Комплексное исследование метилотипов злокачественных новообразований: фундаментальные и прикладные аспекты
Разработка методологии скрининга дифференциального метилирования геномов. Изучение фундаментальных характеристик метиломов злокачественных новообразований. Анализ молекулярной патологии перспективного гена-кандидата на роль супрессора опухолевого роста.
Рубрика | Биология и естествознание |
Вид | автореферат |
Язык | русский |
Дата добавления | 02.08.2018 |
Размер файла | 5,2 M |
Отправить свою хорошую работу в базу знаний просто. Используйте форму, расположенную ниже
Студенты, аспиранты, молодые ученые, использующие базу знаний в своей учебе и работе, будут вам очень благодарны.
4. Анализ молекулярной патологии гена SEMA6B, аномальное метилирование которого при раке молочной железы впервые показано в настоящем исследовании, продемонстрировал наличие повреждений гена (метилирование, потеря гетерозиготности) в 75% образцов рака молочной железы. Впервые выявлена герминальная мутация SEMA6B у пациентки с раком молочной железы. Полученные результаты свидетельствуют о том, что SEMA6B - один из наиболее реальных генов-кандидатов на роль супрессора опухолевого роста в области хромосомы 19р13.3.
5. Скрининг метилирования ДНК из образцов рака молочной железы, светлоклеточного рака почки, рака мочевого пузыря, прилежащих условно нормальных тканей, аутопсийного материала молочной железы, лимфоцитов периферической крови и буккального эпителия здоровых доноров выявил константно метилированные участки генома человека, принадлежащие CpG-островку гена CUX1 в составе альтернативного 3'-концевого экзона, первым экзонам генов LAMA3A, LAMB3, LAMC3, интронным областям генов MAD1L1, FLNA и 3'-CpG-островку гена ZBTB4. Полученные результаты впервые предоставили базу для обоснованного дизайна контролей эффективности метилчувствительной ПЦР.
6. Анализ состояния метилирования участков ДНК в норме и при канцерогенезе в зависимости от локальных характеристик хроматина показал совместное расположение константно метилированных участков с плотной упаковкой нуклеосом при закрытом хроматине, константно неметилированных участков - с низкой плотностью упаковки нуклеосом при закрытом хроматине, и дифференциально метилированных участков - с областями открытого хроматина при любой плотности нуклеосомной упаковки. Это позволило разработать синтетический подход к отбору для анализа дифференциального метилирования кандидатных участков генов, вовлеченных в канцерогенез.
7. Использование разработанной в ходе исследования методологии локус-специфического анализа метилирования для изучения эпигенетической патологии семейства генов ламининов подтвердило предсказанное дифференциальное метилирование 70% промоторных областей этих генов при раке молочной железы. Шесть промоторных областей демонстрируют неметилированное состояние в нормальных тканях и аномальное метилирование при раке молочной железы, с частотами, составившими для генов LAMA1 - 36%, LAMA2 - 38%, LAMA3B - 6%, LAMA4 - 2%, LAMB1 - 16%, LAMC3 - 8%. Промотор гена LAMC2 показал дифференциальное метилирование в зависимости от тканевого происхождения образцов: в буккальном эпителии и лимфоцитах периферической крови метилирование отсутствует, в то время как образцы ДНК из нормальных и опухолевых тканей молочной железы метилированы в 100% случаев. Константное метилирование предсказано и подтверждено для промоторных областей генов субъединиц ламининов LAMA3A и LAMB3. Полученные результаты говорят о высоком предиктивном потенциале разработанного синтетического подхода к отбору для анализа дифференциального метилирования кандидатных участков генов, вовлеченных в канцерогенез.
8. Разработана новая универсальная стратегия и оригинальная методическая база анализа метиломов в норме и при патологии для поиска и характеристики функциональных нарушений, вызывающих различные заболевания у человека. На значительном экспериментальном материале (более 1000 образцов операционного материала рака молочной железы, рака мочевого пузыря, светлоклеточного рака почки и прилежащих тканей, немелкоклеточного рака легких, острого лимфобластного лейкоза, аутопсийного материала молочной железы, буккального эпителия и лимфоцитов периферической крови здоровых доноров) показана эффективность разработанных подходов, охарактеризованы новые гены и районы, вовлеченные в процесс канцерогенеза.
СПИСОК ОПУБЛИКОВАННЫХ РАБОТ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ
1. Strelnikov V., Nemtsova M., Chesnokova G., Kuleshov N., Zaletayev D. A simple multiplex FRAXA, FRAXE, and FRAXF PCR assay convenient for wide screening programs // Human Mutation, 1999. V. 13. № 2. P. 166-169
2. Немцова М.В., Стрельников В.В., Бабенко О.В., Васильев Е.В., Залетаев Д.В. Методические аспекты анализа метилирования при генетических и онкологических заболеваниях // Сборник трудов ГНТП "Геном человека", 2000. С. 167?168
3. Бабенко О.В., Саакян С.В., Бровкина А.Ф., Козлова В.М., Стрельников В.В., Залетаев Д.В., Немцова М.В. Спектр и частота структурной патологии гена RB1 при ретинобластоме // Молекулярная биология, 2002. Т. 36. № 4. С. 623-629
4. Бабенко О.В., Землякова В.В., Саакян С.В., Бровкина А.Ф., Стрельников В.В., Залетаев Д.В., Немцова М.В. Функциональная патология генов RB1 и CDKN2A, приводящая к развитию ретинобластомы // Молекулярная биология, 2002. Т.36 № 5, С. 777?783
5. Немцова М.В., Землякова В.В., Жевлова А.И., Бабенко О.В., Стрельников В.В., Васильев Е.В., Дрозд О.В., Бочков Н.П., Залетаев Д.В.. Профиль метилирования генов-су-прессров опухолевого роста при различных формах рака. // Вестник НИИ Молекулярной медицины ММА им. Сеченова, 2002. № 2, С. 65?84
6. Zemlyakova V., Lubchenko L., Zborovskaya I., Strelnikov V., Artamonov V., Nemtsova M. P16INK4a, p15INK4b, p14ARF, Rb1 and ECAD Genes Aberrant Methylation in Various Cancers.// European Journal of Human Genetics, 2002. V.10 Suppl. 1, P. 99
7. Дрозд О.В., Стрельников В.В., Немцова М.В., Залетаев Д.В. Метилчувствительный фингерпринтинг как метод выявления структурных и функциональных изменений в геноме опухолевых клеток // Материалы научно-практического симпозиума "Технологии генодиагностики в практическом здравоохранении", 2002. С. 130?134
8. Землякова В.В., Жевлова А.И., Зборовская И.Б., Стрельников В.В., Залетаев Д.В., Немцова М.В.. Аномальное метилирование некоторых генов-супрессоров при немелкоклеточном раке легкого // Молекулярная биология, 2003. Т.37 № 6, С. 983?988
9. Землякова В.В., Жевлова А.И., Стрельников В.В., Любченко Л.Н., Вишневская Я.В., Третьякова В.А., Залетаев Д.В., Немцова М.В. Аномальное метилирование некоторых генов-супрессоров при спорадическом раке молочной железы // Молекулярная биология, 2003. Т.37 № 4, С. 696?703
10. Залетаев Д.В., Немцова М.В., Стрельников В.В., Бабенко О.В., Васильев Е.В., Землякова В.В., Жевлова А.И., Дрозд О.В. Диагностика эпигенетической патологии при наследственных и онкологических заболеваниях // Молекулярная биология, 2004. Т.38 № 2, С. 213?223
11. Землякова В.В., Стрельников В.В., Зборовская И.Б., Балукова О.В., Майорова О.А., Васильев Е.В., Залетаев Д.В., Немцова М.В. Сравнительный анализ аномального метилирования CpG-островков, расположенных в промоторных областях генов p16/CDKN2А и р14/ARF при немелкоклеточном раке легкого и остром лимфобластном лейкозе // Молекулярная биология, 2004. Т.38 № 6, С. 966?972
12. Кузнецова Е.Б., Дрозд О.В., Бабенко О.В., Землякова В.В., Немцова М.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Идентификация генов, вовлеченных в канцерогенез, методом метилчувствительного ПЦР-фингерпринтинга // Медицинская генетика, 2004. Т.3 № 12, С. 563?568
13. Kuznetsova E., Mikhaylenko D., Liubchenko L., Zborovskaya I., Strelnikov V. Differential methylation of LAMC3 and TGFBR1 CpG islands in non-small cell lung and breast cancer identified by methylation-sensitive restriction fingerprinting (MSRF) // European Journal of Human Genetics, 2004. V.12 Suppl. 1, P. 190
14. Zemlyakova V., Babenko O., Zborovskaya I., Yakubovskaya M., Lyubchenko L., Maiorova O., Strelnikov V., Nemtsova M. Methylation of a number of tumor suppressor genes in various cancers // European Journal of Human Genetics, 2004. V.12 Suppl. 1, P. 191
15. Klinkov A.A., Strelnikov V.V., Babenko O.V., Zemlyakova V.V., Zaletayev D.V., Ivanov M.A., Kuznetsova E.B., Nikitin E.A., Maiorova O.V.
TNR/11q#1 Trinucleotide (GCC)n Repeat Alleles and Predisposition to Acute and Chronic Leukemia // Annals of Human Genetics, 2004. Т. 68. № 4. С. 362-366.
16. Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В., Дрозд О.В., Бабенко О.В., Землякова В.В., Кекеева О.В., Немцова М.В., Залетаев Д.В. Поиск и характеристика новых маркеров метилирования и генов, вовлеченных в канцерогенез, методом метилчувствительного фингерпринтинга // Вестник НИИ молекулярной медицины ММА им. И.М.Сеченова, 2005. № 5, C. 73?88
17. Михайленко Д.С., Любченко Л.Н., Зборовская И.Б., Стрельников В.В., Залетаев Д.В. Анализ полиморфных вариантов CGG-повтора гена GIPC1 в норме, при раке молочной железы и немелкоклеточном раке легкого // Генетика, 2005. Т.41 №9, С. 1289?1295
18. Немцова М.В., Стрельников В.В., Бабенко О.В., Землякова В.В., Залетаев Д.В. Молекулярная диагностика эпигенетических нарушений при синдроме Видеманна-Беквита // Медицинская генетика, 2005. № 1, С. 33?38
19. Kuznetsova E., Lubchenko L., Zborovskaya I., Strelnikov V, Zaletayev D. Differential methylation of LAMC3, SEMA6B, VCIP135 and BIN1 CpG islands in breast cancer identified by methylation-sensitive restriction fingerprinting (MSRF) // European Journal of Human Genetics, 2005. V. 13 Suppl. 1, P. 192
20. Nemtsova M, Zemlyakova V, Kusnetsova E, Strelnikov V, Lyubchenko L, Zaletayev D. Methylation profiling of carcinogenesis-associated genes in sporadic breast cancer // Breast Cancer Research, 2005. № 7 Suppl. 2, P. 4.17
21. Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В., Дрозд О.В., Немцова М.В., Залетаев Д.В. Поиск и характеристика новых маркеров метилирования и генов, вовлеченных в канцерогенез, методом метилчувствительного ПЦР-фингерпринтинга // Тезисы второй международной конференции «Молекулярная медицина и биобезопасность», Москва, 2005. С. 168
22. Кузнецова Е.Б., Дрозд О.В., Немцова М.В., Стрельников В.В. Идентификация генов, вовлеченных в канцерогенез, методом метилчувствительного ПЦР-фингерпринтинга // V съезд российского общества медицинских генетиков, Уфа, Россия, Медицинская генетика, 2005. № 5, С. 214
23. Strelnikov V.V., Kuznetsova E.B., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V. Identification of methylation and expression abnormalities associated with breast cancer // European Journal of Human Genetics, 2006. V.14 Suppl. 1, P. 87
24. Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В. Методы анализа метилирования ДНК // Медицинская генетика, 2006. № 11. С. 3?11
25. Залетаев Д.В., Немцова М.В., Стрельников В.В., Кузнецова Е.Б. Диагностика эпигенетических нарушений при наследственных заболеваниях // Медицинская генетика, 2006. Т. 5. Прил. 1. С. 54
26. Strelnikov V.V., Kuznetsova E.B., Larin S.S., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V. Novel cancer related genes and methylation/expression markers associated with breast cancer. // AACR Meeting Abstracts, 2006. B129
27. Strelnikov V.V., Kuznetsova E.B., Larin S.S., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V. Identification of novel methylation/expression markers and genes associated with breast cancer // AACR Meeting Abstracts, 2006. A96
28. Kuznetsova E.B., Kekeeva T.V., Larin S.S., Zemlyakova V.V., Khomyakova A.V. Babenko O.V., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V., Strelnikov V.V. Methylation of the BIN1 gene promoter CpG island associated with breast and prostate cancer // Journal of Carcinogenesis, 2007. 6: 9.
29. Кузнецова Е.Б., Кекеева Т.В., Ларин С.С., Землякова В.В., Бабенко О.В., Немцова М.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Новые маркеры метилирования и экспрессии генов при раке молочной железы // Молекулярная биология, 2007. Т.41 №4, С. 624-633
30. Kuznetsova E.B., Mikhaylenko D. S., Pudova E.A., Larin S.S., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V., Strelnikov V.V. Inactivation of the laminin gamma 3 chain (LAMC3) gene in various cancers // European Journal of Human Genetics, 2007. V.15 Suppl. 1, P. 160.
31. Strelnikov V.V., Kuznetsova E.B., Pudova E.A., Larin S.S., Nemtsova M.V., Zaletayev D.V. SEMA6B is a candidate tumor suppressor gene on 19p13.3 // European Journal of Human Genetics, 2007. V.15 Suppl. 1, P. 170
32. Залетаев Д.В., Немцова М.В., Стрельников В.В., Бабенко О.В., Пальцева Е.М., Землякова В.В., Кузнецова, Кекеева Т.В., Михайленко Д.С., Манохина И.К. Эпигенетическая регуляция экспрессии генов в процессах канцерогенеза // Молекулярная медицина, 2008. № 4, С. 46?51
33. Shkarupo V.V., Tanas A.S., Kuznetsova E.B., Zavalishina L.E., Frank G.A., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. A semi-automated unbiased differential methylation screening assay for applications in cancer epigenetic research // European Journal of Human Genetics, 2008. V.16 Suppl. 2, P. 223
34. Pudova E.A., Kuznetsova E.B., Zavalishina L.E., Frank G.A., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Dissection of allelic molecular pathology of the SEMA6B gene frequently altered in breast cancer // European Journal of Human Genetics, 2008. V.16 Suppl. 2, P. 206
35. Пудова Е.А., Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В., Залетаев Д.В. Механизмы инактивации предполагаемого гена - супрессора опухолевого роста SEMA6B при раке молочной железы // Тезисы V Конференции молодых ученых России с международным участием «Фундаментальные науки и прогресс клинической медицины» Москва, 2008. C. 349
36. Шкарупо В.В., Танас А.С., Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В.,Залетаев Д.В. Метод анализа структурно-функциональной организации эпигеномов клеток рака молочной железы // Тезисы V Конференции молодых ученых России с международным участием «Фундаментальные науки и прогресс клинической медицины» Москва, 2008. C. 489
37. Strelnikov V.V., Tanas A.S., Shkarupo V.V., Kuznetsova E.B., Zaletaev D.V. Unbiased differential methylation screening assay for applications in cancer epigenetic research // Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology, 2008. P. 59-60
38. Танас А.С., Стрельников В.В., Шкарупо В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В. Современный высокотехнологичный метод диагностики маркеров метилирования в онкологии // Онкогематология, 2008. №4, С. 73?74
39. Стрельников В.В., Танас А.С., Шкарупо В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В. Современные высокотехнологичные методы диагностики маркеров метилирования ДНК в онкологии // Пятый московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», Москва, 16-20 марта 2009. С. 90?91
40. Strelnikov V. A State-of-the-Art Differential Methylation Screening Technique Based on the Amplification of Intermethylated Sites // Epigenetics World Congress - Event Proceedings, 2009. P. 27
41. Залетаев Д.В., Немцова М.В., Стрельников В.В. Эпигенетическая регуляция экспрессии генов на ранних стадиях и в эмбриональных стволовых клетках // Учебник под ред. М.А.Пальцева «Биология стволовых клеток и клеточные технологии» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Идательство «Медицина», 2009. Т. 1. С. 107 - 140
42. Стрельников В.В., Танас А.С., Шкарупо В.В., Кузнецова Е.Б., Кекеева Т.В., Завалишина Л.Э., Франк Г.А., Залетаев Д.В. Современный высокотехнологичный метод скрининга дифференциального метилирования геномов на основе амплификации интерметилированных сайтов // Молекулярная медицина, 2009. № 4, С. 18?26
43. Стрельников В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В. Поиск и характеристика новых маркеров метилирования и генов, вовлеченных в канцерогенез // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Системы генетических и эпигенетических маркеров в диагностике онкологических новообразований» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Идательство «Медицина», 2009. С. 76-113
44. Стрельников В.В., Танас А.С., Залетаев Д.В. Разработка новых методов диагностики метилирования ДНК в онкологии // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Системы генетических и эпигенетических маркеров в диагностике онкологических новообразований» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Идательство «Медицина», 2009. С. 349-384
45. Танас А.С., Шкарупо В.В., Стрельников В.В. Программное обеспечение для скринига дифференциального метилирования геномов на основе амплификации интерметилированных сайтов// Медицинская генетика, 2009, Т.8 №12 (90), С. 33
46. Tanas A.S., Shkarupo V.V., Kuznetsova E.B., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Amplification of intermethylated sites, Bioinformatics and Capillary electrophoresis: the ABC of the cancer methylomes // European Journal of Human Genetics, 2009. V.17 Suppl. 2, P. 284
47. Tanas A.S., Shkarupo V.V, Kuznetsova E.B., Zaletayev D.V., Strelnikov V.V. Novel tools for unbiased DNA differential methylation screening // Epigenomics, 2010. V.2 No. 2, P. 325-333
48. Залетаев Д.В., Стрельников В.В., Немцова М.В., Бабенко О.В., Кузнецова Е.Б., Землякова В.В., Кекеева Т.В., Михайленко Д.С., Шкарупо В.В., Танас А.С. Маркеры метилирования в диагностике онкологических заболеваний // Медицинская генетика, 2010. Т. 9 №1, С. 15?21
49. Танас А.С., Шкарупо В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Дизайн эксперимента и анализ результатов амплификации интерметилированных сайтов с использованием компьютерной программы AIMS in silico // Молекулярная биология, 2010. Т.44 № 2, С. 355?365
50. Strelnikov V., Tanas A., Shkarupo V., Kuznetsova E., Gorban N., Zaletaev D. Non-microarray DNA differential methylation screening in breast cancer // Cancer Genetics and Cytogenetics, 2010. Vol.203 No 1, P. 93
51. Tanas A., Shkarupo V., Kuznetsova E., Zaletaev D., Strelnikov V. AIMS in silico & PeakPick: a software package supporting unbiased screening of DNA differential methylation in cancer // Cancer Genetics and Cytogenetics, 2010. Vol.203 No 1, P. 94
52. Алексеева E.A., Шубина M.B., Землякова В.B., Кузнецова Е.Б., Смолин A.B., Прозоренко Е.B., Залетаев Д.B., Стрельников B.B. Молекулярно-генетическая диагностика опухолей головного мозга. Сборник научных работ по материалам I Международного российско-американского симпозиума «Инновационные технологии в генетике и детской эпилептологии». Москва, 27-28 июня 2011. С. 72?84
53. Стрельников В.В., Малышева А.С., Землякова В.В., Кузнецова Е.Б., Алексеева Е.А., Смолин А.В., Прозоренко Е.В., Залетаев Д.В. Делеции области расположения гена MGMT на хромосоме 10q26.3 в глиомах // Молекулярная медицина, 2011. № 2, С. 28?31
54. Танас А.С., Руденко В.В., Стрельников В.В., Залетаев Д.В. Алгоритмы и программное обеспечение скрининга эпигенетических нарушений при раке. // Шестой московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва, 21-25 марта 2011. C. 139?140
55. Бабенко О.В., Стрельников В.В., Залетаев Д.В. Классификация, номенклатура и классические методы детекции мутаций // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Введение в молекулярную диагностику» для студентов медицинских вузов. ОАО «Издательство «Медицина», 2011. Т. 2. С. 11-36
56. Стрельников В.В., Кузнецова Е.Б., Танас А.А. Методы анализа метилирования ДНК // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Введение в молекулярную диагностику» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Издательство «Медицина», 2011. Т. 2. С. 80-99
57. Стрельников В.В., В.В.Землякова, И.П.Белецкий. ДНК-диагностика с использованием биологических микрочипов // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Введение в молекулярную диагностику» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Издательство «Медицина», 2011. Т. 2. С. 148-165
58. Залетаев Д.В., В.В.Стрельников, О.В.Бабенко, Землякова В.В., Немцова М.В. Общие подходы к молекулярно-генетической диагностике в онкологии // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Введение в молекулярную диагностику» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Издательство «Медицина», 2011. Т. 2. С. 402-448
59. Стрельников В.В., В.В.Землякова, М.В.Шубина. Молекулярно-генетическая диагностика опухолей головного мозга // Учебник под ред. М.А.Пальцева и Д.В.Залетаева «Введение в молекулярную диагностику» для студентов медицинских вузов. М.: ОАО «Идательство «Медицина», 2011. Т. 2. С. 486-503
60. Залетаев Д.В., Стрельников В.В., Кекеева Т.В., Землякова В.В., Кузнецова Е.Б., Михайленко Д.С. Аномалии метилирования в процессах канцерогенеза: поиск новых генов, разработка методов и систем ДНК-маркеров для диагностики // Экологическая генетика, 2011. Т.IX. № 3. С. 27?32.
Зарегистрированные новые медицинские технологии, алгоритмы и компьютерные программы, заявки на патент:
1. Руденко В.В., Танас А.С., Стрельников В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В. Скрининг аномального метилирования ДНК на основе метода амплификации интерметилированных сайтов для диагностики злокачественного опухолевого процесса // Медицинская ДНК-технология. Разрешение ФС № 2011/132 от 27.05.2011г.
2. Немцова М.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Молекулярная диагностика нарушений метилирования импринтированных районов IGF2, H19, KCNQ1OT1 у пациентов с синдромом Видеманна-Беквита // Медицинская ДНК-технология. Разрешение ФС № 2011/131 от 27.05.2011 г.
3. Танас А.С., Шкарупо В.В., Стрельников В.В. Компьютерная программа AIMS in silico // Рекламно-техническое описание, описание программы, описание применения. Регистрационный номер ВНТИЦ 50201050017. Москва, 2010 г.
4. Танас А.С., Руденко В.В., Стрельников В.В. Компьютерная программа PeakPick // Рекламно-техническое описание, описание программы, описание применения. Регистрационный номер ВНТИЦ 50201050040. Москва, 2010 г.
5. Танас А.С., Руденко В.В., Стрельников В.В. Программа для ЭВМ "AIMS in silico 2". Рекламно-техническое описание, описание применения. Регистрационный номер ВНТИЦ 50201151514, Москва, 2011 г.
6. Руденко В.В., Танас А.С., Кузнецова Е.Б., Стрельников В.В., Залетаев Д.В. Способ формирования панелей маркеров метилирования ДНК // Заявка на получение патента, регистрационный номер 2011119871, Роспатент, Москва, 2011 г.
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
АИМС - амплификация интерметилированных сайтов
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
ИБГ - Институт биологии гена
КЭФ - капиллярный электрофорез
МРНЦ - Медико-радиологический научный центр
МЧ-ПЦР - метилчувствительная полимеразная цепная реакция
МЧФП - метилчувствительный фингерпринтинг
НМРЛ - немелкоклеточный рак легких
п.н. - пара нуклеотидов
ПААГ - полиакриламидный гель
ПЦР - полимеразная цепная реакция
РМЖ - рак молочной железы
РМП - рак мочевого пузыря
РОНЦ - Российский онкологический научный центр
РП - рак почки
РПЖ - рак предстательной железы
РФФИ - Российский фонд фундаментальных исследований
AFLOAT - Amplified Fragment Length Oriented Analysis (анализ, ориентированный на длину амплифицируемых фрагментов)
В-ОЛЛ - В-клеточный острый лимфобластный лейкоз
MLPA - мультиплексная лигазная проба-зависимая амплификация
Размещено на Allbest.ru
...Подобные документы
Биосинтез пуриновых нуклеотидов. Образование AMP и GMP из IMP. Ингибиторы биосинтеза пуринов. Синтез пуриновых дезоксирибонуклеотидов. Ингибиторы ферментов синтеза дезоксирибонуклеотидов и их использование для лечения злокачественных новообразований.
курсовая работа [333,4 K], добавлен 25.05.2009Принципы разделения естественно-научных проблем на прикладные и фундаментальные. Сущность проблем, которые ставятся перед учеными, возникших внутри самой науки. Характеристика современных экспериментов сопряженных с использованием сложного оборудования.
презентация [3,3 M], добавлен 02.04.2015Понятие процесса эпигенетической регуляции. Молекулярные основы эпигенетики. Осуществление импринтинга посредством метилирования ДНК в промоторах. Репрессия транскрипции посредством метилирования ДНК. Функции метилирования ДНК, его деметилирование.
презентация [290,8 K], добавлен 18.05.2014Внесение мутированного гена в наследственную информацию клеток с целью "препарирования" генетического заболевания. Определение роли метилирования ДНК и механизма его негативного воздействия организм. Содержание методики "программируемого нокаута генов".
реферат [608,3 K], добавлен 15.06.2010Характеристика эволюции человека в сфере коллективного сознания и резкий рост асимметрии в направлении доминирования позитивного рационального интеллекта, граничащего с прагматизмом. Определение природы биоэнергетики, ее значение и прикладные аспекты.
контрольная работа [19,0 K], добавлен 13.03.2009Структура геномов эукариот. Опыты Фредерика Гриффита. Принципы строения ДНК. Сюрпризы митохондриального генома. Эксперимент Альфреда Херши и Марты Чейз. Особенности структуры хроматина. Характеристика нуклеосомы и ее состав. Понятие структурного гена.
лекция [247,9 K], добавлен 21.07.2009Генетическая система бактерий. Полимеразная цепная реакция. Применение генетических методов в диагностике инфекционных заболеваний. Метод молекулярной гибридизации. Особенности генетики вирусов. Системы репарации бактерий. Взаимодействие вирусных геномов.
презентация [2,6 M], добавлен 13.09.2015Описание васкулярного эндотелиального фактора роста как семейства ростовых факторов. Основные белки семейства, их биологическая роль с учётом молекулярной структуры и принципы их направленной модификации с целью изменения спектра биологического действия.
курсовая работа [838,1 K], добавлен 06.01.2016Физиологическая роль факторов роста (HIF, VEGF, IGF) в организме, анализ эффективности и направления их исследования, оценка роли и участия в инициации канцерогенеза. Методы изучения факторов роста. Результаты исследования степени экспрессии VEGF.
контрольная работа [150,0 K], добавлен 02.06.2014Характеристика однонуклеотидных полиморфизмов, строение, функции и значение гена Fas. Первичная структура генов и их функциональные элементы. Выявление генотипов промоторной области гена Fas в клетках. Частоты генотипов однонуклеотидных полиморфизмов.
дипломная работа [877,9 K], добавлен 26.02.2013Наследственность и изменчивость - фундаментальные свойства организмов - осуществляются генами. Гены хранят и передают информацию об организме последующим поколениям. Структура, классификация, функции генов. Современные представления о генотипе.
реферат [174,6 K], добавлен 14.04.2008Метод полимеразной цепной реакции в реальном времени, его использование в диагностике мутаций в генах, приводящих к возникновению рака молочной железы и яичника. Действие генов-супрессоров на формирование опухолевого процесса. Наследственные формы рака.
дипломная работа [306,1 K], добавлен 09.10.2013Характеристика и разнообразие гибридогенных позвоночных. Генетические механизмы гибридной несовместимости. Клональные позвоночные, сетчатое видообразование. Исследование генома гибридогенного позвоночного. Локус-специфическая полимеразно-цепная реакция.
дипломная работа [559,0 K], добавлен 02.02.2018Молекулярно-генетический уровень организации живого. Схема строения ДНК. Экспрессия гена как процесс реализации информации, закодированной в нем. Центральная догма молекулярной биологии. Транскрипционный аппарат клетки. Схемы транскрипции и сплайсинга.
презентация [725,1 K], добавлен 21.02.2014Селен как важный микроэлемент, необходимый для поддержания иммунной системы человека. Предотвращение и приостановление развития злокачественных опухолей. Синтез йодосодержащих гормонов щитовидной железы. Основной компонент фермента пероксидазы глютатиона.
презентация [570,5 K], добавлен 31.05.2014Общая характеристика науки биологии. Этапы развития биологии. Открытие фундаментальных законов наследственности. Клеточная теория, законы наследственности, достижения биохимии, биофизики и молекулярной биологии. Вопрос о функциях живого вещества.
контрольная работа [28,1 K], добавлен 25.02.2012Значение естествознания в формировании профессиональных знаний. Фундаментальные и прикладные проблемы естествознания. Развитие естествознания и антинаучные тенденции. Рациональная и реальная картина мира. Естественно-научные и религиозные знания.
реферат [68,7 K], добавлен 13.12.2009Естествознание в современном понимании. Его структура, основанная на воспроизводимой эмпирической проверке гипотез и создании теорий или эмпирических обобщений, описывающих природные явления. Науки: фундаментальные и прикладные, их назначение и функции.
презентация [933,0 K], добавлен 20.12.2015Фундаментальные взаимодействия: гравитационное, электромагнитное, сильное, слабое; их понятие и краткая история. Взаимосвязь всех материальных объектов микро, макро и мегамира. Электромагнитное взаимодействие между телами в космических масштабах.
реферат [332,4 K], добавлен 10.07.2011Изучение процесса образования, развития и созревания клеток крови: лейкоцитов, эритроцитов, тромбоцитов у позвоночных. Исследование основных гемопоэтических факторов роста. Клетки - предшественницы кроветворения. Анализ основных классов клеток крови.
презентация [2,9 M], добавлен 07.04.2014