.04.2015Проведення дослідження особливостей пристосувань певних видів рослин до ентомофілії. Оцінка господарської цінності, значення та можливості використання комахозапилення у практичній діяльності людини. Вивчення взаємної адаптації квитків та їх запилювачів.
контрольная работа [3,0 M], добавлен 11.11.2014Дослідження структурної організації зоопланктонних угруповань річкової ділянки літоралі Каховського водосховища в літній період. Видовий склад, представленість таксономічних груп, динаміка чисельності і біомаси зоопланктону упродовж 3-4 років дослідження.
статья [663,5 K], добавлен 21.09.2017Сутність, види і механізм дії мікробного антагонізму. Історія відкриття антибіотиків, особливості їх раціонального застосування в сучасних умова. Роль антибіотиків у біоценозах. Розгляд бактеріостатичної дії антибактеріальних препаратів на мікроорганізми.
курсовая работа [966,8 K], добавлен 21.09.2010Аналіз екологічних особливостей ампельних рослин та можливостей використання їх у кімнатному дизайні. Характеристика основних видів ампельних рослин: родина страстоцвітні, аралієві, спаржеві, ароїдні, комелінові, акантові, ластовневі, лілійні, геснерієві.
курсовая работа [1,4 M], добавлен 21.09.2010