Популяційно-генетична характеристика великої білої породи свиней за різними типами молекулярно-генетичних маркерів

3. Корінний С.М. Імуногенетична характеристика різних генотипів великої білої породи свиней в Україні / С.М. Корінний // Науковий вісник Львівської національної академії ветеринарної медицини ім. С.З.Гжицького. Львів 2004. Т.6(№3) Ч.4. - С. 60-66.

4. Корінний С.М. Шерсть тварин, як зручний об'єкт виділення ДНК для аналізу за допомогою ПЛР / С.М. Корінний, К.Ф. Почерняєв, В.М. Балацький // Ветеринарна біотехнологія. - 2005. - №7. - C.80-82. (Дисертантом проведено лабораторну роботу, підготовлено розділ матеріали і методи та сформульовано висновки).

5. Корінний С.М. Популяційно-генетична характеристика великої білої породи свиней за мікросателітними маркерами / С.М. Корінний // Науковий вісник Львівського національного університету ветеринарної медицини та біотехнологій ім. С.З.Гжицького. Львів 2008. Т.10(№3) Ч.3. - С. 58-64.

6. Корінний С.М. Генетична структура великої білої породи свиней за результатами генотипування по локусах мікросателітної ДНК / С.М. Корінний, В.М. Балацький // Науковий вісник Національного університету біоресурсів і природокористування України/ Редкол.: Д.О. Мельничук (відп. ред.) та ін. - К., 2009. - Вип.138. - С.336-344. (Дисертантом проведено типування тварин за мікросателітними локусами, сформульовано висновки та підготовлено статтю).

7. Корінний С.М. Порівняння популяційної структури ліній внутрішньопородних типів УВБ-1 і УВБ-2 за імуногенетичними та ДНК-маркерами / С.М. Корінний // «Вісник аграрної науки Причорномор'я» Миколаївського державного аграрного університету. Редкол.: В.С. Шебанін (гол. ред.) та ін. - Миколаїв, 2010. - Вип. 2 (53). - 2010. - С. 250-262.

Корінний С.М. Популяційно-генетична характеристика великої білої породи свиней за різними типами молекулярно-генетичних маркерів. - Рукопис.

Дисертація на здобуття наукового ступеня кандидата сільськогосподарських наук за спеціальністю 03.00.15 - генетика. Інститут розведення і генетики тварин НААН, с. Чубинське, 2011.

Дисертація присвячена вивченню популяційно-генетичних характеристик внутрішньопородних типів великої білої породи української селекції (УВБ-1, УВБ-2) і великої білої породи англійської селекції (ВБА) за імуногенетичними маркерами та локусами мікросателітної ДНК. Проведено порівняльний аналіз трьох популяцій УВБ-1, УВБ-2 та ВБА, що утримуються в провідних племінних господарствах з розведення великої білої породи свиней. Також проведено порівняльний аналіз популяційно-генетичних параметрів родин і ліній внутрішньопородних типів УВБ-1 і УВБ-2 за двома типами молекулярно-генетичних маркерів. Основними популяційно-генетичними параметрами, залученими для порівняння були: частоти алелів імуногенетичних та мікросателітних ДНК-маркерів, рівні гетерозиготності фактичної та очікуваної, відхилення в розподілі генотипів від очікуваного, генетичні дистанції розраховані за алгоритмами Нея для імуногенетичних маркерів і локусів мікросателітної ДНК та Роджерса для імуногенетичних маркерів. На основі генетичних дистанцій побудовані дендрограми філогенетичних взаємовідносин за методом UPGMA. Встановлені статистично достовірні відмінності частот алелів за обома типами молекулярно-генетичних маркерів.

Виявлено достовірні відмінності рівнів фактичної і очікуваної гетерозиготності за локусами мікросателітної ДНК. В ході досліджень вперше розроблені організаційно-технологічні принципи використання локусів мікросателітної ДНК в мультиплексній полімеразній ланцюговій реакції для оцінки генетичної диференціації внутрішньопородних типів у великій білій породі свиней.

Проведені дослідження дають можливість охарактеризувати популяції свиней великої білої породи - внутрішньопородних типів УВБ-1, УВБ-2 та англійської селекції на сучасному етапі їхнього становлення.

Коринный С.Н. Популяционно-генетическая характеристика крупной белой породы свиней по разным типам молекулярно-генетических маркеров. - Рукопись.

Диссертация на соискание научной степени кандидата сельскохозяйственных наук по специальности 03.00.15 - генетика. Институт разведения и генетики животных НААН, с. Чубинское, 2011.

Диссертация посвящена изучению популяционно-генетических характеристик внутрипородных типов крупной белой породы украинской селекции (УКБ-1, УКБ-2) и крупной белой породы английской селекции (КБА) по иммуногенетическим маркерам и локусам микросателлитной ДНК. Проведен сравнительный анализ трех популяций УКБ-1, УКБ-2 и КБА, которые разводятся в ведущих племенных хозяйствах по разведению крупной белой породы свиней. Также проведен сравнительный анализ популяционно-генетических параметров семейств и линий внутрипородных типов УКБ-1 и УКБ-2 по двум типам молекулярно-генетических маркеров. Основными популяционно-генетическими параметрами, которые использовались для сравнения, были: частоты аллелей иммуногенетических и микросателлитных маркеров, уровни наблюдаемой и ожидаемой гетерозиготности, достоверность отклонения в распределении генотипов в сравнении с ожидаемым распределением по Харди-Вайнбергу. Генетические дистанции рассчитанные по алгоритмам Нея для двух типов маркеров и Роджерса для иммуногенетических маркеров. На основании генетических дистанций были построены дендрограммы взаимоотношений по методу UPGMA. Установлены статистически достоверные отличия частот аллелей по двум типам молекулярно-генетических маркеров. Обнаружены достоверные отличия уровней наблюдаемой и ожидаемой гетерозиготности по локусам микросателлитной ДНК. В ходе исследований впервые разработаны организационно-технологические принципы использования локусов микросателлитной ДНК в мультиплексной полимеразной цепной реакции для оценки генетической дифференциации внутрипородных типов в крупной белой породе свиней. Проведенные исследования дают возможность охарактеризовать популяции свиней крупной белой породы - внутрипородных типов УКБ-1, УКБ-2 и КБА на современном этапе их становления.

S.N. Korinniy. Population Genetic Characteristics of Large White Pigs on Different Types of Molecular Genetic Markers. - Manuscript.

Dissertation for the Candidate's degree in agriculture on speciality 03.00.15 - Genetics. The NASA Breeding and Genetics of animals Institute, v. Chubinske, 2011.

The dissertation work presents the results obtained by means of population - genetic analyzing the intrabreed types of Ukrainian selection large White pigs (ULW-1, ULW-2) and the English selection large White pigs (LWE) using two types of molecular genetic markers, both immunogenetic and microsatellite. The technology of micro-satellite loci analysis in the multiplex polymerase chain reaction was improved. The comparative study of the ULW-1, ULW-2 and LWE pigs was executed at the leading pedigree farms specialized in large White pigs breeding. The comparative analysis of the intrabreed types ULW-1 and ULW-2 families and lines population genetic parameters was also conducted. The basic population genetic parameters used for comparison were the following: immunogenetic and micro-satellite markers allelic frequencies, levels of the observed and the expected heterozygosity, deviations in genotype distribution in comparison with the expected one. Genetic distances were calculated on Neis' algorithms for immunogenetic and micro-satellite markers and on Rogers' algorithms for immunogenetics markers. On the genetic distances basis dendrograms of phylogenetic relations were built by the UPGMA method.

The reliable differences on allelic frequencies of immunogenetic markers were detected between the animal populations on H, K, E and L blood group systems. The above fact demonstrates genetic features peculiar for each animal population. Analyzing the result of herd typing on five micro-satellite DNA loci also revealed the reliable allelic frequencies differences on all the five loci, thus demonstrating the fact of certain allelic funds formation, peculiar for the Ukrainian Selections intrabreed types as well as for LWE for the period of separate direct selection.

The average actual heterozygosity on immunogenetic and DNA markers was lower than the expected one in all the studied populations. It may be the result of the selection pressure, which helps to homozygous animals selection. The mean heterozygosity indices demonstrate the high level of genetic consolidation in pig herds belonging to the leading pedigree farms of Ukraine specialized in Large White Pigs breeding.

Statistically reliable differences were observed in ULW-1, ULW-2 and LWE populations in genotype distribution comparing to the expected one on blood groups and microsatellite markers. The ULW-1 type animals demonstrated deviations on G (p < 0.05), E (p < 0.05) and B (p < 0.01) blood groups systems.

These indices made for the LWE animals: G (p < 0.01), D (p < 0.01), E (p < 0.01) and L (p < 0.05), and for the ULW-2 pigs - B (p < 0.001), E (p < 0.001), G (p < 0.001), L (p < 0.001) and D (p < 0.01) systems. On microsatellite loci so reliable deviations were observed in LWE

(p < 0.001) on S0105, S0101, SW857 and S0005 loci (p < 0.01). In the random group of ULW-1 pigs the reliable deviations were observed (p < 0.001) on S0105, S0101, SW240 and S0005 loci (p < 0.01). The deviations in the ULW-2 population demonstrate a reliable difference in the genotypes distribution in comparison with the theoretically expected deviations (according to Hardi-Weinberg) in S0155 and SW857 (p < 0.001) and in S0101 loci (p < 0.05). In the most cases the genotypes distribution deviations from the expected one showed the tendency of homozygotes increase, which is peculiar for the closed animal populations or herds undergoing selection pressure.

Genealogical relations demonstrate the similarity of the received dendrograms on immunogenetic and microsatellite DNA markers. The intrabreed types of both home and English Large White pigs selection are located in the common sub-cluster, thus testifying to their common origin and to the presence of similar allelic fund on the both types of markers. The relationship inside the types on genealogical lines and families displays their distinct division on types, thus testifying to the process of genetic differentiation, which took place in these populations.

Thus, in the course of studies the organizational technological principles of using microsatellite DNA loci in the multiplex polymerase chain reaction were first developed for estimation of genetic differentiation in the Large White pigs' intrabreed types. The conducted studies permit the genetic characterizing of Large White pigs - the intrabreed types ULW-1, ULW-2 and LWE for the present period of their becoming.

Размещено на Allbest.ru