Мониторинг как способ изучения состояния коллективного иммунитета и циркуляции вирусов гриппа и острой респираторной вирусной инфекции

3.2 Изоляция вирусов гриппа и их антигенная характеристика

Изоляция вирусов гриппа. Для увеличения эффективности выделения вирусов гриппа в региональных базовых лабораториях (РБЛ) НЦГ ВОЗ при НИИ гриппа было рекомендовано предварительное ПЦР-тестирование клинических образцов для отбора положительных на грипп материалов. Выделение вирусов осуществлялось от пациентов с тяжелой острой респираторной инфекцией (ТОРИ), с гриппоподобными заболеваниями (ГПЗ) и с острыми респираторными инфекциям (ОРИ), а также из ПЦР положительных образцов от умерших больных.

Исследования по выделению вирусов гриппа были начаты с 40-ой недели 2014 г. В течение сезона работы выполнялись в 31 РБЛ и в двух НЦГ. Первые штаммы вируса гриппа A(H3N2) были изолированы на 51 неделе 2014 г. в г. Астрахань. Начиная с 4 недели 2015 г., выделение вирусов гриппа A(H3N2) и гриппа В стало регулярным в разных городах страны. Пик выделения вирусов гриппа был достигнут на 7 неделе с последующим постепенным снижением. Результаты мониторинга процесса выделения вирусов гриппа показали, что начало эпидемии (с 51 недели 2014г. по 4 неделю 2015г.) было обусловлено циркуляцией вирусов гриппа A(H3N2), однако с 5 недели активизировались и вирусы гриппа В.Максимум выделения вирусов гриппа A(H3N2) пришелся на период с 5 по 11 неделю, хотя они продолжали выделяться и на последующих неделях, но с меньшей частотой. Вирусы гриппа В активно выделялись с 7 недели 2015г. и до конца сезона. Участие вируса гриппа A(H1N1)pdm09 в этиологии заболеваемости на всех этапах эпидемического процесса было незначительным.

Выявлена последовательность смены доминирующих возбудителей эпидемий в период с 2009 г. по 2015 г., как правило, с 2-летним, реже 3- летним интервалом, что иллюстрирует рис.7: грипп A(H1N1)pdm09 - в эпидемии 2009 г., 2011 г., 2013 г. и 2014г., A(H3N2) - в 2012 г. и 2015г., грипп B - 2011 г., 2013 г. и 2015г.

За эпидемический сезон 2014-2015 гг. в НИИ гриппа было проанализировано по РФ 187 вновь выделенных штаммов вируса гриппа на чувствительность к антивирусным препаратам. Из изученных изолятов 88 вирусов относились к типу А (5 штаммов -H1N1pdm09, 83 штамма - H3N2), а 99 вирусов - к типу В (94 штамма - Ямагатской линии, 5 штаммов - Викторианской линии). Исследована чувствительность вирусов к ингибиторам нейраминидазы - осельтамивиру (Тамифлю) и занамивиру (Реленза), а так же к ингибитору М2-белка - ремантадину.

Все проанализированные штаммы оказались ремантадин-устойчивыми, что было показано при помощи теста ингибиции вирусной репродукции и подтверждено секвенированием по выявлению мутацииS31N, несущего признака ремантадин-устойчивости.

Уровень чувствительности к осельтамивиру различался у вирусов гриппа А и В (вирусы гриппа В были менее чувствительны, однако полностью резистентных изолятов выявлено не было). Так же не было обнаружено изолятов, устойчивых к занамивиру, в этом случае чувствительность вирусов гриппа А и В существенно не различалась[29,31].

По данным вирусологического мониторинга лаборатории ФБУЗ (Центр гигиены и эпидемиологии в Тульской области) в структуре циркулирующих респираторных вирусов доля вируса гриппа составила 12%. Циркуляция вирусов гриппа отмечалась с 7-й недели 2014 года, пик пришелся на 13-18 недели, когда было изолировано 24 штамма вирусов. В структуре вирусов гриппа доминировал подтип гриппа А/H3N2 - 67% от всех выделенных вирусов, вирусы гриппа В составили 33%, вирус гриппа A/H1N1/pdm09 не выделялся.

Одновременно с вирусами гриппа отмечалась циркуляция вирусов не гриппозной этиологии (аденовирус, парагрипп, РС - вирус). Среди них доминировал РС-вирус - 44% от всех выделенных вирусов, аденовирусы составили 28%,вирусы парагриппа - 13%,прочие вирусы - 3%[22].

3.3 Результаты ПЦР - диагностики гриппа и других ОРВИ в НЦГ ВОЗ и региональных базовых лабораториях (РБЛ)

ПЦР исследования были проведены в 54 РБЛ и двумя НЦГ ВОЗ с использованием клинических образцов от 47888 пациентов. Частота диагностики гриппа A(H1N1) pdm09, A (H3N2) и B инфекции для всего населения страны в целом составила 2,2%, 14,3% и 8,7%, соответственно. Парагрипп, аденовирусы и РСВ инфекции, диагностировались в этих исследованиях в 3,4%, 3,7% и 6,0%, соответственно.

Кроме того, впервые были проанализированы возрастные особенности этиологии гриппа и ОРВИ по итогам обследования 38078 пациентов в РБЛ, представивших данные диагностики с разбивкой по возрастным группам больных 0-2, 3-6, 7-14, 15 и более лет. При этом обнаружено преобладание РСВ инфекции (14,4% случаев) в ОРВИ у детей младшего возраста(до 2 лет). Частота обнаружения РСВ снижалась с увеличением возраста (до 1,2% в возрастной группе 15 лет и более). Напротив, роль гриппа с возрастом увеличивалась: от 16,4% в возрастной группе 0-2 лет до 31% в возрастной группе школьников 7-14 лет (оба типа вирусов в целом) с сопутствующим снижением частоты детекций РСВ, парагриппа и аденовирусов (суммарно по ОРИ с 23,9% до 5,5%).

Мониторинг активности вирусов гриппа по результатам ПЦР диагностики и ИФА в РБЛ двух Национальных центров ВОЗ по гриппу за указанный период выявил сходные тенденции, свидетельствующие о доминировании вирусов гриппа A(H3N2) и В на всех этапах эпидемического процесса при минимальном участии вирусов гриппа A(H1N1)pdm09(рис. 18).

Рис.18. Мониторинг гриппа за 6 последовательных сезонов по результатам ПЦР диагностики по РФ[31]

В этом сезоне в период развития эпидемии, начиная с 6-й недели, наблюдалось увеличение случаев и РСВ-инфекции с пиком на 12-й неделе, которое оставалось высоким вплоть до 16-20 недели, когда активность гриппа уже резко снизилась. Как и в предыдущие годы, аденовирусные и парагриппозные инфекции регулярно регистрировались в течение всего сезона, хотя число случаев парагриппа было ниже в 2014-2015 гг. по сравнению с тремя предыдущими сезонами. РСВ-инфекция преобладала в течение последних трех сезонов, в сравнении с 2009-2010 гг. и 2010-2011гг., когда она была относительно низкой. Как правило, ее рост начинался одновременно с развитием эпидемии, но продолжался более длительное время (рис. 19) .

Рис.19. Мониторинг РСВ, парагриппозной и аденовирусной инфекций за 6 последовательных сезонов по данным ПЦР диагностики по РФ[31]

Согласно данным вирусологической лаборатории ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Тульской области», при использовании иммуноферментной (ИФ) и ПЦР (полимеразная цепная реакция) диагностики общая частота распознавания природы респираторной вирусной инфекции, включая грипп, составила 34%.

По результатам анализа материалов от 597 больных основным этиологическим агентом заболеваемости в эпидемического сезон 2014-2015 гг. в г. Туле служили возбудители ОРВИ не гриппозной этиологии: аденовирусы, риновирусы, вирусы парагриппа, респираторно-синцитиальные вирусы, бокавирусы, метапневмовирусы (62%).

Вирусы гриппа лабораторными методами были обнаружены в 78 случаях (38%). Первые случаи гриппа А были лабораторно подтверждены на 50 недели 2014 г. Всего за сезон их было 48. Вирусы гриппа В впервые обнаружены на 5 неделе 2015 года. Всего за сезон их было 29. Вирус гриппа А (H1N1)pdm09 был обнаружен в одном случае на 18 неделе 2015 года (рис.20)[36].

Рис.20.Мониторинг гриппа и ОРВИ по результатам ИФА и ПЦР диагностики в вирусологической лаборатории ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Тульской области» в эпидемический сезон с сентября 2014 г. по май 2015 г.[36]

Заключение

Грипп и другие острые респираторные вирусные инфекции, на которые в структуре инфекционной заболеваемости приходится 95%, остаются одной из самых актуальных проблем здравоохранения, нанося огромный ущерб как здоровью населения, так и экономике страны.

По прогнозам Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) и Федерального Центра по гриппу в ближайшее время следует ожидать появления нового варианта вируса гриппа, к которому у населения отсутствует иммунитет, что может привести к пандемии гриппа.

В соответствии с целью, предметом и объектом исследования изучены литературные данные о свойствах и особенностях вирусов, их циркуляции, эпидемиологии.

Выяснены цели и задачи санитарно-эпидемиологического надзора за гриппом и ОРВИ, главными из которых являются:

Мониторинг заболеваемости гриппом и ОРВИ.

Мониторинг за циркуляцией возбудителей гриппа и ОРВИ.

Слежение за иммунологической структурой населения.

Прогнозирование развития эпидемиологической ситуации.

В ходе выполнения ВКР мною был проведен анализ еженедельных данных заболеваемости гриппом и ОРВИ, частоты госпитализации и летальных исходов в сезон 2014-2015 гг., полученных в результате регулярного взаимодействия двух Национальных центров по гриппу ВОЗ в России с эпидемиологами 59 региона базовых лабораторий (РБЛ).

В целом показатели заболеваемости гриппом и ОРВИв РФ в 2014- 2015гг.были значительно выше по сравнению с предыдущим сезоном 2013- 2014 гг. Эпидемия гриппа в стране началась раньше, с превышением эпидемических порогов (ЭП) уже на 50 неделе 2014г., и затем продолжилась, начиная с 4 недели (после новогодних каникул). Базовая линия заболеваемости была превышена на неделю позже. Пик активности гриппа с уровнем заболеваемости, составившим 101,6 случая на 10000 населения, был зарегистрирован на 7-й неделе с последующим постепенным снижением, опустившимся ниже эпидемического порога на 14 неделе.

Анализ смертности показал, что за период эпидемии было зарегистрировано в общей сложности 44 летальных случая с лабораторно подтвержденным гриппом в 59 городах, находящихся под наблюдением, среди них - 20 случаев, связанных с гриппом А(H1N1)pdm09, 12 случаев - с гриппом В, 11 случаев - с гриппом A(H3N2) и 1 случай - с гриппом А (не субтипирован).Таким образом, как и в предыдущие годы, вирус гриппа A(H1N1)pdm09 был главной причиной летальных исходов в России. Тем не менее, в прошедшем сезоне впервые отмечено увеличение доли вирусов гриппа A(H3N2) и В в общей структуре смертности.

Мониторинг за циркуляцией возбудителей гриппа и ОРВИ был начат с 40 недели 2014 г. В течение сезона работы выполнялись в 31 РБЛ и в двух НЦГ. Первые штаммы вируса гриппа A(H3N2) были изолированы на 51 неделе 2014 г. в г. Астрахань. Начиная с 4 недели 2015 г., выделение вирусов гриппа A(H3N2) и гриппа В стало регулярным в разных городах страны. Пик выделения вирусов гриппа был достигнут на 7 неделе с последующим постепенным снижением. Результаты мониторинга процесса выделения вирусов гриппа показали, что начало эпидемии (с 51 недели 2014г. по 4 неделю 2015г.) было обусловлено циркуляцией в основном вирусов гриппа A(H3N2), однако с 5 недели активизировались и вирусы гриппа В.

В результате проведенного анализа выявлена последовательность смены доминирующих возбудителей эпидемий в период с 2009 г. по 2015 г., как правило, с 2-летним, реже 3-летним интервалом: грипп A(H1N1)pdm09 - в эпидемии 2009 г., 2011 г., 2013 г. и 2014г., A(H3N2) - в 2012 г. и 2015г., грипп B - 2011 г., 2013 г. и 2015г.

В дополнение к вышеизложенному, необходимо указать, что наблюдение за иммунологической структурой населения осуществляется федеральными бюджетными учреждениями здравоохранения в регионах. При этом установлено, что от уровня привитости населения против гриппа напрямую зависит течение эпидемического процесса, заболеваемость и смертность населения.

По данным Роспотребнадзора по Тульской области снижению уровня заболеваемости гриппом и ОРВИ способствует активная прививочная кампания. Так, в соответствии с национальным календарем профилактических прививок в области в 2014 г. было привито 448604 человека, из них детей - 120000, составив 29,5% от численности населения области, что на 1,4 % больше, чем в 2013 г. Показатель заболеваемости гриппом был равен 3,48 случая на 100 тыс. населения, в 2013 г - 12,3 на 100 тыс. населения.

ВЫВОДЫ

Анализ литературных данных свидетельствует о том, что вирусы гриппа обладают определенным набором поверхностных антигенов, которые характеризуются выраженной способностью к изменчивости этого микроорганизма. Более вирулентными являются вирусы гриппа А, так как они содержат 2 типа нейраминедазы и 4 - гемагглютинина.

В ходе выполнения ВКР осуществлено в условиях непосредственно вирусологической лаборатории ознакомление с методами лабораторной диагностики гриппа и ОРВИ, такими как, вирусологический, иммунофлюоресцентный, метод ПЦР диагностики. В настоящее время метод полимеразно-цепной реакции является наиболее эффективным и перспективным экспресс-методом лабораторной диагностики вирусных болезней.

Выяснено, что показатели заболеваемости гриппом и ОРВИ в РФ в 2014-2015 гг. составили 101,6 случаев на 10000 населения, значительно превышая его по сравнению с сезоном 2013-2014 гг. - 77,3 на 10000 населения. За период эпидемии 2014-2015 гг. в РФ было зарегистрировано 44 летальных случая, среди них - 20 случаев, связанных с гриппом А(H1N1) pdm09, 12 случаев - с гриппом В, 11 случаев - с гриппом A(H3N2) и 1 случай - с гриппом А (не субтипирован). Таким образом, вирус гриппа А(H1N1) pdm09 был главной причиной летальных исходов в России.

.Результаты мониторинга процесса выделения вирусов гриппа в сезон 2014-2015 гг. показали, что начало эпидемии было обусловлено циркуляцией вирусов гриппа А(H3N2).Выявлена последовательность смены доминирующих возбудителей эпидемий в период с 2009 г. по 2015 г., как правило с 2-х летним (грипп А (H1N1) pdm09, В) и с 3-х летним интервалом (грипп А(H3N2).

.На основании данных Роспотребнадзора по Тульской области отмечено снижение уровня заболеваемости гриппом и ОРВИ в результате проведения активной прививочной работы. Так, показатель заболеваемости гриппом в 2013 г. был равен 12,3 случая на 100 тысяч, при охвате населения прививками на 28,1%, а в2014 г. он снизился до 3,48 на 100 тыс. населения Тульской области при охвате прививками 29,5% жителей.

Список литературы

1. .Актуальные вопросы профилактики гриппа и ОРВИ / В.Л. Максакова, М.К. Ерофеева. //Фарматека. - 2013. - № 15 (268). - С. 73-78.

2. .Атлас по медицинской микробиологии, вирусологии и иммунологии: Учебное пособие для студентов медицинских вузов / Под ред. А.А. Воробьева, А.С. Быкова.- М.: Медицинское информационное агентство, 2003. - 236 с. ил.

3. .Грипп: Руководство / Под ред. Г.И. Карпухина.- Л.: Медицина, 1986. - С. 7-20.

4. .Грипп и другие респираторные вирусные инфекции: эпидемиология, профилактика, диагностика и терапия. / Под ред. О.И. Киселева, И.Г. Маринича, А.А. Сомининой.- СПб., 2003. -С. 24-27, 42-52, 55.

5. .Грипп: история, клиника, патогенез. / М.Ю. Щелканов Л.В. Колобухина., Д.К. Львов. // Лечащий врач. - 2011. -№ 10. -С. 33-38.

6. .Единое окно доступа к образовательным ресурсам: портал [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://sezongrippa.ru/c5955.html. Дата обращения: 25.01.2016.

7. .Инфекционные болезни и эпидемиология / В.И. Покровский, С.Г. Пак, Н.И. Брико - М.: "ГЭОТАР - медиа", 2007. - стр. 344 - 358

8. .Лабораторная диагностика острых респираторных вирусных инфекций в условиях эволюционной изменчивости вирусов гриппа / Суховецкая В.Ф., Дондурей Е.А., Дриневский В.П., Соминина А.А., Майорова В.Г., Писарева М.М., Гудкова Т.М., Амосова И.В., Кривицкая В.З., Голованова А.К.. Журнал инфектологии. 2012;4(1):36-41.

9. .Медицинская вирусология. Часть вторая./ Под ред. А.М. Королюка, В.Б. Сбойчакова. - СПб., 2002. - 163 с.

10. .Медицинская микробиология / Под ред. В.И. Покровского, О.К. Поздеева.- М.: ГЭОТАР МЕДИЦИНА, 1998. -С. 774-779.

11. .Медицинская микробиология, вирусология, иммунология:Учебник / Л.Б. Борисов. - М.: ООО "Медицинское информационное агентство", 2005. - С. 536-542.

12. .Молекулярно-генетические факторы патогенности вируса гриппа A(H1N1)pdm09 / В.В. Цветков, Э.Г. Деева, Д.М. Даниленко, Т.В. Сологуб, Е.П. Тихонова // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2014. - Т.19, № 4. - С. 4-11.

13. Методические рекомендации "Быстрая диагностика гриппа и другихОРВИ иммунофлуоресцентным методом". - СПб., 2006. - С. 3-7.

14. Методические рекомендации "Выделение вирусов гриппа в клеточной культуре куриных эмбрионов и их идентификация". - СПб., 2006.

15. - С. 8-16.

16. .Методические рекомендации "По применению набора реагентов для типирования вирусов гриппа А методом ПЦР с гибридизационно - флуоресцентной детекцией". - Москва, 2014. - С.3-10.

17. .Об итогах пандемии гриппа A (H1N1)/09 в мире и Российской Федерации в эпидсезон 2009-2010 годов и прогнозе на эпидсезон 2010-2011 годов / Г.Г. Онищенко // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2010. - № 2.- С. 16.

18. .О санитарно - эпидемиологической обстановке в Тульской области в 2009 году: Государственный доклад. - Тула: Управление федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Тульской области, 2010.

19. О санитарно - эпидемиологической обстановке в Тульской области в 2010 году: Государственный доклад. - Тула: Управление федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Тульской области, 2011.

20. .О санитарно - эпидемиологической обстановке в Тульской области в 2011 году: Государственный доклад. - Тула: Управление федеральной

21. службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Тульской области, 2012.

22. .О санитарно - эпидемиологической обстановке в Тульской области в 2012 году: Государственный доклад. - Тула: Управление федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Тульской области, 2013.

23. .О санитарно - эпидемиологической обстановке в Тульской области в 2013 году: Государственный доклад.- Тула: Управление федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Тульской области, 2014.

24. .О санитарно - эпидемиологической обстановке в Тульской области в 2014 году: Государственный доклад. - Тула: Управление федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Тульской области, 2015.

25. .Особенности клинического течения острых респираторных заболеваний, вызванных аденовирусами эпидемически значимых серотипов / Н.И. Львов, А.А. Соминина, К.В. Жданов, Ю.В. Лобзин // Журнал инфектологии. - 2014. - Т.6, № 2. - С. 5-11.

26. .Особенности социркуляции вирусов гриппа в постпандемический период 2010-2011 гг. по итогам деятельности Центра экологии и эпидемиологии гриппа ФГУ «НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского» / Е.И. Бурцева, Д.К. Львов, М.Ю. Щелканов, Л.В. Колобухина, А.Г. Прилипов: Минздравсоцразвития России // Вопросы вирусологии. - 2012. - № 57 (1). -С. 20-28.

27. .Пандемия гриппа в России как часть глобального распространения гриппа A(H1N1)pdm09 в 2009-2011 гг./ Л.С. Карпова, М.Ю. Пелих, К.А. Столяров, Н.М. Поповцева, Т.П. Столярова // Вопросы вирусологии.- 2012. -

28. № 6. - С. 26-30.

29. .Противовирусная терапия и профилактика острых респираторных инфекций/ Л.В. Осидак, Е.Г. Головачева, Е.А. Дондурей, О.И. Афанасьева,

30. Е.В. Образцова, В.П. Дриневский, Е.С. Гончарова, В.Ф. Суховецкая, К.К. Милькинт // Детские инфекции.- 2012. - Т.11, спец. выпуск. - С. 16-23.

31. .Профилактика гриппа и других острых респираторных вирусных инфекций: СП 3.1.2.3117 - 13.

32. .Развитие надзора за гриппом в России в системе национального центра ВОЗ по гриппу / А.А. Соминина, М.П. Грудинин, М.Ю. Еропкин, Е.А. Смородинцева, М.М. Писарева, А.Б. Комиссаров, Н.И. Коновалова, Д.М. Даниленко, Т.М. Гудкова, О.И. Киселев // Вопросы вирусологии.- 2012. - № 6. - С. 17-21.

33. 29. Разработка новых препаратов против вируса гриппа на основе синтетических и природных соединений / В.В. Зарубаев, П.М. Анфимов, А.А. Штро, А.В. Гаршинина, И.А. Мелешкина, Л.А. Карпинская, К.Н. Козелецкая, О.И. Киселев // Вопросы вирусологии.- 2012. - № 6. - С. 30-36.

34. .Смертность от соматических и инфекционных заболеваний и ее корреляция с заболеваемостью гриппом и ОРВИ населения Санкт- Петербурга (2004-2010 гг.) / Л.С. Карпова, Е.Р. Ишкина, К.А. Столяров, Н.М. Поповцева, Т.П. Столярова, А.В. Забайкин //Эпидемиология и вакцинопрофилактика.- 2012. - № 4(65). - C. 29-36.

35. .Эпидемия гриппа в России. Сезон 2014 - 2015. Годовой отчет.: Национальный центр по гриппу ВОЗ при НИИ гриппа. - Санкт - Петербург, 2015.

36. .Эпидемия гриппа в России в сезон 2012-2013 годов / Л.С. Карпова, А.А. Соминина, М.Ю. Пелих, Н.М. Поповцева, Т.П. Столярова, Е.И. Бурцева, О.И. Киселев // Эпидемиология и вакцинопрофилактика.- 2013. - № 4 (71) . - С. 7-13.

37. 33.Scholtissek C. Molecular evolution of influenza viruses // Virus. Genes. - 1996. - № 11. - P.209-215.

38. .Единое окно доступа к образовательным ресурсам: портал [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://medi.ru/doc/a21020704.htm.

39. Дата обращения: 06.02.2016.

40. .Единое окно доступа к образовательным ресурсам: портал [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://www.influenza.spb.ru/system/fc_flu/. Дата обращения: 06.02.2016.

41. .Единое окно доступа к образовательным ресурсам: портал [Электронный ресурс]. - Режим доступа: http://71.rospotrebnadzor.ru/Дата обращения: 11.02.2016.

Размещено на Allbest.ru