Генофонды удмуртов и бесермян в контексте финно-угорских и других окружающих народов: полногеномные и фармакогенетические данные
Характеристика фармакогенетического статуса населения Удмуртии. Определение близости частот генетических маркеров, используемых в фармакогенетических рекомендациях, у бесермян и удмуртов с частотами коренного населения Поволжья, Приуралья и Южного Урала.
Рубрика | Биология и естествознание |
Вид | статья |
Язык | русский |
Дата добавления | 11.07.2023 |
Размер файла | 1,7 M |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
25. Чураков В. С. Каринский стан: история, территория, население // Исторические, философские, политические и юридические науки, культурология и искусствоведение. Вопросы теории и практики. 2017. № 12. Ч. 3. С. 215-219.
26. Чураков В. С. К критике воршудной теории // Финно-угроведение. 2003. № 2. С 3-18.
27. Широбоков И. Г. К антропологии пермских народов XVII-XIX вв. (краниологические данные) // Ежегодник финно-угорских исследований. 2014. № 3. С. 80-98.
28. Юсупов Ю. М., Схаляхо Р. А., Балановский О. П. и др. Генетические портреты семи кланов северозападных башкир: вклад финно-угорского компонента в генофонд башкир // Вестник Московского университета. Серия XXIII. Антропология. 2017. № 3. C. 94-103.
29. Alexander D. H., Novembre J., Lange K. Fast model-based estimation of ancestry in unrelated individuals // Genome Research. 2009. V. 19. P. 1655-64.
30. Chang, C. C., Chow, C. C., Tellier, L. C. et al. Second-generation PLINK: rising to the challenge of larger and richer datasets // Gigascience. 2015. V. 4. no. 1. P. 13742-015.
31. Core ADME Gene List [Электронный ресурс]. URL: http://pharmaadme.org/joomla/index.php?option=com_content&task=view&id=12&Itemid=27 (дата обращения 25.04.2021).
32. GG-base [Электронный ресурс]. URL: https://www.gg-base.org/ (дата обращения 25.04.2021).
33. Ilumae A. M., Balanovska E., Balanovsky O. et al. Human Y Chromosome Haplogroup N: A Non-trivial TimeResolved Phylogeography that Cuts across Language Families // Am J Hum Genet. 2016. V. 99. P. 163-173.
34. Jeong C., Balanovsky O., Balanovska E. et al. The genetic history of admixture across inner Eurasia // Nature ecology & evolution. 2019. V. 3. no. 6. P. 966-976.
35. Johnson J. A., Caudle K. E., Gong L. et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) guideline for pharmacogenetics-guided warfarin dosing: 2017 update // Clinical Pharmacology & Therapeutics. 2017. V. 102. no. 3. P. 397-404.
36. Lazaridis I., Balanovska E., Balanovsky O. et al. Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans // Nature. 2014. V. 513. no. 7518. P. 409-413.
37. Lima J. J., Thomas C. D., Barbarino J. et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) guideline for CYP2C19 and proton pump inhibitor dosing // Clinical Pharmacology & Therapeutics. 2020.
38. Patterson N., Moorjani P. et al. Ancient admixture in human history // Genetics. 2012. Vol. 192, no. 3. P. 10651093.
39. Patterson N., Price A. L., Reich D. Population structure and eigenanalysis // PLoS genet. 2006. Vol. 2, no. 12. P. 190.
40. PharmGKB [Электронный ресурс]. URL: https://www.pharmgkb.org (дата обращения 25.04.2021).
41. Scott S. A., Sangkuhl K., Stein C. M. et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium guidelines for CYP2C19 genotype and clopidogrel therapy: 2013 update //Clinical Pharmacology & Therapeutics. 2013. Vol. 94, no. 3. P. 317-323.
42. Tambets K., Balanovsky O., Balanovska E. et al. Genes reveal traces of common recent demographic history for most of the Uralic-speaking populations // Genome biology. 2018. V. 19. no. 1. P. 1-20.
43. Tambets K., Balanovsky O., Balanovska E. et al. The western and eastern roots of the Saami--the story of genetic “outliers” told by mitochondrial DNA and Y chromosomes // The American Journal of Human Genetics. 2004. Т. 74. Vol. 4. P. 661-682.
44. Triska P., Chekanov N., Prokhortchouk E.. et al. Between Lake Baikal and the Baltic Sea: genomic history of the gateway to Europe. BMC genetics. 2017. V. 18. no. 1. P. 5-20.
45. Waskom M. L. Seaborn: statistical data visualization. Journal of Open Source Software. 2021. V. 6. no. 60. P. 3021.
References
1. Aksyanova G. A. Antropologiya besermyan [Anthropology of Besermyan] Etnograficheskoe obozrenie [Ethnographic review], 2012, no, 2. P. 100-117. In Russian.
2. Aksyanova G. A. K antropologicheskoi kharakteristike yuzhnykh udmurtov [Anthropological characteristics of the southern Udmurts]. Etnograficheskoe obozrenie [Ethnographic review], 2003, no. 2. P. 110-126. In Russian.
3. Balanovska E. V., Zhabagin M. K., Balanovsky O. P. et al. Populyatsionnye biobanki: printsipy organizatsii i perspektivy primeneniya v genogeografii i personalizirovannoi meditsine [Population biobanks: principles of organization and prospects of application in genogeography and personalized medicine] // Genetika [Genetics], 2016, no. 12. P. 1371-1387. In Russian.
4. Balanovska E. V., Agdzhoyan A. T., Balanovsky O. P. et al. Tatary Evrazii: svoeobrazie genofondov krymskikh, povolzhskikh i sibirskikh tatar [Tatars of Eurasia: the originality of the gene pools of the Crimean, Volga and Siberian Tatars]. Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya XXIII. “Antropologiya” [Bulletin of Moscow University. Series XXIII. “Anthropology”], 2016, no.3. P. 72-82. In Russian.
5. Balanovska E. V., Chernevskiy D. K., Balanovsky O. P. Svoeobrazie novgorodskogo genofonda v kontekste narodonaseleniya Evropeiskoi ashki Rossii [The originality of the Novgorod gene pool in the context of the population of the European part of Russia]. Uchenye zapiski Novgorodskogo gosudarstvennogo universiteta [Memoirs of NovSU], 2021. In print. In Russian.
6. Balanovsky O. P. GenofondEvropy [The gene pool of Europe.]. Moscow: Tovarishchestvo nauchnykh izdanii KMK Publ., 2015. 354 p. In Russian.
7. Balanovsky O. P., Gorin I. O., Balanovska E. V. et al. Vzaimodeistvie genofondov russkogo i finnoyazychnogo naseleniya Tverskoi oblasti: analiz 4 mln SNP-markerov [Interaction of gene pools of the Russian and Finnish-speaking population of the Tver region: analysis of 4 million SNP markers]. VestnikRGMU [Bulletin of the Russian State Medical University], 2020, no. 6. P. 24-31. In Russian.
8. Belykh S. K Problema raspada prapermskoi etnoyazykovoi obshchnosti [The problem of the collapse of the prePermian ethno-linguistic community]. Izhevsk: Udmurtskii gosudarstvennyi universitet Publ., 2009. 149 p. In Russian.
9. Bermisheva M. A., Ginter E. K., Khusnutdinova E. K. et al. Populyatsionno-geneticheskoe issledovanie populyatsii udmurtov (analiz desyati polimorfnykh DNK-lokusov yadernogo genoma) [Population genetic study of the Udmurt population (analysis of ten polymorphic DNA loci of the nuclear genome)]. Genetika [Genetics], 2007, vol. 43, no. 5. P. 688-705. In Russian.
10. Grosheva A. N., Shneider Yu. V., Morozova I. Yu., et al. Geneticheskoe raznoobrazie besermyan po dannym opolimorfizme mitokhondrial'noi DNK [Genetic diversity of besermyans according to data on mitochondrial DNA polymorphism]. Genetika [Genetics], 2013, no. 11. P. 1337-1344. In Russian.
11. Grosheva A. N., Shneider Yu.V., Zhukova O. V., et al. Osobennosti mitokhondrial'nogo genofonda udmurtov v svyazi s ikh rodoplemennoi strukturoi [Features of the mitochondrial gene pool of Udmurts in connection with their tribal structure]. Genetika [Genetics], 2014, vol. 50, no. 9. P. 1104-1104. In Russian.
12. Deryabin V. E. K etnicheskoi antropologii sovremennykh fmskikh i tyurkskikh narodov vostochnoevropeiskoi Rossii [On the ethnic anthropology of modern Finnish and Turkic peoples of East European Russia]. Narody Rossii: ot proshlogo k nastoyashchemu. Antropologiya [Peoples of Russia: from the past to the present. Anthropology], 1998. P. 14-37. In Russian.
13. Kosareva I. A. Etnograficheskie gruppy udmurtskogo naroda (opyt vydeleniya). Chast' 1 [Ethnographic groups of the Udmurt people (isolation experience). Part 1]. Izvestiya Obshchestva arkheologii, istorii i etnografii pri Kazanskom universitete [News of the Society of Archeology, History and Ethnography at Kazan University], 2017, vol. 37, no. 2. 195 p. In Russian.
14. Koshel' S. M. Geoinformatsionnye tekhnologii v genogeografii [Geoinformation technologies in genogeography]. Sovremennaya geograficheskaya kartografiya [Modern geographical cartography]. Moscow: Data - Publ., 2012. P. 158-166. In Russian.
15. Matveev A. K. Substratnaya toponimiya Russkogo Severa. IV. Toponimiya meryanskogo [Substratum toponymy of the Russian North. IV. Meryanskiy toponymy]. Yekaterinburg: Izdatel'stvo Ural'skogo universiteta Publ., 2015. 313 p. In Russian.
16. Matveev A. K. Substratnaya toponimiya Russkogo Severa. Chast' I [Substratum toponymy of the Russian North. Part I.]. Yekaterinburg, 2001. 277 p. In Russian.
17. Matveev A. K. Substratnaya toponimiya Russkogo Severa. Chast' III [Substratum toponymy of the Russian North. Part III.]. Yekaterinburg, 2007. In Russian.
18. Matveev, A. K. Substratnaya toponimiya Russkogo Severa. Chast' II [Substratum toponymy of the Russian North. Part II]. Yekaterinburg: Izdatel'stvo Ural'skogo universiteta Publ., 2004. 21 p. In Russian.
19. Napol'skikh, V. V. Ocherki po etnicheskoi istorii [Essays on Ethnic History]. Kazan: Kazanskaya nedvizhimost' Publ., 2015. 646 p. In Russian.
20. Pislegin N. V., Churakov V. S. Naselennye punkty Udmurtskogo Prikam 'ya XVII - serediny XIX v. [Settlements of the Udmurt Prikamye of the 17th - mid-19th centuries]. Izhevsk: Udmurtskii federal'nyi issledovatel'skii tsentr Ural'skogo otdeleniya Rossiiskoi akademii nauk Publ., 2020, 784 p. In Russian.
21. Sadikov R. R. Poseleniya i zhilishcha zakamskikh udmurtov (material'nyi i dukhovnyi aspekty) [Settlements and dwellings of the Trans-Kama Udmurts (material and spiritual aspects)]. Ufa: Gilem Publ, 2001, 181 p. In Russian.
22. Smirnov O. V. K voprosu o permskom toponimicheskom substrate na territorii Marii El i v basseine srednego techeniya Vyatki (v svete etnicheskoi interpretatsii arkheologicheskikh kul 'tur). 1 [On the question of the Permian toponymic substratum on the territory of Mari El and in the basin of the middle reaches of the Vyatka (in the light of the ethnic interpretation of archaeological cultures). 1]. Voprosy onomastiki [Onomastics issues], 2013, no. 2(15). P. 7-59. In Russian.
23. Smirnov O. V. K voprosu o permskom toponimicheskom substrate na territorii Marii El i v basseine srednego techeniya Vyatki (v svete etnicheskoi interpretatsii arkheologicheskikh kul 'tur). 2 [On the question of the Permian toponymic substratum on the territory of Mari El and in the basin of the middle reaches of the Vyatka (in the light of the ethnic interpretation of archaeological cultures). 2] // Voprosy onomastiki [Onomastics issues], 2014, no. 2(16). P. 7-33. In Russian.
24. Trofimova, N. V., Litvinov, S. S., Khusnutdinova, E. K et al. Geneticheskaya kharakteristika populyatsii Volgo-Ural'skogo regiona po dannym ob izmenchivosti Y-khromosomy [Genetic characteristics of the populations of the Volga-Ural region according to the data on the variability of the Y chromosome]. Genetika [Genetics], 2015, vol. 51, no. 1. 122 p. In Russian.
25. Churakov V. S. Karinskii stan: istoriya, territoriya, naselenie [Karinsky Stan: history, territory, population]. Istoricheskie, filosofskie, politicheskie i yuridicheskie nauki, kul 'turologiya i iskusstvovedenie. Voprosy teorii i praktiki [Historical, philosophical, political and legal sciences, cultural studies and art history. Questions of theory and practice], 2017, no. 12. Part. 3. P. 215-219. In Russian.
26. Churakov V.S. K kritike vorshudnoi teorii [To the criticism of the vorshudnaya theory]. Finno-ugrovedenie [Finno-Ugric Studies], 2003, no. 2. P. 3-18. In Russian.
27. Shirobokov I. G. K antropologii permskikh narodov XVII--XIX vv. (kraniologicheskie dannye) [On the anthropology of the Permian peoples of the 17th-19th centuries. (craniological data)]. Ezhegodnikfmno-ugorskikh issledovanii [Yearbook of Finno-Ugric Studies], 2014, no. 3. P. 80-98. In Russian.
28. Yusupov Yu. M., Skhalyakho R. A., Balanovsky O. P. et al. Geneticheskie portrety semi klanov severozapadnykh ashkir: vklad finno-ugorskogo komponenta v genofond ashkir [Genetic portraits of the seven clans of the northwestern Bashkirs: the contribution of the Finno-Ugric component to the Bashkir gene pool]. Vestnik Moskovskogo universiteta. Seriya XXIII. Antropologiya [Bulletin of Moscow University. Series XXIII. Anthropology], 2017, no. 3. P. 94-103. In Russian.
29. Alexander D. H., Novembre J., Lange K. Fast model-based estimation of ancestry in unrelated individuals. Genome Research, 2009, vol. 19. Р. 1655-64.
30. Chang, C. C., Chow, C. C., Tellier, L. C. et al. Second-generation PLINK: rising to the challenge of larger and richer datasets. Gigascience, 2015, vol. 4, no. 1. P. 13742-015.
31. Core ADME Gene List [internet]. URL: http://pharmaadme.org/joomla/index.php?option=com_content &task=view&id=12&Itemid=27 (accessed 25.04.2021).
32. GG-base [internet]. URL: https://www.gg-base.org/ (accessed 25.04.2021).
33. Ilumae A. M., Balanovska E., Balanovsky O. et al. Human Y Chromosome Haplogroup N: A Non-trivial Time-Resolved Phylogeography that Cuts across Language Families. Am J Hum Genet, 2016, vol. 99. P. 163-173.
34. Jeong C., Balanovsky O., Balanovska E. et al. The genetic history of admixture across inner Eurasia. Nature ecology & evolution, 2019, vol. 3, no. 6. P. 966-976.
35. Johnson J. A., Caudle K. E., Gong L. et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) guideline for pharmacogenetics-guided warfarin dosing: 2017 update. Clinical Pharmacology & Therapeutics, 2017, vol. 102, no. 3. P. 397-404.
36. Lazaridis I., Balanovska E., Balanovsky O. et al. Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature, 2014, vol. 513, no. 7518. P. 409-413.
37. Lima J.J., Thomas C.D., Barbarino J. Et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) guideline for CYP2C19 and proton pump inhibitor dosing. Clinical Pharmacology & Therapeutics, 2020.
38. Patterson N., Moorjani P., Luo Y. et al. Ancient admixture in human history. Genetics. 2012, vol. 192, no. 3. P. 1065-1093.
39. Patterson N., Price A. L., Reich D. Population structure and eigenanalysis. PloS genet, 2006, vol. 2, no. 12. P. 190.
40. Pharm GKB [internet]. URL: https://www.pharmgkb.org (accessed 25.04.2021).
41. Scott S. A., Sangkuhl K., Stein C. M. Et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium guidelines for CYP2C19 genotype and clopidogrel therapy: 2013 update. Clinical Pharmacology & Therapeutics, 2013, vol. 94, no. 3. P. 317-323.
42. Tambets K., Balanovsky O., Balanovska E. et al. Genes reveal traces of common recent demographic history for most of the Uralic-speaking populations. Genome biology, 2018, vol. 19, no. 1. P. 1-20.
43. Tambets K., Balanovsky O., Balanovska E. et al. The western and eastern roots of the Saami--the story of genetic “outliers” told by mitochondrial DNA and Y chromosomes. The American Journal of Human Genetics, 2004, vol. 74, no. 4. P. 661-682.
44. Triska P., Balanovsky O., Prokhortchouk E. et al. Between Lake Baikal and the Baltic Sea: genomic history of the gateway to Europe. BMC genetics, 2017, vol. 18, no. 1. P. 5-20.
45. Waskom M. L. Seaborn: statistical data visualization. Journal of Open Source Software, 2021, vol. 6, no. 60, 3021 p.
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Оценка возможности использования генетических маркеров опухолевой ткани при раке легких. Определение частоты возникновения мутаций в гене EGFR. Влияние вдыхаемого табачного дыма на возникновения мутаций. Зависимость выбора тактики лечения от мутаций.
дипломная работа [186,7 K], добавлен 17.10.2013Характеристика условий Крайнего Севера. Воздействие метеорологических, геофизических и гелиофизических факторов региона на здоровье человека. Сравнение способности к адаптации и акклиматизации к условиям Крайнего Севера у пришлого и коренного населения.
презентация [1,5 M], добавлен 28.10.2016Грызуны как компоненты природных, исторически сложившихся территориальных комплексов Южного Урала. Лесные биотопы в Бузулукском бору, Шубарагашской лесной даче. Рацион грызунов и их значение для человека. Семейство беличьи, бобровые, хомяковые, мышиные.
курсовая работа [49,5 K], добавлен 23.01.2014- Особенности распространения и состояния популяций вяза шершавого на территории Архангельской области
Распространение и экологическая приуроченность вяза шершавого в России и в мире. Территория Воронежского заповедника. Старовозрастные леса Южного Урала. Физико-географическая характеристика района исследований. Диаметр ствола, высота дерева и кроны.
курсовая работа [6,3 M], добавлен 16.01.2014 Морфологическая разнообразность лимфоцитов, экспрессирование ими особых у каждой субпопуляции поверхностных маркеров. Различие Т-клеток по своим антигенраспознающим рецепторам. Дифференцировка В-клеток, активация Т и В-клеток, вызывающая синтез маркеров.
реферат [17,0 K], добавлен 26.09.2009Природно-климатическая характеристика района исследования. Методы учёта и сбора жужелиц. Методы анализа структуры населения жужелиц. Видовой состав. Экологические группы жужелиц по биотопическому преферендуму, степени увлажнения предпочитаемых биотопов.
курсовая работа [1,2 M], добавлен 13.03.2009Практические познания об окружающих человека растениях. Признаки семейства крестоцветных, его видовое разнообразие. Экологическая и хозяйственная роль представителей семейства крестоцветных в составе растительности Южного полушария и тропической зоны.
реферат [26,5 K], добавлен 09.07.2015Характеристика изменений, которые происходят в геноме клетки, и возникают при вставке мобильных генетических элементов в геном. Мобильные генетические элементы в геноме Drosophila Melanogaster (дрозофила чернобрюхая). Мобильные элементы гетерохроматина.
курсовая работа [72,8 K], добавлен 29.05.2015Выделение участков формации тростника южного по проективному покрытию. Особенности геологического строения и рельефа. Видовой состав растительности окрестностей станицы Алексее-Тенгинской района. Оценка жизненного состояния тростника южного района.
дипломная работа [4,0 M], добавлен 11.12.2015Особенности формирования ихтиофауны рек бассейна Сухоны. Качественный состав ихтиофауны и количественные характеристики рыбного населения в реках бассейна верхней Сухоны. Характеристика популяций основных видов–рыб в реках бассейна верхней Сухоны.
дипломная работа [1,0 M], добавлен 07.10.2016Феноменологическая теория роста населения Земли С.П. Капицы как значительное явление российской науки последнего времени. Анализ основных положений демографической теории, перспективы развития человечества в ее контексте. Количественные маркеры развития.
реферат [193,2 K], добавлен 25.11.2012Гидробиология как наука, изучающая жизнь в гидросфере в экологическом плане. Изучение водного населения в единстве с его средой, как живого компонента "блоков" биосферы - биогеоценозов, или экосистем. Основные факторы абиотической среды водного населения.
реферат [48,2 K], добавлен 23.07.2010История развития и изучения биоиндикации почвы. Структура животного населения почвы и факторы его разнообразия. Место беспозвоночных животных в почвообразовании. Влияние техногенного загрязнения и других внешних факторов на почвенных беспозвоночных.
реферат [1,2 M], добавлен 14.11.2010Обобщение способов сохранения и укрепления здоровья населения в современных условиях. Обзор основных методологических подходов к изучению влияния факторов внешней среды на состояние здоровья населения: эпидемиологического, донозологического, системного.
реферат [31,2 K], добавлен 01.04.2015Роль обыкновенной пустельги в агроценозах, места зимовки кобчика. Окраска верха тела самцов дербника. Численность и особенности гнездовой биологии пустельги и чеглока в Москве. Адаптация мелких соколов и других птиц к жизни среди населения мегаполиса.
курсовая работа [3,1 M], добавлен 27.01.2018Механизм эволюции прокариотического и эукариотического геномов. Свойства, отбор и динамика рисунка локализации мобильных генетических элементов. Роль мобильных генетических элементов и горизонтального переноса генетического материала в эволюции генома.
курсовая работа [84,5 K], добавлен 30.09.2009Программное обеспечение для осуществления моделирования биохимических и генетических процессов в клетке. Математическая модель динамики изменения объема и потенциала эритроцита. Симуляция гибели эритроцита методом фиксации трансмембранного потенциала.
дипломная работа [1,3 M], добавлен 26.05.2012Определение и регулирование осанки рефлексами позы, отображение физического и психического состояния человека, осанка как один из основных показателей здоровья. Роль позвоночника и окружающих его мышц в формировании осанки, определение осанки человека.
контрольная работа [27,9 K], добавлен 19.08.2010Принципы решения генетических задач. Гомозиготные организмы как представители "чистых линий". Гетерозиготные организмы при полном доминировании. Моногибридное и дигибридное скрещивание. Определение генотипов организмов по генотипам родителей и потомков.
методичка [29,0 K], добавлен 06.05.2009Население шмелей населенных пунктов России. Физико-географическая характеристика Вологодской области. Экологические особенности шмелей этого региона. Локальные фауны обитания шмелей. Население шмелей клумб. Видовой состав шмелей с. Тарногский Городок.
курсовая работа [319,3 K], добавлен 20.03.2017